Published January 1, 2013 | Version v1
Publication Open

Promoter activity analysis and methylation characterization of LTR elements of PERVs in NIH miniature pig

Creators

  • 1. Pusan National University
  • 2. Dankook University
  • 3. National Veterinary Research Institute
  • 4. National Institute of Animal Science

Description

The potential risk of porcine endogenous retrovirus (PERV) transmission is an important issue in xenotransplantation (pig-to-human transplantation). Long terminal repeats (LTRs) in PERV elements show promoter activity that could affect neighboring functional genes. The methylation status and promoter activities of 3 LTR structures (PERV-LTR1, LTR2, and LTR3 elements) belonging to the PERV-A family were examined using luciferase reporter genes in human liver cell lines (HepG2 and Hep3B). The PERV LTR3 element exhibited hypomethylation and stronger promoter activity than the other LTR elements in human liver cells. We also performed comparative sequences analysis of the PERV LTR elements by using bioinformatics tools. Our findings showed that several transcription factors such as Nkx2-2 and Elk-1 positively influenced the high transcriptional activity of the PERV LTR3 element.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

يعد الخطر المحتمل لانتقال الفيروس الرجعي الداخلي المنشأ للخنازير (PERV) مشكلة مهمة في زراعة الأعضاء الأجنبية (زراعة الخنازير إلى الإنسان). تُظهر التكرارات الطرفية الطويلة (LTRs) في العناصر المنحرفة نشاطًا معززًا يمكن أن يؤثر على الجينات الوظيفية المجاورة. تم فحص حالة المثيلة والأنشطة المعززة لـ 3 هياكل LTR (عناصر PERV - LTR1 و LTR2 و LTR3) التي تنتمي إلى عائلة PERV - A باستخدام جينات مراسل لوسيفيراز في خطوط خلايا الكبد البشرية (HepG2 و Hep3B). أظهر عنصر بيرف LTR3 انخفاض الميثيل ونشاط معزز أقوى من عناصر LTR الأخرى في خلايا الكبد البشرية. أجرينا أيضًا تحليلًا للتسلسلات المقارنة لعناصر LTR المنحرفة باستخدام أدوات المعلوماتية الحيوية. أظهرت النتائج التي توصلنا إليها أن العديد من عوامل النسخ مثل Nkx2 -2 و ELK -1 أثرت بشكل إيجابي على النشاط النسخي العالي لعنصر PERV LTR3.

Translated Description (French)

Le risque potentiel de transmission du rétrovirus endogène porcin (REP) est un enjeu important de la xénotransplantation (transplantation porcine-humaine). Les répétitions terminales longues (LTR) dans les éléments PERV montrent une activité promotrice qui pourrait affecter les gènes fonctionnels voisins. Le statut de méthylation et les activités promotrices de 3 structures LTR (éléments PERV-LTR1, LTR2 et LTR3) appartenant à la famille PERV-A ont été examinés à l'aide de gènes rapporteurs de luciférase dans des lignées cellulaires hépatiques humaines (HepG2 et Hep3B). L'élément PERV LTR3 présentait une hypométhylation et une activité promotrice plus forte que les autres éléments LTR dans les cellules hépatiques humaines. Nous avons également effectué une analyse comparative des séquences des éléments PERV LTR à l'aide d'outils bioinformatiques. Nos résultats ont montré que plusieurs facteurs de transcription tels que Nkx2-2 et Elk-1 influençaient positivement l'activité transcriptionnelle élevée de l'élément PERV LTR3.

Translated Description (Spanish)

El riesgo potencial de transmisión de retrovirus endógenos porcinos (PERV) es un problema importante en el xenotrasplante (trasplante de cerdo a humano). Las repeticiones terminales largas (LTR) en los elementos PERV muestran una actividad promotora que podría afectar a los genes funcionales vecinos. El estado de metilación y las actividades promotoras de 3 estructuras LTR (elementos PERV-LTR1, LTR2 y LTR3) pertenecientes a la familia PERV-A se examinaron utilizando genes indicadores de luciferasa en líneas celulares hepáticas humanas (HepG2 y Hep3B). El elemento PERV LTR3 exhibió hipometilación y actividad promotora más fuerte que los otros elementos LTR en células hepáticas humanas. También realizamos un análisis comparativo de secuencias de los elementos PERV LTR mediante el uso de herramientas bioinformáticas. Nuestros hallazgos mostraron que varios factores de transcripción como Nkx2-2 y Elk-1 influyeron positivamente en la alta actividad transcripcional del elemento PERV LTR3.

Files

_pdf.pdf

Files (586.8 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:5d251210012a34591eae6b5a8713d973
586.8 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تحليل نشاط المروج وتوصيف المثيلة لعناصر لتر من بيرف فيس في المعاهد الوطنية للصحة الخنازير المصغرة
Translated title (French)
Analyse de l'activité du promoteur et caractérisation par méthylation des éléments LTR des PERV chez le porc miniature NIH
Translated title (Spanish)
Análisis de la actividad del promotor y caracterización de la metilación de los elementos LTR de los PERV en cerdos miniatura de los NIH

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2005425858
DOI
10.1266/ggs.88.135

Is supplement to
https://openalex.org/W4391294648 (Other)
https://openalex.org/W4299584049 (Other)
https://openalex.org/W4297463906 (Other)
https://openalex.org/W4280514127 (Other)
https://openalex.org/W2507077062 (Other)
https://openalex.org/W2371947609 (Other)
https://openalex.org/W2073433678 (Other)
https://openalex.org/W2064454978 (Other)
https://openalex.org/W2035283631 (Other)
https://openalex.org/W2024575909 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Nigeria

References

  • https://openalex.org/W1581414507
  • https://openalex.org/W1967064280
  • https://openalex.org/W1967414895
  • https://openalex.org/W1972654575
  • https://openalex.org/W1994440387
  • https://openalex.org/W1994596946
  • https://openalex.org/W1998328650
  • https://openalex.org/W2005678266
  • https://openalex.org/W2007245032
  • https://openalex.org/W2012169798
  • https://openalex.org/W2021032706
  • https://openalex.org/W2022936129
  • https://openalex.org/W2023576585
  • https://openalex.org/W2033907252
  • https://openalex.org/W2035959247
  • https://openalex.org/W2036836163
  • https://openalex.org/W2041988826
  • https://openalex.org/W2044539511
  • https://openalex.org/W2047235631
  • https://openalex.org/W2048514754
  • https://openalex.org/W2049368361
  • https://openalex.org/W2051506066
  • https://openalex.org/W2054523011
  • https://openalex.org/W2056942748
  • https://openalex.org/W2059659827
  • https://openalex.org/W2063766134
  • https://openalex.org/W2090631790
  • https://openalex.org/W2098090820
  • https://openalex.org/W2098320143
  • https://openalex.org/W2108280026
  • https://openalex.org/W2109299179
  • https://openalex.org/W2114908540
  • https://openalex.org/W2116120304
  • https://openalex.org/W2116548735
  • https://openalex.org/W2118722562
  • https://openalex.org/W2120540733
  • https://openalex.org/W2125841407
  • https://openalex.org/W2126248834
  • https://openalex.org/W2131712345
  • https://openalex.org/W2146074277
  • https://openalex.org/W2157567433
  • https://openalex.org/W2162352317
  • https://openalex.org/W2165500753
  • https://openalex.org/W2165962676
  • https://openalex.org/W2168013364
  • https://openalex.org/W2171727559
  • https://openalex.org/W2221459232
  • https://openalex.org/W81136551