Published February 27, 2024
| Version v1
Publication
Open
First detection and genetic characterization of canine bufavirus in domestic dogs, Thailand
Creators
- 1. Chulalongkorn University
Description
Abstract Canine bufavirus (CBuV) was reported in domestic dogs worldwide. We conducted a survey of canine bufavirus in domestic dogs in Thailand from September 2016 to October 2022. Rectal swab samples (n = 531) were collected from asymptomatic dogs and dogs with gastroenteritis signs. The samples were tested for CBuV using PCR with specific primers to the VP1/VP2 gene, and 9.42% (50/531) was CBuV positive. Our findings showed that CBuVs could be detected in both symptomatic and healthy dogs. The Thai CBuVs were found in dogs from different age groups, with a significant presence in those under 1 year (12.60%) and dogs aged 1–5 years (7.34%) ( p < 0.05), suggesting a high prevalence of Thai CBuVs in dogs under 5 years of age. We performed complete genome sequencing (n = 15) and partial VP1/VP2 sequencing (n = 5) of Thai CBuVs. Genetic and phylogenetic analyses showed that whole genomes of Thai CBuVs were closely related to Chinese and Italian CBuVs, suggesting the possible origin of Thai CBuVs. The analysis of VP1 and VP2 genes in Thai CBuVs showed that 18 of them were placed in subgroup A, while only 2 belonged to subgroup B. This study is the first to report the detection and genetic characterization of CBuVs in domestic dogs in Thailand. Additionally, surveillance and genetic characterization of CBuVs in domestic animals should be further investigated on a larger scale to elucidate the dynamic, evolution, and distribution of CBuVs.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تم الإبلاغ عن فيروس بوفيروس الكلاب التجريدي (CBuV) في الكلاب الأليفة في جميع أنحاء العالم. أجرينا مسحًا لفيروس بوفا في الكلاب الأليفة في تايلاند من سبتمبر 2016 إلى أكتوبر 2022. تم جمع عينات مسحة المستقيم (العدد = 531) من الكلاب التي لا تظهر عليها أعراض والكلاب التي تظهر عليها علامات التهاب المعدة والأمعاء. تم اختبار العينات لـ CBuV باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل مع بادئات محددة لجين VP1/VP2، وكان 9.42 ٪ (50/531) إيجابيًا لـ CBuV. أظهرت النتائج التي توصلنا إليها أنه يمكن اكتشاف فيروسات CBuV في كل من الكلاب المصابة بالأعراض والصحية. تم العثور على فيروسات CBuV التايلاندية في الكلاب من مختلف الفئات العمرية، مع وجود كبير في أولئك الذين تقل أعمارهم عن سنة واحدة (12.60 ٪) والكلاب التي تتراوح أعمارهم بين 1–5 سنوات (7.34 ٪) ( p < 0.05)، مما يشير إلى ارتفاع معدل انتشار فيروسات CBuV التايلاندية في الكلاب التي تقل أعمارهم عن 5 سنوات. أجرينا تسلسلًا كاملًا للجينوم (n = 15) وتسلسلًا جزئيًا لـ VP1/VP2 (n = 5) لـ CBuVs التايلاندية. أظهرت التحليلات الجينية والوراثية أن الجينوم الكامل لفيروسات CBuV التايلاندية كان مرتبطًا ارتباطًا وثيقًا بفيروسات CBuV الصينية والإيطالية، مما يشير إلى الأصل المحتمل لفيروسات CBuV التايلاندية. أظهر تحليل جينات VP1 و VP2 في فيروسات CBuVs التايلاندية أن 18 منها تم وضعها في المجموعة الفرعية A، بينما ينتمي اثنان فقط إلى المجموعة الفرعية B. هذه الدراسة هي الأولى التي أبلغت عن الكشف عن فيروسات CBuVs وتوصيفها الجيني في الكلاب المنزلية في تايلاند. بالإضافة إلى ذلك، يجب إجراء مزيد من التحقيق في المراقبة والتوصيف الجيني للفيروسات CBuVs في الحيوانات الأليفة على نطاق أوسع لتوضيح ديناميكية وتطور وتوزيع فيروسات CBuVs.Translated Description (French)
Résumé Le bufavirus canin (CBuV) a été signalé chez les chiens domestiques dans le monde entier. Nous avons mené une enquête sur le bufavirus canin chez les chiens domestiques en Thaïlande de septembre 2016 à octobre 2022. Des échantillons d'écouvillonnage rectal (n = 531) ont été prélevés sur des chiens asymptomatiques et des chiens présentant des signes de gastro-entérite. Les échantillons ont été testés pour le CBuV par PCR avec des amorces spécifiques au gène VP1/VP2, et 9,42 % (50/531) étaient positifs pour le CBuV. Nos résultats ont montré que les CBuV pouvaient être détectés chez les chiens symptomatiques et en bonne santé. Les CBuV thaïlandais ont été trouvés chez des chiens de différents groupes d'âge, avec une présence significative chez les moins de 1 an (12,60 %) et les chiens âgés de 1 à 5 ans (7,34 %) ( p < 0,05), ce qui suggère une prévalence élevée des CBuV thaïlandais chez les chiens de moins de 5 ans. Nous avons effectué un séquençage complet du génome (n = 15) et un séquençage partiel VP1/VP2 (n = 5) des CBuV thaïlandais. Des analyses génétiques et phylogénétiques ont montré que des génomes