Published April 30, 2020 | Version v1
Publication Open

Analysis of BRCA1 large genomic rearrangements to identify individuals at risk of breast cancer

Creators

  • 1. Polytechnic University of Puerto Rico
  • 2. Autonomous University of Sinaloa
  • 3. Mexican Social Security Institute
  • 4. Universidad Autónoma de Occidente

Description

Abstract Background. Breast cancer (BC) is a malignant neoplasm in which genetic and environmental aspects contribute to its development. In many cases, pathogenic mutations in BRCA1 are caused by large genomic rearrangements such as copy number variations, a mechanism of gene inactivation that increases the risk of BC. Therefore, identifying women at high risk of BC through genetic testing is of great importance. This study aimed to identify large BRCA1 rearrangements in patients with early-onset or family history of BC. Methods. Peripheral blood from patients with (n= 38) and without (n= 30) BC was analyzed using the multiplex ligation-dependent probe amplification assay to detect large genomic rearrangements in BRCA1. Results. One patient with sporadic BC showed an ambiguous deletion in exon 12 of the BRCA1 gene. To validate this result, full sequencing of this region was performed. The mutation detected by MLPA resulted in a false positive, showing that large genomic rearrangements in BRCA1 were absent in all subjects. Moreover, in this same patient, we detected the presence of c.4308T>C (rs1060915) polymorphism. Conclusions. In our patients with BC, large genomic rearrangements in BRCA1 are held unaccountable for the development of the disease. We identified the presence of single nucleotide polymorphism, c.4308T>C (rs1060915), in a patient with sporadic BC.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

خلفية مجردة. سرطان الثدي (BC) هو ورم خبيث تساهم فيه الجوانب الوراثية والبيئية في تطوره. في كثير من الحالات، تحدث الطفرات المسببة للأمراض في BRCA1 بسبب عمليات إعادة الترتيب الجيني الكبيرة مثل اختلافات عدد النسخ، وهي آلية لتعطيل الجينات تزيد من خطر BC. لذلك، فإن تحديد النساء المعرضات لخطر كبير من BC من خلال الاختبارات الجينية له أهمية كبيرة. تهدف هذه الدراسة إلى تحديد إعادة ترتيب BRCA1 الكبيرة في المرضى الذين يعانون من تاريخ مبكر أو عائلي من BC. الطرق. تم تحليل الدم المحيطي من المرضى الذين يعانون من (n= 38) وبدون (n= 30) قبل الميلاد باستخدام اختبار تضخيم المجس المتعدد المعتمد على الربط للكشف عن إعادة الترتيب الجيني الكبير في BRCA1. النتائج. أظهر أحد المرضى المصابين بـ BC المتقطع حذفًا غامضًا في إكسون 12 من جين BRCA1. للتحقق من صحة هذه النتيجة، تم إجراء تسلسل كامل لهذه المنطقة. أدت الطفرة التي اكتشفتها MLPA إلى نتيجة إيجابية خاطئة، مما يدل على أن عمليات إعادة الترتيب الجيني الكبيرة في BRCA1 كانت غائبة في جميع الموضوعات. علاوة على ذلك، اكتشفنا في هذا المريض نفسه وجود تعدد الأشكالc.4308T >C (rs1060915). الاستنتاجات. في مرضانا الذين يعانون من BC، يتم اعتبار عمليات إعادة الترتيب الجيني الكبيرة في BRCA1 غير مسؤولة عن تطور المرض. حددنا وجود تعدد أشكال نيوكليوتيد واحد، c.4308T >C (rs1060915)، في مريض مصاب بـ BC متقطع.

Translated Description (French)

