Published April 16, 2013 | Version v1
Publication Open

Consistent high concentration of the viral microRNA BART17 in plasma samples from nasopharyngeal carcinoma patients - evidence of non-exosomal transport

Creators

  • 1. Institut Gustave Roussy
  • 2. University of Paris-Sud
  • 3. French National Centre for Scientific Research
  • 4. Tenon Hospital
  • 5. Sorbonne Université
  • 6. Inserm
  • 7. Institut Salah-Azaïz
  • 8. Pitié-Salpêtrière Hospital

Description

Because latent Epstein Barr (EBV)-infection is a specific characteristic of malignant nasopharyngeal carcinoma (NPC), various molecules of viral origin are obvious candidate biomarkers in this disease. In a previous study, we could show in a few clinical samples that it was possible to detect a category of EBV microRNAs called miR-BARTs in the plasma of at least a fraction of NPC patients. The first aim of the present study was to investigate the status of circulating miR-BART17-5p (one of the miR-BARTs hereafter called miR-BART17) and EBV DNA in a larger series of NPC plasma samples. The second aim was to determine whether or not circulating miR-BART17 was carried by plasma exosomes.Plasma samples were collected from 26 NPC patients and 10 control donors, including 9 patients with non-NPC Head and Neck squamous cell carcinoma and one healthy EBV carrier. Concentrations of miR-BART17 and two cellular microRNAs (hsa-miR-16 and -146a) were assessed by real-time quantitative PCR with spike-in normalization and absolute quantification. In addition, for 2 patients, exosome distributions of miR-BART17 and miR-16 were investigated following plasma lipoprotein fractionation by isopycnic density gradient ultrcentrifugation.The miR-BART17 was significantly more abundant in plasma samples from NPC patients compared to non-NPC donors. Above a threshold of 506 copies/mL, detection of miR-BART17 was highly specific for NPC patients (ROC curve analysis: AUC=0.87 with true positive rate = 0.77, false positive rate = 0.10). In this relatively small series, the concentration of plasma miR-BART17 and the plasma EBV DNA load were not correlated. When plasma samples were fractionated, miR-BART17 co-purified with a protein-rich fraction but not with exosomes.Detection of high concentrations of plasma miR-BART17 is consistent in NPC patients. This parameter is, at least in part, independent of the viral DNA load. Circulating miR-BART17 does not co-purify with exosomes.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

نظرًا لأن عدوى إبشتاين بار الكامنة (EBV) هي سمة محددة لسرطان البلعوم الأنفي الخبيث (NPC)، فإن الجزيئات المختلفة ذات الأصل الفيروسي هي مؤشرات حيوية مرشحة واضحة في هذا المرض. في دراسة سابقة، يمكننا أن نظهر في بضع عينات سريرية أنه كان من الممكن اكتشاف فئة من الرنا الميكروي EBV تسمى miR - BARTs في البلازما لجزء صغير على الأقل من مرضى NPC. كان الهدف الأول من هذه الدراسة هو التحقيق في حالة تعميم miR - BART17 -5p (أحد miR - BARTs المسمى فيما بعد miR - BART17) والحمض النووي EBV في سلسلة أكبر من عينات البلازما NPC. كان الهدف الثاني هو تحديد ما إذا كانت الأجسام الخارجية للبلازما تحمل miR - BART17 المتداولة أم لا. تم جمع عينات البلازما من 26 مريضًا من الأشخاص الطبيعيين الطبيعيين و 10 متبرعين متحكمين، بما في ذلك 9 مرضى يعانون من سرطان الخلايا الحرشفية في الرأس والرقبة من غير الأشخاص الطبيعيين وحامل EBV صحي واحد. تم تقييم تركيزات miR - BART17 واثنين من الرنا الميكروي الخلوي (hsa - miR -16 و -146 a) بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي مع ارتفاع في التطبيع والقياس الكمي المطلق. بالإضافة إلى ذلك، بالنسبة لمريضين، تم فحص توزيعات الأجسام الخارجية لـ miR - BART17 و miR -16 بعد تجزئة البروتين الدهني في البلازما عن طريق الطرد الفائق لتدرج الكثافة المتساوية. كان miR - BART17 أكثر وفرة بشكل ملحوظ في عينات البلازما من مرضى الأشخاص الطبيعيين مقارنة بالمتبرعين من غير الأشخاص الطبيعيين. فوق عتبة 506 نسخة/مل، كان الكشف عن miR - BART17 محددًا للغاية لمرضى الأشخاص الطبيعيين (تحليل منحنى ROC: AUC=0.87 مع معدل إيجابي حقيقي = 0.77، معدل إيجابي كاذب = 0.10). في هذه السلسلة الصغيرة نسبيًا، لم يتم ربط تركيز البلازما miR - BART17 وحمل الحمض النووي EBV البلازما. عندما تم تجزئة عينات البلازما، تمت تنقية miR - BART17 بشكل مشترك مع جزء غني بالبروتين ولكن ليس مع الإكسوسومات. ويتسق اكتشاف التركيزات العالية من miR - BART17 في البلازما لدى مرضى الأشخاص الطبيعيين. هذه المعلمة، على الأقل جزئيًا، مستقلة عن حمل الحمض النووي الفيروسي. لا يترافق تعميم miR - BART17 مع تنقية الإكسوسومات.

