Published March 30, 2023 | Version v1
Publication Open

Detection of Virulence and β-lactamase resistance genes of non-typhoidal Salmonella isolates from human and animal origin in Egypt "one health concern"

Creators

  • 1. South Valley University
  • 2. Assiut University

Description

Non-typhoidal Salmonella (NTS) is a major foodborne zoonotic pathogen worldwide. In the current study, Various NTS strains were isolated from (cows, milk and dairy products in addition to humans) in New Valley and Assiut Governorate, Egypt. NTS were firstly serotyped and tested by antibiotic sensitivity test. Secondly, some virulence genes and Antibiotic resistance genes have been identified by using PCR. Finally, Phylogenesis was performed depending on the invA gene, for two S. typhimurium isolates (one of animal origin and the other of human origin for evaluating zoonotic potential).Out of 800 examined samples, the total number of isolates was 87 (10.88%), which were classified into 13 serotypes, with the most prevalent being S. Typhimurium and S. enteritidis. Both bovine and human isolates showed the highest resistance to clindamycin and streptomycin, with 90.80% of the tested isolates exhibiting MDR. The occurrence of the invA gene was 100%, while 72.22%, 30.56%, and 94.44% of the examined strains were positive for stn, spvC, and hilA genes, respectively. Additionally, blaOXA-2 was detected in 16.67% (6/ 36) of the tested isolates, while blaCMY-1 was detected in 30.56% (11of 36) of the tested isolates. Phylogenesis revealed a high degree of similarity between the two isolates.The high occurrence of MDR strains of NTS in both human and animal samples with high degree of genetic similarity, shows that cows, milk and milk product may be a valuable source of human infection with NTS and interfere with treatment procedures.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

السالمونيلا غير التيفية (NTS) هي أحد مسببات الأمراض الحيوانية المنشأ الرئيسية التي تنقلها الأغذية في جميع أنحاء العالم. في الدراسة الحالية، تم عزل سلالات NTS المختلفة من (الأبقار والحليب ومنتجات الألبان بالإضافة إلى البشر) في الوادي الجديد ومحافظة أسيوط، مصر. تم أولاً تنميط NTS واختباره عن طريق اختبار حساسية المضادات الحيوية. ثانيًا، تم تحديد بعض جينات الفوعة وجينات مقاومة المضادات الحيوية باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل. أخيرًا، تم إجراء تكوين السلالة اعتمادًا على جين invA، لعزلتين من S. typhimurium (واحدة من أصل حيواني والأخرى من أصل بشري لتقييم الإمكانات الحيوانية المنشأ). من بين 800 عينة تم فحصها، كان العدد الإجمالي للعزلات 87 (10.88 ٪)، والتي تم تصنيفها إلى 13 نمطًا مصليًا، وأكثرها انتشارًا هو S. Typhimurium و S. enteritidis. أظهر كل من عزلات الأبقار والبشر أعلى مقاومة للكليندامايسين والستربتومايسين، حيث أظهرت 90.80 ٪ من العزلات التي تم اختبارها MDR. كان حدوث جين invA بنسبة 100 ٪، في حين أن 72.22 ٪ و 30.56 ٪ و 94.44 ٪ من السلالات التي تم فحصها كانت إيجابية لجينات stn و spvC و hilA، على التوالي. بالإضافة إلى ذلك، تم اكتشاف blaOXA -2 في 16.67 ٪ ( 6/36) من العزلات التي تم اختبارها، بينما تم اكتشاف blaCMY -1 في 30.56 ٪ (11 من 36) من العزلات التي تم اختبارها. كشف تطور السلالة عن درجة عالية من التشابه بين الاثنين المعزولين. يظهر ارتفاع حدوث سلالات MDR من NTS في كل من العينات البشرية والحيوانية مع درجة عالية من التشابه الجيني، أن الأبقار والحليب ومنتجات الألبان قد تكون مصدرًا قيمًا للعدوى البشرية بـ NTS وتتداخل مع إجراءات العلاج.

Translated Description (French)

La salmonelle non typhoïde (NTS) est un pathogène zoonotique majeur d'origine alimentaire dans le monde entier. Dans la présente étude, diverses souches de NTS ont été isolées à partir de (vaches, lait et produits laitiers en plus des humains) dans la Nouvelle Vallée et le gouvernorat d'Assiout, en Égypte. Les NTS ont d'abord été sérotypés et testés par test de sensibilité aux antibiotiques. Deuxièmement, certains gènes de virulence et gènes de résistance aux antibiotiques ont été identifiés en utilisant la PCR. Enfin, la phylogenèse a été réalisée en fonction du gène invA, pour deux isolats de S. typhimurium (l'un d'origine animale et l'autre d'origine humaine pour évaluer le potentiel zoonotique) Sur 800 échantillons examinés, le nombre total d'isolats était de 87 (10,88%), qui ont été classés en 13 sérotypes, les plus répandus étant S. Typhimurium et S. enteritidis. Les isolats bovins et humains ont montré la résistance la plus élevée à la clindamycine et à la streptomycine, 90,80 % des isolats testés présentant une MDR. L'occurrence du gène invA était de 100 %, tandis que 72,22 %, 30,56 % et 94,44 % des souches examinées étaient positives pour les gènes stn, spvC et hilA, respectivement. De plus, blaOXA-2 a été détecté dans 16,67 % (6/ 36) des isolats testés, tandis que blaCMY-1 a été détecté dans 30,56 % (11 sur 36) des isolats testés. La phylogenèse a révélé un degré élevé de similitude entre les deux isolats. La fréquence élevée de souches MDR de NTS dans des échantillons humains et animaux avec un degré élevé de similitude génétique montre que les vaches, le lait et les produits laitiers peuvent être une source précieuse d'infection humaine par le NTS et interférer avec les procédures de traitement.

