Published August 4, 2021 | Version v1
Publication Open

Upsurge of human rhinovirus infection followed by a delayed seasonal respiratory syncytial virus infection in Thai children during the coronavirus pandemic

Creators

  • 1. Chulalongkorn University

Description

Respiratory syncytial virus (RSV) and human rhinovirus (HRV) commonly cause influenza-like illness in young children. The global coronavirus pandemic beginning in 2020 altered the seasonality and prevalence of these respiratory infections in Thailand. We aimed to characterize the upsurge of HRV and the subsequent RSV infection observed among young children who sought medical care at a hospital in Bangkok.From July to December 2020, nasopharyngeal swabs from children ≤5 years of age presented with influenza-like illness were tested for RSV and HRV using reverse-transcription polymerase chain reaction. Positive samples were Sanger sequenced. Genotyping was performed using sequence and phylogenetic analysis.Upsurge of HRV infection began in July and was subsequently replaced by a surge of RSV infection from September onward. In 6 months, HRV was detected in 27.5% (158/574) of the samples, of which 44% (69/158) were HRV-A, 7% (11/158) were HRV-B, and 36% (57/158) were HRV-C. Meanwhile, RSV was detected in 40.4% (232/574) of the samples, of which 78% (181/232) were RSV-A and 6% (14/232) were RSV-B. RSV peaked in October 2020, approximately 2 months later than typically seen in previous years. All RSV-A were of subgenotype ON1. Codetection of HRV and RSV was found in 5.1% (29/574).HRV and RSV infection among young children coincided with relaxed local coronavirus public health measures, including the return to in-class schooling. The delayed RSV season in 2020 was predominantly associated with RSV-A.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

عادة ما يسبب الفيروس المخلوي التنفسي (RSV) وفيروس الأنف البشري (HRV) مرضًا شبيهًا بالإنفلونزا لدى الأطفال الصغار. غيرت جائحة فيروس كورونا العالمية التي بدأت في عام 2020 موسمية وانتشار هذه الالتهابات التنفسية في تايلاند. كنا نهدف إلى توصيف الزيادة المفاجئة في فيروس الورم الحليمي البشري والعدوى اللاحقة بفيروس الورم الحليمي البشري التي لوحظت بين الأطفال الصغار الذين سعوا للحصول على الرعاية الطبية في مستشفى في بانكوك. من يوليو إلى ديسمبر 2020، تم اختبار مسحات البلعوم الأنفي من الأطفال ≤5 سنوات من العمر الذين يعانون من مرض شبيه بالإنفلونزا لفحص فيروس الورم الحليمي البشري وفيروس الورم الحليمي البشري باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل بالنسخ العكسي. تم تسلسل العينات الإيجابية Sanger. تم إجراء التنميط الجيني باستخدام تحليل التسلسل والتطور. بدأت طفرة عدوى فيروس الورم الحليمي البشري في يوليو واستبدلت لاحقًا بطفرة عدوى الفيروس المخلوي التنفسي من سبتمبر فصاعدًا. في غضون 6 أشهر، تم اكتشاف فيروس الورم الحليمي البشري في 27.5 ٪ (158/574) من العينات، منها 44 ٪ (69/158) من فيروس الورم الحليمي البشري- أ، و 7 ٪ (11/158) من فيروس الورم الحليمي البشري- ب، و 36 ٪ (57/158) من فيروس الورم الحليمي البشري- ج. وفي الوقت نفسه، تم اكتشاف فيروس الورم الحليمي البشري في 40.4 ٪ (232/574) من العينات، منها 78 ٪ (181/232) من فيروس الورم الحليمي البشري- أ و 6 ٪ (14/232) من فيروس الورم الحليمي البشري- ب. بلغ فيروس الورم الحليمي البشري ذروته في أكتوبر 2020، أي بعد شهرين تقريبًا مما كان معتادًا في السنوات السابقة. كانت جميع RSV - A من النوع الفرعي ON1. تم العثور على الكشف عن فيروس HRV و RSV في 5.1 ٪ (29/574). تزامنت عدوى فيروس HRV و RSV بين الأطفال الصغار مع تدابير الصحة العامة المحلية المريحة لفيروس كورونا، بما في ذلك العودة إلى التعليم داخل الفصل. ارتبط موسم RSV المتأخر في عام 2020 في الغالب بـ RSV - A.

Translated Description (French)

