Published October 24, 2015 | Version v1
Publication Open

Hepatitis D virus and hepatitis B virus infection in Amerindian communities of the Amazonas state, Colombia

Creators

  • 1. Antioquia Institute of Technology
  • 2. Universidad de Antioquia
  • 3. Instituto Tecnológico Metropolitano
  • 4. Secretaría de Salud de Bogotá
  • 5. Instituto Nacional de Salud

Description

In Colombia, cases of Hepatitis D virus (HDV) infection have been officially described since 1985 mainly in Amerindian population from Sierra Nevada de Santa Marta (North Caribbean Coast), Uraba (North West), and Amazon (South East). The last official report of a clinical case of HDV infection in Colombia was registered in 2005. The aims of this study were to identify cases of HDV and/or Hepatitis B virus (HBV) infection in asymptomatic Amerindians from Amazonas state, South East Colombia, and to describe the circulating viral genotypes in this population. The study population was recruited in 19 Amerindian communities in the Amazonas state. Individuals over 18 years old were screened by rapid test for Hepatitis B surface Antigen (HBsAg). Blood samples obtained from individuals positives for HBsAg in the rapid-test assay were analyzed for HBsAg, anti-HBc, anti-HDV IgM/IgG by ELISA. The detection of HBV DNA and HDV RNA was performed by PCR amplification. The viral genotype was determined by sequencing and phylogenetic analysis. A total of 23/861 individuals were positive for HBsAg detection by rapid test. Serological and/or molecular markers of HDV infection were demonstrated in 43.5 % (10/23) of samples from Amerindians. The phylogenetic analysis demonstrated the exclusive circulation of HBV subgenotype F1b of and HDV 3 in this population. A high frequency of HBV/HDV infection was found in Amerindian population from Amazonas State, Colombia (43.5 %, 10/23). Nine cases were identified in a population of 861 asymptomatic Amerindian individuals; one symptomatic case (with diagnosis of end-stage hepatic disease) was also identified in the study. The circulation of HDV 3 and HBV subgenotype F1b suggests a constant flow of these viral genotypes as a result of the interaction of the Amerindian populations from Amazon basin. Further studies are necessary to confirm whether HBV subgenotype F1b is the prevalent in the population from South East region in Colombia.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

في كولومبيا، تم وصف حالات الإصابة بفيروس التهاب الكبد D (HDV) رسميًا منذ عام 1985 بشكل رئيسي بين السكان الأمريكيين الهنود من سييرا نيفادا دي سانتا مارتا (ساحل شمال الكاريبي) وأورابا (شمال غرب) وأمازون (جنوب شرق). تم تسجيل آخر تقرير رسمي عن حالة سريرية للإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية في كولومبيا في عام 2005. كانت أهداف هذه الدراسة هي تحديد حالات الإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية و/أو فيروس التهاب الكبد الوبائي ب (HBV) في الهنود الأمريكيين الذين لا تظهر عليهم أعراض من ولاية أمازوناس، جنوب شرق كولومبيا، ووصف الأنماط الجينية الفيروسية المنتشرة في هذه الفئة من السكان. تم تجنيد مجتمع الدراسة في 19 مجتمعًا هنديًا أمريكيًا في ولاية أمازوناس. تم فحص الأفراد الذين تزيد أعمارهم عن 18 عامًا عن طريق اختبار سريع لمستضد سطح التهاب الكبد B (HBsAg). تم تحليل عينات الدم التي تم الحصول عليها من الأفراد الإيجابيين لـ HBsAg في اختبار الاختبار السريع لـ HBsAg و anti - HBc و anti - HDV IgM/IgG بواسطة ELISA. تم إجراء الكشف عن الحمض النووي لـ HBV والحمض النووي الريبي لـ HDV عن طريق تضخيم PCR. تم تحديد النمط الجيني الفيروسي من خلال التسلسل والتحليل الوراثي. كان ما مجموعه 23/861 فردًا إيجابيًا للكشف عن HBsAg عن طريق الاختبار السريع. تم عرض العلامات المصلية و/أو الجزيئية لعدوى فيروس نقص المناعة البشرية في 43.5 ٪ (10/23) من العينات من الهنود الحمر. أظهر التحليل الوراثي للسلالات الدوران الحصري للنمط الجيني الفرعي HBV F1b من و HDV 3 في هذه الفئة من السكان. تم العثور على تواتر مرتفع لعدوى فيروس التهاب الكبد الوبائي/فيروس التهاب الكبد الوبائي بين السكان الأمريكيين الهنود من ولاية أمازوناس، كولومبيا (43.5 ٪، 10/23). تم تحديد تسع حالات في مجموعة من 861 فردًا من الهنود الأمريكيين بدون أعراض ؛ كما تم تحديد حالة عرضية واحدة (مع تشخيص مرض كبدي في المرحلة النهائية) في الدراسة. يشير دوران النمط الجيني الفرعي لفيروس التهاب الكبد الوبائي 3 وفيروس التهاب الكبد الوبائي F1b إلى تدفق مستمر لهذه الأنماط الجينية الفيروسية نتيجة لتفاعل السكان الأمريكيين الهنود من حوض الأمازون. من الضروري إجراء مزيد من الدراسات لتأكيد ما إذا كان النمط الجيني الفرعي F1b لفيروس التهاب الكبد B هو السائد بين السكان من المنطقة الجنوبية الشرقية في كولومبيا.

