Published December 7, 2023 | Version v1
Publication Open

Facile green <i>in situ</i> hemisynthesis of new chiral chromeno-pyrimidine derivatives: antibacterial, antioxidant activities and molecular docking study

Creators

  • 1. Constantine 1 University
  • 2. Centre de Recherche sur l'Information Scientifique et Technique
  • 3. Université de Reims Champagne-Ardenne
  • 4. Institut de Chimie Moléculaire de Reims
  • 5. Centre National de la Recherche Scientifique

Description

A hemisynthesis 'in situ' reaction of (thio)barbituric acids with an α,β-unsaturated aldehyde using perillaldehyde from Ammodaucus leucotrichus essential oil, afforded chromeno-pyrimidine derivatives B-1 and B-2. The reaction was carried out in water and water/ethanol medium without a catalyst. The obtained pyrimidines were identified by their spectral 1H,13C, Dept-135, HMBC, HSQC, COSY, and NOESY 2D. The antioxidant activity of both compounds was evaluated using different in vitro methods (DPPH, ABTS, and CUPRAC). The hemisynthesized molecules exhibited a bacteriostatic effect against ten tested gram (+) and gram (-) strains. According to the molecular docking analysis, B-1 showed lower binding energies compared to B-2 against (PDB: 1HD2) and (PDB: 1KZN) targets, which is in agreement with the ABTS and E. Coli assays. Furthermore, a probable promising anti-HIV activity was noticed against reverse transcriptase (PDB: 2RKI), a key enzyme for HIV replication. The ADME properties calculations showed no Lipinski's rule violation for both compounds.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

رد فعل نصفي التخليق "في الموقع" لأحماض الباربيتوريك (ثيو) مع ألدهيد α، β غير المشبع باستخدام بيريلالدهيد من زيت أميودوكوس لوكوتريشوس العطري، ومشتقات كرومينو بريميدين B -1 و B -2. تم تنفيذ التفاعل في وسط الماء والماء/الإيثانول بدون محفز. تم تحديد البيريميدينات التي تم الحصول عليها من خلال أطيافها1H و 13C و Dept -135 و HMBC و HSQC و COSY و NOESY 2D. تم تقييم النشاط المضاد للأكسدة لكلا المركبين باستخدام طرق مختلفة في المختبر (DPPH و ABTS و CUPRAC). أظهرت الجزيئات نصف المركبة تأثيرًا جراثيمياً ضد عشرة سلالات من الغرام (+) والغرام (-) تم اختبارها. وفقًا لتحليل الالتحام الجزيئي، أظهر B -1 طاقات ربط أقل مقارنة بأهداف B -2 ضد (PDB: 1HD2) و (PDB: 1KZN)، والتي تتفق مع فحوصات ABTS و E. Coli. علاوة على ذلك، لوحظ نشاط واعد محتمل لمكافحة فيروس نقص المناعة البشرية ضد النسخ العكسي (PDB: 2RKI)، وهو إنزيم رئيسي لتكرار فيروس نقص المناعة البشرية. أظهرت حسابات خصائص ADME عدم وجود انتهاك لقواعد Lipinski لكلا المركبين.

Translated Description (French)

Une réaction « in situ » d'hémisynthèse des acides (thio)barbituriques avec un aldéhyde α,β-insaturé en utilisant le périllaldéhyde de l'huile essentielle d'Ammodaucus leucotrichus, a donné les dérivés chroméno-pyrimidine B-1 et B-2. La réaction a été réalisée en milieu eau et eau/éthanol sans catalyseur. Les pyrimidines obtenues ont été identifiées par leurs spectres 1H, 13C, Dept-135, HMBC, HSQC, COSY et NOESY 2D. L'activité antioxydante des deux composés a été évaluée en utilisant différentes méthodes in vitro (DPPH, ABTS et CUPRAC). Les molécules hémisynthétisées présentaient un effet bactériostatique contre dix souches gram (+) et gram (-) testées. Selon l'analyse d'amarrage moléculaire, B-1 a montré des énergies de liaison plus faibles par rapport à B-2 contre les cibles (PDB : 1HD2) et (PDB : 1KZN), ce qui est en accord avec les tests ABTS et E. Coli. De plus, une activité anti-VIH probablement prometteuse a été observée contre la transcriptase inverse (PDB : 2RKI), une enzyme clé pour la réplication du VIH. Les calculs des propriétés de l'ADME n'ont montré aucune violation de la règle de Lipinski pour les deux composés.

