Published April 8, 2020
| Version v1
Publication
Open
Development of Nested PCR-Heteroduplex Mobility Assay for Determination of Genetic Diversity in the Block 2 Region of the Plasmodium falciparum Merozoite Surface Protein 1 Gene
- 1. Rangsit University
- 2. Mahidol University
- 3. Chulalongkorn University
Description
Genetic diversity of Plasmodium parasite has significantly related to malaria control and vaccine development. The P. falciparum merozoite surface protein 1 (Pfmsp1) gene is a commonly used molecular marker to differentiate genetic diversity. This study is aimed at developing a nested PCR-Heteroduplex Mobility Assay (nPCR-HMA) for determination of the block 2 of the Pfmsp1 gene. The MAD20 family allele of P. falciparum was used as a control for optimization of the annealing and polyacrylamide gel electrophoresis conditions. In order to evaluate the developed nPCR-HMA, 8 clinical P. falciparum isolates were examined for allelic variants. The results revealed 9 allelic variants. Our study indicated that the successful nPCR-HMA with good precision and accuracy offers a more rapid, efficient, and cheap method for large-scale molecular epidemiological studies as compared to nucleotide sequencing.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
يرتبط التنوع الوراثي لطفيل المتصورة ارتباطًا كبيرًا بمكافحة الملاريا وتطوير اللقاحات. الجين P. falciparum merozoite surface protein 1 (Pfmsp1) هو علامة جزيئية شائعة الاستخدام للتمييز بين التنوع الجيني. تهدف هذه الدراسة إلى تطوير اختبار التنقل المتداخل PCR - Heteroduplex (nPCR - HMA) لتحديد الكتلة 2 من جين Pfmsp1. تم استخدام أليل عائلة MAD20 من P. falciparum كعنصر تحكم لتحسين ظروف الرحلان الكهربائي للصلب وبولي أكريلاميد. من أجل تقييم nPCR - HMA المطور، تم فحص 8 عزلات سريرية من P. falciparum بحثًا عن متغيرات الأليلات. وكشفت النتائج عن 9 متغيرات أليلية. أشارت دراستنا إلى أن nPCR - HMA الناجح بدقة ودقة جيدة يوفر طريقة أسرع وأكثر كفاءة ورخيصة للدراسات الوبائية الجزيئية واسعة النطاق مقارنة بتسلسل النيوكليوتيدات.Translated Description (French)
La diversité génétique du parasite Plasmodium est liée de manière significative à la lutte contre le paludisme et au développement de vaccins. Le gène Pfmsp1 (P. falciparum merozoite surface protein 1) est un marqueur moléculaire couramment utilisé pour différencier la diversité génétique. Cette étude vise à développer un test de mobilité PCR-hétéroduplex imbriqué (nPCR-HMA) pour la détermination du bloc 2 du gène Pfmsp1. L'allèle de la famille MAD20 de P. falciparum a été utilisé comme contrôle pour l'optimisation des conditions de recuit et d'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. Afin d'évaluer le nPCR-HMA développé, 8 isolats cliniques de P. falciparum ont été examinés pour des variants alléliques. Les résultats ont révélé 9 variants alléliques. Notre étude a indiqué que le succès du nPCR-HMA avec une bonne précision et une bonne exactitude offre une méthode plus rapide, efficace et peu coûteuse pour les études épidémiologiques moléculaires à grande échelle par rapport au séquençage des nucléotides.Translated Description (Spanish)
La diversidad genética del parásito Plasmodium se ha relacionado significativamente con el control de la malaria y el desarrollo de vacunas. El gen de la proteína de superficie 1 del merozoito P. falciparum (Pfmsp1) es un marcador molecular comúnmente utilizado para diferenciar la diversidad genética. Este estudio tiene como objetivo desarrollar un ensayo de movilidad anidada PCR-Heterodúplex (nPCR-HMA) para la determinación del bloque 2 del gen Pfmsp1. El alelo de la familia MAD20 de P. falciparum se utilizó como control para la optimización de las condiciones de recocido y electroforesis en gel de poliacrilamida. Para evaluar la nPCR-HMA desarrollada, se examinaron 8 aislados clínicos de P. falciparum en busca de variantes alélicas. Los resultados revelaron 9 variantes alélicas. Nuestro estudio indicó que el nPCR-HMA exitoso con buena precisión y exactitud ofrece un método más rápido, eficiente y barato para estudios epidemiológicos moleculares a gran escala en comparación con la secuenciación de nucleótidos.Files
9520326.pdf.pdf
Files
(15.9 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:9ef66bb09901d2ba1ae00a2d003988e2
|
15.9 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تطوير اختبار التنقل المتداخل PCR - Heteroduplex لتحديد التنوع الجيني في منطقة البلوك 2 من البروتين السطحي Merozoite 1 للمتصورة المنجلية
- Translated title (French)
- Développement d'un test de mobilité par PCR-hétéroduplex imbriqué pour la détermination de la diversité génétique dans la région du bloc 2 du gène de la protéine de surface 1 du mérozoïte de Plasmodium falciparum
- Translated title (Spanish)
- Desarrollo del ensayo de movilidad anidada PCR-heterodúplex para la determinación de la diversidad genética en la región del bloque 2 del gen de la proteína 1 de la superficie del merozoito Plasmodium falciparum
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3015925749
- DOI
- 10.1155/2020/9520326
References
- https://openalex.org/W1833642178
- https://openalex.org/W1959613857
- https://openalex.org/W1966834016
- https://openalex.org/W2006737060
- https://openalex.org/W2020080583
- https://openalex.org/W2039825890
- https://openalex.org/W2061489377
- https://openalex.org/W2062972555
- https://openalex.org/W2077754180
- https://openalex.org/W2092638358
- https://openalex.org/W2094356691
- https://openalex.org/W2126925732
- https://openalex.org/W2138585716
- https://openalex.org/W2143371516
- https://openalex.org/W2159394280
- https://openalex.org/W2167394796
- https://openalex.org/W2169195671
- https://openalex.org/W2395286594
- https://openalex.org/W2624476313
- https://openalex.org/W2652205004
- https://openalex.org/W2767660681
- https://openalex.org/W2806920537
- https://openalex.org/W2892864170
- https://openalex.org/W2966139534