Translated Description (French)

En Colombie, des cas d'infection par le virus de l'hépatite D (VHD) ont été officiellement décrits depuis 1985, principalement chez la population amérindienne de la Sierra Nevada de Santa Marta (côte nord des Caraïbes), d'Uraba (nord-ouest) et d'Amazonie (sud-est). Le dernier rapport officiel d'un cas clinique d'infection à HDV en Colombie a été enregistré en 2005. Les objectifs de cette étude étaient d'identifier les cas d'infection par le VHD et/ou le virus de l'hépatite B (VHB) chez les Amérindiens asymptomatiques de l'État d'Amazonas, dans le sud-est de la Colombie, et de décrire les génotypes viraux circulants dans cette population. La population étudiée a été recrutée dans 19 communautés amérindiennes de l'État d'Amazonas. Les personnes de plus de 18 ans ont été dépistées par un test rapide de dépistage de l'antigène de surface de l'hépatite B (AgHBs). Des échantillons de sang obtenus à partir d'individus positifs pour HBsAg dans le test rapide ont été analysés pour HBsAg, anti-HBc, IgM/IgG anti-HDV par ELISA. La détection de l'ADN du VHB et de l'ARN du VHD a été réalisée par amplification PCR. Le génotype viral a été déterminé par séquençage et analyse phylogénétique. Un total de 23/861 personnes étaient positives pour la détection de l'AgHBs par test rapide. Des marqueurs sérologiques et/ou moléculaires de l'infection à HDV ont été mis en évidence dans 43,5 % (10/23) des échantillons provenant d'Amérindiens. L'analyse phylogénétique a démontré la circulation exclusive du sous-génotype F1b du VHB et du VHD 3 dans cette population. Une fréquence élevée d'infection par le VHB/VHD a été observée dans la population amérindienne de l'État d'Amazonas, en Colombie (43,5 %, 10/23). Neuf cas ont été identifiés dans une population de 861 personnes amérindiennes asymptomatiques ; un cas symptomatique (avec diagnostic de maladie hépatique terminale) a également été identifié dans l'étude. La circulation du sous-génotype F1b du VHD 3 et du VHB suggère un flux constant de ces génotypes viraux à la suite de l'interaction des populations amérindiennes du bassin amazonien. D'autres études sont nécessaires pour confirmer si le sous-génotype F1b du VHB est prévalent dans la population de la région du Sud-Est de la Colombie.

