Transcriptome profiling of bovine endometrial epithelial cells induced by lipopolysaccharides <i>in vitro</i>
Creators
- GuangWei Zhou
- Puxiu Shen
-
Yi Sun1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18
-
Xing Zhang18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 1
- Chenbo Yan
-
Jingcheng Yu
-
Fang Liu27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37
-
Dexin Yang
-
Ling Deng
- EnBu Xu
-
Yizhen Wang
-
Lin Liu38, 39, 40, 41, 42, 43, 18, 1, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 4, 52, 7, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 37
-
Chao Tong63, 64
-
Tao Sun45, 46, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75
-
XueBing Wang
- 1. Shanghai Jiao Tong University
- 2. University of Tsukuba
- 3. Columbia University
- 4. Harbin Medical University
- 5. Fourth Affiliated Hospital of Harbin Medical University
- 6. Second Affiliated Hospital of Zhejiang University
- 7. Peking University
- 8. Peking University Cancer Hospital
- 9. Shanghai Ninth People's Hospital
- 10. Qingdao Agricultural University
- 11. En Chu Kong Hospital
- 12. Northeast Institute of Geography and Agroecology
- 13. Jilin Agricultural University
- 14. Hebei Academy of Agriculture and Forestry Sciences
- 15. Peking Union Medical College Hospital
- 16. Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College
- 17. National Cheng Kung University
- 18. Zhejiang University
- 19. Renmin University of China
- 20. China Academy of Chinese Medical Sciences
- 21. Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy
- 22. Guizhou University
- 23. City University of Macau
- 24. Sixth Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University
- 25. Sun Yat-sen University
- 26. Southwest University
- 27. UNSW Sydney
- 28. University of Notre Dame
- 29. Fujian Agriculture and Forestry University
- 30. Shenzhen University
- 31. Beijing Hua Xin Hospital
- 32. Wuhan Union Hospital
- 33. Ningbo First Hospital
- 34. Shenzhen Second People's Hospital
- 35. Hebei Academy of Sciences
- 36. Children's Hospital of Fudan University
- 37. Huazhong University of Science and Technology
- 38. University of South Australia
- 39. Xinjiang Medical University
- 40. Shandong Normal University
- 41. Second Hospital of Shanxi Medical University
- 42. Shanxi Medical University
- 43. Sichuan Agricultural University
- 44. China Agricultural University
- 45. Capital University
- 46. Capital Medical University
- 47. South China Normal University
- 48. Mitchell Institute
- 49. Texas A&M University
- 50. University of California, San Diego
- 51. Hangzhou Normal University
- 52. Peking University First Hospital
- 53. Northeast Agricultural University
- 54. Shenyang Agricultural University
- 55. Chinese PLA General Hospital
- 56. Soochow University
- 57. First Affiliated Hospital of Soochow University
- 58. First Affiliated Hospital of Xi'an Jiaotong University
- 59. First Affiliated Hospital Zhejiang University
- 60. Institute of Soil and Water Conservation
- 61. Guizhou Provincial People's Hospital
- 62. National Clinical Research Center for Digestive Diseases
- 63. First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University
- 64. Chongqing Medical University
- 65. Shandong University
- 66. Shandong First Medical University
- 67. China University of Mining and Technology
- 68. Beijing Tian Tan Hospital
- 69. Wuhan University
- 70. Renmin Hospital of Wuhan University
- 71. East China University of Technology
- 72. Henan University of Urban Construction
- 73. Qilu Hospital of Shandong University
- 74. Shandong Provincial QianFoShan Hospital
- 75. Chinese Academy of Sciences
Description
Endometritis is an inflammation of the surface of the endometrium that does not penetrate the submucosa and can cause infertility and increase the elimination rate in cows. Endometrial epithelial cells are the first barrier of the endometrium against foreign stimuli and bacterial infection. Understanding the genetic changes in stimulated endometrial epithelial cells will help in the efforts to prevent and treat endometritis. This study investigated changes in bovine endometrial epithelial (BEEC) gene expression induced by lipopolysaccharide (LPS)-induced inflammation and compared transcriptome-wide gene changes between LPS- and phosphate-buffered saline (PBS)- treated BEECs by RNA sequencing. Compared with the PBS group, the LPS group showed 60 differentially expressed genes (DEGs) (36 upregulated, 24 downregulated). Gene Ontology enrichment analysis revealed that most enrichment occurred during CXCR chemokine receptor binding, inflammatory response, and neutrophil migration. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway analysis showed DEGs mainly concentrated in cytokine–cytokine receptor interactions; IL-17, tumor necrosis factor, NOD-like receptor, chemokine, Toll-like receptor, and nuclear factor-κB signaling pathways; and the cytoplasmic DNA sensing pathway. Moreover, results revealed that cytokines SAA3 and HP increased significantly after LPS treatment. These effects of LPS on BEECs transcriptome and the molecular mechanism of endometritis provide a basis for improved clinical treatment and novel drug development.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