Le virus respiratoire syncytial (VRS) et le rhinovirus humain (VHR) provoquent généralement une maladie pseudo-grippale chez les jeunes enfants. La pandémie mondiale de coronavirus qui a débuté en 2020 a modifié la saisonnalité et la prévalence de ces infections respiratoires en Thaïlande. Nous avons cherché à caractériser la recrudescence du VRC et l'infection subséquente par le VRS observée chez les jeunes enfants qui ont demandé des soins médicaux dans un hôpital de Bangkok. De juillet à décembre 2020, des prélèvements nasopharyngés d'enfants âgés de ≤5 ans présentant une maladie pseudo-grippale ont été testés pour le VRS et le VRC à l'aide d'une réaction en chaîne par polymérase à transcription inverse. Les échantillons positifs ont été séquencés par Sanger. Le génotypage a été effectué à l'aide d'une analyse de séquence et phylogénétique. L'augmentation de l'infection par le VRC a commencé en juillet et a ensuite été remplacée par une augmentation de l'infection par le VRS à partir de septembre. En 6 mois, le VRC a été détecté dans 27,5 % (158/574) des échantillons, dont 44 % (69/158) étaient le VRC-A, 7 % (11/158) étaient le VRC-B et 36 % (57/158) étaient le VRC-C. Pendant ce temps, le VRS a été détecté dans 40,4 % (232/574) des échantillons, dont 78 % (181/232) étaient le VRS-A et 6 % (14/232) étaient le VRS-B. Le VRS a culminé en octobre 2020, environ 2 mois plus tard que généralement observé les années précédentes. Tous les RSV-A étaient de sous-génotype ON1. La détection du VRC et du VRS a été trouvée chez 5,1 % (29/574). L'infection par le VRC et le VRS chez les jeunes enfants a coïncidé avec l'assouplissement des mesures locales de santé publique liées au coronavirus, y compris le retour à la scolarité en classe. La saison retardée du VRS en 2020 était principalement associée au VRS-A.

Translated Description (Spanish)

El virus sincitial respiratorio (RSV) y el rinovirus humano (HRV) comúnmente causan enfermedades similares a la influenza en niños pequeños. La pandemia mundial de coronavirus que comenzó en 2020 alteró la estacionalidad y la prevalencia de estas infecciones respiratorias en Tailandia. Nuestro objetivo fue caracterizar el aumento de la HRV y la posterior infección por RSV observada entre los niños pequeños que buscaron atención médica en un hospital de Bangkok. De julio a diciembre de 2020, se analizaron hisopos nasofaríngeos de niños ≤5 años de edad que presentaban una enfermedad similar a la influenza para detectar RSV y HRV utilizando la reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa. Las muestras positivas fueron secuenciadas por Sanger. El genotipado se realizó mediante análisis de secuencia y filogenético. El aumento de la infección por VFC comenzó en julio y posteriormente fue reemplazado por un aumento de la infección por VRS a partir de septiembre. En 6 meses, se detectó VFC en el 27,5% (158/574) de las muestras, de las cuales el 44% (69/158) eran VFC-A, el 7% (11/158) eran VFC-B y el 36% (57/158) eran VFC-C. Mientras tanto, se detectó VRS en el 40,4% (232/574) de las muestras, de las cuales el 78% (181/232) eran VRS-A y el 6% (14/232) eran VRS-B. El VRS alcanzó su punto máximo en octubre de 2020, aproximadamente 2 meses después de lo observado normalmente en años anteriores. Todos los RSV-A eran del subgenotipo ON1. La codetección de HRV y RSV se encontró en el 5.1% (29/574). La infección por HRV y RSV entre los niños pequeños coincidió con la relajación de las medidas locales de salud pública por coronavirus, incluido el regreso a la escolarización en clase. La temporada de VSR retrasada en 2020 se asoció predominantemente con VSR-A.

Files

irv.12893.pdf

Files (15.9 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:be8766d1a47b5d1e753d6931f431cab5
15.9 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تصاعد عدوى فيروس الأنف البشري تليها عدوى الفيروس المخلوي التنفسي الموسمية المتأخرة لدى الأطفال التايلنديين خلال جائحة فيروس كورونا
Translated title (French)
Augmentation de l'infection par le rhinovirus humain suivie d'une infection par le virus respiratoire syncytial saisonnier retardée chez les enfants thaïlandais pendant la pandémie de coronavirus
Translated title (Spanish)
Aumento de la infección por rinovirus humano seguido de una infección estacional tardía por el virus sincitial respiratorio en niños tailandeses durante la pandemia de coronavirus

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3190796263
DOI
10.1111/irv.12893

Is supplement to
https://openalex.org/W4309600431 (Other)
https://openalex.org/W3007508125 (Other)
https://openalex.org/W2954832874 (Other)
https://openalex.org/W2891285184 (Other)
https://openalex.org/W2786867092 (Other)
https://openalex.org/W2760515465 (Other)
https://openalex.org/W2585511484 (Other)
https://openalex.org/W2142706873 (Other)
https://openalex.org/W2056416587 (Other)
https://openalex.org/W1984511303 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Thailand

References

  • https://openalex.org/W1978053539
  • https://openalex.org/W1985599982
  • https://openalex.org/W2045940974
  • https://openalex.org/W2049375682
  • https://openalex.org/W2063145133
  • https://openalex.org/W2080826572
  • https://openalex.org/W2110219231
  • https://openalex.org/W2148456153
  • https://openalex.org/W2165012312
  • https://openalex.org/W2466803592
  • https://openalex.org/W2741949539
  • https://openalex.org/W2755200049
  • https://openalex.org/W2766412467
  • https://openalex.org/W2799524357
  • https://openalex.org/W2889562406
  • https://openalex.org/W2935742733
  • https://openalex.org/W3002583071
  • https://openalex.org/W3017629299
  • https://openalex.org/W3031530948
  • https://openalex.org/W3034168228
  • https://openalex.org/W3039808874
  • https://openalex.org/W3048190508
  • https://openalex.org/W3048866099
  • https://openalex.org/W3080635650
  • https://openalex.org/W3087478272
  • https://openalex.org/W3093810176
  • https://openalex.org/W3108238684
  • https://openalex.org/W3129373390
  • https://openalex.org/W3159321443
  • https://openalex.org/W4211261689