Published April 5, 2022 | Version v1
Publication Open

Epidemiology of Group A rotavirus in rodents and shrews in Bangladesh

Creators

  • 1. EcoHealth Alliance
  • 2. International Centre for Diarrhoeal Disease Research
  • 3. Institute of Epidemiology, Disease Control and Research

Description

Rodents and shrews live in close proximity to humans and have been identified as important hosts of zoonotic pathogens. This study aimed to detect Group A rotavirus (RVA) and its potential risk factors in rodents and shrews in Bangladesh. We captured 417 small mammals from 10 districts with a high degree of contact between people and domestic animals and collected rectal swab samples between June 2011 and October 2013. We tested the swab samples for RVA RNA, targeting the NSP3 gene segment using real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (rRT-PCR). Overall, RVA prevalence was the same (6.7%) in both rodents and shrews. We detected RVA RNA in 5.3% of Bandicota bengalensis (4/76; 95% CI: 1.4-12.9), 5.1% of B. indica (4/79; 95% CI: 1.4-12.4), 18.2% of Mus musculus (4/22; 95% CI: 5.2-40.3), 6.7% of Rattus rattus (6/90; 95% CI: 2.5-13.9), and 6.7% of Suncus murinus (10/150; 95% CI: 3.2-11.9). We found significantly more RVA in males (10.4%; OR: 3.4; P = 0.007), animals with a poor body condition score (13.9%; OR: 2.7; P = 0.05), during wet season (8.3%; OR: 4.1; P = 0.032), and in urban land gradients (10.04%; OR: 2.9; P = 0.056). These findings form a basis for understanding the prevalence of rotaviruses circulating among rodents and shrews in this region. We recommend additional molecular studies to ascertain the genotype and zoonotic potential of RVA circulating in rodents and shrews in Bangladesh.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تعيش القوارض والبراغيث على مقربة من البشر وقد تم تحديدها كمضيفين مهمين لمسببات الأمراض الحيوانية المنشأ. تهدف هذه الدراسة إلى الكشف عن فيروس الروتا من المجموعة أ (RVA) وعوامل الخطر المحتملة في القوارض والبراعم في بنغلاديش. التقطنا 417 من الثدييات الصغيرة من 10 مناطق مع درجة عالية من الاتصال بين الناس والحيوانات الأليفة وجمعنا عينات مسحة المستقيم بين يونيو 2011 وأكتوبر 2013. اختبرنا عينات المسحة لـ RVA RNA، مستهدفين الجزء الجيني NSP3 باستخدام تفاعل سلسلة النسخ العكسي والبوليميراز في الوقت الفعلي (rRT - PCR). بشكل عام، كان انتشار RVA هو نفسه (6.7 ٪) في كل من القوارض والبراعم. اكتشفنا RVA RNA في 5.3 ٪ من Bandicota bengalensis (4/76 ؛ 95 ٪ CI: 1.4-12.9)، 5.1 ٪ من B. indica (4/79 ؛ 95 ٪ CI: 1.4-12.4)، 18.2 ٪ من Mus musculus (4/22 ؛ 95 ٪ CI: 5.2-40.3)، 6.7 ٪ من Rattus rattus (6/90 ؛ 95 ٪ CI: 2.5-13.9)، و 6.7 ٪ من Suncus murinus (10/150 ؛ 95 ٪ CI: 3.2-11.9). وجدنا المزيد من RVA في الذكور (10.4 ٪ ؛ أو: 3.4 ؛ P = 0.007)، والحيوانات ذات درجة حالة الجسم السيئة (13.9 ٪ ؛ أو: 2.7 ؛ P = 0.05)، خلال موسم الأمطار (8.3 ٪ ؛ أو: 4.1 ؛ P = 0.032)، وفي تدرجات الأراضي الحضرية (10.04 ٪ ؛ أو: 2.9 ؛ P = 0.056). تشكل هذه النتائج أساسًا لفهم انتشار فيروسات الروتا المنتشرة بين القوارض والبراعم في هذه المنطقة. نوصي بإجراء دراسات جزيئية إضافية للتأكد من النمط الجيني والإمكانات الحيوانية المنشأ لـ RVA المنتشرة في القوارض والبراعم في بنغلاديش.

Translated Description (French)

Les rongeurs et les musaraignes vivent à proximité des humains et ont été identifiés comme des hôtes importants d'agents pathogènes zoonotiques. Cette étude visait à détecter le rotavirus du groupe A (RVA) et ses facteurs de risque potentiels chez les rongeurs et les musaraignes au Bangladesh. Nous avons capturé 417 petits mammifères de 10 districts avec un degré élevé de contact entre les personnes et les animaux domestiques et recueilli des échantillons d'écouvillonnage rectal entre juin 2011 et octobre 2013. Nous avons testé les échantillons prélevés sur écouvillon pour l'ARN RVA, en ciblant le segment du gène NSP3 à l'aide de la réaction en chaîne de la transcription inverse-polymérase (rRT-PCR) en temps réel. Dans l'ensemble, la prévalence de l'AVR était la même (6,7 %) chez les rongeurs et les musaraignes. Nous avons détecté l'ARN RVA dans 5,3 % des Bandicota bengalensis (4/76 ; IC à 95 % : 1,4-12,9), 5,1 % des B. indica (4/79 ; IC à 95 % : 1,4-12,4), 18,2 % des Mus musculus (4/22 ; IC à 95 % : 5,2-40,3), 6,7 % des Rattus rattus (6/90 ; IC à 95 % : 2,5-13,9) et 6,7 % des Suncus murinus (10/150 ; IC à 95 % : 3,2-11,9). Nous avons trouvé significativement plus de RVA chez les mâles (10,4 % ; RC : 3,4 ; P = 0,007), les animaux avec un score de mauvaise condition corporelle (13,9 % ; RC : 2,7 ; P = 0,05), pendant la saison humide (8,3 % ; RC : 4,1 ; P = 0,032) et dans les gradients de terrain urbains (10,04 % ; RC : 2,9 ; P = 0,056). Ces résultats constituent une base pour comprendre la prévalence des rotavirus circulant chez les rongeurs et les musaraignes dans cette région. Nous recommandons des études moléculaires supplémentaires pour déterminer le génotype et le potentiel zoonotique de la RVA circulant chez les rongeurs et les musaraignes au Bangladesh.

