Published September 5, 2018 | Version v1
Publication Open

DNA barcoding of Malaysian commercial snapper reveals an unrecognized species of the yellow-lined Lutjanus (Pisces:Lutjanidae)

  • 1. Universiti Sains Malaysia
  • 2. Sultan Idris Education University
  • 3. Universiti Malaysia Terengganu
  • 4. National Taiwan University

Description

Management of wild fisheries resources requires accurate knowledge on which species are being routinely exploited, but it can be hard to identify fishes to species level, especially in speciose fish groups where colour patterns vary with age. Snappers of the genus Lutjanus represent one such group, where fishes can be hard to identify and as a result fisheries statistics fail to capture species-level taxonomic information. This study employs traditional morphological and DNA barcoding approaches to identify adult and juvenile Lutjanus species harvested in Malaysian waters. Our results reveal a suite of species that differs markedly from those that have previously been considered important in the Malaysian wild-capture fishery and show that official fisheries statistics do not relate to exploitation at the species level. Furthermore, DNA barcoding uncovered two divergent groups of bigeye snapper ('Lutjanus lutjanus') distributed on either side of the Malay Peninsula, displaying a biogeographical pattern similar to distributions observed for many co-occurring reef-distributed fish groups. One of these bigeye snapper groups almost certainly represents an unrecognized species in need of taxonomic description. The study demonstrates the utility of DNA barcoding in uncovering overlooked diversity and for assessing species catch composition in a complicated but economically important taxonomic group.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تتطلب إدارة موارد مصايد الأسماك البرية معرفة دقيقة بالأنواع التي يتم استغلالها بشكل روتيني، ولكن قد يكون من الصعب تحديد الأسماك حسب مستوى الأنواع، خاصة في مجموعات الأسماك المحددة حيث تختلف أنماط الألوان مع تقدم العمر. يمثل النهاشون من جنس Lutjanus إحدى هذه المجموعات، حيث يصعب تحديد الأسماك ونتيجة لذلك تفشل إحصاءات مصايد الأسماك في التقاط المعلومات التصنيفية على مستوى الأنواع. تستخدم هذه الدراسة الأساليب التقليدية المورفولوجية وترميز الحمض النووي لتحديد أنواع اللوتجانوس البالغة واليافعة التي يتم حصادها في المياه الماليزية. تكشف نتائجنا عن مجموعة من الأنواع التي تختلف بشكل ملحوظ عن تلك التي كانت تعتبر في السابق مهمة في مصايد الأسماك البرية الماليزية وتظهر أن إحصاءات مصايد الأسماك الرسمية لا تتعلق بالاستغلال على مستوى الأنواع. علاوة على ذلك، كشف تشفير الحمض النووي عن مجموعتين متباعدتين من سمك النهاش الجاحظ (" Lutjanus lutjanus ") الموزعة على جانبي شبه جزيرة الملايو، والتي تعرض نمطًا جغرافيًا حيويًا مشابهًا للتوزيعات التي لوحظت للعديد من مجموعات الأسماك الموزعة على الشعاب المرجانية. من شبه المؤكد أن إحدى مجموعات سمك النهاش الجاحظ هذه تمثل نوعًا غير معترف به يحتاج إلى وصف تصنيفي. توضح الدراسة فائدة الترميز الشريطي للحمض النووي في الكشف عن التنوع الذي تم تجاهله وتقييم تكوين صيد الأنواع في مجموعة تصنيفية معقدة ولكنها مهمة اقتصاديًا.

Translated Description (French)

La gestion des ressources halieutiques sauvages nécessite des connaissances précises sur les espèces qui sont régulièrement exploitées, mais il peut être difficile d'identifier les poissons au niveau des espèces, en particulier dans les groupes de poissons particuliers où les modèles de couleur varient avec l'âge. Les vivaneaux du genre Lutjanus représentent l'un de ces groupes, où les poissons peuvent être difficiles à identifier et, par conséquent, les statistiques de la pêche ne parviennent pas à capturer les informations taxonomiques au niveau des espèces. Cette étude utilise des approches morphologiques et de codage à barres d'ADN traditionnelles pour identifier les espèces adultes et juvéniles de Lutjanus récoltées dans les eaux malaisiennes. Nos résultats révèlent une série d'espèces qui diffèrent nettement de celles qui étaient auparavant considérées comme importantes dans la pêche de capture sauvage en Malaisie et montrent que les statistiques officielles de la pêche ne se rapportent pas à l'exploitation au niveau des espèces. En outre, le codage à barres de l'ADN a révélé deux groupes divergents de vivaneaux à gros yeux (« Lutjanus lutjanus ») répartis de part et d'autre de la péninsule malaise, affichant un schéma biogéographique similaire aux distributions observées pour de nombreux groupes de poissons co-occurrents répartis sur les récifs. L'un de ces groupes de vivaneaux à gros yeux représente presque certainement une espèce non reconnue qui a besoin d'une description taxonomique. L'étude démontre l'utilité du codage à barres de l'ADN pour découvrir la diversité négligée et pour évaluer la composition des captures d'espèces dans un groupe taxonomique compliqué mais économiquement important.

