Published February 5, 2021 | Version v1
Publication Open

Infection pattern, case fatality rate and spread of Lassa virus in Nigeria

Creators

  • 1. University of Uyo
  • 2. Ahmadu Bello University
  • 3. Damanhour University
  • 4. Taif University
  • 5. Cairo University
  • 6. Kogi State University

Description

Lassa fever (LF) is a zoonotic infectious disease of public concern in Nigeria. The infection dynamics of the disease is not well elucidated in Nigeria. This study was carried out to describe the pattern of infection, case fatality rate and spread of lassa virus (LASV) from 2017 to 2020.Weekly epidemiological data on LF from December, 2016 to September, 2020 were obtained from Nigeria Centre for Disease Control. The number of confirmed cases and deaths were computed according to months and states. Descriptive statistics was performed and case fatality rate was calculated. Distribution and spread maps of LF over the four years period was performed on ArcMap 10.7.A total of 2787 confirmed cases and 516 deaths were reported in Nigeria from December, 2016 to September, 2020. Increase in number of cases and deaths were observed with 298, 528, 796 and 1165 confirmed cases and 79, 125, 158 and 158 deaths in 2017, 2018, 2019 and 2020 respectively. Over 60% of the cases were reported in two states, Edo and Ondo states. The LF cases spread from 19 states in 2017 to 32 states and Federal Capital Territory (FCT) in 2020. Ondo state (25.39%) had the highest of deaths rate from LF over the four years. Case fatality rate (CFR) of LF was highest in 2017 (26.5%) with CFR of 23.7, 19.6 and 13.4% in 2018, 2019 and 2020 respectively. The peak of infection was in the month of February for the four years. Infections increases at the onset of dry season in November and decline till April when the wet season sets-in.There is an annual increase in the number of LASV infection across the states in Nigeria. There is need to heighten control strategies through the use of integrated approach, ranging from vector control, health education and early diagnosis.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

حمى لاسا (LF) هو مرض معدي حيواني المنشأ مثير للقلق العام في نيجيريا. لم يتم توضيح ديناميكيات العدوى للمرض بشكل جيد في نيجيريا. تم إجراء هذه الدراسة لوصف نمط العدوى ومعدل وفيات الحالات وانتشار فيروس لاسا (LASV) من 2017 إلى 2020. تم الحصول على بيانات وبائية أسبوعية عن فيروس لاسا من ديسمبر 2016 إلى سبتمبر 2020 من مركز نيجيريا لمكافحة الأمراض. تم احتساب عدد الحالات المؤكدة والوفيات حسب الأشهر والولايات. تم إجراء إحصائيات وصفية وتم حساب معدل وفيات الحالات. تم إجراء خرائط توزيع وانتشار LF على مدى فترة السنوات الأربع على ArcMap 10.7. تم الإبلاغ عن ما مجموعه 2787 حالة مؤكدة و 516 حالة وفاة في نيجيريا من ديسمبر 2016 إلى سبتمبر 2020. ولوحظت زيادة في عدد الحالات والوفيات مع 298 و 528 و 796 و 1165 حالة مؤكدة و 79 و 125 و 158 و 158 حالة وفاة في 2017 و 2018 و 2019 و 2020 على التوالي. تم الإبلاغ عن أكثر من 60 ٪ من الحالات في ولايتين، ولايتي إيدو وأوندو. انتشرت حالات LF من 19 ولاية في عام 2017 إلى 32 ولاية وإقليم العاصمة الفيدرالية (FCT) في عام 2020. كانت ولاية أوندو (25.39 ٪) لديها أعلى معدل وفيات من LF على مدى السنوات الأربع. كان معدل وفيات الحالات (CFR) من LF أعلى في عام 2017 (26.5 ٪) مع CFR من 23.7 و 19.6 و 13.4 ٪ في 2018 و 2019 و 2020 على التوالي. كانت ذروة العدوى في شهر فبراير لمدة أربع سنوات. تزداد العدوى في بداية موسم الجفاف في نوفمبر وتنخفض حتى أبريل عندما يبدأ موسم الأمطار. هناك زيادة سنوية في عدد عدوى LASV في جميع أنحاء الولايات في نيجيريا. هناك حاجة إلى زيادة استراتيجيات المكافحة من خلال استخدام نهج متكامل، بدءًا من مكافحة ناقلات الأمراض والتثقيف الصحي والتشخيص المبكر.

Translated Description (French)

