Published January 17, 2018 | Version v1
Publication Open

Human papillomavirus genotype distribution in cervical cancer biopsies from Nepalese women

Creators

  • 1. B.P. Koirala Memorial Cancer Hospital
  • 2. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud
  • 3. Tribhuvan University
  • 4. Government of Nepal
  • 5. Oregon State University

Description

Cervical cancer (CC) is the leading cause of morbidity and mortality from cancer in Nepalese women. Nearly all cases of CC are caused by infection with certain genotypes of human papillomavirus (HPV). Data on HPV genotype distribution in Nepalese CC patients is sparse. We aimed to determine the distribution of HPV genotypes in biopsies of CC tissue from Nepalese women. This study examined 248 archived paraffin-embedded tissue specimens from CC cases from patients of B.P. Koirala Memorial Cancer Hospital, Bharatpur, Chitwan, Nepal. DNA was extracted from the biopsies and HPV detection performed by PCR. HPV genotyping was then carried out by a reverse line hybridization technique capable of identifying 36 distinct HPV genotypes. Most of the samples were from tumors that had been designated by hospital pathologists as squamous cell carcinoma (77.6%). 165 of the 248 samples contained DNA of sufficient quality for rigorous PCR testing. All the analyzable specimens were positive for HPV. The most common HPV genotypes, in decreasing order of frequency were 16, 18, 45, 33, 52, 56 and 31; most were found as single infections (94.5%). Together, HPV types 16, 18, and 45 were found in 92% of the tumor samples. This study strengthens the knowledge-base of HPV genotype distribution in CC cases in Nepal. Hopefully, this information will be useful to the medical community and public health policy-makers in generating improved HPV-surveillance, −prevention and -treatment strategies in Nepal.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

سرطان عنق الرحم (CC) هو السبب الرئيسي للاعتلال والوفيات الناجمة عن السرطان لدى النساء النيباليات. تحدث جميع حالات CC تقريبًا بسبب الإصابة بأنماط وراثية معينة من فيروس الورم الحليمي البشري (HPV). البيانات المتعلقة بتوزيع النمط الوراثي لفيروس الورم الحليمي البشري في مرضى القماش الخرساني - CC النيباليين قليلة. كنا نهدف إلى تحديد توزيع الأنماط الجينية لفيروس الورم الحليمي البشري في خزعات نسيج القماش الخرساني - CC من النساء النيباليات. فحصت هذه الدراسة 248 عينة من الأنسجة المحفوظة المضمنة في البارافين من حالات CC من مرضى مستشفى بي بي كويرالا التذكاري للسرطان، بهاراتبور، شيتوان، نيبال. تم استخراج الحمض النووي من الخزعات واكتشاف فيروس الورم الحليمي البشري الذي تم إجراؤه بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل. ثم تم إجراء التنميط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري من خلال تقنية تهجين الخط العكسي القادرة على تحديد 36 نمطًا وراثيًا متميزًا لفيروس الورم الحليمي البشري. كانت معظم العينات من الأورام التي حددها أخصائيو علم الأمراض في المستشفيات على أنها سرطان الخلايا الحرشفية (77.6 ٪). 165 من 248 عينة تحتوي على الحمض النووي ذات الجودة الكافية لاختبار PCR الصارم. كانت جميع العينات القابلة للتحليل إيجابية لفيروس الورم الحليمي البشري. كانت الأنماط الجينية الأكثر شيوعًا لفيروس الورم الحليمي البشري، بترتيب تنازلي للتكرار هي 16 و 18 و 45 و 33 و 52 و 56 و 31 ؛ تم العثور على معظمها على أنها عدوى فردية (94.5 ٪). تم العثور على أنواع فيروس الورم الحليمي البشري 16 و 18 و 45 معًا في 92 ٪ من عينات الورم. تعزز هذه الدراسة قاعدة المعرفة لتوزيع النمط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري في حالات القشرة المخروطية في نيبال. نأمل أن تكون هذه المعلومات مفيدة للمجتمع الطبي وصانعي سياسات الصحة العامة في توليد استراتيجيات محسنة لمراقبة فيروس الورم الحليمي البشري والوقاية منه وعلاجه في نيبال.

Translated Description (French)

