Published February 21, 2017
| Version v1
Publication
Open
Comparison of methods for identifying causative bacterial microorganisms in presumed acute endophthalmitis: conventional culture, blood culture, and PCR
- 1. King Chulalongkorn Memorial Hospital
- 2. Thai Red Cross Society
- 3. Chulalongkorn University
Description
Identification of bacterial pathogens in endophthalmitis is important to inform antibiotic selection and treatment decisions. Hemoculture bottles and polymerase chain reaction (PCR) analysis have been proposed to offer good detection sensitivity. This study compared the sensitivity and accuracy of a blood culture system, a PCR approach, and conventional culture methods for identification of causative bacteria in cases of acute endophthalmitis.Twenty-nine patients with a diagnosis of presumed acute bacterial endophthalmitis who underwent vitreous specimen collection at King Chulalongkorn Memorial Hospital were enrolled in this study. Forty-one specimens were collected. Each specimen was divided into three parts, and each part was analyzed using one of three microbial identification techniques: conventional plate culture, blood culture, and polymerase chain reaction and sequencing. The results of the three methods were then compared.Bacteria were identified in 15 of the 41 specimens (36.5%). Five (12.2%) specimens were positive by conventional culture methods, 11 (26.8%) were positive by hemoculture, and 11 (26.8%) were positive by PCR. Cohen's kappa analysis revealed p-values for conventional methods vs. hemoculture, conventional methods vs. PCR, and hemoculture vs. PCR of 0.057, 0.33, and 0.009, respectively. Higher detection rates of Enterococcus faecalis were observed for hemoculture and PCR than for conventional methods.Blood culture bottles and PCR detection may facilitate bacterial identification in cases of presumed acute endophthalmitis. These techniques should be used in addition to conventional plate culture methods because they provide a greater degree of sensitivity than conventional plate culture alone for the detection of specific microorganisms such as E. faecalis.Thai Clinical Trial Register No. TCTR20110000024 .
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
يعد تحديد مسببات الأمراض البكتيرية في التهاب باطن العين أمرًا مهمًا لإبلاغ اختيار المضادات الحيوية وقرارات العلاج. تم اقتراح زجاجات استزراع الدم وتحليل تفاعل سلسلة البلمرة (PCR) لتوفير حساسية جيدة للكشف. قارنت هذه الدراسة حساسية ودقة نظام استنبات الدم، ونهج تفاعل البوليميراز المتسلسل، وطرق الاستنبات التقليدية لتحديد البكتيريا المسببة في حالات التهاب باطن العين الحاد. تم تسجيل تسعة وعشرين مريضًا تم تشخيصهم بالتهاب باطن العين البكتيري الحاد المفترض الذين خضعوا لجمع العينات الزجاجية في مستشفى الملك شولالونغكورن التذكاري في هذه الدراسة. تم جمع 41 عينة. تم تقسيم كل عينة إلى ثلاثة أجزاء، وتم تحليل كل جزء باستخدام واحدة من ثلاث تقنيات لتحديد الهوية الميكروبية: زراعة الصفائح التقليدية، وزراعة الدم، وتفاعل سلسلة البلمرة وتسلسلها. ثم تمت مقارنة نتائج الطرق الثلاث. تم تحديد البكتيريا في 15 من 41 عينة (36.5 ٪). كانت خمس عينات (12.2 ٪) إيجابية من خلال طرق الزراعة التقليدية، و 11 عينة (26.8 ٪) إيجابية من خلال زراعة الدم، و 11 عينة (26.8 ٪) إيجابية من خلال تفاعل البوليميراز المتسلسل. كشف تحليل كوهين لكابا عن قيم p للطرق التقليدية مقابل زراعة الدم، والطرق التقليدية مقابل تفاعل البوليميراز المتسلسل، وزراعة الدم مقابل تفاعل البوليميراز المتسلسل عند 0.057 و 0.33 و 0.009 على التوالي. لوحظت معدلات اكتشاف أعلى للمكورات المعوية البرازية لزراعة الدم و تفاعل البوليميراز المتسلسل مقارنة بالطرق التقليدية. قد تسهل زجاجات زراعة الدم وكشف تفاعل البوليميراز المتسلسل التعرف على البكتيريا في حالات التهاب باطن العين الحاد المفترض. يجب استخدام هذه التقنيات بالإضافة إلى طرق زراعة الألواح التقليدية لأنها توفر درجة أكبر من الحساسية من زراعة الألواح التقليدية وحدها للكشف عن كائنات دقيقة محددة مثل E. faecalis.Thai سجل التجارب السريرية رقم TCTR20110000024 .Translated Description (French)
L'identification des agents pathogènes bactériens dans l'endophtalmie est importante pour éclairer la sélection des antibiotiques et les décisions de traitement. Les flacons d'hémoculture et l'analyse par réaction en chaîne de la polymérase (PCR) ont été proposés pour offrir une bonne sensibilité de détection. Cette étude a comparé la sensibilité et la précision d'un système d'hémoculture, d'une approche PCR et de méthodes de culture conventionnelles pour l'identification des bactéries responsables en cas d'endophtalmie aiguë. Vingt-neuf patients ayant reçu un diagnostic d'endophtalmie bactérienne aiguë présumée et ayant subi un prélèvement d'échantillon vitré au King Chulalongkorn Memorial Hospital ont été inclus dans cette étude. Quarante et un échantillons ont été prélevés. Chaque échantillon a été divisé en trois parties, et chaque partie a été analysée en utilisant l'une des trois techniques d'identification microbienne : culture sur plaque conventionnelle, hémoculture, réaction en chaîne par polymérase et séquençage. Les résultats des trois méthodes ont ensuite été comparés. Des