Translated Description (French)

Parce que l'infection latente à Epstein Barr (EBV) est une caractéristique spécifique du carcinome nasopharyngé malin (CPN), diverses molécules d'origine virale sont des biomarqueurs candidats évidents dans cette maladie. Dans une étude précédente, nous avons pu montrer dans quelques échantillons cliniques qu'il était possible de détecter une catégorie de microARNs EBV appelés miR-BARTs dans le plasma d'au moins une fraction de patients NPC. Le premier objectif de la présente étude était d'étudier l'état du miR-BART17-5p circulant (l'un des miR-BART ci-après appelé miR-BART17) et de l'ADN EBV dans une plus grande série d'échantillons de plasma NPC. Le deuxième objectif était de déterminer si le miR-BART17 circulant était porté ou non par des exosomes plasmatiques. Des échantillons de plasma ont été prélevés chez 26 patients atteints de NPC et 10 donneurs témoins, dont 9 patients atteints d'un carcinome épidermoïde de la tête et du cou non NPC et un porteur sain de l'EBV. Les concentrations de miR-BART17 et de deux microARN cellulaires (hsa-miR-16 et -146a) ont été évaluées par PCR quantitative en temps réel avec normalisation à pic et quantification absolue. De plus, pour 2 patients, les distributions exosomiques de miR-BART17 et miR-16 ont été étudiées après fractionnement des lipoprotéines plasmatiques par ultracentrifugation à gradient de densité isopycnique. Le miR-BART17 était significativement plus abondant dans les échantillons de plasma des patients NPC par rapport aux donneurs non NPC. Au-dessus d'un seuil de 506 copies/mL, la détection de miR-BART17 était très spécifique pour les patients atteints de NPC (analyse de la courbe roc : ASC=0,87 avec taux de vrais positifs = 0,77, taux de faux positifs = 0,10). Dans cette série relativement petite, la concentration de miR-BART17 plasmatique et la charge d'ADN EBV plasmatique n'étaient pas corrélées. Lorsque les échantillons de plasma ont été fractionnés, miR-BART17 a été co-purifié avec une fraction riche en protéines mais pas avec des exosomes. La détection de concentrations élevées de miR-BART17 dans le plasma est cohérente chez les patients atteints de NPC. Ce paramètre est, au moins en partie, indépendant de la charge d'ADN viral. Le miR-BART17 circulant ne co-purifie pas avec les exosomes.

