Published November 9, 2022 | Version v1
Publication Open

Molecular Characterization and the Antimicrobial Resistance Profile of Salmonella spp. Isolated from Ready-to-Eat Foods in Ouagadougou, Burkina Faso

Creators

  • 1. Université Joseph Ki-Zerbo
  • 2. Kamuzu Central Hospital

Description

The emergence of antimicrobial-resistantfood-borne bacteria is a great challenge to public health. This study was conducted to characterize and determine the resistance profile of Salmonella strains isolated from foods including sesames, ready-to-eat (RTE) salads, mango juices, and lettuce in Burkina Faso. One hundred and forty-eight biochemically identified Salmonella isolates were characterized by molecular amplification of Salmonella marker invA and spiC, misL, orfL, and pipD virulence genes. After that, all confirmed strains were examined for susceptibility to sixteen antimicrobials, and PCR amplifications were used to identify the following resistance genes: blaTEM, temA, temB, StrA, aadA, sul1, sul2, tet(A), and tet(B). One hundred and eight isolates were genetically confirmed as Salmonella spp. Virulence genes were observed in 57.4%, 55.6%, 49.1%, and 38% isolates for pipD, SpiC, misL, and orfL, respectively. Isolates have shown moderate resistance to gentamycin (26.8%), ampicillin (22.2%), cefoxitin (19.4%), and nalidixic acid (18.5%). All isolates were sensitive to six antibiotics, including cefotaxime, ceftazidime, aztreonam, imipenem, meropenem, and ciprofloxacin. Among the 66 isolates resistant to at least one antibiotic, 11 (16.7%) were multidrug resistant. The Multiple Antimicrobial Resistance (MAR) index of Salmonella serovars ranged from 0.06 to 0.53. PCR detected 7 resistance genes (tet(A), tet(B), blaTEM, temB, sul1, sul2, and aadA) in drug-resistant isolates. These findings raise serious concerns because ready-to-eat food in Burkina Faso could serve as a reservoir for spreading antimicrobial resistance genes worldwide.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

يمثل ظهور البكتيريا التي تنقلها مضادات الميكروبات تحدياً كبيراً للصحة العامة. أجريت هذه الدراسة لتوصيف وتحديد خصائص مقاومة سلالات السالمونيلا المعزولة عن الأطعمة بما في ذلك السمسم والسلطات الجاهزة للأكل (RTE) وعصائر المانجو والخس في بوركينا فاسو. اتسمت مائة وثمانية وأربعون عزلات السالمونيلا التي تم تحديدها كيميائيًا حيويًا بالتضخيم الجزيئي لجينات فوعة السالمونيلا INVA و SPIC و misL و orfL و pipD. بعد ذلك، تم فحص جميع السلالات المؤكدة للتعرض لستة عشر من مضادات الميكروبات، وتم استخدام تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل لتحديد جينات المقاومة التالية: blaTEM و temA و temB و StrA و aadA و sul1 و sul2 و tet(A) و tet(B). تم تأكيد مائة وثمانية عزلات وراثيًا على أنها أنواع السالمونيلا. لوحظت جينات الفوعة في 57.4 ٪ و 55.6 ٪ و 49.1 ٪ و 38 ٪ من العزلات لـ pipD و SpiC و misL و orfL، على التوالي. أظهرت المواد المعزولة مقاومة معتدلة للجنتاميسين (26.8 ٪)، والأمبيسلين (22.2 ٪)، والسيفوكسيتين (19.4 ٪)، وحمض الناليديكسيك (18.5 ٪). كانت جميع العزلات حساسة لستة مضادات حيوية، بما في ذلك سيفوتاكسيم، سيفتازيديم، أزتريونام، إيميبينيم، ميروبينيم، وسيبروفلوكساسين. من بين 66 عزلة مقاومة لمضاد حيوي واحد على الأقل، كانت 11 (16.7 ٪) مقاومة للأدوية المتعددة. تراوح مؤشر مقاومة مضادات الميكروبات المتعددة (MAR) لسالمونيلا سيروفارس من 0.06 إلى 0.53. اكتشف تفاعل البوليميراز المتسلسل 7 جينات مقاومة (tet(A) و tet(B) و blaTEM و temB و sul1 و sul2 و aadA) في عزلات مقاومة للأدوية. تثير هذه النتائج مخاوف جدية لأن الطعام الجاهز للأكل في بوركينا فاسو يمكن أن يكون بمثابة خزان لنشر جينات مقاومة مضادات الميكروبات في جميع أنحاء العالم.

