Published May 18, 2022
| Version v1
Publication
Open
Extended-spectrum-beta-lactamases and carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae isolated from fresh produce farms in different governorates of Egypt
Description
Fresh produce farms represents a major source of concern since they are becoming increasingly antibiotic resistant. This study aimed to investigate the occurrence of carbapenemase and extended-spectrum-beta-lactamases (ESBL) - producing genes in Klebsiella pneumoniae isolated from fresh produce farms in Egypt, irrigation water, and people working in these fields.One hundred tomatoes from typical farms were collected in plastic bags. The study also included 20 surface-water samples from different irrigation watersheds in fresh produce farms, as well as 50 feces samples from farmworkers. Suspected K. pneumoniae was grown on Eosin Methylene Blue agar for 24 h before being biochemically identified using the RapID ONE test. PCR was used to detect carbapenemase (blaKPC, blaOXA-48, and blaNDM) and ESBL (blaSHV, blaTEM, and blaCTX) expressing genes on isolates.K. pneumoniae was identified in 30% of water and 10% of worker samples, while only one isolate was found in tomato samples. One of the six irrigation water isolates tested positive for carbapenem-resistant NDM. In contrast, two isolates tested positive for ESBL determinants, one of which was blSHV and the other having both blaSHV and blaTEM genes. Two of the five K. pneumoniae isolates from farmworkers were positive for blaNDM, with one isolate also testing positive for blaSHV and blaTEM. The blaOXA-48 gene was also discovered in the carbapenem-resistant K. pneumoniae tomato isolate used in this study.Carbapenemase- and ESBL-producing K. pneumoniae were found in fresh produce farms, implying that these resistance genes were being passed down to Egyptian consumers.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تمثل مزارع المنتجات الطازجة مصدر قلق رئيسي لأنها أصبحت مقاومة للمضادات الحيوية بشكل متزايد. هدفت هذه الدراسة إلى التحقيق في حدوث الكاربابينيماز وبيتا لاكتاماز ممتدة الطيف (ESBL) - إنتاج الجينات في Klebsiella pneumoniae المعزولة من مزارع المنتجات الطازجة في مصر، ومياه الري، والأشخاص العاملين في هذه المجالات. تم جمع مائة طماطم من المزارع النموذجية في أكياس بلاستيكية. وشملت الدراسة أيضًا 20 عينة من المياه السطحية من مستجمعات مياه الري المختلفة في مزارع المنتجات الطازجة، بالإضافة إلى 50 عينة من البراز من عمال المزارع. نمت K. pneumoniae المشتبه بها على أجار Eosin Methylene Blue لمدة 24 ساعة قبل أن يتم تحديدها كيميائيًا باستخدام اختبار RapID ONE. تم استخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل للكشف عن الكاربابينيماز (blaKPC و blaOXA -48 و blaNDM) و ESBL (blaSHV و blaTEM و blaCTX) التي تعبر عن الجينات على العازلات. تم تحديد الالتهاب الرئوي في 30 ٪ من المياه و 10 ٪ من عينات العمال، في حين تم العثور على عزل واحد فقط في عينات الطماطم. واحدة من عزلات مياه الري الستة التي تم اختبارها إيجابية لـ NDM المقاوم للكاربابينيم. في المقابل، تم اختبار عزلتين إيجابيتين لمحددات ESBL، أحدهما كان blSHV والآخر يحتوي على كل من جينات blaSHV و blaTEM. كانت اثنتان من خمس عوازل K. الرئوية من عمال المزارع إيجابية لـ blaNDM، مع وجود عزل واحد إيجابي أيضًا لـ blaSHV و blaTEM. تم اكتشاف جين blaOXA -48 أيضًا في عزل الطماطم K. pneumoniae المقاوم للكاربابينيم المستخدم في هذه الدراسة. تم العثور على K. pneumoniae المنتج للكاربابينيماز و ESBL في مزارع المنتجات الطازجة، مما يعني أن جينات المقاومة هذه تنتقل إلى المستهلكين المصريين.Translated Description (French)
Les fermes de produits frais représentent une source majeure de préoccupation car elles deviennent de plus en plus résistantes aux antibiotiques. Cette étude visait à étudier la présence de gènes producteurs de carbapénémases et de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) chez Klebsiella pneumoniae isolée dans des fermes de produits frais en Égypte, d'eau d'irrigation et de personnes travaillant dans ces champs. Une centaine de tomates provenant de fermes typiques ont été collectées dans des sacs en plastique. L'étude comprenait également 20 échantillons d'eaux de surface provenant de différents bassins versants d'irrigation dans des fermes de produits frais, ainsi que 50 échantillons de matières fécales provenant d'ouvriers agricoles. K. pneumoniae suspectée a été cultivée sur gélose Eosin Methylene Blue pendant 24 h avant d'être identifiée biochimiquement à l'aide du test RapID ONE. La PCR a été utilisée pour détecter les gènes exprimant la carbapénémase (blaKPC, blaOXA-48 et blaNDM) et le BLSE (blaSHV, blaTEM et blaCTX) sur les isolats. K. pneumoniae a été identifié dans 30 % des échantillons d'eau et 10 % des échantillons de travailleurs, tandis qu'un seul isolat a été trouvé dans des échantillons de tomates. L'un des six isolats d'eau d'irrigation a été testé positif au NDM résistant au carbapénème. En revanche, deux isolats ont été testés positifs pour les déterminants du BLSE, dont l'un était le blSHV et l'autre avait à la fois des gènes blaSHV et blaTEM. Deux des cinq isolats de K. pneumoniae provenant d'ouvriers agricoles étaient positifs pour le blaNDM, un isolat étant également positif pour le blaSHV et le blaTEM. Le gène blaOXA-48 a également été découvert dans l'isolat de tomate K. pneumoniae résistant aux carbapénèmes utilisé dans cette étude. Des K. pneumoniae producteurs de carbapénémase et de BLSE ont été trouvés dans des fermes de produits frais, ce qui implique que ces gènes de résistance étaient transmis aux consommateurs égyptiens.Translated Description (Spanish)
