Published February 18, 2015 | Version v1
Publication Open

Prospective evaluation of GeneXpert for the diagnosis of HIV- negative pediatric TB cases

Creators

  • 1. Oxford University Clinical Research Unit
  • 2. Liverpool School of Tropical Medicine

Description

The GeneXpertMTB/RIF (Xpert) assay is now recommended by WHO for diagnosis of tuberculosis (TB) in children but evaluation data is limited.One hundred and fifty consecutive HIV negative children (<15 years of age) presenting with suspected TB were enrolled at a TB referral hospital in Ho Chi Minh City, Vietnam. 302 samples including sputum (n = 79), gastric fluid (n = 215), CSF (n = 3), pleural fluid (n = 4) and cervical lymphadenopathic pus (n = 1) were tested by smear, automated liquid culture (Bactec MGIT) and Xpert. Patients were classified retrospectively using the standardised case definition into confirmed, probable, possible, TB unlikely or not TB categories. Test accuracy was evaluated against 2 gold standards: [1] clinical (confirmed, probable and possible TB) and [2] 'confirmed TB' alone.The median age of participants was 18 months [IQR 5-170]. When test results were aggregated by patient, the sensitivity of smear, Xpert and MGIT against clinical diagnosis as the gold standard were 9.2% (n = 12/131) [95%CI 4.2; 14.1], 20.6% (n = 27/131) [95%CI 13.7; 27.5] and 29.0% (n = 38/131) [21.2;36.8], respectively. Specificity 100% (n = 19/19), 94.7% (n = 18/19), 94.7% (n = 18/19), respectively. Xpert was more sensitive than smear (P = <0.001) and less sensitive than MGIT (P = 0.002).The systematic use of Xpert will increase early TB case confirmation in children and represents a major advance but sensitivity of all tests remains unacceptably low. Improved rapid diagnostic tests and algorithm approaches for pediatric TB are still an urgent research priority.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

توصي منظمة الصحة العالمية الآن بفحص GeneXpertMTB/RIF (Xpert) لتشخيص مرض السل (TB) لدى الأطفال ولكن بيانات التقييم محدودة. تم تسجيل مائة وخمسين طفلاً مصابًا بفيروس نقص المناعة البشرية (<15 عامًا) مصابًا بالسل المشتبه به في مستشفى إحالة السل في مدينة هوشي منه، فيتنام. تم اختبار 302 عينة بما في ذلك البلغم (n = 79)، سائل المعدة (n = 215)، السائل النخاعي (n = 3)، السائل الجنبي (n = 4) وصديد اعتلال العقد اللمفية العنقية (n = 1) عن طريق اللطاخة، المزرعة السائلة الآلية (Bactec MGIT) و Xpert. تم تصنيف المرضى بأثر رجعي باستخدام تعريف الحالة الموحد إلى فئات مؤكدة أو محتملة أو محتملة أو غير محتملة أو غير محتملة من السل. تم تقييم دقة الاختبار مقابل معيارين ذهبيين: [1] السريرية (السل المؤكد والمحتمل والمحتمل) و [2] "السل المؤكد" وحده. كان متوسط عمر المشاركين 18 شهرًا [IQR 5-170]. عندما تم تجميع نتائج الاختبار من قبل المريض، كانت حساسية اللطاخة و Xpert و MGIT مقابل التشخيص السريري كمعيار ذهبي 9.2 ٪ (n = 12/131) [95 ٪CI 4.2 ؛ 14.1]، 20.6 ٪ (n = 27/131) [95 ٪CI 13.7 ؛ 27.5] و 29.0 ٪ (n = 38/131) [21.2 ؛36.8]، على التوالي. النوعية 100 ٪ (العدد = 19/19)، 94.7 ٪ (العدد = 18/19)، 94.7 ٪ (العدد = 18/19)، على التوالي. كان Xpert أكثر حساسية من اللطاخة (P = <0.001) وأقل حساسية من MGIT (P = 0.002). سيزيد الاستخدام المنهجي لـ Xpert من تأكيد حالة السل المبكر لدى الأطفال ويمثل تقدمًا كبيرًا ولكن حساسية جميع الاختبارات لا تزال منخفضة بشكل غير مقبول. لا تزال الاختبارات التشخيصية السريعة المحسنة ونهج الخوارزميات لسل الأطفال أولوية بحثية ملحة.

Translated Description (French)

