Published August 4, 2017 | Version v1
Publication Open

Aspergillus Secondary Metabolite Database, a resource to understand the Secondary metabolome of Aspergillus genus

Creators

  • 1. Indian Institute of Chemical Technology
  • 2. National Institute of Pharmaceutical Education and Research
  • 3. Ministry of Science and Technology

Description

Aspergillus is a genus of ubiquitous fungi that are pathologically & therapeutically important. Aspergillus Secondary Metabolites Database (A2MDB) is a curated compendium of information on Aspergillus & its secondary metabolome. A2MDB catalogs 807 unique non-redundantsecondary metabolites derived from 675 Aspergillus species. A2MDB has a compilation of 100 cellular targets of secondary metabolites, 44 secondary metabolic pathways, 150 electron and light microscopy images of various Aspergillus species. A phylogenetic representation of over 2500 strains has been provided. A2MDB presents a detailed chemical information of secondary metabolites and their mycotoxins. Molecular docking models of metabolite-target protein interactions have been put together. A2MDB also has epidemiological data representing Aspergillosis and global occurrence of Aspergillus species. Furthermore a novel classification of Aspergillosis along with 370 case reports with images, were made available. For each metabolite catalogued, external links to related databases have been provided. All this data is available on A2MDB, launched through Indian Institute of Chemical Technology, Hyderabad, India, as an open resource http://www.iictindia.org/A2MDB . We believe A2MDB is of practical relevance to the scientific community that is in pursuit of novel therapeutics.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الرشاشيات هي جنس من الفطريات المنتشرة في كل مكان والتي تعتبر مهمة من الناحية المرضية والعلاجية. قاعدة بيانات المستقلبات الثانوية للرشاشيات (A2MDB) هي خلاصة وافية منسقة للمعلومات حول الرشاشيات ومستقلبها الثانوي. يقوم A2MDB بفهرسة 807 من الأيضات الفريدة غير الزائدة عن الحاجة المشتقة من 675 نوعًا من الرشاشيات. يحتوي A2MDB على مجموعة من 100 هدف خلوي للمستقلبات الثانوية، و 44 مسارًا استقلابيًا ثانويًا، و 150 صورة إلكترونية ومجهرية ضوئية لمختلف أنواع الرشاشيات. تم توفير تمثيل النشوء والتطور لأكثر من 2500 سلالة. يقدم A2MDB معلومات كيميائية مفصلة عن المستقلبات الثانوية وسمومها الفطرية. تم وضع نماذج الالتحام الجزيئي لتفاعلات البروتين المستقلب المستهدف معًا. يحتوي A2MDB أيضًا على بيانات وبائية تمثل داء الرشاشيات والظهور العالمي لأنواع الرشاشيات. علاوة على ذلك، تم توفير تصنيف جديد لداء الرشاشيات إلى جانب 370 تقرير حالة مع صور. لكل مستقلب مفهرس، تم توفير روابط خارجية لقواعد البيانات ذات الصلة. جميع هذه البيانات متاحة على A2MDB، الذي تم إطلاقه من خلال المعهد الهندي للتكنولوجيا الكيميائية، حيدر أباد، الهند، كمورد مفتوح http://www.iictindia.org/A2MDB . نعتقد أن A2MDB ذو صلة عملية بالمجتمع العلمي الذي يسعى إلى العلاجات الجديدة.

Translated Description (French)

Aspergillus est un genre de champignons omniprésents qui sont importants sur le plan pathologique et thérapeutique. Aspergillus Secondary Metabolites Database (A2MDB) est un recueil d'informations sur Aspergillus et son métabolome secondaire. A2MDB catalogue 807 métabolites secondaires non redondants uniques dérivés de 675 espèces d'Aspergillus. A2MDB a une compilation de 100 cibles cellulaires de métabolites secondaires, 44 voies métaboliques secondaires, 150 images en microscopie électronique et optique de diverses espèces d'Aspergillus. Une représentation phylogénétique de plus de 2500 souches a été fournie. A2MDB présente une information chimique détaillée des métabolites secondaires et de leurs mycotoxines. Des modèles d'amarrage moléculaire des interactions métabolites-protéines cibles ont été mis en place. A2MDB dispose également de données épidémiologiques représentant l'aspergillose et la présence mondiale d'espèces d'Aspergillus. En outre, une nouvelle classification de l'aspergillose ainsi que 370 rapports de cas avec images ont été mis à disposition. Pour chaque métabolite catalogué, des liens externes vers des bases de données connexes ont été fournis. Toutes ces données sont disponibles sur A2MDB, lancé par l'Institut indien de technologie chimique, Hyderabad, Inde, en tant que ressource ouverte http://www.iictindia.org/A2MDB . Nous pensons que l'A2MDB présente un intérêt pratique pour la communauté scientifique à la recherche de nouvelles thérapies.

