Published April 30, 2024 | Version v1
Publication Open

Evaluation of Antibiotics by Disk Diffusion and Minimum Inhibitory Concentration Breakpoints in Urinary Tract Infections

Creators

  • 1. Khyber Medical College
  • 2. University of Sargodha
  • 3. Karachi Medical and Dental College
  • 4. Ayub Medical College

Description

Antibiotic resistance (ABR) has made it more challenging to treat uropathogenic organisms. It is impossible to compromise antimicrobial susceptibility testing (AST), which is essential and has a significant impact on infection treatment strategies. Although labor-intensive and technically challenging for everyday laboratory use, the agar dilution technique is appropriate for monitoring and assessing novel antimicrobials. Objective: To determine the minimum inhibitory concentration (MIC), Agar dilution technique and disk diffusion as susceptibility test methodologies. Methods: This study was carried out at Khyber Girls Medical College (KGMC) Peshawar. Keeping in view the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) guidelines AST was executed. BIOMÉRIEUX® API® kits and gram staining were utilized for identification of bacteria. The disk diffusion was performed using Thermo ScientificTM OxoidTM antibiotic discs of Co-trimoxazole, Levofloxacin, Nitrofurantoin and Fosfomycin. The MIC and zone of inhibitions for disk diffusion were noted according to the CLSI protocol. Results: 158 culture positive samples were isolated out of 680 total received. Esherechia Coli (E. coli) (74.1%) being the most isolated organism. In comparison of disk diffusion and agar dilution, categorical agreement for Levofloxacin, Cotrimoxazole, Nitrofurantoin and Fosfomycin were (82.28%, 72.15 %, 87.97% and 82.28%) respectively. Kappa coefficients of (0.64, 0.43, 0.57 and 0.37) (p < 0.0001) were calculated for Levofloxacin, Co-trimoxazole, Nitrofurantoin, and Fosfomycin respectively, revealing considerable level of agreement for these antibiotics. Conclusions: It was concluded that Agar dilution is more precise than disk diffusion but being more labor intensive and technical. Disk diffusion can still produce significantly accurate results with less resource consumption.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

جعلت مقاومة المضادات الحيوية (ABR) من الصعب علاج الكائنات الحية المسببة للأمراض البولية. من المستحيل المساس باختبار الحساسية لمضادات الميكروبات (AST)، وهو أمر ضروري وله تأثير كبير على استراتيجيات علاج العدوى. على الرغم من كثرة العمالة والصعوبة التقنية للاستخدام اليومي في المختبرات، إلا أن تقنية تخفيف الآجار مناسبة لمراقبة وتقييم مضادات الميكروبات الجديدة. الهدف: تحديد الحد الأدنى للتركيز المثبط (MIC) وتقنية تخفيف AGAR وانتشار القرص كمنهجيات اختبار الحساسية. الأساليب: أجريت هذه الدراسة في كلية خيبر الطبية للبنات في بيشاور. مع مراعاة تنفيذ إرشادات معهد المعايير السريرية والمخبرية (CLSI) AST. تم استخدام مجموعات BIOMÉRIEUX® API® وتلطيخ الجرام لتحديد البكتيريا. تم إجراء نشر القرص باستخدام أقراص المضادات الحيوية Thermo ScientificTM OxoidTM من Co - trimoxazole و Levofloxacin و Nitrofurantoin و Fosfomycin. تمت ملاحظة الميكروفون ومنطقة مثبطات انتشار القرص وفقًا لبروتوكول CLSI. النتائج: تم عزل 158 عينة إيجابية من أصل 680 عينة تم استلامها. الاشريكية القولونية (الإشريكية القولونية) (74.1 ٪) هي الكائن الأكثر عزلة. وبالمقارنة بين انتشار القرص وتخفيف الآجار، كانت الاتفاقية القطعية لليفوفلوكساسين وكوتريموكسازول والنيتروفورانتوين وفوسفوميسين (82.28 ٪ و 72.15 ٪ و 87.97 ٪ و 82.28 ٪) على التوالي. تم حساب معاملات كابا (0.64، 0.43، 0.57 و 0.37) (p < 0.0001) لليفوفلوكساسين، Co - trimoxazole، Nitrofurantoin، و Fosfomycin على التوالي، مما يكشف عن مستوى كبير من الاتفاق على هذه المضادات الحيوية. الاستنتاجات: تم التوصل إلى أن تخفيف أجار أكثر دقة من انتشار القرص ولكنه أكثر كثافة في العمل وتقنية. لا يزال بإمكان نشر القرص إنتاج نتائج دقيقة بشكل كبير مع استهلاك أقل للموارد.

Translated Description (French)