Translated Description (Spanish)

Debido a que la infección latente de Epstein Barr (EBV) es una característica específica del carcinoma nasofaríngeo maligno (NPC), varias moléculas de origen viral son biomarcadores candidatos obvios en esta enfermedad. En un estudio previo, pudimos demostrar en algunas muestras clínicas que era posible detectar una categoría de microARN de EBV llamados miR-BART en el plasma de al menos una fracción de los pacientes con NPC. El primer objetivo del presente estudio fue investigar el estado de miR-BART17-5p circulante (uno de los miR-BART en lo sucesivo denominado miR-BART17) y el ADN de EBV en una serie más grande de muestras de plasma de NPC. El segundo objetivo fue determinar si miR-BART17 circulante era o no portado por exosomas plasmáticos. Se recogieron muestras de plasma de 26 pacientes con NPC y 10 donantes de control, incluidos 9 pacientes con carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello sin NPC y un portador sano de EBV. Las concentraciones de miR-BART17 y dos microARN celulares (hsa-miR-16 y -146a) se evaluaron mediante PCR cuantitativa en tiempo real con normalización de adición y cuantificación absoluta. Además, para 2 pacientes, se investigaron las distribuciones de exosomas de miR-BART17 y miR-16 después del fraccionamiento de lipoproteínas plasmáticas mediante ultracentrifugación en gradiente de densidad isopícnica. El miR-BART17 fue significativamente más abundante en muestras de plasma de pacientes con NPC en comparación con donantes sin NPC. Por encima de un umbral de 506 copias/ml, la detección de miR-BART17 fue altamente específica para los pacientes con NPC (análisis de la curva Roc: AUC=0,87 con tasa de verdaderos positivos = 0,77, tasa de falsos positivos = 0,10). En esta serie relativamente pequeña, la concentración de miR-BART17 en plasma y la carga de ADN de EBV en plasma no se correlacionaron. Cuando se fraccionaron las muestras de plasma, miR-BART17 se copurificó con una fracción rica en proteínas pero no con exosomas. La detección de altas concentraciones de miR-BART17 en plasma es consistente en pacientes con NPC. Este parámetro es, al menos en parte, independiente de la carga de ADN viral. El miR-BART17 circulante no se copurifica con los exosomas.

Files

1743-422X-10-119.pdf

Files (1.5 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:8ac8360ce94122a7df2d8b830a26fbfd
1.5 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تركيز عالٍ ثابت من الحمض النووي الريبي الفيروسي BART17 في عينات البلازما من مرضى سرطان البلعوم الأنفي - دليل على انتقال غير إكسوزومي
Translated title (French)
Concentration élevée constante du microARN viral BART17 dans les échantillons de plasma de patients atteints de carcinome nasopharyngé - preuve de transport non osomal
Translated title (Spanish)
Alta concentración constante del microARN viral BART17 en muestras de plasma de pacientes con carcinoma nasofaríngeo: evidencia de transporte no exosómico

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2149423226
DOI
10.1186/1743-422x-10-119

Is supplement to
https://openalex.org/W4387637728 (Other)
https://openalex.org/W4386033707 (Other)
https://openalex.org/W4321166613 (Other)
https://openalex.org/W1970650594 (Other)
https://openalex.org/W4378085118 (Other)
https://openalex.org/W2111545764 (Other)
https://openalex.org/W2067275497 (Other)
https://openalex.org/W2947838112 (Other)
https://openalex.org/W2073341747 (Other)
https://openalex.org/W2529223554 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Tunisia

References

  • https://openalex.org/W173041575
  • https://openalex.org/W650449067
  • https://openalex.org/W1515952044
  • https://openalex.org/W2005731224
  • https://openalex.org/W2017857120
  • https://openalex.org/W2024206172
  • https://openalex.org/W2027434506
  • https://openalex.org/W2032696674
  • https://openalex.org/W2057752054
  • https://openalex.org/W2068118422
  • https://openalex.org/W2074185840
  • https://openalex.org/W2074689365
  • https://openalex.org/W2077502954
  • https://openalex.org/W2094077020
  • https://openalex.org/W2100896374
  • https://openalex.org/W2115093090
  • https://openalex.org/W2119293638
  • https://openalex.org/W2121179939
  • https://openalex.org/W2129038927
  • https://openalex.org/W2131375124
  • https://openalex.org/W2148424234
  • https://openalex.org/W2149966907
  • https://openalex.org/W2155966781
  • https://openalex.org/W2159278398
  • https://openalex.org/W2167604259