Published April 30, 2024 | Version v1
Publication Open

Streptococcus pneumoniae among the children of Aden, Yemen: a cross-sectional report of post-pneumococcal conjugate vaccine

  • 1. University of Aden
  • 2. Hadhramout University
  • 3. Lovely Professional University
  • 4. Robert Koch Institute

Description

Introduction: Streptococcus pneumoniae cause a significant global health challenge. We aimed to determine nasopharyngeal carriage, serotypes distribution, and antimicrobial profile of pneumococci among the children of Aden. Methodology: A total of 385 children, aged 2-17 years, were included. Asymptomatic samples were randomly collected from children in selected schools and vaccination centers. Symptomatic samples were obtained from selected pediatric clinics. The nasopharyngeal swabs were tested for pneumococci using culture and real time polymerase chain reaction (RT-PCR). Serotyping was done with a pneumotest-latex kit and antimicrobial susceptibility was tested by disc diffusion and Epsilometer test. Results: The total pneumococcal carriage was 44.4% and 57.1% by culture and RT-PCR, respectively. There was a statistically significant association between carriage rate and living in single room (OR = 7.9; p = 0.00001), sharing a sleeping space (OR = 15.1; p = 0.00001), and low monthly income (OR = 2.02; p = 0.007). The common serotypes were 19, 1, 4, 5, 2, and 23. The proportion of non-pneumococcal conjugate vaccine (non-PCV13) serotypes was 24%. Pneumococci were resistant to penicillin (96.5%), cefepime (15.8%), ceftriaxone (16.4%), and amoxicillin-clavulanate (0%). Erythromycin, azithromycin, and doxycycline had resistance rates of 48%, 31%, and 53.3%, respectively. Conclusions: A high pneumococcal carriage rate was observed in Yemeni children, particularly in low-income households and shared living conditions. There was significant penicillin resistance at meningitis breakpoint. Furthermore, non-PCV13 serotypes were gradually replacing PCV13 serotypes. The findings underscore the urgent need for enhanced surveillance and stewardship to improve vaccination and antibiotic policies in Yemen.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

مقدمة: تسبب العقدية الرئوية تحديًا صحيًا عالميًا كبيرًا. كنا نهدف إلى تحديد النقل الأنفي البلعومي، وتوزيع الأنماط المصلية، والملف المضاد للميكروبات للمكورات الرئوية بين أطفال عدن. المنهجية: تم تضمين ما مجموعه 385 طفلاً تتراوح أعمارهم بين 2 و 17 عامًا. تم جمع عينات بدون أعراض بشكل عشوائي من الأطفال في مدارس ومراكز تلقيح مختارة. تم الحصول على عينات أعراض من عيادات أطفال مختارة. تم اختبار مسحات البلعوم الأنفي للمكورات الرئوية باستخدام المزرعة وتفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي (RT - PCR). تم إجراء التنميط المصلي باستخدام مجموعة اختبار الرئة اللاتكس وتم اختبار الحساسية المضادة للميكروبات عن طريق انتشار القرص واختبار إبسيلوميتر. النتائج: بلغ إجمالي نقل المكورات الرئوية 44.4 ٪ و 57.1 ٪ حسب الثقافة و RT - PCR، على التوالي. كان هناك ارتباط ذو دلالة إحصائية بين معدل النقل والعيش في غرفة مفردة (OR = 7.9 ؛ p = 0.00001)، وتقاسم مساحة النوم (OR = 15.1 ؛ p = 0.00001)، وانخفاض الدخل الشهري (OR = 2.02 ؛ p = 0.007). كانت الأنماط المصلية الشائعة هي 19 و 1 و 4 و 5 و 2 و 23. بلغت نسبة الأنماط المصلية للقاح المتقارن غير المكورات الرئوية (غير PCV13) 24 ٪. كانت المكورات الرئوية مقاومة للبنسلين (96.5 ٪)، سيفيبيم (15.8 ٪)، سيفترياكسون (16.4 ٪)، وأموكسيسيلين كلافولانات (0 ٪). كانت معدلات مقاومة الإريثروميسين والأزيثروميسين والدوكسيسيكلين 48 ٪ و 31 ٪ و 53.3 ٪ على التوالي. الاستنتاجات: لوحظ ارتفاع معدل نقل المكورات الرئوية لدى الأطفال اليمنيين، لا سيما في الأسر ذات الدخل المنخفض والظروف المعيشية المشتركة. كانت هناك مقاومة كبيرة للبنسلين عند نقطة توقف التهاب السحايا. علاوة على ذلك، كانت الأنماط المصلية غير PCV13 تحل تدريجياً محل الأنماط المصلية PCV13. تؤكد النتائج على الحاجة الملحة لتعزيز المراقبة والإشراف لتحسين سياسات التطعيم والمضادات الحيوية في اليمن.