التهاب بطانة الرحم هو التهاب في سطح بطانة الرحم لا يخترق الغشاء المخاطي ويمكن أن يسبب العقم ويزيد من معدل التخلص في الأبقار. الخلايا الظهارية لبطانة الرحم هي الحاجز الأول لبطانة الرحم ضد المحفزات الأجنبية والعدوى البكتيرية. سيساعد فهم التغيرات الجينية في الخلايا الظهارية المحفزة لبطانة الرحم في الجهود المبذولة للوقاية من التهاب بطانة الرحم وعلاجه. بحثت هذه الدراسة في التغيرات في التعبير الجيني لبطانة الرحم البقري (BEEC) الناجم عن الالتهاب الناجم عن عديد السكاريد الشحمي (LPS) وقارنت التغيرات الجينية على مستوى النسخ بين المحلول الملحي المخزن بالـ LPS والفوسفات (PBS)- BEECs المعالجة بتسلسل الحمض النووي الريبي. بالمقارنة مع مجموعة PBS، أظهرت مجموعة LPS 60 جينًا معبرًا عنها بشكل تفاضلي (DEGs) (36 معاد تنظيمها، 24 معاد تنظيمها). كشف تحليل إثراء علم الوجود الجيني أن معظم الإثراء حدث أثناء ربط مستقبلات الكيموكين CXCR، والاستجابة الالتهابية، وهجرة العدلات. أظهرت موسوعة كيوتو للجينات وتحليل مسار الجينوم أن DEGs تتركز بشكل أساسي في تفاعلات مستقبلات السيتوكين والسيتوكين ؛ IL -17، عامل نخر الورم، مستقبلات تشبه NOD، كيموكين، مستقبلات تشبه الرسوم، ومسارات إشارات العامل النووي - κB ؛ ومسار استشعار الحمض النووي السيتوبلازمي. علاوة على ذلك، كشفت النتائج أن السيتوكينات SAA3 وHP زادت بشكل كبير بعد علاج LPS. توفر تأثيرات LPS هذه على ترانسكريبتوم BEECs والآلية الجزيئية لالتهاب بطانة الرحم أساسًا لتحسين العلاج السريري وتطوير الأدوية الجديدة.Translated Description (French)
L'endométrite est une inflammation de la surface de l'endomètre qui ne pénètre pas dans la sous-muqueuse et peut provoquer l'infertilité et augmenter le taux d'élimination chez les vaches. Les cellules épithéliales endométriales sont la première barrière de l'endomètre contre les stimuli étrangers et les infections bactériennes. Comprendre les changements génétiques dans les cellules épithéliales de l'endomètre stimulées contribuera aux efforts de prévention et de traitement de l'endométrite. Cette étude a examiné les modifications de l'expression du gène de l'épithélium de l'endomètre bovin (BEEC) induites par l'inflammation induite par les lipopolysaccharides (LPS) et a comparé les modifications du gène à l'échelle du transcriptome entre les BEEC traitées par une solution saline tamponnée au LPS et au phosphate (PBS) par séquençage de l'ARN. Par rapport au groupe PBS, le groupe LPS présentait 60 gènes exprimés différentiellement (DEG) (36 régulés à la hausse, 24 régulés à la baisse). L'analyse de l'enrichissement en ontologie génique a révélé que la plupart des enrichissements se produisaient au cours de la liaison aux récepteurs des chimiokines CXCR, de la réponse inflammatoire et de la migration des neutrophiles. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway analysis shown DEGs mainly concentrated in cytokine–cytokine receptor interactions ; IL-17, tumor necrosis factor, NOD-like receptor, chemokine, Toll-like receptor, and nuclear factor-κB signaling pathways ; and the cytoplasmic DNA sensing pathway. De plus, les résultats ont révélé que les cytokines SAA3 et HP augmentaient significativement après le traitement par LPS. Ces effets du LPS sur le transcriptome des BEEC et le mécanisme moléculaire de l'endométrite fournissent une base pour l'amélioration du traitement clinique et le développement de nouveaux médicaments.Translated Description (Spanish)
La endometritis es una inflamación de la superficie del endometrio que no penetra en la submucosa y puede causar infertilidad y aumentar la tasa de eliminación en las vacas. Las células epiteliales del endometrio son la primera barrera del endometrio contra los estímulos extraños y la infección bacteriana. Comprender los cambios genéticos en las células epiteliales endometriales estimuladas ayudará en los esfuerzos para prevenir y tratar la endometritis. Este estudio investigó los cambios en la expresión génica del epitelio endometrial bovino (BEEC) inducidos por la inflamación inducida por lipopolisacáridos (LPS) y comparó los cambios génicos en todo el transcriptoma entre los BEEC tratados con LPS y solución salina tamponada con fosfato (PBS) mediante secuenciación de ARN. En comparación con el grupo de PBS, el grupo de LPS mostró 60 genes expresados diferencialmente (DEG) (36 regulados al alza, 24 regulados a la baja). El análisis de enriquecimiento de ontología génica reveló que la mayor parte del enriquecimiento ocurrió durante la unión al receptor de quimiocinas CXCR, la respuesta inflamatoria y la migración de neutrófilos. El análisis de la vía de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto mostró DEG concentrados principalmente en las interacciones citoquina-receptor de citoquina; IL-17, factor de necrosis tumoral, receptor similar a NOD, quimiocina, receptor similar a Toll y vías de señalización del factor nuclear-κB; y la vía de detección de ADN citoplasmático. Además, los resultados revelaron que las citocinas SAA3 y HP aumentaron significativamente después del tratamiento con LPS. Estos efectos de LPS en el transcriptoma de BEEC y el mecanismo molecular de la endometritis proporcionan una base para mejorar el tratamiento clínico y el desarrollo de nuevos fármacos.Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التنميط النصي للخلايا الظهارية لبطانة الرحم البقري الناجم عن عديدات السكاريد الشحمية <i>في المختبر</i>
- Translated title (French)
- Profilage transcriptomique des cellules épithéliales de l'endomètre bovin induit par les lipopolysaccharides <i>in vitro</i>
- Translated title (Spanish)
- Perfil del transcriptoma de células epiteliales endometriales bovinas inducidas por lipopolisacáridos <i>in vitro</i>
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4394162070
- DOI
- 10.6084/m9.figshare.22059481