Published March 17, 2010 | Version v1
Publication Open

First insights into the genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis isolates from HIV-infected Mexican patients and mutations causing multidrug resistance

Creators

  • 1. Hospital General de México
  • 2. Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán
  • 3. Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud
  • 4. Centro de Investigación Biomédica en Red
  • 5. Hospital Universitario Miguel Servet

Description

Abstract Background The prevalence of infections with Mycobacterium tuberculosis (MTb) and nontuberculous mycobacteria (NTM) species in HIV-infected patients in Mexico is unknown. The aims of this study were to determine the frequency of MTb and NTM species in HIV-infected patients from Mexico City, to evaluate the genotypic diversity of the Mycobacterium tuberculosis complex strains, to determine their drug resistance profiles by colorimetric microplate Alamar Blue assay (MABA), and finally, to detect mutations present in kat G, rpo B and inh A genes, resulting in isoniazid (INH) and rifampin (RIF) resistance. Results Of the 67 mycobacterial strains isolated, 48 were identified as MTb, 9 as M. bovis , 9 as M. avium and 1 as M. intracellulare . IS 6110 -RFLP of 48 MTb strains showed 27 profiles. Spoligotyping of the 48 MTb strains yielded 21 patterns, and 9 M. bovis strains produced 7 patterns. Eleven new spoligotypes patterns were found. A total of 40 patterns were produced from the 48 MTb strains when MIRU-VNTR was performed. Nineteen (39.6%) MTb strains were resistant to one or more drugs. One (2.1%) multidrug-resistant (MDR) strain was identified. A novel mutation was identified in a RIF-resistant strain, GAG → TCG (Glu → Ser) at codon 469 of rpo B gene. Conclusions This is the first molecular analysis of mycobacteria isolated from HIV-infected patients in Mexico, which describe the prevalence of different mycobacterial species in this population. A high genetic diversity of MTb strains was identified. New spoligotypes and MIRU-VNTR patterns as well as a novel mutation associated to RIF-resistance were found. This information will facilitate the tracking of different mycobacterial species in HIV-infected individuals, and monitoring the spread of these microorganisms, leading to more appropriate measures for tuberculosis control.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

خلفية مجردة انتشار العدوى بالسل المتفطرات (MTb) وأنواع المتفطرات غير السلية (NTM) في المرضى المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية في المكسيك غير معروف. كانت أهداف هذه الدراسة هي تحديد تواتر أنواع MTb و NTM في المرضى المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية من مكسيكو سيتي، وتقييم التنوع الوراثي لسلالات السل المتفطرة، وتحديد ملامح مقاومتها للأدوية عن طريق اختبار الصفيحة الدقيقة Alamar Blue (MabA)، وأخيرًا، للكشف عن الطفرات الموجودة في جينات kat G و rpo B و inh A، مما يؤدي إلى مقاومة isoniazid (INH) و rifampin (RIF). نتائج 67 من السلالات الفطرية المعزولة، تم تحديد 48 على أنها MTb، و 9 على أنها M. bovis ، و 9 على أنها M. avium و 1 على أنها M. intracellulare . IS 6110 - أظهرت RFLP من 48 سلالات MTb 27 ملفًا شخصيًا. أسفرت التنميط الضيق لسلالات 48 MTb عن 21 نمطًا، وأنتجت سلالات 9 M. bovis 7 أنماط. تم العثور على أحد عشر نمطًا جديدًا من أنماط spoligotypes. تم إنتاج ما مجموعه 40 نمطًا من سلالات 48 طن متري عند إجراء MIRU - VNTR. كانت تسعة عشر (39.6 ٪) من سلالات MTb مقاومة لعقار واحد أو أكثر. تم تحديد سلالة واحدة (2.1 ٪) مقاومة للأدوية المتعددة (MDR). تم تحديد طفرة جديدة في سلالة مقاومة لـ RIF، GAG → TCG (Glu → Ser) في الكودون 469 من جين rpo B. الاستنتاجات هذا هو أول تحليل جزيئي للبكتيريا الفطرية المعزولة من المرضى المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية في المكسيك، والذي يصف انتشار الأنواع الفطرية المختلفة في هذه المجموعة. تم تحديد تنوع وراثي كبير لسلالات MTb. تم العثور على أنماط spoligotypes جديدة وأنماط MIRU - VNTR بالإضافة إلى طفرة جديدة مرتبطة بمقاومة RIF. ستسهل هذه المعلومات تتبع الأنواع الفطرية المختلفة لدى الأفراد المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية، ومراقبة انتشار هذه الكائنات الحية الدقيقة، مما يؤدي إلى اتخاذ تدابير أكثر ملاءمة لمكافحة السل.

