Published June 25, 2024 | Version v1
Publication Open

DNA Barcoding of Commercially Important Snappers (Genus Lutjanus (Pisces: Lutjanidae)) from Aceh Waters, Indonesia

Creators

  • 1. Syiah Kuala University
  • 2. Samudra University
  • 3. Universiti Malaysia Terengganu

Description

Snappers (Lutjanidae) are a group of reef fishes with high commercial importance in Indonesia.However, there is currently a lack of available information on the bioecology and genetics of these snappers.The present identification of snapper species relies primarily on morphological differences, frequently leading to misidentification due to the high similarity among members of this fish group.Molecular data has emerged as a crucial tool in validating and supporting fisheries management plans.Therefore, this study uses a DNA barcoding approach to analyze and validate the taxonomic status of commercially important snappers harvested from Aceh water.DNA barcoding is a species identification method that uses a DNA base sequence system, typically mitochondrial DNA (mtDNA) "cytochrome oxidase subunit I" (COI) in animals, with a standard length of 648 bp.The fish samples were collected from January to August 2022 at several landing sites across Aceh, namely Weh Island, Aceh Besar, Banda Aceh, Langsa, Simeulue, and Tapak Tuan.A total of 78 sequences belonging to 15 species were successfully generated.The genetic distance and phylogenetic analyses showed that L. decussatus and L. lemniscatus had a close relationship (genetic distance: 4.90%), while the farthest genetic distance was found between L.gibbus and L. lemniscatus (16.97%).In addition, this study provided a reliable DNA barcode reference library of significant snappers from Aceh for fisheries management through precise species identification for conservation strategies.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

سمك النهاش (Lutjanidae) هي مجموعة من أسماك الشعاب المرجانية ذات الأهمية التجارية العالية في إندونيسيا. ومع ذلك، هناك حاليًا نقص في المعلومات المتاحة حول الإيكولوجيا الحيوية وعلم الوراثة لهذه الأنواع. يعتمد التحديد الحالي لأنواع النهاش في المقام الأول على الاختلافات المورفولوجية، مما يؤدي في كثير من الأحيان إلى سوء التحديد بسبب التشابه الكبير بين أعضاء مجموعة الأسماك هذه. ظهرت البيانات الجزيئية كأداة حاسمة في التحقق من صحة ودعم خطط إدارة مصايد الأسماك. لذلك، تستخدم هذه الدراسة نهج الترميز الشريطي للحمض النووي تحليل والتحقق من الحالة التصنيفية للنهاش المهم تجاريًا الذي يتم حصاده من مياه آتشيه. الترميز الشريطي للحمض النووي هو طريقة لتحديد الأنواع تستخدم نظام تسلسل قاعدة الحمض النووي، وعادة ما يكون الحمض النووي للميتوكوندريا (mtDNA) "الوحدة الفرعية لأوكسيداز السيتوكروم I" (COI) في الحيوانات، بطول قياسي يبلغ 648 نقطة أساس. تم جمع عينات الأسماك من يناير إلى أغسطس 2022 في العديد من مواقع الهبوط في جميع أنحاء آتشيه، وهي جزيرة ويه وآتشيه بيسار وباندا آتشيه ولانغسا وسيميولو وتاباك توان. تم بنجاح توليد ما مجموعه 78 تسلسلًا تنتمي إلى 15 نوعًا. أظهرت تحليلات المسافة الوراثية والتطور أن L. decussatus و L. كان لدى lemniscatus علاقة وثيقة (المسافة الوراثية: 4.90 ٪)، في حين تم العثور على أبعد مسافة وراثية بين L.gibbus و L. lemniscatus (16.97 ٪). بالإضافة إلى ذلك، قدمت هذه الدراسة مكتبة مرجعية موثوقة للباركود DNA من سمك النهاش المهم من آتشيه لإدارة مصايد الأسماك من خلال تحديد الأنواع بدقة لاستراتيجيات الحفظ.

Translated Description (French)

Les vivaneaux (Lutjanidae) sont un groupe de poissons de récif ayant une grande importance commerciale en Indonésie.Toutefois, il existe actuellement un manque d'informations disponibles sur la bioécologie et la génétique de ces vivaneaux.L' identification actuelle des espèces de vivaneaux repose principalement sur des différences morphologiques, ce qui conduit souvent à une identification erronée en raison de la forte similitude entre les membres de ce groupe de poissons.Les données moléculaires sont apparues comme un outil crucial pour valider et soutenir les plans de gestion des pêches.Par conséquent, cette étude utilise une approche de codage à barres de l'ADN pour analyser et valider le statut taxonomique des vivaneaux d'importance commerciale récoltés dans l'eau d'Aceh. Le code-barres ADN est une méthode d'identification des espèces qui utilise un système de séquences de bases d'ADN, généralement l'ADN mitochondrial (ADNmt) « sous-unité I de la cytochrome oxydase » (COI) chez les animaux, d'une longueur standard de 648 pb. Les échantillons de poissons ont été prélevés de janvier à août 2022 sur plusieurs sites de débarquement à travers l'Aceh, à savoir l'île Weh, Aceh Besar, Banda Aceh, Langsa, Simeulue et Tapak Tuan. Un total de 78 séquences appartenant à 15 espèces ont été générées avec succès. La distance génétique et les analyses phylogénétiques ont montré que L. decussatus et L. lemniscatus avait une relation étroite (distance génétique : 4,90 %), tandis que la distance génétique la plus éloignée a été trouvée entre L.gibbus et L. lemniscatus (16,97 %). En outre, cette étude a fourni une bibliothèque de référence fiable de codes à barres d'ADN de vivaneaux importants d'Aceh pour la gestion des pêches grâce à l'identification précise des espèces pour les stratégies de conservation.

