Published December 1, 2018 | Version v1
Publication Open

Polymorphism of growth hormone gene in three goat breeds in Egypt

Creators

  • 1. National Research Centre
  • 2. Ain Shams University
  • 3. Cairo University

Description

In Egypt, like other developing countries, goats are prime resources of meat. So, selection of goats for superior growth rate is advantageous. Growth hormone (GH) is the main regulator of animal growth, and encoded by GH gene that exhibits active gene variants improving growth. The objective of this study was to identify GH gene variants in three goat breeds (Barki, Damascus, and Zaraibi), via polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism (PCR–RFLP) and gene sequencing analyses. Three loci on GH gene named GH1, GH2, and GH6 polymorphisms were analyzed. GH1-HaeIII/RFLP showed only two genotypes (AB and BB) in all breeds, with absent AA genotype. Both Barki and Zaraibi exhibited the highest GC genotype frequency (0.95). GH2-HaeIII/RFLP produced only two homozygous genotypes AA in Damascus and BB in both Barki and Zaraibi, with the absence of AB genotype in the three breeds. However, digestion of GH6 by HaeIII was monomorphic; it exhibited different single-nucleotide polymorphisms (SNPs), detected by DNA sequencing, among the studied goat breeds. The revealed SNPs could be employed as useful markers, helping goat breeders in selection of goats for high growth performance. Further analyses with larger sample size are needed for investigating the relationship between the different genotypes and growth traits.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

في مصر، مثل البلدان النامية الأخرى، الماعز هي الموارد الرئيسية للحوم. لذلك، فإن اختيار الماعز لمعدل نمو متفوق أمر مفيد. هرمون النمو (GH) هو المنظم الرئيسي لنمو الحيوان، ويتم ترميزه بواسطة جين GH الذي يُظهر متغيرات جينية نشطة تحسن النمو. كان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد متغيرات جينات هرمون النمو في ثلاثة سلالات من الماعز (بركي ودمشق والزرابي)، من خلال تعدد أشكال طول شظية تقييد تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR - RFLP) وتحليلات تسلسل الجينات. تم تحليل ثلاثة مواضع على جين GH المسمى GH1 و GH2 و GH6 متعدد الأشكال. أظهر GH1 - HaeIII/RFLP نمطين جينيين فقط (AB و BB) في جميع السلالات، مع غياب النمط الجيني AA. أظهر كل من بركي وزريبي أعلى تردد للنمط الجيني GC (0.95). أنتج GH2 - HaeIII/RFLP نمطين جينيين متماثلين فقط AA في دمشق و BB في كل من Barki و Zaraibi، مع عدم وجود النمط الجيني AB في السلالات الثلاثة. ومع ذلك، كان هضم GH6 بواسطة HaeIII أحادي الشكل ؛ فقد أظهر أشكالًا متعددة مختلفة من النوكليوتيدات المفردة (SNPs)، تم اكتشافها بواسطة تسلسل الحمض النووي، بين سلالات الماعز المدروسة. يمكن استخدام SNPs التي تم الكشف عنها كعلامات مفيدة، مما يساعد مربي الماعز في اختيار الماعز لأداء نمو عالي. هناك حاجة إلى مزيد من التحليلات بحجم عينة أكبر للتحقيق في العلاقة بين الأنماط الجينية المختلفة وسمات النمو.

Translated Description (French)

En Égypte, comme dans d'autres pays en développement, les chèvres sont les principales ressources en viande. Ainsi, la sélection de chèvres pour un taux de croissance supérieur est avantageuse. L'hormone de croissance (GH) est le principal régulateur de la croissance animale, et codée par le gène GH qui présente des variants de gènes actifs améliorant la croissance. L'objectif de cette étude était d'identifier des variants du gène GH chez trois races de chèvres (Barki, Damas et Zaraibi), via le polymorphisme de la longueur des fragments de restriction de la réaction en chaîne de la polymérase (PCR–RFLP) et des analyses de séquençage génique. Trois locus sur les polymorphismes du gène GH nommés GH1, GH2 et GH6 ont été analysés. GH1-HaeIII/RFLP n'a montré que deux génotypes (AB et BB) chez toutes les races, avec un génotype AA absent. Barki et Zaraibi présentaient la fréquence de génotype GC la plus élevée (0,95). GH2-HaeIII/RFLP n'a produit que deux génotypes homozygotes AA à Damas et BB chez Barki et Zaraibi, avec l'absence de génotype AB chez les trois races. Cependant, la digestion de GH6 par HaeIII était monomorphe ; elle présentait différents polymorphismes mononucléotidiques (SNP), détectés par séquençage de l'ADN, parmi les races de chèvres étudiées. Les SNP révélés pourraient être utilisés comme marqueurs utiles, aidant les éleveurs de chèvres à sélectionner des chèvres pour une performance de croissance élevée. Des analyses supplémentaires avec une taille d'échantillon plus grande sont nécessaires pour étudier la relation entre les différents génotypes et les traits de croissance.