entiers de CBuV thaïlandais étaient étroitement liés aux CBuV chinois et italiens, suggérant l'origine possible des CBuV thaïlandais. L'analyse des gènes VP1 et VP2 dans les CBuV thaïlandais a montré que 18 d'entre eux étaient placés dans le sous-groupe A, tandis que seulement 2 appartenaient au sous-groupe B. Cette étude est la première à signaler la détection et la caractérisation génétique des CBuV chez les chiens domestiques en Thaïlande. De plus, la surveillance et la caractérisation génétique des CBuV chez les animaux domestiques devraient être approfondies à plus grande échelle pour élucider la dynamique, l'évolution et la distribution des CBuV.Translated Description (Spanish)
Resumen El bufavirus canino (CBuV) fue reportado en perros domésticos en todo el mundo. Realizamos una encuesta sobre el bufavirus canino en perros domésticos en Tailandia desde septiembre de 2016 hasta octubre de 2022. Se recogieron muestras de hisopo rectal (n = 531) de perros asintomáticos y perros con signos de gastroenteritis. Las muestras se analizaron para CBuV usando PCR con cebadores específicos para el gen VP1/VP2, y el 9.42% (50/531) fue positivo para CBuV. Nuestros hallazgos mostraron que los CBuV podían detectarse tanto en perros sintomáticos como sanos. Los CBuV tailandeses se encontraron en perros de diferentes grupos de edad, con una presencia significativa en los menores de 1 año (12,60%) y perros de 1 a 5 años (7,34%) ( p < 0,05), lo que sugiere una alta prevalencia de CBuV tailandeses en perros menores de 5 años de edad. Realizamos la secuenciación completa del genoma (n = 15) y la secuenciación parcial de VP1/VP2 (n = 5) de los CBuV tailandeses. Los análisis genéticos y filogenéticos mostraron que los genomas completos de los CBuV tailandeses estaban estrechamente relacionados con los CBuV chinos e italianos, lo que sugiere el posible origen de los CBuV tailandeses. El análisis de los genes VP1 y VP2 en los CBuV tailandeses mostró que 18 de ellos se ubicaron en el subgrupo A, mientras que solo 2 pertenecían al subgrupo B. Este estudio es el primero en informar la detección y caracterización genética de los CBuV en perros domésticos en Tailandia. Además, la vigilancia y la caracterización genética de los CBuV en animales domésticos deben investigarse más a mayor escala para dilucidar la dinámica, la evolución y la distribución de los CBuV.Files
s41598-024-54914-z.pdf.pdf
Files
(3.4 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:47b58805afb8d98ea0142e59bc896e29
|
3.4 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- أول اكتشاف وتوصيف وراثي لفيروس بوفا في الكلاب الأليفة، تايلاند
- Translated title (French)
- Première détection et caractérisation génétique du bufavirus canin chez les chiens domestiques, Thaïlande
- Translated title (Spanish)
- Primera detección y caracterización genética del bufavirus canino en perros domésticos, Tailandia
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4392199864
- DOI
- 10.1038/s41598-024-54914-z
References
- https://openalex.org/W1146770569
- https://openalex.org/W1499500424
- https://openalex.org/W1759001688
- https://openalex.org/W1971256351
- https://openalex.org/W2017410528
- https://openalex.org/W2020657010
- https://openalex.org/W2029613356
- https://openalex.org/W2034461174
- https://openalex.org/W2044243584
- https://openalex.org/W2052559736
- https://openalex.org/W2078527929
- https://openalex.org/W2101658703
- https://openalex.org/W2115146020
- https://openalex.org/W2118644831
- https://openalex.org/W2145505814
- https://openalex.org/W2149957719
- https://openalex.org/W2157282701
- https://openalex.org/W2166096779
- https://openalex.org/W2174186342
- https://openalex.org/W2272555026
- https://openalex.org/W2281881515
- https://openalex.org/W2322790342
- https://openalex.org/W235261639
- https://openalex.org/W2474199929
- https://openalex.org/W2519169969
- https://openalex.org/W2566243406
- https://openalex.org/W2694968405
- https://openalex.org/W2802422032
- https://openalex.org/W2911914006
- https://openalex.org/W2914101016
- https://openalex.org/W2933837811
- https://openalex.org/W2951205770
- https://openalex.org/W2969823817
- https://openalex.org/W297534896
- https://openalex.org/W3044250425
- https://openalex.org/W3094151453
- https://openalex.org/W3118775658
- https://openalex.org/W3151758131
- https://openalex.org/W3196993827
- https://openalex.org/W4205327891
- https://openalex.org/W4214906102