Translated Description (French)

Résumé Contexte La prévalence des infections à Mycobacterium tuberculosis (MTb) et à des espèces de mycobactéries non tuberculeuses (NTM) chez les patients infectés par le VIH au Mexique est inconnue. Les objectifs de cette étude étaient de déterminer la fréquence des espèces MTb et NTM chez les patients infectés par le VIH de Mexico, d'évaluer la diversité génotypique des souches du complexe Mycobacterium tuberculosis, de déterminer leurs profils de résistance aux médicaments par test colorimétrique sur microplaque Alamar Blue (MABA), et enfin, de détecter les mutations présentes dans les gènes kat G, rpo B et inh A, entraînant une résistance à l'isoniazide (INH) et à la rifampicine (RIF). Résultats Sur les 67 souches mycobactériennes isolées, 48 ont été identifiées comme MTb, 9 comme M. bovis , 9 comme M. avium et 1 comme M. intracellulare . IS 6110 -RFLP de 48 souches MTb a montré 27 profils. Le spoligotypage des 48 souches de MTb a donné 21 patrons, et 9 souches de M. bovis ont produit 7 patrons. Onze nouveaux patrons de spoligotypes ont été trouvés. Au total, 40 patrons ont été produits à partir des souches de 48 MTb lors de la réalisation de MIRU-VNTR. Dix-neuf (39,6 %) souches de MTb étaient résistantes à un ou plusieurs médicaments. Une souche multirésistante (2,1 %) a été identifiée. Une nouvelle mutation a été identifiée dans une souche résistante au RIF, GAG → TCG (Glu → Ser) au codon 469 du gène rpo B. Conclusions Il s'agit de la première analyse moléculaire de mycobactéries isolées de patients infectés par le VIH au Mexique, qui décrit la prévalence de différentes espèces de mycobactéries dans cette population. Une grande diversité génétique des souches de MTb a été identifiée. De nouveaux spoligotypes et modèles MIRU-VNTR ainsi qu'une nouvelle mutation associée à la résistance au RIF ont été trouvés. Ces informations faciliteront le suivi des différentes espèces de mycobactéries chez les individus infectés par le VIH, et le suivi de la propagation de ces micro-organismes, conduisant à des mesures plus appropriées pour la lutte antituberculeuse.

Translated Description (Spanish)

Resumen Antecedentes Se desconoce la prevalencia de infecciones por especies de Mycobacterium tuberculosis (MTb) y micobacterias no tuberculosas (NTM) en pacientes infectados por el VIH en México. Los objetivos de este estudio fueron determinar la frecuencia de las especies MTb y NTM en pacientes infectados por el VIH de la Ciudad de México, evaluar la diversidad genotípica de las cepas del complejo Mycobacterium tuberculosis, determinar sus perfiles de resistencia a los medicamentos mediante el ensayo colorimétrico de microplaca Alamar Blue (mAbA) y, finalmente, detectar mutaciones presentes en los genes kat G, rpo B e inh A, lo que resulta en resistencia a isoniazida (INH) y rifampicina (RIF). Resultados De las 67 cepas micobacterianas aisladas, 48 se identificaron como MTb, 9 como M. bovis , 9 como M. avium y 1 como M. intracellulare . IS 6110 -RFLP de 48 cepas de MTb mostró 27 perfiles. El espoligotipado de las 48 cepas de MTb produjo 21 patrones, y 9 cepas de M. bovis produjeron 7 patrones. Se han encontrado once nuevos patrones de espoligotipos. Se produjeron un total de 40 patrones a partir de las 48 cepas de MTb cuando se realizó MIRU-VNTR. Diecinueve (39.6%) cepas de MTb fueron resistentes a uno o más fármacos. Se identificó una cepa multirresistente (MDR) (2.1%). Se identificó una nueva mutación en una cepa resistente a RIF, GAG → TCG (→Glu Ser) en el codón 469 del gen rpo B. Conclusiones Este es el primer análisis molecular de micobacterias aisladas de pacientes infectados por VIH en México, que describen la prevalencia de diferentes especies de micobacterias en esta población. Se identificó una alta diversidad genética de cepas de MTb. Se encontraron nuevos espoligotipos y patrones MIRU-VNTR, así como una nueva mutación asociada a la resistencia a RIF. Esta información facilitará el seguimiento de diferentes especies de micobacterias en individuos infectados por el VIH y el monitoreo de la propagación de estos microorganismos, lo que conducirá a medidas más apropiadas para el control de la tuberculosis.