Translated Description (Spanish)

En Egipto, al igual que en otros países en desarrollo, las cabras son los principales recursos de carne. Por lo tanto, la selección de cabras para una tasa de crecimiento superior es ventajosa. La hormona del crecimiento (GH) es el principal regulador del crecimiento animal y está codificada por el gen GH que exhibe variantes genéticas activas que mejoran el crecimiento. El objetivo de este estudio fue identificar variantes del gen GH en tres razas de cabra (Barki, Damasco y Zaraibi), a través de polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción de reacción en cadena de la polimerasa (PCR-RFLP) y análisis de secuenciación de genes. Se analizaron tres loci en el gen GH llamados polimorfismos GH1, GH2 y GH6. GH1-HaeIII/RFLP mostró solo dos genotipos (AB y BB) en todas las razas, con genotipo AA ausente. Tanto Barki como Zaraibi mostraron la mayor frecuencia de genotipo GC (0,95). GH2-HaeIII/RFLP produjo solo dos genotipos homocigotos AA en Damasco y BB tanto en Barki como en Zaraibi, con ausencia de genotipo AB en las tres razas. Sin embargo, la digestión de GH6 por HaeIII fue monomórfica; exhibió diferentes polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), detectados por secuenciación de ADN, entre las razas de cabra estudiadas. Los SNP revelados podrían emplearse como marcadores útiles, ayudando a los criadores de cabras en la selección de cabras para un alto rendimiento de crecimiento. Se necesitan análisis adicionales con un tamaño de muestra más grande para investigar la relación entre los diferentes genotipos y los rasgos de crecimiento.

Files

s42269-018-0035-0.pdf

Files (1.6 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:774411ed8bbc5597409c16022abc2b26
1.6 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تعدد أشكال جين هرمون النمو في ثلاثة سلالات من الماعز في مصر
Translated title (French)
Polymorphisme du gène de l'hormone de croissance chez trois races de chèvres en Égypte
Translated title (Spanish)
Polimorfismo del gen de la hormona del crecimiento en tres razas de cabras en Egipto

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2905782986
DOI
10.1186/s42269-018-0035-0

Is supplement to
https://openalex.org/W4242510067 (Other)
https://openalex.org/W3044685055 (Other)
https://openalex.org/W3015228662 (Other)
https://openalex.org/W3012142925 (Other)
https://openalex.org/W226878956 (Other)
https://openalex.org/W2100138201 (Other)
https://openalex.org/W2076521591 (Other)
https://openalex.org/W2037815196 (Other)
https://openalex.org/W1992831750 (Other)
https://openalex.org/W1897084029 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Egypt

References

  • https://openalex.org/W107154658
  • https://openalex.org/W1989469698
  • https://openalex.org/W2003376773
  • https://openalex.org/W2008928024
  • https://openalex.org/W2043117118
  • https://openalex.org/W2056551286
  • https://openalex.org/W2057805731
  • https://openalex.org/W2059418909
  • https://openalex.org/W2064861627
  • https://openalex.org/W2078714634
  • https://openalex.org/W2084241403
  • https://openalex.org/W2086796466
  • https://openalex.org/W2125702370
  • https://openalex.org/W2125712234
  • https://openalex.org/W2132729226
  • https://openalex.org/W2157030502
  • https://openalex.org/W2161886307
  • https://openalex.org/W2166772712
  • https://openalex.org/W2171189401
  • https://openalex.org/W2345291881
  • https://openalex.org/W2544654575
  • https://openalex.org/W335010455
  • https://openalex.org/W4250131882