Le cancer du col de l'utérus (CC) est la principale cause de morbidité et de mortalité par cancer chez les femmes népalaises. Presque tous les cas de CC sont causés par une infection par certains génotypes du virus du papillome humain (VPH). Les données sur la distribution du génotype du VPH chez les patients népalais atteints de CC sont rares. Nous avons cherché à déterminer la distribution des génotypes du VPH dans les biopsies de tissus CC de femmes népalaises. Cette étude a examiné 248 échantillons de tissus archivés inclus en paraffine provenant de cas de CC de patients du B.P. Koirala Memorial Cancer Hospital, Bharatpur, Chitwan, Népal. L'ADN a été extrait des biopsies et la détection du VPH a été effectuée par PCR. Le génotypage HPV a ensuite été réalisé par une technique d'hybridation de lignée inverse capable d'identifier 36 génotypes HPV distincts. La plupart des échantillons provenaient de tumeurs qui avaient été désignées par les pathologistes hospitaliers comme étant un carcinome épidermoïde (77,6 %). 165 des 248 échantillons contenaient de l'ADN de qualité suffisante pour des tests PCR rigoureux. Tous les échantillons analysables étaient positifs pour le VPH. Les génotypes de VPH les plus courants, par ordre décroissant de fréquence, étaient 16, 18, 45, 33, 52, 56 et 31 ; la plupart ont été trouvés comme des infections uniques (94,5 %). Ensemble, les types 16, 18 et 45 du VPH ont été trouvés dans 92 % des échantillons de tumeur. Cette étude renforce la base de connaissances sur la distribution du génotype du VPH dans les cas de CC au Népal. Nous espérons que ces informations seront utiles à la communauté médicale et aux décideurs en matière de santé publique pour générer de meilleures stratégies de surveillance, de prévention et de traitement du VPH au Népal.

Translated Description (Spanish)

El cáncer de cuello uterino (CC) es la principal causa de morbilidad y mortalidad por cáncer en las mujeres nepalesas. Casi todos los casos de CC son causados por la infección con ciertos genotipos del virus del papiloma humano (VPH). Los datos sobre la distribución del genotipo del VPH en pacientes nepaleses con CC son escasos. Nuestro objetivo fue determinar la distribución de los genotipos del VPH en las biopsias de tejido CC de mujeres nepalesas. Este estudio examinó 248 muestras de tejido archivadas incluidas en parafina de casos de CC de pacientes del B.P. Koirala Memorial Cancer Hospital, Bharatpur, Chitwan, Nepal. El ADN se extrajo de las biopsias y la detección del VPH se realizó mediante PCR. El genotipado del VPH se llevó a cabo mediante una técnica de hibridación de línea inversa capaz de identificar 36 genotipos distintos del VPH. La mayoría de las muestras eran de tumores que habían sido designados por los patólogos del hospital como carcinoma de células escamosas (77.6%). 165 de las 248 muestras contenían ADN de calidad suficiente para pruebas rigurosas de PCR. Todas las muestras analizables fueron positivas para VPH. Los genotipos de VPH más comunes, en orden decreciente de frecuencia fueron 16, 18, 45, 33, 52, 56 y 31; la mayoría se encontraron como infecciones únicas (94,5%). Juntos, los tipos de VPH 16, 18 y 45 se encontraron en el 92% de las muestras tumorales. Este estudio fortalece la base de conocimiento de la distribución del genotipo del VPH en casos de CC en Nepal. Con suerte, esta información será útil para la comunidad médica y los responsables de las políticas de salud pública para generar mejores estrategias de vigilancia, prevención y tratamiento del VPH en Nepal.

Files

s13027-018-0176-7.pdf

Files (457.0 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:96aa92f1b2af747fde6eb745990b7eb4
457.0 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
توزيع النمط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري في خزعات سرطان عنق الرحم من النساء النيباليات
Translated title (French)
Répartition du génotype du virus du papillome humain dans les biopsies du cancer du col utérin chez les femmes népalaises
Translated title (Spanish)
Distribución del genotipo del virus del papiloma humano en biopsias de cáncer de cuello uterino de mujeres nepalesas

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2796421547
DOI
10.1186/s13027-018-0176-7

Is supplement to
https://openalex.org/W4214704267 (Other)
https://openalex.org/W2377081546 (Other)
https://openalex.org/W2371269840 (Other)
https://openalex.org/W2369938818 (Other)
https://openalex.org/W2369007717 (Other)
https://openalex.org/W2356390548 (Other)
https://openalex.org/W2351396057 (Other)
https://openalex.org/W2039338301 (Other)
https://openalex.org/W1987790506 (Other)
https://openalex.org/W1973897743 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Argentina

References

  • https://openalex.org/W1586776409
  • https://openalex.org/W1976051908
  • https://openalex.org/W1983551020
  • https://openalex.org/W1987350137
  • https://openalex.org/W2003294580
  • https://openalex.org/W2004767921
  • https://openalex.org/W2016782993
  • https://openalex.org/W2039745983
  • https://openalex.org/W2057137712
  • https://openalex.org/W2059109849
  • https://openalex.org/W2062378191
  • https://openalex.org/W2069143946
  • https://openalex.org/W2091307968
  • https://openalex.org/W2101196984
  • https://openalex.org/W2101758659
  • https://openalex.org/W2103680668
  • https://openalex.org/W2106787323
  • https://openalex.org/W2112859230
  • https://openalex.org/W2124781575
  • https://openalex.org/W2139736159
  • https://openalex.org/W2139738127
  • https://openalex.org/W2141641834
  • https://openalex.org/W2155071719
  • https://openalex.org/W2327814204
  • https://openalex.org/W2472375246
  • https://openalex.org/W2520386988
  • https://openalex.org/W2569542211
  • https://openalex.org/W2602115820
  • https://openalex.org/W2757798274
  • https://openalex.org/W4210779844