Translated Description (French)

Introduction : Streptococcus pneumoniae pose un problème de santé mondial important. Nous avons cherché à déterminer le portage nasopharyngé, la distribution des sérotypes et le profil antimicrobien des pneumocoques chez les enfants d'Aden. Méthodologie : Un total de 385 enfants, âgés de 2 à 17 ans, ont été inclus. Des échantillons asymptomatiques ont été prélevés au hasard chez des enfants dans des écoles et des centres de vaccination sélectionnés. Des échantillons symptomatiques ont été prélevés dans des cliniques pédiatriques sélectionnées. Les écouvillons nasopharyngés ont été testés pour les pneumocoques en utilisant la culture et la réaction en chaîne de la polymérase en temps réel (RT-PCR). Le sérotypage a été effectué avec un kit pneumotest-latex et la sensibilité aux antimicrobiens a été testée par diffusion discale et test Epsilomètre. Résultats : Le portage pneumococcique total était de 44,4% et 57,1% par culture et RT-PCR, respectivement. Il y avait une association statistiquement significative entre le taux de transport et la vie en chambre individuelle (OR = 7,9 ; p = 0,00001), le partage d'un espace de couchage (OR = 15,1 ; p = 0,00001) et un faible revenu mensuel (OR = 2,02 ; p = 0,007). Les sérotypes communs étaient 19, 1, 4, 5, 2 et 23. La proportion de sérotypes de vaccins conjugués non pneumococciques (non-PCV13) était de 24 %. Les pneumocoques étaient résistants à la pénicilline (96,5 %), au céfépime (15,8 %), à la ceftriaxone (16,4 %) et à l'amoxicilline-clavulanate (0 %). L'érythromycine, l'azithromycine et la doxycycline avaient des taux de résistance de 48 %, 31 % et 53,3 %, respectivement. Conclusions : Un taux élevé de portage du pneumocoque a été observé chez les enfants yéménites, en particulier dans les ménages à faible revenu et dans les conditions de vie partagées. Il y avait une résistance significative à la pénicilline au point de rupture de la méningite. De plus, les sérotypes non-PCV13 remplaçaient progressivement les sérotypes PCV13. Les résultats soulignent le besoin urgent d'une surveillance et d'une gestion renforcées pour améliorer les politiques de vaccination et d'antibiotiques au Yémen.

Translated Description (Spanish)

Introducción: Streptococcus pneumoniae causa un importante desafío para la salud mundial. Nuestro objetivo fue determinar el transporte nasofaríngeo, la distribución de los serotipos y el perfil antimicrobiano de los neumococos entre los niños de Adén. Metodología: Se incluyeron un total de 385 niños, de 2 a 17 años. Se recogieron aleatoriamente muestras asintomáticas de niños en escuelas y centros de vacunación seleccionados. Se obtuvieron muestras sintomáticas de clínicas pediátricas seleccionadas. Los hisopos nasofaríngeos se probaron para detectar neumococos utilizando cultivo y reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (RT-PCR). El serotipado se realizó con un kit de neumotest-látex y la susceptibilidad antimicrobiana se probó mediante difusión de disco y prueba de epsilómetro. Resultados: El porte neumocócico total fue de 44,4% y 57,1% por cultivo y RT-PCR, respectivamente. Hubo una asociación estadísticamente significativa entre la tasa de transporte y la vida en habitación individual (OR = 7.9; p = 0.00001), compartiendo un espacio para dormir (OR = 15.1; p = 0.00001) y bajos ingresos mensuales (OR = 2.02; p = 0.007). Los serotipos comunes fueron 19, 1, 4, 5, 2 y 23. La proporción de serotipos de vacuna conjugada no neumocócica (no PCV13) fue del 24%. Los neumococos fueron resistentes a la penicilina (96,5%), cefepima (15,8%), ceftriaxona (16,4%) y amoxicilina-clavulanato (0%). La eritromicina, la azitromicina y la doxiciclina tuvieron tasas de resistencia del 48%, 31% y 53,3%, respectivamente. Conclusiones: Se observó una alta tasa de transporte de neumococos en niños yemeníes, particularmente en hogares de bajos ingresos y condiciones de vida compartidas. Hubo una resistencia significativa a la penicilina en el punto de corte de la meningitis. Además, los serotipos no PCV13 fueron reemplazando gradualmente a los serotipos PCV13. Los hallazgos subrayan la necesidad urgente de mejorar la vigilancia y la administración para mejorar las políticas de vacunación y antibióticos en Yemen.

Files

3326.pdf

Files (247 Bytes)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:2ce13485b32a37f53f75e2948d7e6fad
247 Bytes
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
العقدية الرئوية بين أطفال عدن، اليمن: تقرير مقطعي عن لقاح ما بعد المكورات الرئوية المترافق
Translated title (French)
Streptococcus pneumoniae chez les enfants d'Aden, au Yémen : un rapport transversal sur le vaccin conjugué post-pneumococcique
Translated title (Spanish)
Streptococcus pneumoniae entre los niños de Adén, Yemen: un informe transversal de la vacuna conjugada posneumocócica

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4396812642
DOI
10.3855/jidc.18935

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Yemen