Translated Description (French)

L'émergence de bactéries d'origine alimentaire résistantes aux antimicrobiens est un grand défi pour la santé publique. Cette étude a été menée pour caractériser et déterminer le profil de résistance des souches de Salmonella isolées à partir d'aliments tels que les sésames, les salades prêtes à manger (RTE), les jus de mangue et la laitue au Burkina Faso. Cent quarante-huit isolats de Salmonella identifiés biochimiquement ont été caractérisés par amplification moléculaire des gènes de virulence invA et spiC, misL, orfL et pipD du marqueur Salmonella. Après cela, toutes les souches confirmées ont été examinées pour déterminer leur sensibilité à seize antimicrobiens, et des amplifications par PCR ont été utilisées pour identifier les gènes de résistance suivants : blaTEM, temA, temB, StrA, aadA, sul1, sul2, tet(A) et tet(B). Cent huit isolats ont été génétiquement confirmés comme Salmonella spp. Des gènes de virulence ont été observés dans 57,4 %, 55,6 %, 49,1 % et 38 % des isolats de pipD, SpiC, misL et orfL, respectivement. Les isolats ont montré une résistance modérée à la gentamycine (26,8 %), à l'ampicilline (22,2 %), à la céfoxitine (19,4 %) et à l'acide nalidixique (18,5 %). Tous les isolats étaient sensibles à six antibiotiques, dont la céfotaxime, la ceftazidime, l'aztréonam, l'imipénème, le méropénème et la ciprofloxacine. Parmi les 66 isolats résistants à au moins un antibiotique, 11 (16,7 %) étaient multirésistants. L'indice de résistance aux antimicrobiens multiples (MAR) des sérovars de Salmonella variait de 0,06 à 0,53. La PCR a détecté 7 gènes de résistance (tet(A), tet(B), blaTEM, temB, sul1, sul2 et aadA) dans des isolats résistants aux médicaments. Ces résultats soulèvent de graves préoccupations car les aliments prêts-à-manger au Burkina Faso pourraient servir de réservoir pour la propagation des gènes de résistance aux antimicrobiens dans le monde entier.

Translated Description (Spanish)

La aparición de bacterias resistentes a los antimicrobianos transmitidas por los alimentos es un gran desafío para la salud pública. Este estudio se realizó para caracterizar y determinar el perfil de resistencia de las cepas de Salmonella aisladas de alimentos que incluyen sésamos, ensaladas listas para comer (RTE), zumos de mango y lechuga en Burkina Faso. Ciento cuarenta y ocho aislados de Salmonella identificados bioquímicamente se caracterizaron por la amplificación molecular del marcador de Salmonella invA y los genes de virulencia spiC, misL, orfL y pipD. Después de eso, todas las cepas confirmadas se examinaron para determinar la susceptibilidad a dieciséis antimicrobianos, y se utilizaron amplificaciones por PCR para identificar los siguientes genes de resistencia: blaTEM, temA, temB, StrA, aadA, sul1, sul2, tet(A) y tet(B). Ciento ocho aislados fueron genéticamente confirmados como Salmonella spp. Se observaron genes de virulencia en aislados del 57,4%, 55,6%, 49,1% y 38% para pipD, SpiC, misL y orfL, respectivamente. Los aislados han mostrado una resistencia moderada a la gentamicina (26.8%), ampicilina (22.2%), cefoxitina (19.4%) y ácido nalidíxico (18.5%). Todos los aislados fueron sensibles a seis antibióticos, incluidos cefotaxima, ceftazidima, aztreonam, imipenem, meropenem y ciprofloxacina. Entre los 66 aislados resistentes a al menos un antibiótico, 11 (16,7%) eran resistentes a múltiples fármacos. El índice de resistencia antimicrobiana múltiple (MAR) de los serovares de Salmonella osciló entre 0,06 y 0,53. La PCR detectó 7 genes de resistencia (tet(A), tet(B), blaTEM, temB, sul1, sul2 y aadA) en aislados resistentes a fármacos. Estos hallazgos plantean serias preocupaciones porque los alimentos listos para el consumo en Burkina Faso podrían servir como reservorio para la propagación de genes de resistencia a los antimicrobianos en todo el mundo.

