Published January 12, 2022 | Version v1
Publication Open

ACE2 and TMPRSS2 SNPs as Determinants of Susceptibility to, and Severity of, a COVID-19 Infection

Creators

  • 1. Cairo University
  • 2. Menoufia University
  • 3. Qassim University

Description

Background: Genetic risk factors may be related to the infectivity and severity of SARS-CoV-2 infection. Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) and host transmembrane serine protease (TMPRSS2) have key role in viral cell entrance and priming. Methods: This case-control study on 147 healthy controls and 299 COVID-19 patients identified potential determinants and risk factors, including gene polymorphism involved in the severity (mild, moderate, severe) of COVID-19 disease defined by CORAD radiological criteria. Results: The ACE2 s2285666 and TMPRSS2 rs12329760 SNPs were significantly linked with COVID-19 disease severity, as were certain co-morbidities (hypertension, heart disease) and laboratory parameters. Both SNPs were amongst the highest predictors of disease severity: TMPRSS2 rs12329760 CT + TT [odds ratio (95% CI) 17.6 (5.1-61.10), ACE2 rs2285666 CT + TT 9.9 (3.2-30.9), both p < 0.001]. There was an increase in the expression of genotype frequencies of ACE2 rs2285666 and TMPRSS2 rs1232976 (TT), (CT + TT), and (T) allele in severe COVID-19 group compared to control and mild groups. Disease severity was also linked to elevated CRP, ferritin and D-dimer, and lower lymphocytes and platelet count (all p < 0.001). Conclusion: ACE2 rs2285666 and TMPRSS2 rs12329760 SNPs, in addition to lymphocyte count, CRP, D-dimers, ferritin, and hypertension, are predictors of COVID-19 disease severity.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

معلومات أساسية: قد تكون عوامل الخطر الوراثية مرتبطة بعدوى وشدة عدوى فيروس كورونا 2 المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة. يلعب الإنزيم المحول للأنجيوتنسين 2 (ACE2) وإنزيم سيرين بروتياز المضيف عبر الغشاء (TMPRSS2) دورًا رئيسيًا في دخول الخلايا الفيروسية وتهيئتها. الطرق: حددت دراسة الحالة هذه على 147 ضابطا صحيا و 299 مريضا بكوفيد-19 المحددات المحتملة وعوامل الخطر، بما في ذلك تعدد أشكال الجينات التي تنطوي على شدة (خفيفة، معتدلة، شديدة) مرض كوفيد-19 الذي تحدده معايير كوراد الإشعاعية. النتائج: ارتبط الإنزيم المحول للأنجيوتنسين 2 s2285666 و TMPRSS2 rs12329760 SNPs بشكل كبير بشدة مرض COVID -19، وكذلك بعض الأمراض المصاحبة (ارتفاع ضغط الدم وأمراض القلب) والمعلمات المعملية. كان كل من SNPs من بين أعلى مؤشرات شدة المرض: TMPRSS2 rs12329760 CT + TT [نسبة الاحتمالات (95 ٪ CI) 17.6 (5.1-61.10)، ACE2 rs2285666 CT + TT 9.9 (3.2-30.9)، كلاهما p < 0.001]. كانت هناك زيادة في التعبير عن ترددات النمط الجيني لـ ACE2 rs2285666 و TMPRSS2 rs1232976 (TT) و (CT + TT) و (T) الأليل في مجموعة COVID -19 الشديدة مقارنة بالمجموعات الضابطة والمعتدلة. ارتبطت شدة المرض أيضًا بارتفاع CRP والفيريتين و D - dimer وانخفاض عدد الخلايا الليمفاوية والصفائح الدموية (جميعها p < 0.001). الاستنتاج: ACE2 rs2285666 و TMPRSS2 rs12329760 SNPs، بالإضافة إلى عدد الخلايا الليمفاوية، CRP، D - dimers، ferritin، وارتفاع ضغط الدم، هي مؤشرات على شدة مرض COVID -19.

Translated Description (French)

Contexte : Les facteurs de risque génétiques peuvent être liés à l'infectivité et à la gravité de l'infection par le SRAS-CoV-2. L'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) et la sérine protéase transmembranaire de l'hôte (TMPRSS2) jouent un rôle clé dans l'entrée et l'amorçage des cellules virales. Méthodes : Cette étude cas-témoins portant sur 147 témoins sains et 299 patients atteints de COVID-19 a identifié des déterminants potentiels et des facteurs de risque, y compris le polymorphisme génétique impliqué dans la gravité (légère, modérée, sévère) de la maladie à COVID-19 définie par les critères radiologiques du CORAD. Résultats : Les SNP ACE2 s2285666 et TMPRSS2 rs12329760 étaient significativement liés à la gravité de la maladie à COVID-19, tout comme certaines comorbidités (hypertension, maladie cardiaque) et paramètres de laboratoire. Les deux SNP étaient parmi les prédicteurs les plus élevés de la gravité de la maladie : TMPRSS2 rs12329760 CT + TT [odds ratio (IC à 95 %) 17,6 (5,1-61,10), ACE2 rs2285666 CT + TT 9,9 (3,2-30,9), tous deux p < 0,001]. Il y a eu une augmentation de l'expression des fréquences génotypiques des allèles ACE2 rs2285666 et TMPRSS2 rs1232976 (TT), (CT + TT) et (T) dans le groupe COVID-19 sévère par rapport aux groupes témoin et léger. La gravité de la maladie était également liée à une CRP élevée, à la ferritine et au dimère D, ainsi qu'à une diminution du nombre de lymphocytes et de plaquettes (tous p < 0,001). Conclusion : les SNP ACE2 rs2285666 et TMPRSS2 rs12329760, en plus du nombre de lymphocytes, de la CRP, des D-dimères, de la ferritine et de l'hypertension, sont des prédicteurs de la gravité de la maladie COVID-19.

