Published July 19, 2021 | Version v1
Publication Open

The Simple One-Step (SOS) Stool Processing Method for Use with the Xpert MTB/RIF Assay for a Child-Friendly Diagnosis of Tuberculosis Closer to the Point of Care

Creators

  • 1. TuBerculosis Vaccine Initiative
  • 2. Ethiopian Public Health Institute
  • 3. Maladies Infectieuses et Vecteurs: Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle
  • 4. University of Montpellier
  • 5. Institut de Recherche pour le Développement
  • 6. French National Centre for Scientific Research
  • 7. All Africa Leprosy Tuberculosis and Rehabilitation Training Centre
  • 8. Oromiyaa Regional Health Bureau
  • 9. Inserm
  • 10. Amsterdam Institute for Global Health and Development

Description

Young children cannot easily produce sputum for diagnosis of pulmonary tuberculosis (TB). Alternatively, Mycobacterium tuberculosis complex bacilli can be detected in stool by using the Xpert MTB/RIF (Ultra) assay (Xpert). Published stool processing methods contain somewhat complex procedures and require additional supplies. The aim of this study was to develop a simple one-step (SOS) stool processing method based on gravity sedimentation only, similar to Xpert testing of sputum samples, for the detection of M. tuberculosis in stool samples. We first assessed whether the SOS stool method could provide valid Xpert results without the need for bead-beating, dilution, and filtration steps. We concluded that this was the case, and we then validated the SOS stool method by testing spiked stool samples. By using the SOS stool method, 27 of the 29 spiked samples gave valid Xpert results, and M. tuberculosis was recovered from all 27 samples. The proof of principle of the SOS stool method was demonstrated in routine settings in Addis Ababa, Ethiopia. Nine of 123 children with presumptive TB had M. tuberculosis-positive results for nasogastric aspiration (NGA) samples, and 7 (77.8%) of those children also had M. tuberculosis-positive Xpert results for stool samples. Additionally, M. tuberculosis was detected in the stool samples but not the NGA samples from 2 children. The SOS stool processing method makes use of the standard Xpert assay kit, without the need for additional supplies or equipment. The method can potentially be rolled out to any Xpert site, bringing a bacteriologically confirmed diagnosis of TB in children closer to the point of care.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

لا يمكن للأطفال الصغار إنتاج البلغم بسهولة لتشخيص السل الرئوي. بدلاً من ذلك، يمكن اكتشاف عصيات السل المعقدة في البراز باستخدام اختبار Xpert MTB/RIF (Ultra) (Xpert). تحتوي طرق معالجة البراز المنشورة على إجراءات معقدة إلى حد ما وتتطلب إمدادات إضافية. كان الهدف من هذه الدراسة هو تطوير طريقة بسيطة لمعالجة البراز من خطوة واحدة (SOS) تعتمد على ترسيب الجاذبية فقط، على غرار اختبار إكسبرت لعينات البلغم، للكشف عن السل في عينات البراز. قمنا أولاً بتقييم ما إذا كانت طريقة البراز SOS يمكن أن توفر نتائج Xpert صالحة دون الحاجة إلى خطوات الضرب بالخرز والتخفيف والترشيح. خلصنا إلى أن هذا هو الحال، ثم تحققنا من صحة طريقة استغاثة البراز عن طريق اختبار عينات البراز المسننة. باستخدام طريقة SOS للبراز، أعطت 27 عينة من أصل 29 عينة مسننة نتائج Xpert صالحة، وتم استرداد M. السل من جميع العينات الـ 27. تم إثبات مبدأ طريقة البراز SOS في الإعدادات الروتينية في أديس أبابا، إثيوبيا. كان لدى تسعة من أصل 123 طفلاً مصابًا بالسل المفترض نتائج إيجابية لمرض السل لعينات الشفط الأنفي المعدي (NGA)، وكان لدى 7 (77.8 ٪) من هؤلاء الأطفال أيضًا نتائج M. Tuberosis - positive Xpert لعينات البراز. بالإضافة إلى ذلك، تم الكشف عن السل في عينات البراز ولكن ليس عينات الجيل التالي للجلوكوز من طفلين. تستخدم طريقة معالجة البراز SOS مجموعة اختبار Xpert القياسية، دون الحاجة إلى مستلزمات أو معدات إضافية. يمكن نشر هذه الطريقة في أي موقع من مواقع إكسبيرت، مما يجعل تشخيص السل لدى الأطفال مؤكدًا من الناحية البكتريولوجية بالقرب من نقطة الرعاية.

Translated Description (French)