La résistance aux antibiotiques (ABR) a rendu plus difficile le traitement des organismes uropathogènes. Il est impossible de compromettre les tests de sensibilité aux antimicrobiens (TSA), qui sont essentiels et ont un impact significatif sur les stratégies de traitement des infections. Bien qu'à forte intensité de main-d' œuvre et techniquement difficile pour une utilisation quotidienne en laboratoire, la technique de dilution de la gélose est appropriée pour surveiller et évaluer de nouveaux antimicrobiens. Objectif : Déterminer la concentration minimale inhibitrice (CMI), la technique de dilution de la gélose et la diffusion sur disque comme méthodologies de test de sensibilité. Méthodes : Cette étude a été réalisée au Khyber Girls Medical College (KGMC) de Peshawar. Garder à l'esprit les lignes directrices du Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) AST a été exécuté. Les kits BIOMÉRIEUX® API® et la coloration au gramme ont été utilisés pour l'identification des bactéries. La diffusion discale a été réalisée à l'aide de disques antibiotiques Thermo ScientificTM OxoidTM de Co-trimoxazole, de Lévofloxacine, de Nitrofurantoïne et de Fosfomycine. La CMI et la zone d'inhibition de la diffusion discale ont été notées selon le protocole CLSI. Résultats : 158 échantillons positifs à la culture ont été isolés sur un total de 680 reçus. Esherechia Coli (E. coli) (74,1 %) étant l'organisme le plus isolé. En comparaison de la diffusion sur disque et de la dilution sur gélose, l'accord catégorique pour la lévofloxacine, le cotrimoxazole, la nitrofurantoïne et la fosfomycine était respectivement de 82,28 %, 72,15 %, 87,97 % et 82,28 %. Des coefficients Kappa de (0,64, 0,43, 0,57 et 0,37) (p < 0,0001) ont été calculés pour la lévofloxacine, le co-trimoxazole, la nitrofurantoïne et la fosfomycine respectivement, révélant un niveau d'accord considérable pour ces antibiotiques. Conclusions : Il a été conclu que la dilution de l'agar est plus précise que la diffusion sur disque mais qu'elle est plus laborieuse et technique. La diffusion sur disque peut toujours produire des résultats significativement précis avec moins de consommation de ressources.

Translated Description (Spanish)

La resistencia a los antibióticos (abr) ha hecho que sea más difícil tratar los organismos uropatógenos. Es imposible comprometer las pruebas de susceptibilidad antimicrobiana (AST), que son esenciales y tienen un impacto significativo en las estrategias de tratamiento de infecciones. Aunque requiere mucha mano de obra y es técnicamente difícil para el uso diario en laboratorio, la técnica de dilución en agar es apropiada para monitorear y evaluar nuevos antimicrobianos. Objetivo: Determinar la concentración mínima inhibitoria (CIM), la técnica de dilución de agar y la difusión en disco como metodologías de prueba de susceptibilidad. Métodos: Este estudio se llevó a cabo en el Khyber Girls Medical College (KGMC) Peshawar. Teniendo en cuenta las pautas del Instituto de Estándares Clínicos y de Laboratorio (CLSI), se ejecutó AST. Los kits BIOMÉRIEUX® API® y la tinción de Gram se utilizaron para la identificación de bacterias. La difusión en disco se realizó utilizando discos antibióticos Thermo ScientificTM OxoidTM de Co-trimoxazol, Levofloxacina, Nitrofurantoína y Fosfomicina. La CIM y la zona de inhibiciones para la difusión en disco se anotaron de acuerdo con el protocolo CLSI. Resultados: Se aislaron 158 muestras positivas de cultivo de un total de 680 recibidas. Esherechia Coli (E. coli) (74,1%) siendo el organismo más aislado. En comparación con la difusión en disco y la dilución en agar, la concordancia categórica para levofloxacina, cotrimoxazol, nitrofurantoína y fosfomicina fue de (82,28%, 72,15%, 87,97% y 82,28%) respectivamente. Se calcularon coeficientes Kappa de (0.64, 0.43, 0.57 y 0.37) (p < 0.0001) para Levofloxacina, Co-trimoxazol, Nitrofurantoína y Fosfomicina respectivamente, revelando un nivel considerable de acuerdo para estos antibióticos. Conclusiones: Se concluyó que la dilución de Agar es más precisa que la difusión en disco, pero es más intensiva en mano de obra y técnica. La difusión en disco todavía puede producir resultados significativamente precisos con menos consumo de recursos.

Files

852.pdf

Files (685.9 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:aa6dd5e02aa92c52a70d97a602854e0e
685.9 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تقييم المضادات الحيوية عن طريق انتشار القرص والحد الأدنى من نقاط التوقف عن التركيز المثبط في التهابات المسالك البولية
Translated title (French)
Évaluation des antibiotiques par diffusion sur disque et concentrations minimales inhibitrices dans les infections des voies urinaires
Translated title (Spanish)
Evaluación de antibióticos por difusión en disco y puntos de interrupción de concentración mínima inhibitoria en infecciones del tracto urinario

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4396780227
DOI
10.54393/pjhs.v5i04.1460

Is supplement to
https://openalex.org/W4248680266 (Other)
https://openalex.org/W2606481030 (Other)
https://openalex.org/W2123012074 (Other)
https://openalex.org/W2117117412 (Other)
https://openalex.org/W2102889349 (Other)
https://openalex.org/W2067409815 (Other)
https://openalex.org/W2048731896 (Other)
https://openalex.org/W2036289360 (Other)
https://openalex.org/W2003824598 (Other)
https://openalex.org/W1979375946 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Pakistan

References

  • https://openalex.org/W1841415786
  • https://openalex.org/W2215646221
  • https://openalex.org/W2222642144
  • https://openalex.org/W2550459956
  • https://openalex.org/W2796196815
  • https://openalex.org/W2895455357
  • https://openalex.org/W2908966383
  • https://openalex.org/W2913022205
  • https://openalex.org/W2955931959
  • https://openalex.org/W3011829967
  • https://openalex.org/W3037715302
  • https://openalex.org/W3045566957
  • https://openalex.org/W3048784711
  • https://openalex.org/W3129095230
  • https://openalex.org/W4312185845