La fièvre de Lassa (FL) est une maladie infectieuse zoonotique d'intérêt public au Nigéria. La dynamique infectieuse de la maladie n'est pas bien élucidée au Nigeria. Cette étude a été réalisée pour décrire le schéma d'infection, le taux de létalité et la propagation du virus de la lassa (LASV) de 2017 à 2020. Les données épidémiologiques hebdomadaires sur le LF de décembre 2016 à septembre 2020 ont été obtenues auprès du Centre nigérian de contrôle des maladies. Le nombre de cas confirmés et de décès a été calculé en fonction des mois et des états. Des statistiques descriptives ont été effectuées et le taux de létalité a été calculé. Des cartes de distribution et de diffusion de LF sur la période de quatre ans ont été réalisées sur ArcMap 10.7. Un total de 2 787 cas confirmés et 516 décès ont été signalés au Nigéria de décembre 2016 à septembre 2020. Une augmentation du nombre de cas et de décès a été observée avec 298, 528, 796 et 1165 cas confirmés et 79, 125, 158 et 158 décès en 2017, 2018, 2019 et 2020 respectivement. Plus de 60 % des cas ont été signalés dans deux États, les États d'Edo et d'Ondo. Les cas de LF se sont étendus de 19 États en 2017 à 32 États et Territoire de la capitale fédérale (FCT) en 2020. L'État d'Ondo (25,39 %) a enregistré le taux de décès le plus élevé de LF au cours des quatre années. Le taux de létalité (CFR) de LF était le plus élevé en 2017 (26,5%) avec des CFR de 23,7%, 19,6% et 13,4% en 2018, 2019 et 2020 respectivement. Le pic d'infection était au mois de février pour les quatre années. Les infections augmentent au début de la saison sèche en novembre et diminuent jusqu'en avril, lorsque la saison humide s'installe. Il y a une augmentation annuelle du nombre d'infections par le LASV dans les États du Nigéria. Il est nécessaire de renforcer les stratégies de lutte grâce à l'utilisation d'une approche intégrée, allant de la lutte antivectorielle à l'éducation à la santé et au diagnostic précoce.

Translated Description (Spanish)

La fiebre de Lassa (FL) es una enfermedad infecciosa zoonótica de interés público en Nigeria. La dinámica de infección de la enfermedad no está bien dilucidada en Nigeria. Este estudio se llevó a cabo para describir el patrón de infección, la tasa de letalidad y la propagación del virus lassa (LASV) de 2017 a 2020. Los datos epidemiológicos semanales sobre LF de diciembre de 2016 a septiembre de 2020 se obtuvieron del Centro de Control de Enfermedades de Nigeria. El número de casos confirmados y muertes se calculó de acuerdo con los meses y los estados. Se realizaron estadísticas descriptivas y se calculó la tasa de letalidad. Se realizaron mapas de distribución y propagación de LF durante el período de cuatro años en ArcMap 10.7. Se informaron un total de 2787 casos confirmados y 516 muertes en Nigeria desde diciembre de 2016 hasta septiembre de 2020. Se observó un aumento en el número de casos y muertes con 298, 528, 796 y 1165 casos confirmados y 79, 125, 158 y 158 muertes en 2017, 2018, 2019 y 2020, respectivamente. Más del 60% de los casos se notificaron en dos estados, Edo y Ondo. Los casos de FL se extendieron de 19 estados en 2017 a 32 estados y Territorio de la Capital Federal (FCT) en 2020. El estado de Ondo (25.39%) tuvo la tasa más alta de muertes por LF durante los cuatro años. La tasa de letalidad (CFR) de LF fue más alta en 2017 (26.5%) con un CFR de 23.7, 19.6 y 13.4% en 2018, 2019 y 2020, respectivamente. El pico de infección fue en el mes de febrero para los cuatro años. Las infecciones aumentan al inicio de la estación seca en noviembre y disminuyen hasta abril, cuando comienza la estación húmeda. Hay un aumento anual en el número de infecciones por LASV en los estados de Nigeria. Es necesario aumentar las estrategias de control mediante el uso de un enfoque integrado, que va desde el control de vectores, la educación sanitaria y el diagnóstico precoz.

Files

s12879-021-05837-x.pdf

Files (1.7 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:e20990f1a20f9df528b3d04a4355e11b
1.7 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
نمط العدوى ومعدل وفيات الحالات وانتشار فيروس لاسا في نيجيريا
Translated title (French)
Modèle d'infection, taux de létalité et propagation du virus Lassa au Nigeria
Translated title (Spanish)
Patrón de infección, tasa de letalidad y propagación del virus de Lassa en Nigeria

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3126751000
DOI
10.1186/s12879-021-05837-x

Is supplement to
https://openalex.org/W4390642797 (Other)
https://openalex.org/W4309650692 (Other)
https://openalex.org/W4307267518 (Other)
https://openalex.org/W4297093478 (Other)
https://openalex.org/W3025738797 (Other)
https://openalex.org/W3009247298 (Other)
https://openalex.org/W2410015507 (Other)
https://openalex.org/W2352680682 (Other)
https://openalex.org/W1991423126 (Other)
https://openalex.org/W1543288877 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Egypt

References

  • https://openalex.org/W1490761673
  • https://openalex.org/W1509033271
  • https://openalex.org/W1543288877
  • https://openalex.org/W1796364838
  • https://openalex.org/W1969471958
  • https://openalex.org/W1997390903
  • https://openalex.org/W204357441
  • https://openalex.org/W2091097405
  • https://openalex.org/W2097308926
  • https://openalex.org/W2101067096
  • https://openalex.org/W2103685216
  • https://openalex.org/W2154652945
  • https://openalex.org/W2168996312
  • https://openalex.org/W2176968845
  • https://openalex.org/W2346888305
  • https://openalex.org/W2561826398
  • https://openalex.org/W2596328231
  • https://openalex.org/W2636610941
  • https://openalex.org/W2747940373
  • https://openalex.org/W2883320691
  • https://openalex.org/W2899751295
  • https://openalex.org/W2952736192
  • https://openalex.org/W2999657666
  • https://openalex.org/W3005548329
  • https://openalex.org/W3010807659
  • https://openalex.org/W3034471633
  • https://openalex.org/W3093217960