Les jeunes enfants ne peuvent pas facilement produire des expectorations pour le diagnostic de la tuberculose pulmonaire (TB). Alternativement, les bacilles du complexe Mycobacterium tuberculosis peuvent être détectés dans les selles en utilisant le test Xpert MTB/RIF (Ultra) (Xpert). Les méthodes de traitement des selles publiées contiennent des procédures quelque peu complexes et nécessitent des fournitures supplémentaires. L'objectif de cette étude était de développer une méthode simple de traitement des selles en une étape (SOS) basée uniquement sur la sédimentation par gravité, similaire au test Xpert des échantillons d'expectorations, pour la détection de M. tuberculosis dans les échantillons de selles. Nous avons d'abord évalué si la méthode des selles SOS pouvait fournir des résultats Xpert valides sans avoir besoin d'étapes de battage de billes, de dilution et de filtration. Nous avons conclu que c'était le cas, puis nous avons validé la méthode des selles SOS en testant des échantillons de selles dopées. En utilisant la méthode des selles SOS, 27 des 29 échantillons enrichis ont donné des résultats Xpert valides, et M. tuberculosis a été récupéré à partir des 27 échantillons. La preuve de principe de la méthode des selles SOS a été démontrée dans des contextes de routine à Addis-Abeba, en Éthiopie. Neuf des 123 enfants atteints de tuberculose présumée ont obtenu des résultats positifs à M. tuberculosis pour les échantillons d'aspiration nasogastrique (NGA), et 7 (77,8 %) de ces enfants ont également obtenu des résultats positifs à M. tuberculosis Xpert pour les échantillons de selles. De plus, M. tuberculosis a été détecté dans les échantillons de selles, mais pas dans les échantillons de NGA de 2 enfants. La méthode de traitement des selles SOS utilise le kit de dosage standard Xpert, sans avoir besoin de fournitures ou d'équipements supplémentaires. La méthode peut potentiellement être déployée sur n'importe quel site Xpert, rapprochant ainsi le diagnostic bactériologiquement confirmé de la tuberculose chez les enfants du point de prise en charge.

Translated Description (Spanish)

Los niños pequeños no pueden producir fácilmente esputo para el diagnóstico de tuberculosis pulmonar (TB). Alternativamente, los bacilos complejos de Mycobacterium tuberculosis se pueden detectar en las heces utilizando el ensayo Xpert MTB/RIF (Ultra) (Xpert). Los métodos de procesamiento de heces publicados contienen procedimientos algo complejos y requieren suministros adicionales. El objetivo de este estudio fue desarrollar un método simple de procesamiento de heces en un solo paso (SOS) basado únicamente en la sedimentación por gravedad, similar a las pruebas Xpert de muestras de esputo, para la detección de M. tuberculosis en muestras de heces. Primero evaluamos si el método de heces SOS podría proporcionar resultados válidos de Xpert sin la necesidad de pasos de batido, dilución y filtración de perlas. Llegamos a la conclusión de que este era el caso, y luego validamos el método de heces SOS mediante la prueba de muestras de heces enriquecidas. Mediante el uso del método de heces SOS, 27 de las 29 muestras enriquecidas dieron resultados válidos de Xpert, y se recuperó M. tuberculosis de las 27 muestras. La prueba de principio del método de heces SOS se demostró en entornos de rutina en Addis Abeba, Etiopía. Nueve de 123 niños con presunta tuberculosis tuvieron resultados positivos para M. tuberculosis para muestras de aspiración nasogástrica (NGA), y 7 (77.8%) de esos niños también tuvieron resultados Xpert positivos para M. tuberculosis para muestras de heces. Además, se detectó M. tuberculosis en las muestras de heces, pero no en las muestras de NGA de 2 niños. El método de procesamiento de heces SOS utiliza el kit de ensayo estándar Xpert, sin la necesidad de suministros o equipos adicionales. El método puede implementarse potencialmente en cualquier sitio de Xpert, acercando un diagnóstico de TB confirmado bacteriológicamente en niños al punto de atención.

Files

document.pdf

Files (680.5 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:50f4ade66f007c9002cf7ae859acb451
680.5 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
طريقة معالجة البراز البسيطة ذات الخطوة الواحدة (SOS) للاستخدام مع اختبار Xpert MTB/RIF لتشخيص مرض السل الصديق للطفل بالقرب من نقطة الرعاية
Translated title (French)
La méthode simple de traitement des selles en une étape (SOS) à utiliser avec le test Xpert MTB/RIF pour un diagnostic de la tuberculose adapté aux enfants plus près du point de service
Translated title (Spanish)
El método simple de procesamiento de heces en un solo paso (SOS) para usar con el ensayo Xpert MTB/RIF para un diagnóstico de tuberculosis apto para niños más cerca del punto de atención

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3164565772
DOI
10.1128/jcm.00406-21

Is supplement to
https://openalex.org/W4386476392 (Other)
https://openalex.org/W4242231091 (Other)
https://openalex.org/W3025370270 (Other)
https://openalex.org/W2901541206 (Other)
https://openalex.org/W2414447321 (Other)
https://openalex.org/W2394233015 (Other)
https://openalex.org/W2377116771 (Other)
https://openalex.org/W2353572908 (Other)
https://openalex.org/W2292980301 (Other)
https://openalex.org/W1985084093 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Ethiopia

References

  • https://openalex.org/W1973207608
  • https://openalex.org/W2024030519
  • https://openalex.org/W2028750523
  • https://openalex.org/W2100130885
  • https://openalex.org/W2112022845
  • https://openalex.org/W2133477312
  • https://openalex.org/W2142915988
  • https://openalex.org/W2157972110
  • https://openalex.org/W2309926617
  • https://openalex.org/W2320004017
  • https://openalex.org/W2792512352
  • https://openalex.org/W2876388367
  • https://openalex.org/W2906375305
  • https://openalex.org/W2930734343
  • https://openalex.org/W2969952013
  • https://openalex.org/W2971646033
  • https://openalex.org/W2981765253
  • https://openalex.org/W3030570217
  • https://openalex.org/W3091472095
  • https://openalex.org/W4211169568