Published May 26, 2017 | Version v1
Publication Open

Sex-specific effect of CPB2 Ala147Thr but not Thr325Ile variants on the risk of venous thrombosis: A comprehensive meta-analysis

Creators

  • 1. Public Health Ontario
  • 2. University of Toronto
  • 3. Autonomous University of Queretaro
  • 4. Universidad Nacional Autónoma de México
  • 5. Aix-Marseille University
  • 6. Nutrition Obesity & Risk of Thrombosis
  • 7. Inserm
  • 8. Sorbonne Université

Description

Thrombin activatable fibrinolysis inhibitor (TAFI), encoded by the Carboxypeptidase B2 gene (CPB2), is an inhibitor of fibrinolysis and plays a role in the pathogenesis of venous thrombosis. Experimental findings support a functional role of genetic variants in CPB2, while epidemiological studies have been unable to confirm associations with risk of venous thrombosis. Sex-specific effects could underlie the observed inconsistent associations between CPB2 genetic variants and venous thrombosis.A comprehensive literature search was conducted for associations between Ala147Thr and Thr325Ile variants with venous thrombosis. Authors were contacted to provide sex-specific genotype counts from their studies. Combined and sex-specific random effects meta-analyses were used to estimate a pooled effect estimate for primary and secondary genetic models.A total of 17 studies met the inclusion criteria. A sex-specific meta-analysis applying a dominant model supported a protective effect of Ala147Thr on venous thrombosis in females (OR = 0.81, 95%CI: 0.68,0.97; p = 0.018), but not in males (OR = 1.06, 95%CI:0.96-1.16; p = 0.263). The Thr325Ile did not show a sex-specific effect but showed variation in allele frequencies by geographic region. A subgroup analysis of studies in European countries showed decreased risk, with a recessive model (OR = 0.83, 95%CI:0.71-0.97, p = 0.021) for venous thrombosis.A comprehensive literature review, including unpublished data, provided greater statistical power for the analyses and decreased the likelihood of publication bias influencing the results. Sex-specific analyses explained apparent discrepancies across genetic studies of Ala147Thr and venous thrombosis. While, careful selection of genetic models based on population genetics, evolutionary and biological knowledge can increase power by decreasing the need to adjust for testing multiple models.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

مثبط انحلال الفيبرين القابل للتنشيط بالثرومبين (TAFI)، المشفر بواسطة جين Carboxypeptidase B2 (CPB2)، هو مثبط لتحلل الفيبرين ويلعب دورًا في التسبب في تجلط الدم الوريدي. تدعم النتائج التجريبية الدور الوظيفي للمتغيرات الوراثية في CPB2، في حين أن الدراسات الوبائية لم تتمكن من تأكيد الارتباطات مع خطر التجلط الوريدي. يمكن أن تكمن التأثيرات الخاصة بالجنس في الارتباطات غير المتسقة الملحوظة بين المتغيرات الجينية لـ CPB2 والتخثر الوريدي. تم إجراء بحث شامل في الأدبيات عن الارتباطات بين متغيرات Ala147Thr و Thr325Ile مع التخثر الوريدي. تم الاتصال بالمؤلفين لتقديم تعداد النمط الجيني الخاص بالجنس من دراساتهم. تم استخدام التحليلات التلوية للآثار العشوائية المجمعة والمحددة حسب الجنس لتقدير تقدير التأثير المجمع للنماذج الوراثية الأولية والثانوية. استوفت 17 دراسة إجمالاً معايير الإدراج. دعم التحليل التلوي الخاص بالجنس الذي يطبق نموذجًا سائدًا تأثيرًا وقائيًا لـ Ala147Thr على التخثر الوريدي عند الإناث (OR = 0.81، 95 ٪CI: 0.68،0.97 ؛ p = 0.018)، ولكن ليس عند الذكور (OR = 1.06، 95 ٪CI:0.96-1.16 ؛ p = 0.263). لم يظهر Thr325Ile تأثيرًا محددًا للجنس ولكنه أظهر تباينًا في ترددات الأليل حسب المنطقة الجغرافية. أظهر تحليل مجموعة فرعية من الدراسات في البلدان الأوروبية انخفاض المخاطر، مع نموذج متنحي (OR = 0.83، 95 ٪CI:0.71-0.97، p = 0.021) للتخثر الوريدي. قدمت مراجعة شاملة للأدبيات، بما في ذلك البيانات غير المنشورة، قوة إحصائية أكبر للتحليلات وقللت من احتمال تأثير تحيز النشر على النتائج. أوضحت التحليلات الخاصة بالجنس التناقضات الواضحة عبر الدراسات الجينية لـ Ala147Thr والتخثر الوريدي. في حين أن الاختيار الدقيق للنماذج الجينية القائمة على علم الوراثة السكانية، فإن المعرفة التطورية والبيولوجية يمكن أن تزيد من القوة عن طريق تقليل الحاجة إلى التكيف لاختبار نماذج متعددة.

