Published July 13, 2022 | Version v1
Publication Open

CRISPR Del/Rei: a simple, flexible, and efficient pipeline for scarless genome editing

Creators

  • 1. Johns Hopkins University
  • 2. Johns Hopkins Medicine
  • 3. American University in Cairo
  • 4. National Research Centre

Description

Abstract Scarless genome editing of induced pluripotent stem cells (iPSCs) is crucial for the precise modeling of genetic disease. Here we present CRISPR Del/Rei, a two-step deletion-reinsertion strategy with high editing efficiency and simple PCR-based screening that generates isogenic clones in ~ 2 months. We apply our strategy to edit iPSCs at 3 loci with only rare off target editing.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

يعد تحرير الجينوم بدون ندبات للخلايا الجذعية المستحثة متعددة القدرات (iPSCs) أمرًا بالغ الأهمية للنمذجة الدقيقة للأمراض الوراثية. نقدم هنا CRISPR DEL/REI، وهي استراتيجية من خطوتين للحذف وإعادة الإدراج مع كفاءة تحرير عالية وفحص بسيط قائم على تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) يولد استنساخًا متساوي المنشأ في غضون شهرين تقريبًا. نطبق استراتيجيتنا لتحرير iPSCs في 3 مواقع مع تعديل نادر للهدف فقط.

Translated Description (French)

Résumé L'édition du génome sans cicatrice des cellules souches pluripotentes induites (CSPi) est cruciale pour la modélisation précise des maladies génétiques. Nous présentons ici CRISPR Del/Rei, une stratégie de suppression-réinsertion en deux étapes avec une grande efficacité d'édition et un dépistage simple basé sur la PCR qui génère des clones isogéniques en ~ 2 mois. Nous appliquons notre stratégie pour modifier les iPSC à 3 lieux avec seulement de rares modifications hors cible.

Translated Description (Spanish)

Resumen La edición del genoma sin cicatrices de las células madre pluripotentes inducidas (iPSC) es crucial para el modelado preciso de la enfermedad genética. Aquí presentamos CRISPR Del/Rei, una estrategia de eliminación-reinserción en dos pasos con alta eficiencia de edición y cribado simple basado en PCR que genera clones isogénicos en ~ 2 meses. Aplicamos nuestra estrategia para editar iPSC en 3 loci con solo una edición rara fuera del objetivo.

Files

s41598-022-16004-w.pdf.pdf

Files (3.2 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:511a4fb20efa08e0573100c38c2fe16f
3.2 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
CRISPR DEL/REI: خط أنابيب بسيط ومرن وفعال لتحرير الجينوم بدون ندبات
Translated title (French)
CRISPR Del/Rei : un pipeline simple, flexible et efficace pour l'édition du génome sans cicatrice
Translated title (Spanish)
CRISPR Del/Rei: un canal simple, flexible y eficiente para la edición del genoma sin cicatrices

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4285086646
DOI
10.1038/s41598-022-16004-w

Is supplement to
https://openalex.org/W4367320419 (Other)
https://openalex.org/W4323348658 (Other)
https://openalex.org/W3166356194 (Other)
https://openalex.org/W3035936888 (Other)
https://openalex.org/W2982388533 (Other)
https://openalex.org/W2953536279 (Other)
https://openalex.org/W2914899406 (Other)
https://openalex.org/W2763110592 (Other)
https://openalex.org/W2590381489 (Other)
https://openalex.org/W2514410885 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Egypt

References

  • https://openalex.org/W1776950904
  • https://openalex.org/W2003418092
  • https://openalex.org/W2081970575
  • https://openalex.org/W2162573011
  • https://openalex.org/W2324816762
  • https://openalex.org/W2343876552
  • https://openalex.org/W2739458618
  • https://openalex.org/W2774412797
  • https://openalex.org/W2901255143
  • https://openalex.org/W2950250779
  • https://openalex.org/W2974103075
  • https://openalex.org/W2981137429
  • https://openalex.org/W3017124585
  • https://openalex.org/W3023181423
  • https://openalex.org/W3152896611
  • https://openalex.org/W3157701048
  • https://openalex.org/W3206354438