Résumé Contexte Le cancer du sein (CB) est un néoplasme malin dans lequel les aspects génétiques et environnementaux contribuent à son développement. Dans de nombreux cas, les mutations pathogènes dans BRCA1 sont causées par de grands réarrangements génomiques tels que des variations du nombre de copies, un mécanisme d'inactivation génique qui augmente le risque de BC. Par conséquent, l'identification des femmes à haut risque de BC par le biais de tests génétiques est d'une grande importance. Cette étude visait à identifier les grands réarrangements BRCA1 chez les patients ayant des antécédents précoces ou familiaux de CB. Méthodes. Le sang périphérique des patients avec (n= 38) et sans (n= 30) BC a été analysé en utilisant le test d'amplification de sonde dépendante de la ligation multiplex pour détecter les grands réarrangements génomiques dans BRCA1. Résultats. Un patient avec BC sporadique a montré une délétion ambiguë dans l'exon 12 du gène BRCA1. Pour valider ce résultat, un séquençage complet de cette région a été réalisé. La mutation détectée par MLPA a donné un faux positif, montrant que les grands réarrangements génomiques dans BRCA1 étaient absents chez tous les sujets. Par ailleurs, chez ce même patient, nous avons détecté la présence d'un polymorphisme c.4308T >C (rs1060915). Conclusions. Chez nos patients atteints de CB, les grands réarrangements génomiques dans BRCA1 ne sont pas tenus responsables du développement de la maladie. Nous avons identifié la présence d'un polymorphisme mononucléotidique,c.4308T >C (rs1060915), chez un patient avec BC sporadique.

Translated Description (Spanish)

Resumen Antecedentes El cáncer de mama (BC) es una neoplasia maligna en la que los aspectos genéticos y ambientales contribuyen a su desarrollo. En muchos casos, las mutaciones patógenas en BRCA1 son causadas por grandes reordenamientos genómicos, como variaciones en el número de copias, un mecanismo de inactivación de genes que aumenta el riesgo de BC. Por lo tanto, identificar a las mujeres con alto riesgo de BC a través de pruebas genéticas es de gran importancia. Este estudio tuvo como objetivo identificar grandes reordenamientos de BRCA1 en pacientes con antecedentes familiares o de inicio temprano de BC. Métodos. La sangre periférica de pacientes con (n= 38) y sin (n= 30) BC se analizó utilizando el ensayo de amplificación de sonda dependiente de ligación múltiple para detectar grandes reordenamientos genómicos en BRCA1. Resultados. Un paciente con BC esporádico mostró una deleción ambigua en el exón 12 del gen BRCA1. Para validar este resultado, se realizó la secuenciación completa de esta región. La mutación detectada por MLPA dio como resultado un falso positivo, lo que demuestra que los grandes reordenamientos genómicos en BRCA1 estaban ausentes en todos los sujetos. Además, en este mismo paciente, detectamos la presencia de polimorfismoc.4308T >C (rs1060915). Conclusiones. En nuestros pacientes con BC, los grandes reordenamientos genómicos en BRCA1 no se consideran responsables del desarrollo de la enfermedad. Identificamos la presencia de polimorfismo de un solo nucleótido,c.4308T >C (rs1060915), en un paciente con BC esporádico.

Files

latest.pdf.pdf

Files (469.2 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:81b5c0ac6d9c313da52dd3395430202f
469.2 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تحليل إعادة ترتيب الجينوم الكبير BRCA1 لتحديد الأفراد المعرضين لخطر الإصابة بسرطان الثدي
Translated title (French)
Analyse des grands réarrangements génomiques de BRCA1 pour identifier les individus à risque de cancer du sein
Translated title (Spanish)
Análisis de los grandes reordenamientos genómicos de BRCA1 para identificar a las personas en riesgo de cáncer de mama

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3142516691
DOI
10.21203/rs.3.rs-22497/v1

Is supplement to
https://openalex.org/W4387904467 (Other)
https://openalex.org/W4200117138 (Other)
https://openalex.org/W3006529133 (Other)
https://openalex.org/W2427149715 (Other)
https://openalex.org/W2412931169 (Other)
https://openalex.org/W2381007986 (Other)
https://openalex.org/W2365179609 (Other)
https://openalex.org/W2314934636 (Other)
https://openalex.org/W2216207334 (Other)
https://openalex.org/W2149280534 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Colombia

References

  • https://openalex.org/W1529124608
  • https://openalex.org/W1966651331
  • https://openalex.org/W1971110918
  • https://openalex.org/W1973161750
  • https://openalex.org/W2013836466
  • https://openalex.org/W2052060527
  • https://openalex.org/W2057331934
  • https://openalex.org/W2085115800
  • https://openalex.org/W2085755265
  • https://openalex.org/W2088782057
  • https://openalex.org/W2143924924
  • https://openalex.org/W2149836518
  • https://openalex.org/W2619123093
  • https://openalex.org/W2807321675
  • https://openalex.org/W2892164143