Published April 13, 2018 | Version v1
Publication Open

Population sensitivity of acute flaccid paralysis and environmental surveillance for serotype 1 poliovirus in Pakistan: an observational study

Creators

  • 1. Medical Research Council
  • 2. Imperial College London
  • 3. World Health Organization - Pakistan
  • 4. World Health Organization Regional Office for the Eastern Mediterranean
  • 5. National Institute of Health
  • 6. World Health Organization
  • 7. Ministry of National Health Services Regulation and Coordination

Description

To support poliomyelitis eradication in Pakistan, environmental surveillance (ES) of wastewater has been expanded alongside surveillance for acute flaccid paralysis (AFP). ES is a relatively new method of surveillance, and the population sensitivity of detecting poliovirus within endemic settings requires estimation. Data for wild serotype 1 poliovirus from AFP and ES from January 2011 to September 2015 from 14 districts in Pakistan were analysed using a multi-state model framework. This framework was used to estimate the sensitivity of poliovirus detection from each surveillance source and parameters such as the duration of infection within a community. The location and timing of poliomyelitis cases showed spatial and temporal variability. The sensitivity of AFP surveillance to detect serotype 1 poliovirus infection in a district and its neighbours per month was on average 30.0% (95% CI 24.8–35.8) and increased with the incidence of poliomyelitis cases. The average population sensitivity of a single environmental sample was 59.4% (95% CI 55.4–63.0), with significant variation in site-specific estimates (median varied from 33.3–79.2%). The combined population sensitivity of environmental and AFP surveillance in a given month was on average 98.1% (95% CI 97.2–98.7), assuming four samples per month for each site. ES can be a highly sensitive supplement to AFP surveillance in areas with converging sewage systems. As ES for poliovirus is expanded, it will be important to identify factors associated with variation in site sensitivity, leading to improved site selection and surveillance system performance.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ولدعم القضاء على شلل الأطفال في باكستان، تم توسيع نطاق المراقبة البيئية لمياه الصرف الصحي إلى جانب مراقبة الشلل الرخو الحاد. ES هي طريقة جديدة نسبيًا للمراقبة، وتتطلب الحساسية السكانية للكشف عن فيروس شلل الأطفال في البيئات المتوطنة تقديرًا. تم تحليل بيانات فيروس شلل الأطفال من النمط المصلي البري 1 من وكالة فرانس برس و ES من يناير 2011 إلى سبتمبر 2015 من 14 مقاطعة في باكستان باستخدام إطار نموذجي متعدد الدول. تم استخدام هذا الإطار لتقدير حساسية الكشف عن فيروس شلل الأطفال من كل مصدر ترصد ومعايير مثل مدة العدوى داخل المجتمع. أظهر موقع وتوقيت حالات شلل الأطفال تباينًا مكانيًا وزمانيًا. كانت حساسية ترصد AFP للكشف عن عدوى فيروس شلل الأطفال من النمط المصلي 1 في منطقة وجيرانها شهريًا في المتوسط 30.0 ٪ (95 ٪ CI 24.8-35.8) وزادت مع حدوث حالات شلل الأطفال. كان متوسط الحساسية السكانية لعينة بيئية واحدة 59.4 ٪ (95 ٪ CI 55.4-63.0)، مع تباين كبير في التقديرات الخاصة بالموقع (تراوح المتوسط من 33.3-79.2 ٪). كانت الحساسية السكانية المجمعة للمراقبة البيئية ومراقبة القوات المسلحة الفلبينية في شهر معين في المتوسط 98.1 ٪ (95 ٪ CI 97.2-98.7)، على افتراض أربع عينات شهريًا لكل موقع. يمكن أن تكون ES مكملًا حساسًا للغاية لمراقبة AFP في المناطق ذات أنظمة الصرف الصحي المتقاربة. مع توسع النشاط الجنسي لفيروس شلل الأطفال، سيكون من المهم تحديد العوامل المرتبطة بالتباين في حساسية الموقع، مما يؤدي إلى تحسين اختيار الموقع وأداء نظام المراقبة.

Translated Description (French)

