Published June 1, 2021
| Version v1
Publication
Open
Solving the boundary artifact for the enhanced deconvolution algorithm SUPPOSe applied to fluorescence microscopy
Creators
- 1. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
- 2. Institute of Astronomy and Space Physics
Description
The SUPPOSe enhanced deconvolution algorithm relies in assuming that the image source can be described by an incoherent superposition of virtual point sources of equal intensity and finding the number and position of such virtual sources. In this work we describe the recent advances in the implementation of the method to gain resolution and remove artifacts due to the presence of fluorescent molecules close enough to the image frame boundary. The method was modified removing the invariant used before given by the product of the flux of the virtual sources times the number of virtual sources, and replacing it by a new invariant given by the total flux within the frame, thus allowing the location of virtual sources outside the frame but contributing to the signal inside the frame.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تعتمد خوارزمية فك الالتفاف المحسنة SUPPOSe على افتراض أنه يمكن وصف مصدر الصورة من خلال تراكب غير متماسك لمصادر النقاط الافتراضية ذات الكثافة المتساوية وإيجاد عدد وموضع هذه المصادر الافتراضية. في هذا العمل، نصف التطورات الحديثة في تنفيذ طريقة الحصول على الدقة وإزالة القطع الأثرية بسبب وجود جزيئات الفلورسنت قريبة بما فيه الكفاية من حدود إطار الصورة. تم تعديل الطريقة بإزالة الثابت المستخدم من قبل المعطى بواسطة ناتج تدفق المصادر الافتراضية مضروبًا في عدد المصادر الافتراضية، واستبداله بثابت جديد معطى بواسطة التدفق الكلي داخل الإطار، مما يسمح بتحديد موقع المصادر الافتراضية خارج الإطار ولكن المساهمة في الإشارة داخل الإطار.Translated Description (French)
L'algorithme de déconvolution amélioré SUPPOSe repose sur l'hypothèse que la source d'image peut être décrite par une superposition incohérente de sources ponctuelles virtuelles d'intensité égale et la recherche du nombre et de la position de telles sources virtuelles. Dans ce travail, nous décrivons les progrès récents dans la mise en œuvre de la méthode pour obtenir une résolution et supprimer les artefacts en raison de la présence de molécules fluorescentes assez proches de la limite du cadre de l'image. Le procédé a été modifié en supprimant l'invariant utilisé précédemment donné par le produit du flux des sources virtuelles par le nombre de sources virtuelles, et en le remplaçant par un nouvel invariant donné par le flux total à l'intérieur de la trame, permettant ainsi la localisation des sources virtuelles à l'extérieur de la trame mais contribuant au signal à l'intérieur de la trame.Translated Description (Spanish)
El algoritmo de deconvolución mejorada de SUPPOSe se basa en suponer que la fuente de imagen puede describirse mediante una superposición incoherente de fuentes puntuales virtuales de igual intensidad y encontrar el número y la posición de dichas fuentes virtuales. En este trabajo describimos los avances recientes en la implementación del método para ganar resolución y eliminar artefactos debido a la presencia de moléculas fluorescentes lo suficientemente cerca del límite del marco de la imagen. El método se modificó eliminando la invariante utilizada antes dada por el producto del flujo de las fuentes virtuales multiplicado por el número de fuentes virtuales, y reemplazándola por una nueva invariante dada por el flujo total dentro de la trama, permitiendo así la ubicación de fuentes virtuales fuera de la trama pero contribuyendo a la señal dentro de la trama.Files
450314.pdf.pdf
Files
(1.3 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:7fedf0a21b07baa5a282d808f1ffc503
|
1.3 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- حل أداة الحدود لخوارزمية فك الالتفاف المحسنة SUPPOSe المطبقة على المجهر الفلوري
- Translated title (French)
- Résolution de l'artefact limite pour l'algorithme de déconvolution amélioré SUPPOSe appliqué à la microscopie à fluorescence
- Translated title (Spanish)
- Resolver el artefacto de límite para el algoritmo de deconvolución mejorado SUPPOSe aplicado a la microscopía de fluorescencia
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3176751186
- DOI
- 10.18287/2412-6179-co-825
References
- https://openalex.org/W1978249718
- https://openalex.org/W1991815226
- https://openalex.org/W1992858116
- https://openalex.org/W2005836623
- https://openalex.org/W2010932144
- https://openalex.org/W2018778093
- https://openalex.org/W2020111712
- https://openalex.org/W2027310996
- https://openalex.org/W2037290654
- https://openalex.org/W2043663696
- https://openalex.org/W2043709234
- https://openalex.org/W2053697885
- https://openalex.org/W2054455698
- https://openalex.org/W2062317708
- https://openalex.org/W2063978272
- https://openalex.org/W2065490663
- https://openalex.org/W2066521860
- https://openalex.org/W2067042811
- https://openalex.org/W2076425962
- https://openalex.org/W2088909704
- https://openalex.org/W2090799758
- https://openalex.org/W2098761256
- https://openalex.org/W2100556411
- https://openalex.org/W2101336703
- https://openalex.org/W2104569066
- https://openalex.org/W2106316394
- https://openalex.org/W2113674028
- https://openalex.org/W2115737236
- https://openalex.org/W2145096794
- https://openalex.org/W2147604686
- https://openalex.org/W2149241780
- https://openalex.org/W2154612705
- https://openalex.org/W2170608748
- https://openalex.org/W2296138801
- https://openalex.org/W2538697729
- https://openalex.org/W2551137837
- https://openalex.org/W2568027424
- https://openalex.org/W2588088434
- https://openalex.org/W2597088123
- https://openalex.org/W2770959800
- https://openalex.org/W2799290404
- https://openalex.org/W2893395426
- https://openalex.org/W2897967736
- https://openalex.org/W2916908097
- https://openalex.org/W2944046676
- https://openalex.org/W2963270586
- https://openalex.org/W2970109317
- https://openalex.org/W3047546205