Published February 26, 2021
| Version v1
Publication
Open
The Dynamic Immune Response of Yellow Catfish (Pelteobagrus fulvidraco) Infected With Edwardsiella ictaluri Presenting the Inflammation Process
Creators
- 1. Chinese Research Academy of Environmental Sciences
- 2. Huazhong Agricultural University
- 3. Ministry of Agriculture and Rural Affairs
- 4. Chinese Academy of Fishery Sciences
Description
Edwardsiella ictaluri is a highly destructive pathogen in cultured yellow catfish, thus it was very necessary to study the immune response of yellow catfish against bacterial infection. In this study, RNA-Seq technology was used to study the immune response in two distinct tissues of yellow catfish at eight different time points (h) after E. ictaluri infection. The number of differentially expressed genes (DEGs) in the spleen and liver was low at 3 h and 6 h post-infection, respectively. Afterwards, the most number of DEGs in the spleen was detected at 72 h, while the number of DEGs in the liver maintained a high level from 24 h to 120 h. The GO and KEGG enrichment analyses of DEGs at different time points uncovered that cytokines were continuously transcribed at 6 h to 120 h; whereas the liver is the main organ that secretes the components of the complement system, and metabolic regulation was activated from 12 h to 120 h. Moreover, an overview of the inflammation response of yellow catfish was exhibited including pattern-recognition receptors, inflammatory cytokines, chemokines, complements, and inflammation-related signal pathways. The similar expression tendency of nine genes by qRT-PCR validated the accuracy of transcriptome analyses. The different transcriptomic profiles obtained from the spleen and liver will help to better understand the dynamic immune response of fish against bacterial infection, and will provide basic information for establishing effective measures to prevent and control diseases in fish.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
Edwardsiella ictaluri هو عامل ممرض مدمر للغاية في سمك السلور الأصفر المستزرع، وبالتالي كان من الضروري جدًا دراسة الاستجابة المناعية لسمك السلور الأصفر ضد العدوى البكتيرية. في هذه الدراسة، تم استخدام تقنية RNA - Seq لدراسة الاستجابة المناعية في نسيجين متميزين من سمك السلور الأصفر في ثماني نقاط زمنية مختلفة (h) بعد عدوى E. ictaluri. كان عدد الجينات المعبر عنها بشكل تفاضلي (DEGs) في الطحال والكبد منخفضًا عند 3 ساعات و 6 ساعات بعد العدوى، على التوالي. بعد ذلك، تم اكتشاف أكبر عدد من DEGs في الطحال عند 72 ساعة، في حين حافظ عدد DEGs في الكبد على مستوى عالٍ من 24 ساعة إلى 120 ساعة. كشفت تحليلات إثراء GO و KEGG لـ DEGs في نقاط زمنية مختلفة أن السيتوكينات يتم نسخها باستمرار من 6 ساعات إلى 120 ساعة ؛ في حين أن الكبد هو العضو الرئيسي الذي يفرز مكونات نظام المكمل، وتم تنشيط التنظيم الأيضي من 12 ساعة إلى 120 ساعة. علاوة على ذلك، تم عرض نظرة عامة على استجابة التهاب سمك السلور الأصفر بما في ذلك مستقبلات التعرف على الأنماط، والسيتوكينات الالتهابية، والكيموكينات، والمكملات، ومسارات الإشارة المتعلقة بالالتهاب. أكد ميل التعبير المماثل لتسعة جينات بواسطة qRT - PCR دقة تحليلات transcriptome. ستساعد ملفات النسخ المختلفة التي تم الحصول عليها من الطحال والكبد على فهم أفضل للاستجابة المناعية الديناميكية للأسماك ضد العدوى البكتيرية، وستوفر المعلومات الأساسية لوضع تدابير فعالة للوقاية من الأمراض ومكافحتها في الأسماك.Translated Description (French)
Edwardsiella ictaluri est un agent pathogène hautement destructeur chez le poisson-chat jaune d'élevage, il était donc très nécessaire d'étudier la réponse immunitaire du poisson-chat jaune contre l'infection bactérienne. Dans cette étude, la technologie RNA-Seq a été utilisée pour étudier la réponse immunitaire dans deux tissus distincts de poisson-chat jaune à huit moments différents (h) après l'infection par E. ictaluri. Le nombre de gènes exprimés différentiellement (DEG) dans la rate et le foie était faible 3 h et 6 h après l'infection, respectivement. Par la suite, le plus grand nombre de DEG dans la rate a été détecté à 72 h, tandis que le nombre de DEG dans le foie s'est maintenu à un niveau élevé de 24 h à 120 h. Les analyses d'enrichissement en GO et en KEGG des DEG à différents moments ont révélé que les cytokines étaient continuellement transcrites entre 6 h et 120 h ; alors que le foie est le principal organe qui sécrète les composants du système du complément, et que la régulation métabolique était activée entre 12 h et 120 h. De plus, un aperçu de la réponse inflammatoire du poisson-chat jaune a été présenté, y compris les récepteurs de reconnaissance des modèles, les cytokines inflammatoires, les chimiokines, les compléments et les voies de signalisation liées à l'inflammation. La tendance à l'expression similaire de neuf gènes par qRT-PCR a validé la précision des analyses du transcriptome. Les différents profils transcriptomiques obtenus à partir de la rate et du foie aideront à mieux comprendre la réponse immunitaire dynamique des poissons contre les infections bactériennes et fourniront des informations de base pour établir des mesures efficaces de prévention et de contrôle des maladies chez les poissons.Translated Description (Spanish)