bactéries ont été identifiées dans 15 des 41 échantillons (36,5 %). Cinq échantillons (12,2 %) étaient positifs par des méthodes de culture conventionnelles, 11 (26,8 %) étaient positifs par hémoculture et 11 (26,8 %) étaient positifs par PCR. L'analyse kappa de Cohen a révélé des valeurs p pour les méthodes conventionnelles par rapport à l'hémoculture, les méthodes conventionnelles par rapport à la PCR et l'hémoculture par rapport à la PCR de 0,057, 0,33 et 0,009, respectivement. Des taux de détection d'Enterococcus faecalis plus élevés ont été observés pour l'hémoculture et la PCR que pour les méthodes conventionnelles. Les flacons de culture de sang et la détection par PCR peuvent faciliter l'identification bactérienne en cas d'endophtalmie aiguë présumée. Ces techniques doivent être utilisées en plus des méthodes de culture en plaques conventionnelles car elles fournissent un degré de sensibilité plus élevé que la culture en plaques conventionnelle seule pour la détection de micro-organismes spécifiques tels que E. faecalis. Registre des essais cliniques thaïlandais n ° TCTR20110000024 .Translated Description (Spanish)
La identificación de patógenos bacterianos en la endoftalmitis es importante para informar la selección de antibióticos y las decisiones de tratamiento. Se han propuesto botellas de hemocultivo y análisis de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para ofrecer una buena sensibilidad de detección. Este estudio comparó la sensibilidad y precisión de un sistema de hemocultivo, un enfoque de PCR y métodos de cultivo convencionales para la identificación de bacterias causales en casos de endoftalmitis aguda. Veintinueve pacientes con un diagnóstico de presunta endoftalmitis bacteriana aguda que se sometieron a recolección de muestras vítreas en el King Chulalongkorn Memorial Hospital se inscribieron en este estudio. Se recogieron cuarenta y una muestras. Cada muestra se dividió en tres partes y cada parte se analizó utilizando una de las tres técnicas de identificación microbiana: cultivo en placa convencional, hemocultivo y reacción en cadena de la polimerasa y secuenciación. Luego se compararon los resultados de los tres métodos. Se identificaron bacterias en 15 de los 41 especímenes (36.5%). Cinco (12.2%) muestras fueron positivas por métodos de cultivo convencionales, 11 (26.8%) fueron positivas por hemocultivo y 11 (26.8%) fueron positivas por PCR. El análisis kappa de Cohen reveló valores p para métodos convencionales frente a hemocultivo, métodos convencionales frente a PCR y hemocultivo frente a PCR de 0,057, 0,33 y 0,009, respectivamente. Se observaron mayores tasas de detección de Enterococcus faecalis para el hemocultivo y la PCR que para los métodos convencionales. Los frascos de cultivo de sangre y la detección por PCR pueden facilitar la identificación bacteriana en casos de presunta endoftalmitis aguda. Estas técnicas deben usarse además de los métodos de cultivo en placa convencionales porque proporcionan un mayor grado de sensibilidad que el cultivo en placa convencional solo para la detección de microorganismos específicos como E. faecalis.Thai Registro de Ensayos Clínicos No. TCTR20110000024 .Files
s12879-017-2264-5.pdf
Files
(422.7 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:4dcf73853c8b69a99b43351cf36c71a7
|
422.7 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- مقارنة بين طرق تحديد الكائنات الحية الدقيقة البكتيرية المسببة في التهاب باطن العين الحاد المفترض: الثقافة التقليدية، وزراعة الدم، و تفاعل البوليميراز المتسلسل
- Translated title (French)
- Comparaison des méthodes d'identification des micro-organismes bactériens responsables dans l'endophtalmie aiguë présumée : culture conventionnelle, hémoculture et PCR
- Translated title (Spanish)
- Comparación de métodos para identificar microorganismos bacterianos causantes en presunta endoftalmitis aguda: cultivo convencional, hemocultivo y PCR
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2589316888
- DOI
- 10.1186/s12879-017-2264-5
References
- https://openalex.org/W1965994724
- https://openalex.org/W1973047984
- https://openalex.org/W1976812010
- https://openalex.org/W1989791219
- https://openalex.org/W1997104297
- https://openalex.org/W1997969082
- https://openalex.org/W2002223321
- https://openalex.org/W2016484956
- https://openalex.org/W2021096912
- https://openalex.org/W2028225267
- https://openalex.org/W2033379331
- https://openalex.org/W2035623302
- https://openalex.org/W2057576129
- https://openalex.org/W2058359573
- https://openalex.org/W2071294828
- https://openalex.org/W2074092251
- https://openalex.org/W2084820415
- https://openalex.org/W2087232296
- https://openalex.org/W2097529307
- https://openalex.org/W2098885386
- https://openalex.org/W2135607642
- https://openalex.org/W2143034879
- https://openalex.org/W2184475185
- https://openalex.org/W2387995621
- https://openalex.org/W4253875289
- https://openalex.org/W4299861055
- https://openalex.org/W4366067874
- https://openalex.org/W62207833