Translated Description (Spanish)

Una reacción de hemisíntesis 'in situ' de ácidos (tío)barbitúricos con un aldehído α,β-insaturado utilizando perilaldehído del aceite esencial de Ammodaucus leucotrichus, proporcionó los derivados de cromo-pirimidina B-1 y B-2. La reacción se llevó a cabo en agua y medio de agua/etanol sin catalizador. Las pirimidinas obtenidas se identificaron por sus espectrales 1H, 13C, Dept-135, HMBC, HSQC, COSY y NOESY 2D. La actividad antioxidante de ambos compuestos se evaluó utilizando diferentes métodos in vitro (DPPH, ABTS y CUPRAC). Las moléculas hemisintetizadas mostraron un efecto bacteriostático contra diez cepas gram (+) y gram (-) probadas. De acuerdo con el análisis de acoplamiento molecular, B-1 mostró energías de unión más bajas en comparación con B-2 contra objetivos (PDB: 1HD2) y (PDB: 1KZN), lo que está de acuerdo con los ensayos ABTS y E. Coli. Además, se observó una probable actividad prometedora contra el VIH contra la transcriptasa inversa (PDB: 2RKI), una enzima clave para la replicación del VIH. Los cálculos de las propiedades de ADME no mostraron ninguna violación de la regla de Lipinski para ambos compuestos.

Files

43534948.pdf.pdf

Files (2.7 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:ff6c3eb2fcbb1a41550e4251d60830a1
2.7 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تخليق <i>جزئي</i> أخضر سهل لمشتقات الكرومينو- بريميدين الجديدة: الأنشطة المضادة للبكتيريا ومضادات الأكسدة ودراسة الالتحام الجزيئي
Translated title (French)
Hémisynthèse <i>in situ</i> Facile Green de nouveaux dérivés chiraux de chroméno-pyrimidine&nbsp;: activités antibactériennes, antioxydantes et étude d'amarrage moléculaire
Translated title (Spanish)
Hemisíntesis <i>in situ</i> verde fácil de nuevos derivados quirales de cromo-pirimidina: estudio de actividades antibacterianas, antioxidantes y acoplamiento molecular

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4389483323
DOI
10.1080/14786419.2023.2290148

Is supplement to
https://openalex.org/W3140442941 (Other)
https://openalex.org/W3127865259 (Other)
https://openalex.org/W2951824536 (Other)
https://openalex.org/W2413986183 (Other)
https://openalex.org/W2363825988 (Other)
https://openalex.org/W2085378696 (Other)
https://openalex.org/W2072866078 (Other)
https://openalex.org/W2064060456 (Other)
https://openalex.org/W2033009127 (Other)
https://openalex.org/W2028259684 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Algeria

References

  • https://openalex.org/W1015836377
  • https://openalex.org/W1994363604
  • https://openalex.org/W1995855887
  • https://openalex.org/W2004719850
  • https://openalex.org/W2037601345
  • https://openalex.org/W2061892444
  • https://openalex.org/W2087101357
  • https://openalex.org/W2088123476
  • https://openalex.org/W2141440960
  • https://openalex.org/W2751285754
  • https://openalex.org/W2779624043
  • https://openalex.org/W2886355521
  • https://openalex.org/W2910634913
  • https://openalex.org/W2921088624
  • https://openalex.org/W2950970602
  • https://openalex.org/W3080835867
  • https://openalex.org/W3137491083
  • https://openalex.org/W3154909688
  • https://openalex.org/W3190083767
  • https://openalex.org/W3191514146
  • https://openalex.org/W4200203794