Published November 1, 2019
| Version v1
Publication
Open
Metagenomic analysis of microbial community associated with coral mucus from the Gulf of Aqaba
Creators
- 1. Yarmouk University
- 2. College of Applied Sciences, Nizwa
- 3. Ca' Foscari University of Venice
- 4. University of Jordan
- 5. Ohio University
Description
Abstract
Coral-associated microbial communities contribute to a wide variety of useful roles regarding the their host, and therefore, the arrangement of the general microbiome network can emphatically impact coral wellbeing and survival. Various pollution sources can interfere and disrupt the microbial relationship with corals. Here, we adopted the bacterial tag-encoded FLX amplicon pyrosequencing (bTEFAP®) technique to investigate the shift of microbial communities associated with the mucus of the coral Stylophora pistillata collected from five sites (Marine Science Station, Industrial Complex, Oil Terminal, Public Beach, and Phosphate Port) along the Gulf of Aqaba (Red Sea). Our results revealed a high diversity in bacterial populations associated with coral mucus. Proteobacteria were observed to be the dominating phylum among all sampling sites. The identified bacterial taxa belong to the pathogenic bacteria from the genus Vibrio was presented in varying abundances at all sampling sites. Diversity and similarity analysis of microbial communists based on rarefaction curve and UniFrac cluster respectively demonstrated that there are variances in microbial groups associated with coral mucus along sites. The pollution sources among different locations along the Gulf of Aqaba seem to affect the coral-associated holobiont leading to changes in bacterial populations due to increasing human activities.Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
الملخص
تساهم المجتمعات الميكروبية المرتبطة بالمرجان في مجموعة واسعة من الأدوار المفيدة فيما يتعلق بمضيفها، وبالتالي، فإن ترتيب شبكة الميكروبيوم العامة يمكن أن يؤثر بشكل قاطع على رفاهية المرجان وبقائه. يمكن أن تتداخل مصادر التلوث المختلفة وتعطل العلاقة الميكروبية مع الشعاب المرجانية. هنا، اعتمدنا تقنية التسلسل الحراري لأمبليكون FLX (bTEFAP ®) المرمزة بالعلامة البكتيرية للتحقيق في تحول المجتمعات الميكروبية المرتبطة بمخاط مدقة ستيلوفورا المرجانية التي تم جمعها من خمسة مواقع (محطة العلوم البحرية، والمجمع الصناعي، ومحطة النفط، والشاطئ العام، وميناء الفوسفات) على طول خليج العقبة (البحر الأحمر). كشفت نتائجنا عن تنوع كبير في المجموعات البكتيرية المرتبطة بالمخاط المرجاني. ولوحظ أن البكتيريا البروتينية هي الشعبة المهيمنة بين جميع مواقع أخذ العينات. تنتمي الأصناف البكتيرية المحددة إلى البكتيريا المسببة للأمراض من جنس الضمة تم تقديمها بوفرة متفاوتة في جميع مواقع أخذ العينات. أظهر تحليل التنوع والتشابه للشيوعيين الميكروبيين بناءً على منحنى التخلخل ومجموعة UniFrac على التوالي أن هناك تباينات في المجموعات الميكروبية المرتبطة بالمخاط المرجاني على طول المواقع. يبدو أن مصادر التلوث بين المواقع المختلفة على طول خليج العقبة تؤثر على الهولوبيونت المرتبط بالشعاب المرجانية مما يؤدي إلى تغيرات في المجموعات البكتيرية بسبب زيادة الأنشطة البشرية.Translated Description (French)
Résumé
Les communautés microbiennes associées aux coraux contribuent à une grande variété de rôles utiles concernant leur hôte, et par conséquent, l'arrangement du réseau général du microbiome peut avoir un impact important sur le bien-être et la survie des coraux. Diverses sources de pollution peuvent interférer et perturber la relation microbienne avec les coraux. Ici, nous avons adopté la technique de pyroséquençage de l'amplicon FLX à marquage bactérien (bTEFAP ®) pour étudier le déplacement des communautés microbiennes associées au mucus du corail Stylophora pistillata collecté sur cinq sites (Station des sciences marines, complexe industriel, terminal pétrolier, plage publique et port de phosphate) le long du golfe d'Aqaba (mer Rouge). Nos résultats ont révélé une grande diversité de populations bactériennes associées au mucus corallien. Les protéobactéries ont été observées comme le phylum dominant parmi tous les sites d'échantillonnage. Les taxons bactériens identifiés appartiennent aux bactéries pathogènes du genre Vibrio et ont été présentés en abondance variable à tous les sites d'échantillonnage. L'analyse de la diversité et de la similarité des communistes microbiens basée sur la courbe de raréfaction et le cluster UniFrac respectivement a démontré qu'il existe des variances dans les groupes microbiens associés au mucus corallien le long des sites. Les sources de pollution entre les différents endroits le long du golfe d'Aqaba semblent affecter l'holobionte associé au corail, entraînant des changements dans les populations bactériennes en raison de l'augmentation des activités humaines.Translated Description (Spanish)
