Published February 21, 2024 | Version v1
Publication

Handling missing disease information due to death in diseases that need two visits to diagnose

  • 1. Monash University
  • 2. University of Oxford
  • 3. Oxford University Clinical Research Unit

Description

In studies that assess disease status periodically, time of disease onset is interval censored between visits. Participants who die between two visits may have unknown disease status after their last visit. In this work, we consider an additional scenario where diagnosis requires two consecutive positive tests, such that disease status can also be unknown at the last visit preceding death. We show that this impacts the choice of censoring time for those who die without an observed disease diagnosis. We investigate two classes of models that quantify the effect of risk factors on disease outcome: a Cox proportional hazards model with death as a competing risk and an illness death model that treats disease as a possible intermediate state. We also consider four censoring strategies: participants without observed disease are censored at death (Cox model only), the last visit, the last visit with a negative test, or the second last visit. We evaluate the performance of model and censoring strategy combinations on simulated data with a binary risk factor and illustrate with a real data application. We find that the illness death model with censoring at the second last visit shows the best performance in all simulation settings. Other combinations show bias that varies in magnitude and direction depending on the differential mortality between diseased and disease‐free subjects, the gap between visits, and the choice of the censoring time.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

في الدراسات التي تقيم حالة المرض بشكل دوري، يتم فرض رقابة على وقت ظهور المرض بين الزيارات. قد يكون لدى المشاركين الذين يموتون بين زيارتين حالة مرضية غير معروفة بعد زيارتهم الأخيرة. في هذا العمل، ننظر في سيناريو إضافي حيث يتطلب التشخيص اختبارين إيجابيين متتاليين، بحيث يمكن أن تكون حالة المرض غير معروفة أيضًا في الزيارة الأخيرة التي سبقت الوفاة. نظهر أن هذا يؤثر على اختيار وقت الرقابة لأولئك الذين يموتون دون تشخيص مرض ملحوظ. نقوم بالتحقيق في فئتين من النماذج التي تحدد تأثير عوامل الخطر على نتائج المرض: نموذج المخاطر النسبية COX مع الموت كمخاطر منافسة ونموذج الموت المرضي الذي يعامل المرض كحالة وسيطة محتملة. وننظر أيضًا في أربع استراتيجيات للرقابة: يخضع المشاركون الذين لا يعانون من مرض ملحوظ للرقابة عند الوفاة (نموذج كوكس فقط)، أو الزيارة الأخيرة، أو الزيارة الأخيرة مع اختبار سلبي، أو الزيارة الأخيرة الثانية. نقوم بتقييم أداء مجموعات النماذج واستراتيجيات الرقابة على البيانات المحاكاة باستخدام عامل خطر ثنائي ونوضح ذلك باستخدام تطبيق بيانات حقيقي. نجد أن نموذج الموت المرضي مع الرقابة في الزيارة الأخيرة الثانية يظهر أفضل أداء في جميع إعدادات المحاكاة. تُظهر مجموعات أخرى تحيزًا يختلف في الحجم والاتجاه اعتمادًا على الفرق في الوفيات بين المرضى والخاليين من الأمراض، والفجوة بين الزيارات، واختيار وقت الرقابة.

Translated Description (French)

Dans les études qui évaluent périodiquement l'état de la maladie, le moment de l'apparition de la maladie est censuré entre les visites. Les participants qui meurent entre deux visites peuvent avoir un statut de maladie inconnu après leur dernière visite. Dans ce travail, nous considérons un scénario supplémentaire où le diagnostic nécessite deux tests positifs consécutifs, de sorte que l'état de la maladie peut également être inconnu lors de la dernière visite précédant le décès. Nous montrons que cela a un impact sur le choix du temps de censure pour ceux qui meurent sans diagnostic de maladie observé. Nous étudions deux classes de modèles qui quantifient l'effet des facteurs de risque sur l'issue de la maladie : un modèle à risques proportionnels de Cox avec la mort comme risque concurrent et un modèle de mortalité par maladie qui traite la maladie comme un état intermédiaire possible. Nous considérons également quatre stratégies de censure : les participants sans maladie observée sont censurés au décès (modèle de Cox uniquement), à la dernière visite, à la dernière visite avec un test négatif ou à l'avant-dernière visite. Nous évaluons la performance des combinaisons de modèle et de stratégie de censure sur des données simulées avec un facteur de risque binaire et illustrons avec une application de données réelles. Nous constatons que le modèle de mort de maladie avec censure à l'avant-dernière visite montre les meilleures performances dans tous les contextes de simulation. D'autres combinaisons montrent un biais dont l'ampleur et la direction varient en fonction de la mortalité différentielle entre les sujets malades et les sujets sans maladie, de l'écart entre les visites et du choix du temps de censure.

Translated Description (Spanish)

En los estudios que evalúan el estado de la enfermedad periódicamente, el tiempo de aparición de la enfermedad se censura en intervalos entre las visitas. Los participantes que mueren entre dos visitas pueden tener un estado de enfermedad desconocido después de su última visita. En este trabajo, consideramos un escenario adicional en el que el diagnóstico requiere dos pruebas positivas consecutivas, de modo que el estado de la enfermedad también puede ser desconocido en la última visita anterior a la muerte. Mostramos que esto afecta la elección del tiempo de censura para aquellos que mueren sin un diagnóstico de enfermedad observado. Investigamos dos clases de modelos que cuantifican el efecto de los factores de riesgo en el resultado de la enfermedad: un modelo de riesgos proporcionales de Cox con la muerte como un riesgo competitivo y un modelo de muerte por enfermedad que trata la enfermedad como un posible estado intermedio. También consideramos cuatro estrategias de censura: los participantes sin enfermedad observada son censurados en el momento de la muerte (solo modelo de Cox), la última visita, la última visita con una prueba negativa o la segunda última visita. Evaluamos el rendimiento de las combinaciones de modelos y estrategias de censura en datos simulados con un factor de riesgo binario e ilustramos con una aplicación de datos reales. Encontramos que el modelo de muerte por enfermedad con censura en la segunda última visita muestra el mejor rendimiento en todos los entornos de simulación. Otras combinaciones muestran un sesgo que varía en magnitud y dirección dependiendo de la mortalidad diferencial entre sujetos enfermos y libres de enfermedad, la brecha entre las visitas y la elección del tiempo de censura.

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التعامل مع معلومات المرض المفقودة بسبب الوفاة في الأمراض التي تحتاج إلى زيارتين لتشخيصها
Translated title (French)
Gérer les informations manquantes sur les maladies dues au décès dans les maladies qui nécessitent deux visites pour diagnostiquer
Translated title (Spanish)
Manejo de la información faltante de la enfermedad debido a la muerte en enfermedades que necesitan dos visitas para diagnosticar

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4392017336
DOI
10.1002/sim.10038

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Vietnam

References

  • https://openalex.org/W2031090097
  • https://openalex.org/W2057847137
  • https://openalex.org/W2098400283
  • https://openalex.org/W2123362440
  • https://openalex.org/W2124991621
  • https://openalex.org/W2552477635
  • https://openalex.org/W2735640454
  • https://openalex.org/W2891412296
  • https://openalex.org/W2894006875
  • https://openalex.org/W3098865414
  • https://openalex.org/W3114998752
  • https://openalex.org/W4234044340