Translated Description (Spanish)

Aspergillus es un género de hongos ubicuos que son patológica y terapéuticamente importantes. La base de datos de metabolitos secundarios de Aspergillus (A2MDB) es un compendio curado de información sobre Aspergillus y su metaboloma secundario. A2MDB cataloga 807 metabolitos secundarios no redundantes únicos derivados de 675 especies de Aspergillus. A2MDB tiene una recopilación de 100 dianas celulares de metabolitos secundarios, 44 vías metabólicas secundarias, 150 imágenes de microscopía electrónica y óptica de varias especies de Aspergillus. Se ha proporcionado una representación filogenética de más de 2500 cepas. A2MDB presenta una información química detallada de los metabolitos secundarios y sus micotoxinas. Se han elaborado modelos de acoplamiento molecular de interacciones metabolito-proteína diana. A2MDB también tiene datos epidemiológicos que representan la aspergilosis y la aparición global de especies de Aspergillus. Además, se puso a disposición una nueva clasificación de la aspergilosis junto con 370 informes de casos con imágenes. Para cada metabolito catalogado, se han proporcionado enlaces externos a bases de datos relacionadas. Todos estos datos están disponibles en A2MDB, lanzado a través del Instituto Indio de Tecnología Química, Hyderabad, India, como un recurso abierto http://www.iictindia.org/A2MDB . Creemos que A2MDB es de relevancia práctica para la comunidad científica que busca terapias novedosas.

Files

s41598-017-07436-w.pdf.pdf

Files (4.0 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:a47faf6cb0f3f84b87e985e87f00959a
4.0 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
قاعدة بيانات الأيض الثانوي للرشاشيات، وهي مورد لفهم الأيض الثانوي لجنس الرشاشيات
Translated title (French)
Aspergillus Secondary Metabolite Database, une ressource pour comprendre le métabolome secondaire du genre Aspergillus
Translated title (Spanish)
Base de datos de metabolitos secundarios de Aspergillus, un recurso para comprender el metaboloma secundario del género Aspergillus

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2740431964
DOI
10.1038/s41598-017-07436-w

Is supplement to
https://openalex.org/W4324010944 (Other)
https://openalex.org/W4293221075 (Other)
https://openalex.org/W2938607100 (Other)
https://openalex.org/W2889935651 (Other)
https://openalex.org/W2494588723 (Other)
https://openalex.org/W2443036239 (Other)
https://openalex.org/W2120117970 (Other)
https://openalex.org/W2099368167 (Other)
https://openalex.org/W2036012616 (Other)
https://openalex.org/W2015381774 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
India

References

  • https://openalex.org/W1548910728
  • https://openalex.org/W1572194202
  • https://openalex.org/W1935434993
  • https://openalex.org/W1986578797
  • https://openalex.org/W1988248986
  • https://openalex.org/W1989277387
  • https://openalex.org/W2006437796
  • https://openalex.org/W2014975375
  • https://openalex.org/W2018696862
  • https://openalex.org/W2020350008
  • https://openalex.org/W2024412644
  • https://openalex.org/W2026370952
  • https://openalex.org/W2039925520
  • https://openalex.org/W2053317726
  • https://openalex.org/W2062194675
  • https://openalex.org/W2062946300
  • https://openalex.org/W2063028213
  • https://openalex.org/W2063642998
  • https://openalex.org/W2074722678
  • https://openalex.org/W2085707114
  • https://openalex.org/W2086953382
  • https://openalex.org/W2089477777
  • https://openalex.org/W2096521011
  • https://openalex.org/W2103565574
  • https://openalex.org/W2103954134
  • https://openalex.org/W2118306023
  • https://openalex.org/W2118324861
  • https://openalex.org/W2125418911
  • https://openalex.org/W2128601422
  • https://openalex.org/W2129337483
  • https://openalex.org/W2131848047
  • https://openalex.org/W2132262459
  • https://openalex.org/W2134394193
  • https://openalex.org/W2134967712
  • https://openalex.org/W2135639274
  • https://openalex.org/W2136434605
  • https://openalex.org/W2141197648
  • https://openalex.org/W2147874847
  • https://openalex.org/W2148653176
  • https://openalex.org/W2151498748
  • https://openalex.org/W2160378127
  • https://openalex.org/W2160867136
  • https://openalex.org/W2177317049
  • https://openalex.org/W2336040088
  • https://openalex.org/W2415728719
  • https://openalex.org/W2471116074
  • https://openalex.org/W2529920144
  • https://openalex.org/W2558625498
  • https://openalex.org/W2558999090
  • https://openalex.org/W2952498720
  • https://openalex.org/W4233910700