Resumen
Las comunidades microbianas asociadas a los corales contribuyen a una amplia variedad de funciones útiles con respecto a su huésped y, por lo tanto, la disposición de la red general de microbiomas puede afectar enfáticamente el bienestar y la supervivencia de los corales. Varias fuentes de contaminación pueden interferir e interrumpir la relación microbiana con los corales. Aquí, adoptamos la técnica de pirosecuenciación de amplicones FLX codificados por etiquetas bacterianas (bTEFAP ®) para investigar el cambio de las comunidades microbianas asociadas con el moco del coral Stylophora pistillata recolectado de cinco sitios (Estación de Ciencias Marinas, Complejo Industrial, Terminal Petrolera, Playa Pública y Puerto de Fosfatos) a lo largo del Golfo de Aqaba (Mar Rojo). Nuestros resultados revelaron una alta diversidad en las poblaciones bacterianas asociadas con el moco de coral. Se observó que las proteobacterias eran el filo dominante entre todos los sitios de muestreo. Los taxones bacterianos identificados pertenecen a las bacterias patógenas del género Vibrio y se presentaron en diferentes abundancias en todos los sitios de muestreo. Los análisis de diversidad y similitud de los comunistas microbianos basados en la curva de rarefacción y el grupo UniFrac respectivamente demostraron que hay variaciones en los grupos microbianos asociados con el moco de coral a lo largo de los sitios. Las fuentes de contaminación entre diferentes lugares a lo largo del Golfo de Aqaba parecen afectar al holobionte asociado al coral, lo que lleva a cambios en las poblaciones bacterianas debido al aumento de las actividades humanas.Files
pdf.pdf
Files
(16.1 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:8243b2fc78874c15c50c8ce0fe434f16
|
16.1 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التحليل الميتاجينومي للمجتمع الميكروبي المرتبط بالمخاط المرجاني من خليج العقبة
- Translated title (French)
- Analyse métagénomique de la communauté microbienne associée au mucus corallien du golfe d'Aqaba
- Translated title (Spanish)
- Análisis metagenómico de la comunidad microbiana asociada con el moco de coral del Golfo de Aqaba
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2989960801
- DOI
- 10.1016/j.heliyon.2019.e02876
References
- https://openalex.org/W1532246450
- https://openalex.org/W1809313724
- https://openalex.org/W1964282650
- https://openalex.org/W1965172919
- https://openalex.org/W1966413305
- https://openalex.org/W1984682151
- https://openalex.org/W1999565816
- https://openalex.org/W1999736591
- https://openalex.org/W2016872004
- https://openalex.org/W2019595204
- https://openalex.org/W2019635999
- https://openalex.org/W2022523556
- https://openalex.org/W2024763652
- https://openalex.org/W2029625729
- https://openalex.org/W2034711850
- https://openalex.org/W2036013964
- https://openalex.org/W2038838030
- https://openalex.org/W2040565150
- https://openalex.org/W2062308315
- https://openalex.org/W2062676544
- https://openalex.org/W2077047836
- https://openalex.org/W2077681695
- https://openalex.org/W2078160841
- https://openalex.org/W2084372590
- https://openalex.org/W2087671769
- https://openalex.org/W2100216289
- https://openalex.org/W2105807803
- https://openalex.org/W2106503480
- https://openalex.org/W2114094146
- https://openalex.org/W2121402501
- https://openalex.org/W2121592635
- https://openalex.org/W2122890606
- https://openalex.org/W2133274884
- https://openalex.org/W2136811216
- https://openalex.org/W2138528146
- https://openalex.org/W2142598180
- https://openalex.org/W2148481938
- https://openalex.org/W2151911433
- https://openalex.org/W2154079405
- https://openalex.org/W2166927678
- https://openalex.org/W2168539630
- https://openalex.org/W2176994624
- https://openalex.org/W2232072141
- https://openalex.org/W2294512339
- https://openalex.org/W2414643416
- https://openalex.org/W2733114474
- https://openalex.org/W2742942429
- https://openalex.org/W2754359579
- https://openalex.org/W310199979