Translated Description (Spanish)

En Colombia, los casos de infección por el virus de la hepatitis D (VHD) se han descrito oficialmente desde 1985, principalmente en la población amerindia de Sierra Nevada de Santa Marta (costa norte del Caribe), Urabá (noroeste) y Amazonia (sureste). El último informe oficial de un caso clínico de infección por VHD en Colombia se registró en 2005. Los objetivos de este estudio fueron identificar casos de infección por VHD y/o virus de la hepatitis B (VHB) en amerindios asintomáticos del estado de Amazonas, sureste de Colombia, y describir los genotipos virales circulantes en esta población. La población del estudio se reclutó en 19 comunidades amerindias en el estado de Amazonas. Las personas mayores de 18 años fueron examinadas mediante una prueba rápida para el antígeno de superficie de la hepatitis B (HBsAg). Las muestras de sangre obtenidas de individuos positivos para HBsAg en el ensayo de prueba rápida se analizaron para HBsAg, anti-HBc, IgM/IgG anti-HDV mediante ELISA. La detección de ADN del VHB y ARN del VHD se realizó mediante amplificación por PCR. El genotipo viral se determinó mediante secuenciación y análisis filogenético. Un total de 23/861 individuos dieron positivo para la detección de HBsAg mediante prueba rápida. Se demostraron marcadores serológicos y/o moleculares de infección por VHD en el 43,5 % (10/23) de las muestras de amerindios. El análisis filogenético demostró la circulación exclusiva del subgenotipo F1b del VHB y del VHD 3 en esta población. Se encontró una alta frecuencia de infección por VHB/VHD en la población amerindia del estado de Amazonas, Colombia (43.5 %, 10/23). Se identificaron nueve casos en una población de 861 individuos amerindios asintomáticos; también se identificó un caso sintomático (con diagnóstico de enfermedad hepática terminal) en el estudio. La circulación del VHD 3 y el subgenotipo F1b del VHB sugiere un flujo constante de estos genotipos virales como resultado de la interacción de las poblaciones amerindias de la cuenca amazónica. Se necesitan más estudios para confirmar si el subgenotipo F1b del VHB es el prevalente en la población de la región sureste de Colombia.

Files

s12985-015-0402-5.pdf

Files (1.7 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:f2c55ff68e65be23762f43feff9e0cc3
1.7 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
عدوى فيروس التهاب الكبد الوبائي D وفيروس التهاب الكبد الوبائي B في مجتمعات الهنود الحمر في ولاية أمازوناس، كولومبيا
Translated title (French)
Infection par le virus de l'hépatite D et le virus de l'hépatite B dans les communautés amérindiennes de l'État d'Amazonas, en Colombie
Translated title (Spanish)
Infección por el virus de la hepatitis D y el virus de la hepatitis B en comunidades amerindias del estado de Amazonas, Colombia

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2172044291
DOI
10.1186/s12985-015-0402-5

Is supplement to
https://openalex.org/W4380906651 (Other)
https://openalex.org/W3024743488 (Other)
https://openalex.org/W2978728557 (Other)
https://openalex.org/W2796230093 (Other)
https://openalex.org/W2389391447 (Other)
https://openalex.org/W2140782898 (Other)
https://openalex.org/W2100920251 (Other)
https://openalex.org/W1981834611 (Other)
https://openalex.org/W1965270384 (Other)
https://openalex.org/W1900427498 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Colombia

References

  • https://openalex.org/W13427735
  • https://openalex.org/W1520948883
  • https://openalex.org/W1576778842
  • https://openalex.org/W1979283933
  • https://openalex.org/W1985372866
  • https://openalex.org/W1987581118
  • https://openalex.org/W1999148628
  • https://openalex.org/W2000328099
  • https://openalex.org/W2009193537
  • https://openalex.org/W2018051424
  • https://openalex.org/W2029323997
  • https://openalex.org/W2040378247
  • https://openalex.org/W2053461665
  • https://openalex.org/W2084995946
  • https://openalex.org/W2085492145
  • https://openalex.org/W2086697185
  • https://openalex.org/W2097518733
  • https://openalex.org/W2099034649
  • https://openalex.org/W2102004729
  • https://openalex.org/W2106283831
  • https://openalex.org/W2108337228
  • https://openalex.org/W2111713012
  • https://openalex.org/W2112602049
  • https://openalex.org/W2113251109
  • https://openalex.org/W2116671066
  • https://openalex.org/W2122514369
  • https://openalex.org/W2132626841
  • https://openalex.org/W2133726254
  • https://openalex.org/W2156065259
  • https://openalex.org/W2160046306
  • https://openalex.org/W2162264146
  • https://openalex.org/W2164192667
  • https://openalex.org/W2332252443
  • https://openalex.org/W4206305126