Translated Description (French)

L'inhibiteur de la fibrinolyse activable par la thrombine (TAFI), codé par le gène de la carboxypeptidase B2 (CPB2), est un inhibiteur de la fibrinolyse et joue un rôle dans la pathogenèse de la thrombose veineuse. Les résultats expérimentaux confirment le rôle fonctionnel des variants génétiques dans le CPB2, tandis que les études épidémiologiques n'ont pas été en mesure de confirmer les associations avec le risque de thrombose veineuse. Des effets spécifiques au sexe pourraient sous-tendre les associations incohérentes observées entre les variants génétiques CPB2 et la thrombose veineuse. Une recherche documentaire complète a été menée pour les associations entre les variants Ala147Thr et Thr325Ile avec la thrombose veineuse. Les auteurs ont été contactés pour fournir des dénombrements génotypiques spécifiques au sexe à partir de leurs études. Des méta-analyses combinées et des méta-analyses des effets aléatoires spécifiques au sexe ont été utilisées pour estimer une estimation des effets regroupés pour les modèles génétiques primaires et secondaires. Au total, 17 études répondaient aux critères d'inclusion. Une méta-analyse spécifique au sexe appliquant un modèle dominant a confirmé un effet protecteur de l'Ala147Thr sur la thrombose veineuse chez les femmes (RC = 0,81, IC à 95 % : 0,68,0,97 ; p = 0,018), mais pas chez les hommes (RC = 1,06, IC à 95 % : 0,96-1,16 ; p = 0,263). Le Thr325Ile n'a pas montré d'effet spécifique au sexe, mais a montré une variation des fréquences des allèles par région géographique. Une analyse en sous-groupe des études menées dans les pays européens a montré une diminution du risque, avec un modèle récessif (RC = 0,83, IC à 95 % :0,71-0,97, p = 0,021) pour la thrombose veineuse. Une revue complète de la littérature, comprenant des données non publiées, a fourni une plus grande puissance statistique pour les analyses et a diminué la probabilité de biais de publication influençant les résultats. Des analyses spécifiques au sexe ont expliqué les divergences apparentes entre les études génétiques de l'Ala147Thr et de la thrombose veineuse. Bien qu'une sélection minutieuse des modèles génétiques basée sur la génétique des populations, les connaissances évolutives et biologiques puissent augmenter la puissance en diminuant le besoin de s'adapter pour tester plusieurs modèles.

Translated Description (Spanish)

El inhibidor de la fibrinólisis activable por trombina (TAFI), codificado por el gen de la carboxipeptidasa B2 (CPB2), es un inhibidor de la fibrinólisis y desempeña un papel en la patogénesis de la trombosis venosa. Los hallazgos experimentales apoyan un papel funcional de las variantes genéticas en CPB2, mientras que los estudios epidemiológicos no han podido confirmar las asociaciones con el riesgo de trombosis venosa. Los efectos específicos del sexo podrían ser la base de las asociaciones inconsistentes observadas entre las variantes genéticas de CPB2 y la trombosis venosa. Se realizó una búsqueda bibliográfica exhaustiva de asociaciones entre las variantes Ala147Thr y Thr325Ile con la trombosis venosa. Se contactó a los autores para proporcionar recuentos de genotipos específicos por sexo de sus estudios. Se utilizaron metanálisis de efectos aleatorios combinados y específicos del sexo para estimar una estimación del efecto combinado para modelos genéticos primarios y secundarios. Un total de 17 estudios cumplieron con los criterios de inclusión. Un metanálisis específico del sexo que aplica un modelo dominante respaldó un efecto protector de Ala147Thr sobre la trombosis venosa en mujeres (OR = 0.81, IC del 95%: 0.68,0.97; p = 0.018), pero no en hombres (OR = 1.06, IC del 95%:0.96-1.16; p = 0.263). El Thr325Ile no mostró un efecto específico del sexo, pero mostró variación en las frecuencias alélicas por región geográfica. Un análisis de subgrupos de estudios en países europeos mostró una disminución del riesgo, con un modelo recesivo (OR = 0,83; IC del 95%:0,71-0,97, p = 0,021) para la trombosis venosa. Una revisión exhaustiva de la literatura, que incluyó datos no publicados, proporcionó un mayor poder estadístico para los análisis y disminuyó la probabilidad de que el sesgo de publicación influyera en los resultados. Los análisis específicos del sexo explicaron las discrepancias aparentes entre los estudios genéticos de Ala147Thr y la trombosis venosa. Si bien, la selección cuidadosa de modelos genéticos basados en la genética de poblaciones, el conocimiento evolutivo y biológico puede aumentar el poder al disminuir la necesidad de ajustar para probar múltiples modelos.