Files

9640828.pdf.pdf

Files (15.9 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:464c639bfb519b49da16252fa3de2cf3
15.9 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التوصيف الجزيئي ومقاومة مضادات الميكروبات للسالمونيلا النيابة. معزولة عن الأطعمة الجاهزة للأكل في واغادوغو، بوركينا فاسو
Translated title (French)
Caractérisation moléculaire et profil de résistance aux antimicrobiens de Salmonella spp. Isolé à partir d'aliments prêts-à-manger à Ouagadougou, Burkina Faso
Translated title (Spanish)
Caracterización molecular y perfil de resistencia antimicrobiana de Salmonella spp. Aislado de los alimentos listos para el consumo en Uagadugú, Burkina Faso

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4308654756
DOI
10.1155/2022/9640828

Is supplement to
https://openalex.org/W325971691 (Other)
https://openalex.org/W3004577790 (Other)
https://openalex.org/W2976888286 (Other)
https://openalex.org/W2465833206 (Other)
https://openalex.org/W2418943397 (Other)
https://openalex.org/W2351680346 (Other)
https://openalex.org/W2351323778 (Other)
https://openalex.org/W1990438648 (Other)
https://openalex.org/W1987327841 (Other)
https://openalex.org/W1982183197 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Malawi

References

  • https://openalex.org/W1138162457
  • https://openalex.org/W1511624002
  • https://openalex.org/W1973487717
  • https://openalex.org/W2006562572
  • https://openalex.org/W2019786050
  • https://openalex.org/W2029298401
  • https://openalex.org/W2051253890
  • https://openalex.org/W2064683530
  • https://openalex.org/W2077994120
  • https://openalex.org/W2081360912
  • https://openalex.org/W2086223988
  • https://openalex.org/W2090390408
  • https://openalex.org/W2101523175
  • https://openalex.org/W2101997581
  • https://openalex.org/W2114213575
  • https://openalex.org/W2121695290
  • https://openalex.org/W2125512946
  • https://openalex.org/W2135173569
  • https://openalex.org/W2152428490
  • https://openalex.org/W2184405267
  • https://openalex.org/W2346991215
  • https://openalex.org/W2399133269
  • https://openalex.org/W2406202255
  • https://openalex.org/W2552936918
  • https://openalex.org/W2591143112
  • https://openalex.org/W2626328596
  • https://openalex.org/W2736250208
  • https://openalex.org/W2737055875
  • https://openalex.org/W2766249197
  • https://openalex.org/W2783873184
  • https://openalex.org/W2793921305
  • https://openalex.org/W2800674284
  • https://openalex.org/W2806955305
  • https://openalex.org/W2883667130
  • https://openalex.org/W2899797158
  • https://openalex.org/W2904168975
  • https://openalex.org/W2908182383
  • https://openalex.org/W2908977087
  • https://openalex.org/W2946682634
  • https://openalex.org/W2965279519
  • https://openalex.org/W2965381572
  • https://openalex.org/W2967842253
  • https://openalex.org/W2970426868
  • https://openalex.org/W3028512329
  • https://openalex.org/W3034983291
  • https://openalex.org/W3040966402
  • https://openalex.org/W3074318563
  • https://openalex.org/W3092374179
  • https://openalex.org/W3092588932
  • https://openalex.org/W3118821530
  • https://openalex.org/W3132114071
  • https://openalex.org/W3167104002
  • https://openalex.org/W3167397357
  • https://openalex.org/W3168147572
  • https://openalex.org/W3171437948
  • https://openalex.org/W4200254592
  • https://openalex.org/W4214866703