Le test GeneXpertMTB/RIF (Xpert) est maintenant recommandé par l'OMS pour le diagnostic de la tuberculose (TB) chez les enfants, mais les données d'évaluation sont limitées. Cent cinquante enfants VIH-négatifs consécutifs (<15 ans) présentant une suspicion de tuberculose ont été inscrits dans un hôpital de référence pour la tuberculose à Ho Chi Minh-Ville, au Vietnam. 302 échantillons comprenant des expectorations (n = 79), du liquide gastrique (n = 215), du LCR (n = 3), du liquide pleural (n = 4) et du pus lymphadénopathique cervical (n = 1) ont été testés par frottis, culture liquide automatisée (Bactec MGIT) et Xpert. Les patients ont été classés rétrospectivement en utilisant la définition de cas standardisée dans les catégories confirmées, probables, possibles, TB improbable ou non TB. La précision du test a été évaluée par rapport à 2 normes d'or : [1] clinique (TB confirmée, probable et possible) et [2] « TB confirmée » seule. L'âge médian des participants était de 18 mois [IQR 5-170]. Lorsque les résultats des tests ont été agrégés par patient, la sensibilité du frottis, de Xpert et de MGIT au diagnostic clinique comme étalon-or était de 9,2 % (n = 12/131) [IC à 95 % 4,2 ; 14,1], 20,6 % (n = 27/131) [IC à 95 % 13,7 ; 27,5] et 29,0 % (n = 38/131) [21,2 ;36,8], respectivement. Spécificité 100% (n = 19/19), 94,7% (n = 18/19), 94,7% (n = 18/19), respectivement. Xpert était plus sensible que le frottis (P = <0,001) et moins sensible que le MGIT (P = 0,002). L'utilisation systématique de Xpert augmentera la confirmation précoce des cas de tuberculose chez les enfants et représente une avancée majeure, mais la sensibilité de tous les tests reste inacceptable. L'amélioration des tests de diagnostic rapide et des approches algorithmiques pour la tuberculose pédiatrique reste une priorité de recherche urgente.

Translated Description (Spanish)

El ensayo GeneXpertMTB/RIF (Xpert) ahora es recomendado por la OMS para el diagnóstico de tuberculosis (TB) en niños, pero los datos de evaluación son limitados. Ciento cincuenta niños VIH negativos consecutivos (<15 años de edad) QUE presentaban sospecha de TB se inscribieron en un hospital de referencia de TB en Ciudad Ho Chi Minh, Vietnam. 302 muestras que incluían esputo (n = 79), líquido gástrico (n = 215), LCR (n = 3), líquido pleural (n = 4) y pus linfadenopático cervical (n = 1) se analizaron mediante frotis, cultivo líquido automatizado (Bactec MGIT) y Xpert. Los pacientes se clasificaron retrospectivamente utilizando la definición de caso estandarizada en categorías confirmadas, probables, posibles, TB improbable o no TB. La precisión de la prueba se evaluó contra 2 estándares Gold: [1] TB clínica (confirmada, probable y posible) y [2] 'TB confirmada' sola. La mediana de edad de los participantes fue de 18 meses [IQR 5-170]. Cuando los resultados de las pruebas se agregaron por paciente, la sensibilidad del frotis, Xpert y MGIT frente al diagnóstico clínico como estándar de oro fue del 9,2% (n = 12/131) [IC del 95%: 4,2; 14,1], 20,6% (n = 27/131) [IC del 95%: 13,7; 27,5] y 29,0% (n = 38/131) [21,2;36,8], respectivamente. Especificidad 100% (n = 19/19), 94.7% (n = 18/19), 94.7% (n = 18/19), respectivamente. Xpert fue más sensible que el frotis (P = <0.001) y menos sensible que MGIT (P = 0.002). El uso sistemático de Xpert aumentará la confirmación temprana de casos de TB en niños y representa un avance importante, pero la sensibilidad de todas las pruebas sigue siendo inaceptablemente baja. Las pruebas de diagnóstico rápido mejoradas y los enfoques algorítmicos para la tuberculosis pediátrica siguen siendo una prioridad de investigación urgente.

Files

s12879-015-0814-2.pdf

Files (686.0 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:24916c711bdd28758a7f9bfb6026e42e
686.0 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التقييم المستقبلي لـ GeneXpert لتشخيص حالات السل لدى الأطفال المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية
Translated title (French)
Évaluation prospective de GeneXpert pour le diagnostic des cas de tuberculose pédiatrique séronégatifs
Translated title (Spanish)
Evaluación prospectiva de GeneXpert para el diagnóstico de casos de TB pediátrica VIH negativa

Identifiers

Other
https://openalex.org/W1980533620
DOI
10.1186/s12879-015-0814-2

Is supplement to
https://openalex.org/W3196771338 (Other)
https://openalex.org/W2578830243 (Other)
https://openalex.org/W2502021263 (Other)
https://openalex.org/W2433418086 (Other)
https://openalex.org/W2423052876 (Other)
https://openalex.org/W2408419688 (Other)
https://openalex.org/W2333003367 (Other)
https://openalex.org/W2231588071 (Other)
https://openalex.org/W1995384656 (Other)
https://openalex.org/W1983839753 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Vietnam

References

  • https://openalex.org/W1545162265
  • https://openalex.org/W1971626943
  • https://openalex.org/W1994831055
  • https://openalex.org/W2033696917
  • https://openalex.org/W2064492432
  • https://openalex.org/W2066999889
  • https://openalex.org/W2088110177
  • https://openalex.org/W2089866381
  • https://openalex.org/W2101080794
  • https://openalex.org/W2102332285
  • https://openalex.org/W2107554560
  • https://openalex.org/W2118976331
  • https://openalex.org/W2122341038
  • https://openalex.org/W2122614221
  • https://openalex.org/W2124832757
  • https://openalex.org/W2135672450
  • https://openalex.org/W2139379706
  • https://openalex.org/W2146929221
  • https://openalex.org/W2152900977
  • https://openalex.org/W2157972110
  • https://openalex.org/W2159835967
  • https://openalex.org/W2168807244
  • https://openalex.org/W3009705041
  • https://openalex.org/W4387322458