Pour soutenir l'éradication de la poliomyélite au Pakistan, la surveillance environnementale (SE) des eaux usées a été étendue parallèlement à la surveillance de la paralysie flasque aiguë (PFA). L'ES est une méthode de surveillance relativement nouvelle, et la sensibilité de la population à la détection du poliovirus dans les contextes endémiques nécessite une estimation. Les données pour le poliovirus sauvage de sérotype 1 provenant de l'AFP et de l'ES de janvier 2011 à septembre 2015 provenant de 14 districts au Pakistan ont été analysées à l'aide d'un cadre de modèle multi-états. Ce cadre a été utilisé pour estimer la sensibilité de la détection du poliovirus à partir de chaque source de surveillance et de paramètres tels que la durée de l'infection au sein d'une communauté. La localisation et le calendrier des cas de poliomyélite ont montré une variabilité spatiale et temporelle. La sensibilité de la surveillance de la PFA pour détecter l'infection par le poliovirus de sérotype 1 dans un district et ses voisins par mois était en moyenne de 30,0 % (IC à 95 % 24,8-35,8) et augmentait avec l'incidence des cas de poliomyélite. La sensibilité moyenne de la population d'un seul échantillon environnemental était de 59,4 % (IC à 95 % 55,4-63,0), avec une variation significative des estimations spécifiques au site (médiane variant de 33,3-79,2 %). La sensibilité combinée de la population à la surveillance de l'environnement et de la PFA au cours d'un mois donné était en moyenne de 98,1 % (IC à 95 % 97,2-98,7), en supposant quatre échantillons par mois pour chaque site. ES peut être un complément très sensible à la surveillance AFP dans les zones avec des systèmes d'égouts convergents. À mesure que l'ES pour le poliovirus se développera, il sera important d'identifier les facteurs associés à la variation de la sensibilité du site, ce qui améliorera la sélection du site et les performances du système de surveillance.

Translated Description (Spanish)

Para apoyar la erradicación de la poliomielitis en Pakistán, se ha ampliado la vigilancia ambiental (ES) de las aguas residuales junto con la vigilancia de la parálisis flácida aguda (AFP). La ES es un método de vigilancia relativamente nuevo, y la sensibilidad de la población para detectar el poliovirus en entornos endémicos requiere una estimación. Los datos para el poliovirus serotipo 1 salvaje de AFP y ES de enero de 2011 a septiembre de 2015 de 14 distritos en Pakistán se analizaron utilizando un marco de modelo multiestatal. Este marco se utilizó para estimar la sensibilidad de la detección del poliovirus de cada fuente de vigilancia y parámetros como la duración de la infección dentro de una comunidad. La ubicación y el momento de los casos de poliomielitis mostraron variabilidad espacial y temporal. La sensibilidad de la vigilancia de AFP para detectar la infección por poliovirus de serotipo 1 en un distrito y sus vecinos por mes fue de media del 30,0% (IC del 95%: 24,8-35,8) y aumentó con la incidencia de casos de poliomielitis. La sensibilidad media de la población de una sola muestra ambiental fue del 59,4% (IC del 95%: 55,4-63,0), con una variación significativa en las estimaciones específicas del sitio (la mediana varió del 33,3 al 79,2%). La sensibilidad de la población combinada de la vigilancia ambiental y de AFP en un mes determinado fue en promedio del 98,1% (IC del 95% 97,2-98,7), suponiendo cuatro muestras por mes para cada sitio. El ES puede ser un complemento altamente sensible a la vigilancia de AFP en áreas con sistemas de alcantarillado convergentes. A medida que se amplíe el ES para el poliovirus, será importante identificar los factores asociados con la variación en la sensibilidad del sitio, lo que conducirá a una mejor selección del sitio y al rendimiento del sistema de vigilancia.

Files

s12879-018-3070-4.pdf

Files (1.7 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:ed46faf1e42fc9f8bd602e5b9924804b
1.7 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
الحساسية السكانية للشلل الرخو الحاد والمراقبة البيئية لفيروس شلل الأطفال من النمط المصلي 1 في باكستان: دراسة قائمة على الملاحظة
Translated title (French)
Sensibilité de la population à la paralysie flasque aiguë et surveillance environnementale du poliovirus de sérotype 1 au Pakistan : une étude observationnelle
Translated title (Spanish)
Sensibilidad poblacional de parálisis flácida aguda y vigilancia ambiental para poliovirus serotipo 1 en Pakistán: un estudio observacional

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2807605283
DOI
10.1186/s12879-018-3070-4

Is supplement to
https://openalex.org/W4302038248 (Other)
https://openalex.org/W4291284901 (Other)
https://openalex.org/W4234134603 (Other)
https://openalex.org/W2915647452 (Other)
https://openalex.org/W2412465237 (Other)
https://openalex.org/W2383231695 (Other)
https://openalex.org/W2280499299 (Other)
https://openalex.org/W2167550865 (Other)
https://openalex.org/W2118878184 (Other)
https://openalex.org/W2108539575 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Egypt

References

  • https://openalex.org/W1967687964
  • https://openalex.org/W1968591229
  • https://openalex.org/W2021603915
  • https://openalex.org/W2028211652
  • https://openalex.org/W2037110820
  • https://openalex.org/W2053989303
  • https://openalex.org/W2055020213
  • https://openalex.org/W2065093898
  • https://openalex.org/W2098538101
  • https://openalex.org/W2113826009
  • https://openalex.org/W2114738766
  • https://openalex.org/W2118477036
  • https://openalex.org/W2118858707
  • https://openalex.org/W2125488301
  • https://openalex.org/W2126076108
  • https://openalex.org/W2129428531
  • https://openalex.org/W2151618428
  • https://openalex.org/W2171567692
  • https://openalex.org/W2329193981
  • https://openalex.org/W2737153474
  • https://openalex.org/W4212908912