Edwardsiella ictaluri es un patógeno altamente destructivo en el bagre amarillo cultivado, por lo que fue muy necesario estudiar la respuesta inmune del bagre amarillo contra la infección bacteriana. En este estudio, se utilizó la tecnología RNA-Seq para estudiar la respuesta inmune en dos tejidos distintos de bagre amarillo en ocho puntos de tiempo diferentes (h) después de la infección por E. ictaluri. El número de genes expresados diferencialmente (DEG) en el bazo y el hígado fue bajo a las 3 h y 6 h después de la infección, respectivamente. Posteriormente, el mayor número de DEGs en el bazo se detectó a las 72 h, mientras que el número de DEGs en el hígado mantuvo un nivel alto de 24 h a 120 h. Los análisis de enriquecimiento GO y KEGG de DEGs en diferentes puntos de tiempo revelaron que las citoquinas se transcribieron continuamente de 6 h a 120 h; mientras que el hígado es el órgano principal que secreta los componentes del sistema del complemento, y la regulación metabólica se activó de 12 h a 120 h. Además, se mostró una visión general de la respuesta a la inflamación del bagre amarillo, incluidos los receptores de reconocimiento de patrones, las citocinas inflamatorias, las quimiocinas, los complementos y las vías de señalización relacionadas con la inflamación. La tendencia de expresión similar de nueve genes por qRT-PCR validó la precisión de los análisis de transcriptoma. Los diferentes perfiles transcriptómicos obtenidos del bazo y el hígado ayudarán a comprender mejor la respuesta inmune dinámica de los peces contra la infección bacteriana, y proporcionarán información básica para establecer medidas efectivas para prevenir y controlar las enfermedades en los peces.Files
pdf.pdf
Files
(10.0 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:4a0a6ed24c15b2d8465701afd9d55885
|
10.0 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- الاستجابة المناعية الديناميكية لسمك السلور الأصفر (Pelteobagrus fulvidraco) المصاب بـ Edwardsiella ictaluri الذي يقدم عملية الالتهاب
- Translated title (French)
- La réponse immunitaire dynamique du poisson-chat jaune (Pelteobagrus fulvidraco) infecté par Edwardsiella ictaluri présentant le processus d'inflammation
- Translated title (Spanish)
- La respuesta inmune dinámica del bagre amarillo (Pelteobagrus fulvidraco) infectado con Edwardsiella ictaluri que presenta el proceso de inflamación
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3134814094
- DOI
- 10.3389/fimmu.2021.625928
References
- https://openalex.org/W1182348828
- https://openalex.org/W1507596009
- https://openalex.org/W1543575007
- https://openalex.org/W1809465273
- https://openalex.org/W1964954110
- https://openalex.org/W1979446719
- https://openalex.org/W1986285119
- https://openalex.org/W1988097700
- https://openalex.org/W1988167511
- https://openalex.org/W1990305706
- https://openalex.org/W2001166572
- https://openalex.org/W2003851048
- https://openalex.org/W2011051379
- https://openalex.org/W2020686859
- https://openalex.org/W2028314455
- https://openalex.org/W2029059789
- https://openalex.org/W2029228085
- https://openalex.org/W2030313939
- https://openalex.org/W2048907122
- https://openalex.org/W2058805572
- https://openalex.org/W2059410321
- https://openalex.org/W2060600956
- https://openalex.org/W2071756586
- https://openalex.org/W2074896108
- https://openalex.org/W2078664576
- https://openalex.org/W2085187432
- https://openalex.org/W2091472261
- https://openalex.org/W2092165052
- https://openalex.org/W2099434149
- https://openalex.org/W2107277218
- https://openalex.org/W2109491705
- https://openalex.org/W2118742454
- https://openalex.org/W2136648677
- https://openalex.org/W2153065272
- https://openalex.org/W2171194410
- https://openalex.org/W2192080449
- https://openalex.org/W2202800654
- https://openalex.org/W2218732210
- https://openalex.org/W2290310648
- https://openalex.org/W2292904186
- https://openalex.org/W2295965848
- https://openalex.org/W2400245958
- https://openalex.org/W2474883340
- https://openalex.org/W2506165436
- https://openalex.org/W2509178044
- https://openalex.org/W2548072772
- https://openalex.org/W2562486629
- https://openalex.org/W2597326109
- https://openalex.org/W2696472386
- https://openalex.org/W2708757046
- https://openalex.org/W2736344634
- https://openalex.org/W2737388023
- https://openalex.org/W2753549503
- https://openalex.org/W2756426481
- https://openalex.org/W2769657971
- https://openalex.org/W2771968994
- https://openalex.org/W2774510388
- https://openalex.org/W2793445046
- https://openalex.org/W2800545870
- https://openalex.org/W2811216645
- https://openalex.org/W2884081989
- https://openalex.org/W2887105999
- https://openalex.org/W2893064906
- https://openalex.org/W2893631054
- https://openalex.org/W2898567584
- https://openalex.org/W2903015006
- https://openalex.org/W2912195086
- https://openalex.org/W2939625028
- https://openalex.org/W2943748648
- https://openalex.org/W2947711765
- https://openalex.org/W2979466636
- https://openalex.org/W2990988936
- https://openalex.org/W3000613042
- https://openalex.org/W3010170575
- https://openalex.org/W3012427530
- https://openalex.org/W3013888689
- https://openalex.org/W3015031736
- https://openalex.org/W3022432325
- https://openalex.org/W3026484222
- https://openalex.org/W802784551