Translated Description (Spanish)

Los roedores y las musarañas viven muy cerca de los humanos y se han identificado como huéspedes importantes de patógenos zoonóticos. Este estudio tuvo como objetivo detectar el rotavirus del grupo A (RVA) y sus posibles factores de riesgo en roedores y musarañas en Bangladesh. Capturamos 417 pequeños mamíferos de 10 distritos con un alto grado de contacto entre personas y animales domésticos y recolectamos muestras de hisopos rectales entre junio de 2011 y octubre de 2013. Probamos las muestras de hisopo para determinar el ARN de RVA, apuntando al segmento del gen NSP3 utilizando la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa en tiempo real (rRT-PCR). En general, la prevalencia de AVR fue la misma (6,7%) tanto en roedores como en musarañas. Detectamos ARN de RVA en 5.3% de Bandicota bengalensis (4/76; IC 95%: 1.4-12.9), 5.1% de B. indica (4/79; IC 95%: 1.4-12.4), 18.2% de Mus musculus (4/22; IC 95%: 5.2-40.3), 6.7% de Rattus rattus (6/90; IC 95%: 2.5-13.9) y 6.7% de Suncus murinus (10/150; IC 95%: 3.2-11.9). Encontramos significativamente más RVA en machos (10.4%; OR: 3.4; P = 0.007), animales con una puntuación de mala condición corporal (13.9%; OR: 2.7; P = 0.05), durante la estación húmeda (8.3%; OR: 4.1; P = 0.032), y en gradientes de suelo urbano (10.04%; OR: 2.9; P = 0.056). Estos hallazgos constituyen una base para comprender la prevalencia de rotavirus que circulan entre roedores y musarañas en esta región. Recomendamos estudios moleculares adicionales para determinar el genotipo y el potencial zoonótico del RVA que circula en roedores y musarañas en Bangladesh.

Files

s11259-022-09923-6.pdf.pdf

Files (2.4 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:c6a40a1f618bc9e9a8a67aa82466675e
2.4 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
علم الأوبئة للمجموعة أ فيروس الروتا في القوارض والبراعم في بنغلاديش
Translated title (French)
Épidémiologie du rotavirus du groupe A chez les rongeurs et les musaraignes au Bangladesh
Translated title (Spanish)
Epidemiología del rotavirus del grupo A en roedores y musarañas en Bangladesh

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4226354975
DOI
10.1007/s11259-022-09923-6

Is supplement to
https://openalex.org/W651229102 (Other)
https://openalex.org/W2418228880 (Other)
https://openalex.org/W2127701961 (Other)
https://openalex.org/W2116515872 (Other)
https://openalex.org/W2093996727 (Other)
https://openalex.org/W2050109985 (Other)
https://openalex.org/W2036615653 (Other)
https://openalex.org/W2003432536 (Other)
https://openalex.org/W1981392744 (Other)
https://openalex.org/W1976774954 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Bangladesh

References

  • https://openalex.org/W1650197172
  • https://openalex.org/W1952903862
  • https://openalex.org/W1977240640
  • https://openalex.org/W1986760411
  • https://openalex.org/W1997752500
  • https://openalex.org/W2006763045
  • https://openalex.org/W2011658729
  • https://openalex.org/W2015631630
  • https://openalex.org/W2029613842
  • https://openalex.org/W2030060871
  • https://openalex.org/W2031665927
  • https://openalex.org/W2052085267
  • https://openalex.org/W2065052587
  • https://openalex.org/W2069488807
  • https://openalex.org/W2074733948
  • https://openalex.org/W2077359436
  • https://openalex.org/W2093704979
  • https://openalex.org/W2093965960
  • https://openalex.org/W2098609173
  • https://openalex.org/W2111151226
  • https://openalex.org/W2112981632
  • https://openalex.org/W2121548069
  • https://openalex.org/W2140437331
  • https://openalex.org/W2153517664
  • https://openalex.org/W2154337570
  • https://openalex.org/W2175930402
  • https://openalex.org/W2263661635
  • https://openalex.org/W2320197089
  • https://openalex.org/W2342921717
  • https://openalex.org/W2365025064
  • https://openalex.org/W2544593052
  • https://openalex.org/W2562715441
  • https://openalex.org/W2604285050
  • https://openalex.org/W2607591501
  • https://openalex.org/W2616089404
  • https://openalex.org/W2622330330
  • https://openalex.org/W2800380219
  • https://openalex.org/W2802057259
  • https://openalex.org/W2886376263
  • https://openalex.org/W2944687766
  • https://openalex.org/W2979136258
  • https://openalex.org/W2982974610
  • https://openalex.org/W2990180503
  • https://openalex.org/W2990408391
  • https://openalex.org/W2998690030
  • https://openalex.org/W3011452374
  • https://openalex.org/W3033460454
  • https://openalex.org/W3082761827
  • https://openalex.org/W3093598952
  • https://openalex.org/W3109259326
  • https://openalex.org/W3125412828
  • https://openalex.org/W3131080295
  • https://openalex.org/W3156224873
  • https://openalex.org/W3156929475
  • https://openalex.org/W4255012247