Files

journal.pone.0177768&type=printable.pdf

Files (2.5 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:3cfc057daa0394a151cec99a8874deb7
2.5 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التأثير الخاص بالجنس لـ CPB2 Ala147Thr ولكن ليس Thr325Ile المتغيرات على خطر التخثر الوريدي: تحليل تلوي شامل
Translated title (French)
Effet spécifique au sexe des variants CPB2 Ala147Thr mais pas Thr325Ile sur le risque de thrombose veineuse : une méta-analyse complète
Translated title (Spanish)
Efecto específico del sexo de las variantes CPB2 Ala147Thr pero no Thr325Ile sobre el riesgo de trombosis venosa: un metanálisis exhaustivo

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2618797115
DOI
10.1371/journal.pone.0177768

Is supplement to
https://openalex.org/W4234231270 (Other)
https://openalex.org/W3032376627 (Other)
https://openalex.org/W2793530176 (Other)
https://openalex.org/W2608516093 (Other)
https://openalex.org/W2417862918 (Other)
https://openalex.org/W2403061077 (Other)
https://openalex.org/W2327171547 (Other)
https://openalex.org/W2059299277 (Other)
https://openalex.org/W2046196800 (Other)
https://openalex.org/W2020874295 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Mexico

References

  • https://openalex.org/W1505789768
  • https://openalex.org/W1535834464
  • https://openalex.org/W1873239260
  • https://openalex.org/W1953931483
  • https://openalex.org/W1972264702
  • https://openalex.org/W1974604334
  • https://openalex.org/W1981283096
  • https://openalex.org/W1982858164
  • https://openalex.org/W1984039558
  • https://openalex.org/W1984325642
  • https://openalex.org/W1985919789
  • https://openalex.org/W1990847000
  • https://openalex.org/W1998418011
  • https://openalex.org/W1999117122
  • https://openalex.org/W2000267168
  • https://openalex.org/W2000840812
  • https://openalex.org/W2002792164
  • https://openalex.org/W2017491191
  • https://openalex.org/W2031765790
  • https://openalex.org/W2036955380
  • https://openalex.org/W2037411309
  • https://openalex.org/W2038723412
  • https://openalex.org/W2038728613
  • https://openalex.org/W2047739861
  • https://openalex.org/W2048068126
  • https://openalex.org/W2048531341
  • https://openalex.org/W2050736179
  • https://openalex.org/W2052620157
  • https://openalex.org/W2054455790
  • https://openalex.org/W2060836090
  • https://openalex.org/W2064987448
  • https://openalex.org/W2066822578
  • https://openalex.org/W2069436323
  • https://openalex.org/W2072026981
  • https://openalex.org/W2072856207
  • https://openalex.org/W2073273161
  • https://openalex.org/W2077421021
  • https://openalex.org/W2079175463
  • https://openalex.org/W2079337300
  • https://openalex.org/W2080218780
  • https://openalex.org/W2080681594
  • https://openalex.org/W2081704195
  • https://openalex.org/W2095083583
  • https://openalex.org/W2103616816
  • https://openalex.org/W2106093405
  • https://openalex.org/W2107137688
  • https://openalex.org/W2110272557
  • https://openalex.org/W2118399490
  • https://openalex.org/W2125435699
  • https://openalex.org/W2128201302
  • https://openalex.org/W2130371279
  • https://openalex.org/W2132797437
  • https://openalex.org/W2133272697
  • https://openalex.org/W2133640678
  • https://openalex.org/W2133926184
  • https://openalex.org/W2145589150
  • https://openalex.org/W2148430299
  • https://openalex.org/W2152298518
  • https://openalex.org/W2155132414
  • https://openalex.org/W2158808702
  • https://openalex.org/W2232646685
  • https://openalex.org/W2253116942
  • https://openalex.org/W2271253236
  • https://openalex.org/W2314999790
  • https://openalex.org/W2412255887
  • https://openalex.org/W2412293557
  • https://openalex.org/W2422951578
  • https://openalex.org/W4239540578
  • https://openalex.org/W4252461539
  • https://openalex.org/W619877173