Translated Description (Spanish)

Antecedentes: Los factores de riesgo genético pueden estar relacionados con la infectividad y la gravedad de la infección por SARS-CoV-2. La enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) y la serina proteasa transmembrana del huésped (TMPRSS2) tienen un papel clave en la entrada y el cebado de las células virales. Métodos: Este estudio de casos y controles en 147 controles sanos y 299 pacientes con COVID-19 identificó posibles determinantes y factores de riesgo, incluido el polimorfismo genético involucrado en la gravedad (leve, moderada, grave) de la enfermedad COVID-19 definida por los criterios radiológicos de CORAD. Resultados: Los SNP ACE2 s2285666 y TMPRSS2 rs12329760 se relacionaron significativamente con la gravedad de la enfermedad COVID-19, al igual que ciertas comorbilidades (hipertensión, enfermedad cardíaca) y parámetros de laboratorio. Ambos SNP se encontraban entre los predictores más altos de la gravedad de la enfermedad: TMPRSS2 rs12329760 CT + TT [odds ratio (IC del 95%) 17.6 (5.1-61.10), ACE2 rs2285666 CT + TT 9.9 (3.2-30.9), ambos p < 0.001]. Hubo un aumento en la expresión de las frecuencias de genotipo de los alelos ACE2 rs2285666 y TMPRSS2 rs1232976 (TT), (CT + TT) y (T) en el grupo de COVID-19 grave en comparación con los grupos de control y leve. La gravedad de la enfermedad también se relacionó con una PCR elevada, ferritina y dímero D, y un menor recuento de linfocitos y plaquetas (todos p < 0,001). Conclusión: los SNP ACE2 rs2285666 y TMPRSS2 rs12329760, además del recuento de linfocitos, la PCR, los dímeros D, la ferritina y la hipertensión, son predictores de la gravedad de la enfermedad COVID-19.

Files

pdf.pdf

Files (918.3 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:6ec0b7f7c7cd2dceb14f14c643c609f7
918.3 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
ACE2 و TMPRSS2 SNPs كمحددات لقابلية الإصابة بعدوى كوفيد-19 وشدتها
Translated title (French)
Les SNP ACE2 et TMPRSS2 en tant que déterminants de la sensibilité et de la gravité d'une infection à COVID-19
Translated title (Spanish)
SNP de ACE2 y TMPRSS2 como determinantes de la susceptibilidad y la gravedad de una infección por COVID-19

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4210866479
DOI
10.3389/bjbs.2021.10238

Is supplement to
https://openalex.org/W4206308911 (Other)
https://openalex.org/W3212774057 (Other)
https://openalex.org/W3137523012 (Other)
https://openalex.org/W3094104267 (Other)
https://openalex.org/W3086976307 (Other)
https://openalex.org/W3082928120 (Other)
https://openalex.org/W2102637313 (Other)
https://openalex.org/W2093403502 (Other)
https://openalex.org/W2080248549 (Other)
https://openalex.org/W1499399347 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Egypt

References

  • https://openalex.org/W1970493260
  • https://openalex.org/W1972032770
  • https://openalex.org/W1986727164
  • https://openalex.org/W1998964868
  • https://openalex.org/W2037927640
  • https://openalex.org/W2040536071
  • https://openalex.org/W2086742568
  • https://openalex.org/W2098099928
  • https://openalex.org/W2134872401
  • https://openalex.org/W2171671715
  • https://openalex.org/W2256016639
  • https://openalex.org/W2323403152
  • https://openalex.org/W2503450476
  • https://openalex.org/W2896303576
  • https://openalex.org/W2909787042
  • https://openalex.org/W2910432553
  • https://openalex.org/W2989809415
  • https://openalex.org/W3009446530
  • https://openalex.org/W3009912996
  • https://openalex.org/W3010381061
  • https://openalex.org/W3010819577
  • https://openalex.org/W3015403775
  • https://openalex.org/W3015492319
  • https://openalex.org/W3017331996
  • https://openalex.org/W3028117273
  • https://openalex.org/W3030766335
  • https://openalex.org/W3036122374
  • https://openalex.org/W3041546600
  • https://openalex.org/W3082786676
  • https://openalex.org/W3087075041
  • https://openalex.org/W3087553514
  • https://openalex.org/W3088161102
  • https://openalex.org/W3088676196
  • https://openalex.org/W3110067805
  • https://openalex.org/W3116961761
  • https://openalex.org/W4235339549
  • https://openalex.org/W568030399