Translated Description (Spanish)

Los pargos (Lutjanidae) son un grupo de peces de arrecife con gran importancia comercial en Indonesia. Sin embargo, actualmente existe una falta de información disponible sobre la bioecología y la genética de estos pargos. La identificación actual de especies de pargos se basa principalmente en diferencias morfológicas, lo que con frecuencia conduce a una identificación errónea debido a la alta similitud entre los miembros de este grupo de peces. Los datos moleculares se han convertido en una herramienta crucial para validar y respaldar los planes de gestión pesquera. Por lo tanto, este estudio utiliza un enfoque de códigos de barras de ADN para analizar y validar el estado taxonómico de los pargos comercialmente importantes cosechados del agua de Aceh. El código de barras de ADN es un método de identificación de especies que utiliza un sistema de secuencia de bases de ADN, típicamente ADN mitocondrial (ADNmt) "subunidad I de citocromo oxidasa" (COI) en animales, con una longitud estándar de 648 bp.Las muestras de peces se recolectaron de enero a agosto de 2022 en varios sitios de aterrizaje en Aceh, a saber, Weh Island, Aceh Besar, Banda Aceh, Langsa, Simeulue y Tapak Tuan. Un total de 78 secuencias pertenecientes a 15 especies se generaron con éxito. La distancia genética y los análisis filogenéticos mostraron que L. decussatus y L. lemniscatus tenía una estrecha relación (distancia genética: 4.90%), mientras que la distancia genética más lejana se encontró entre L. gibbus y L. lemniscatus (16.97%). Además, este estudio proporcionó una biblioteca de referencia de código de barras de ADN confiable de pargos significativos de Aceh para la gestión pesquera a través de la identificación precisa de especies para estrategias de conservación.

Files

134524.pdf

Files (1.8 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:e9ab84d6f4756bbfb2c6a465605c6d6b
1.8 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
ترميز الحمض النووي للنهاش المهم تجاريًا (جنس Lutjanus (الحوت: Lutjanidae)) من مياه آتشيه، إندونيسيا
Translated title (French)
Codage à barres de l'ADN des vivaneaux d'importance commerciale (genre Lutjanus (Poissons : Lutjanidae)) d'Aceh Waters, Indonésie
Translated title (Spanish)
Código de barras de ADN de pargos comercialmente importantes (género Lutjanus (Piscis: Lutjanidae)) de Aceh Waters, Indonesia

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4400003225
DOI
10.18280/ijdne.190309

Is supplement to
https://openalex.org/W4394298238 (Other)
https://openalex.org/W4302358572 (Other)
https://openalex.org/W4298158568 (Other)
https://openalex.org/W4206873585 (Other)
https://openalex.org/W2888176588 (Other)
https://openalex.org/W2557398810 (Other)
https://openalex.org/W2513443471 (Other)
https://openalex.org/W2088194895 (Other)
https://openalex.org/W2039297055 (Other)
https://openalex.org/W2035997877 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Malaysia

References

  • https://openalex.org/W1964763440
  • https://openalex.org/W1999236217
  • https://openalex.org/W2079861684
  • https://openalex.org/W2111347924
  • https://openalex.org/W2135866999
  • https://openalex.org/W2152207030
  • https://openalex.org/W2162080532
  • https://openalex.org/W2171405751
  • https://openalex.org/W2577972054
  • https://openalex.org/W2752351010
  • https://openalex.org/W2774493313
  • https://openalex.org/W2779490183
  • https://openalex.org/W2783817196
  • https://openalex.org/W2790314209
  • https://openalex.org/W2890736058
  • https://openalex.org/W2905631329
  • https://openalex.org/W2906332896
  • https://openalex.org/W2940376448
  • https://openalex.org/W2945558095
  • https://openalex.org/W2964824140
  • https://openalex.org/W2990495906
  • https://openalex.org/W2991126756
  • https://openalex.org/W3027041372
  • https://openalex.org/W3037573646
  • https://openalex.org/W3046981780
  • https://openalex.org/W3047001692
  • https://openalex.org/W3093491165
  • https://openalex.org/W3198651059
  • https://openalex.org/W4200141826
  • https://openalex.org/W4220865807
  • https://openalex.org/W4255637749
  • https://openalex.org/W4302445704
  • https://openalex.org/W4317548991
  • https://openalex.org/W4362736335
  • https://openalex.org/W4365452342