Translated Description (Spanish)

La Salmonella no tifoidea (NTS) es un importante patógeno zoonótico transmitido por los alimentos en todo el mundo. En el estudio actual, se aislaron varias cepas de NTS (vacas, leche y productos lácteos además de humanos) en New Valley y Assiut Governorate, Egipto. Los NTS se serotipificaron en primer lugar y se probaron mediante una prueba de sensibilidad a los antibióticos. En segundo lugar, se han identificado algunos genes de virulencia y genes de resistencia a antibióticos mediante PCR. Finalmente, se realizó la filogénesis en función del gen invA, para dos aislados de S. typhimurium (uno de origen animal y otro de origen humano para evaluar el potencial zoonótico). De las 800 muestras examinadas, el número total de aislados fue de 87 (10,88%), que se clasificaron en 13 serotipos, siendo los más prevalentes S. Typhimurium y S. enteritidis. Tanto los aislados bovinos como los humanos mostraron la mayor resistencia a la clindamicina y la estreptomicina, con un 90.80% de los aislados probados que exhiben MDR. La aparición del gen invA fue del 100%, mientras que el 72,22%, 30,56% y 94,44% de las cepas examinadas fueron positivas para los genes stn, spvC e hilA, respectivamente. Además, se detectó blaOXA-2 en el 16.67% (6/ 36) de los aislados probados, mientras que blaCMY-1 se detectó en el 30.56% (11 de 36) de los aislados probados. La filogénesis reveló un alto grado de similitud entre los dos aislados. La alta incidencia de cepas MDR de NTS en muestras humanas y animales con alto grado de similitud genética, muestra que las vacas, la leche y los productos lácteos pueden ser una fuente valiosa de infección humana con NTS e interferir con los procedimientos de tratamiento.

Files

s13099-023-00542-3.pdf

Files (1.5 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:adb6124dc876b4f0488a956db577f2ed
1.5 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
اكتشاف جينات مقاومة الفوعة وبيتا لاكتاماز للسالمونيلا غير التيفودية المعزولة عن الأصل البشري والحيواني في مصر "مصدر قلق صحي واحد"
Translated title (French)
Détection de la virulence et des gènes de résistance à la β-lactamase d'isolats non typhoïdiens de Salmonella d'origine humaine et animale en Égypte « un problème de santé »
Translated title (Spanish)
Detección de genes de resistencia a la virulencia y a la β-lactamasa de aislados de Salmonella no tifoidea de origen humano y animal en Egipto "una preocupación sanitaria"

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4361272939
DOI
10.1186/s13099-023-00542-3

Is supplement to
https://openalex.org/W4391033691 (Other)
https://openalex.org/W3173627137 (Other)
https://openalex.org/W2600400317 (Other)
https://openalex.org/W2409282623 (Other)
https://openalex.org/W2348250278 (Other)
https://openalex.org/W2089414280 (Other)
https://openalex.org/W1992340138 (Other)
https://openalex.org/W1984036511 (Other)
https://openalex.org/W1601818677 (Other)
https://openalex.org/W1579947049 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Egypt

References

  • https://openalex.org/W1555078999
  • https://openalex.org/W1562421081
  • https://openalex.org/W2004101792
  • https://openalex.org/W2041094033
  • https://openalex.org/W2095228998
  • https://openalex.org/W2106882534
  • https://openalex.org/W2128858257
  • https://openalex.org/W2130706154
  • https://openalex.org/W2139642783
  • https://openalex.org/W2145512499
  • https://openalex.org/W2152207030
  • https://openalex.org/W2278380325
  • https://openalex.org/W2328020511
  • https://openalex.org/W2342523135
  • https://openalex.org/W2532435353
  • https://openalex.org/W2587283231
  • https://openalex.org/W2598004447
  • https://openalex.org/W2621049936
  • https://openalex.org/W2693650708
  • https://openalex.org/W2802100684
  • https://openalex.org/W2833933574
  • https://openalex.org/W2843904206
  • https://openalex.org/W2898837407
  • https://openalex.org/W2939327779
  • https://openalex.org/W2946924857
  • https://openalex.org/W2966500990
  • https://openalex.org/W2998727832
  • https://openalex.org/W3016507459
  • https://openalex.org/W3039914567
  • https://openalex.org/W3040087254
  • https://openalex.org/W3086333565
  • https://openalex.org/W3091125880
  • https://openalex.org/W3099639688
  • https://openalex.org/W3156510692
  • https://openalex.org/W3157407364
  • https://openalex.org/W3159126042
  • https://openalex.org/W3165806898
  • https://openalex.org/W3170578530
  • https://openalex.org/W3171437948
  • https://openalex.org/W4200254592
  • https://openalex.org/W4210618635
  • https://openalex.org/W4210666061
  • https://openalex.org/W4213054082
  • https://openalex.org/W4213449446
  • https://openalex.org/W4226076365
  • https://openalex.org/W4296794389
  • https://openalex.org/W4306673454