Las granjas de productos frescos representan una importante fuente de preocupación, ya que se están volviendo cada vez más resistentes a los antibióticos. Este estudio tuvo como objetivo investigar la aparición de genes productores de carbapenemasa y beta-lactamasas de espectro extendido (ESBL) en Klebsiella pneumoniae aisladas de granjas de productos frescos en Egipto, agua de riego y personas que trabajan en estos campos. Se recogieron cien tomates de granjas típicas en bolsas de plástico. El estudio también incluyó 20 muestras de aguas superficiales de diferentes cuencas de riego en granjas de productos frescos, así como 50 muestras de heces de trabajadores agrícolas. La sospecha de K. pneumoniae se cultivó en agar Eosin Methylene Blue durante 24 h antes de ser identificada bioquímicamente utilizando la prueba RapID ONE. Se utilizó PCR para detectar genes que expresan carbapenemasa (blaKPC, blaOXA-48 y blaNDM) y ESBL (blaSHV, blaTEM y blaCTX) en aislados.K. pneumoniae se identificó en el 30% de las muestras de agua y el 10% de las muestras de trabajadores, mientras que solo se encontró un aislado en las muestras de tomate. Uno de los seis aislamientos de agua de riego dio positivo para NDM resistente a carbapenem. Por el contrario, dos aislados dieron positivo para los determinantes de BLEE, uno de los cuales fue blSHV y el otro tenía los genes blaSHV y blaTEM. Dos de los cinco aislados de K. pneumoniae de trabajadores agrícolas dieron positivo para blaNDM, y un aislado también dio positivo para blaSHV y blaTEM. El gen blaOXA-48 también se descubrió en el aislado de tomate K. pneumoniae resistente a carbapenem utilizado en este estudio. Se encontraron K. pneumoniae productoras de carbapenemasa y BLEE en granjas de productos frescos, lo que implica que estos genes de resistencia se transmitían a los consumidores egipcios.Files
6.pdf.pdf
Files
(226 Bytes)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:5360980bad11bf9723da89687501effc
|
226 Bytes | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- الطيف الممتد - بيتا لاكتاماز والكلبسيلة الرئوية المنتجة للكاربابينيماز المعزولة من مزارع المنتجات الطازجة في محافظات مختلفة من مصر
- Translated title (French)
- Bêta-lactamases à spectre étendu et Klebsiella pneumoniae productrice de carbapénémases isolées dans des fermes de produits frais dans différents gouvernorats d'Égypte
- Translated title (Spanish)
- Beta-lactamasas de espectro extendido y Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasas aisladas de granjas de productos frescos en diferentes gobernaciones de Egipto
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4280576953
- DOI
- 10.14202/vetworld.2022.1191-1196
References
- https://openalex.org/W1889879066
- https://openalex.org/W1892680152
- https://openalex.org/W1902535075
- https://openalex.org/W1951178169
- https://openalex.org/W1989148510
- https://openalex.org/W1990379971
- https://openalex.org/W1993048301
- https://openalex.org/W2041685759
- https://openalex.org/W2045247081
- https://openalex.org/W2054223760
- https://openalex.org/W2065337857
- https://openalex.org/W2068982101
- https://openalex.org/W2072946576
- https://openalex.org/W2073709627
- https://openalex.org/W2081243584
- https://openalex.org/W2109578375
- https://openalex.org/W2160835285
- https://openalex.org/W2173537513
- https://openalex.org/W2472968398
- https://openalex.org/W2485056521
- https://openalex.org/W2504135939
- https://openalex.org/W2508147196
- https://openalex.org/W2553674517
- https://openalex.org/W2574955580
- https://openalex.org/W2588777126
- https://openalex.org/W2734763566
- https://openalex.org/W2737953146
- https://openalex.org/W2744534572
- https://openalex.org/W2790168678
- https://openalex.org/W2793098556
- https://openalex.org/W2794891594
- https://openalex.org/W2810523880
- https://openalex.org/W2882996384
- https://openalex.org/W2955276038
- https://openalex.org/W2985762671
- https://openalex.org/W3028016005
- https://openalex.org/W3111914736
- https://openalex.org/W3215034467
- https://openalex.org/W4246818800
- https://openalex.org/W4251262355