Files

1471-2180-10-82.pdf

Files (1.1 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:0213b6e981442924b93359a53cee89c6
1.1 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
أول نظرة ثاقبة للتنوع الجيني لمتفطرة السل تعزل المرضى المكسيكيين المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية والطفرات التي تسبب مقاومة الأدوية المتعددة
Translated title (French)
Premiers aperçus de la diversité génétique des isolats de Mycobacterium tuberculosis provenant de patients mexicains infectés par le VIH et des mutations provoquant une multirésistance aux médicaments
Translated title (Spanish)
Primeros conocimientos sobre la diversidad genética de los aislados de Mycobacterium tuberculosis de pacientes mexicanos infectados por el VIH y mutaciones que causan resistencia a múltiples fármacos

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2096081125
DOI
10.1186/1471-2180-10-82

Is supplement to
https://openalex.org/W2397191776 (Other)
https://openalex.org/W2392799844 (Other)
https://openalex.org/W2357211713 (Other)
https://openalex.org/W2198343267 (Other)
https://openalex.org/W2164931582 (Other)
https://openalex.org/W2149284972 (Other)
https://openalex.org/W2138026001 (Other)
https://openalex.org/W2073489407 (Other)
https://openalex.org/W2021745870 (Other)
https://openalex.org/W1985721542 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Mexico

References

  • https://openalex.org/W186307931
  • https://openalex.org/W1884882993
  • https://openalex.org/W1930339016
  • https://openalex.org/W1965055542
  • https://openalex.org/W1969239890
  • https://openalex.org/W1981840064
  • https://openalex.org/W1987493454
  • https://openalex.org/W1989415838
  • https://openalex.org/W1991001948
  • https://openalex.org/W1994514597
  • https://openalex.org/W1997107662
  • https://openalex.org/W2006303150
  • https://openalex.org/W2007683771
  • https://openalex.org/W2017692297
  • https://openalex.org/W2021729516
  • https://openalex.org/W2025540013
  • https://openalex.org/W2027288573
  • https://openalex.org/W2027771457
  • https://openalex.org/W2029971901
  • https://openalex.org/W2039410126
  • https://openalex.org/W2046333460
  • https://openalex.org/W2055043387
  • https://openalex.org/W2058925610
  • https://openalex.org/W2060003027
  • https://openalex.org/W2061813195
  • https://openalex.org/W2067147999
  • https://openalex.org/W2075000963
  • https://openalex.org/W2079654493
  • https://openalex.org/W2086292647
  • https://openalex.org/W2092580246
  • https://openalex.org/W2096162460
  • https://openalex.org/W2099200219
  • https://openalex.org/W2099326022
  • https://openalex.org/W2099917451
  • https://openalex.org/W2100069291
  • https://openalex.org/W2100246107
  • https://openalex.org/W2100887397
  • https://openalex.org/W2102914435
  • https://openalex.org/W2105255620
  • https://openalex.org/W2106839160
  • https://openalex.org/W2108542673
  • https://openalex.org/W2110303370
  • https://openalex.org/W2111582999
  • https://openalex.org/W2113029891
  • https://openalex.org/W2116526819
  • https://openalex.org/W2118804480
  • https://openalex.org/W2120106916
  • https://openalex.org/W2121004190
  • https://openalex.org/W2127975178
  • https://openalex.org/W2132044656
  • https://openalex.org/W2134080423
  • https://openalex.org/W2134558351
  • https://openalex.org/W2137133706
  • https://openalex.org/W2140419507
  • https://openalex.org/W2146987614
  • https://openalex.org/W2151708720
  • https://openalex.org/W2152489884
  • https://openalex.org/W2155562421
  • https://openalex.org/W2156887574
  • https://openalex.org/W2157645392
  • https://openalex.org/W2157967191
  • https://openalex.org/W2160787060
  • https://openalex.org/W2162912294
  • https://openalex.org/W2163214563
  • https://openalex.org/W2164343297
  • https://openalex.org/W2165822919
  • https://openalex.org/W2167367545
  • https://openalex.org/W2175438983
  • https://openalex.org/W2315232969
  • https://openalex.org/W2411807178
  • https://openalex.org/W4252250457
  • https://openalex.org/W4360754231
  • https://openalex.org/W95474782