Translated Description (Spanish)

La gestión de los recursos pesqueros silvestres requiere un conocimiento preciso sobre qué especies se explotan de forma rutinaria, pero puede ser difícil identificar peces a nivel de especie, especialmente en grupos de peces de especies donde los patrones de color varían con la edad. Los pargos del género Lutjanus representan uno de esos grupos, donde los peces pueden ser difíciles de identificar y, como resultado, las estadísticas de pesca no capturan información taxonómica a nivel de especie. Este estudio emplea enfoques tradicionales de códigos de barras morfológicos y de ADN para identificar especies adultas y juveniles de Lutjanus cosechadas en aguas de Malasia. Nuestros resultados revelan un conjunto de especies que difieren notablemente de las que anteriormente se consideraban importantes en la pesquería de captura silvestre de Malasia y muestran que las estadísticas oficiales de pesca no se relacionan con la explotación a nivel de especie. Además, el código de barras de ADN descubrió dos grupos divergentes de pargos patudos ('Lutjanus lutjanus') distribuidos a ambos lados de la península malaya, mostrando un patrón biogeográfico similar a las distribuciones observadas para muchos grupos de peces distribuidos en arrecifes. Uno de estos grupos de pargos patudos casi con certeza representa una especie no reconocida que necesita una descripción taxonómica. El estudio demuestra la utilidad de los códigos de barras de ADN para descubrir la diversidad pasada por alto y para evaluar la composición de las capturas de especies en un grupo taxonómico complicado pero económicamente importante.

Files

journal.pone.0202945&type=printable.pdf

Files (4.2 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:820ca8ddbf7212c761ba9d7cc6373f82
4.2 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
يكشف ترميز الحمض النووي لسمك النهاش التجاري الماليزي عن نوع غير معترف به من اللوتجانوس المبطن بالأصفر (الحوت:Lutjanidae)
Translated title (French)
Le codage à barres de l'ADN du vivaneau commercial malaisien révèle une espèce non reconnue du Lutjanus à lignes jaunes (Poissons :Lutjanidae)
Translated title (Spanish)
El código de barras de ADN del pargo comercial de Malasia revela una especie no reconocida del Lutjanus de líneas amarillas (Piscis:Lutjanidae)

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2890736058
DOI
10.1371/journal.pone.0202945

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Malaysia

References

  • https://openalex.org/W1979792267
  • https://openalex.org/W1982017863
  • https://openalex.org/W1996134740
  • https://openalex.org/W2004658669
  • https://openalex.org/W2029173860
  • https://openalex.org/W2065461553
  • https://openalex.org/W2070166530
  • https://openalex.org/W2075191094
  • https://openalex.org/W2099594485
  • https://openalex.org/W2099901798
  • https://openalex.org/W2101654334
  • https://openalex.org/W2118567458
  • https://openalex.org/W2127962326
  • https://openalex.org/W2128408957
  • https://openalex.org/W2136093307
  • https://openalex.org/W2147980521
  • https://openalex.org/W2152207030
  • https://openalex.org/W2154600713
  • https://openalex.org/W2162944460
  • https://openalex.org/W2170573703
  • https://openalex.org/W2171405751
  • https://openalex.org/W2175659807
  • https://openalex.org/W255798395
  • https://openalex.org/W3121953277
  • https://openalex.org/W3208313182
  • https://openalex.org/W4233864774
  • https://openalex.org/W4235139827
  • https://openalex.org/W4246954632
  • https://openalex.org/W4251751280
  • https://openalex.org/W4252619652