Published August 22, 2022
| Version v1
Publication
Open
The first study of genetic diversity and population structure of Indo- Pacific bottlenose dolphin (Tursiops aduncus) and pantropical spotted dolphin (Stenella attenuata) in the Thai Andaman Sea based on ISSR
Creators
- 1. Chiang Mai University
- 2. Naresuan University
- 3. Phuket Rajabhat University
Description
The Indo-Pacific bottlenose dolphin, Tursiops aduncus, and the pantropical spotted dolphin, Stenella attenuata, are protected marine mammals in Thailand; however, knowledge regarding the populations of both species in Thai seas is minimal. We aimed to reveal the genetic diversity and population structure of two species, T. aduncus, and S. attenuata, based on inter-simple sequence repeats (ISSRs).Samples of stranded T. aduncus (n = 30) and S. attenuata (n = 23) found along Thai Andaman Sea coasts from 1998 to 2018 were used in this study. A total of 17 and 16 ISSR primers that produced clear and polymorphic bands were selected for T. aduncus and S. attenuata, respectively.The highest percentages of polymorphic bands for T. aduncus and S. attenuata were 93.750% and 92.857%, respectively. Phylogenetic dendrograms indicated that the population of each species was clustered into three groups. This outcome was consistent with the genetic population structure, as both suggested three genetic clusters (DK = 3). Genetic diversity analysis revealed that the average Shannon's information index (I) was 1.926 ± 0.066 for T. aduncus and 1.714 ± 0.090 for S. attenuata, which indicate a high level of genetic variation. Further, low fixation index (F) values were observed for T. aduncus and S. attenuata at -0.231 ± 0.024 and -0.312 ± 0.042, respectively, suggesting that inbreeding is unlikely to have occurred for both species over the past decades.At least three genetic clusters of both species were found in the Thai Andaman Sea, and the diversity indices of each species indicated that these species are not at a critical level for extinction. However, monitoring their population status should be prioritized to observe any future changes in the level of diversity.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
الدلفين الهندي الباسيفيكي، Tursiops aduncus، والدلفين المرقط الاستوائي، Stenella attenuata، هي ثدييات بحرية محمية في تايلاند ؛ ومع ذلك، فإن المعرفة المتعلقة بتعداد كلا النوعين في البحار التايلاندية ضئيلة. كنا نهدف إلى الكشف عن التنوع الجيني والبنية السكانية لنوعين، T. aduncus، و S. attenuata، بناءً على تكرار التسلسل البسيط (ISSRs). تم استخدام عينات من T. aduncus الذين تقطعت بهم السبل (n = 30) و S. attenuata (n = 23) الموجودة على طول سواحل بحر أندامان التايلاندي من 1998 إلى 2018 في هذه الدراسة. تم اختيار ما مجموعه 17 و 16 من بادئات ISSR التي أنتجت نطاقات واضحة ومتعددة الأشكال لـ T. aduncus و S. attenuata، على التوالي. كانت أعلى النسب المئوية للنطاقات متعددة الأشكال لـ T. aduncus و S. attenuata 93.750 ٪ و 92.857 ٪ على التوالي. أشارت التشعبات الوراثية إلى أن تجمعات كل نوع كانت مجمعة في ثلاث مجموعات. كانت هذه النتيجة متسقة مع البنية السكانية الوراثية، حيث اقترح كلاهما ثلاث مجموعات وراثية (DK = 3). كشف تحليل التنوع الجيني أن متوسط مؤشر معلومات شانون (I) كان 1.926 ± 0.066 لـ T. aduncus و 1.714 ± 0.090 لـ S. attenuata، مما يشير إلى مستوى عالٍ من الاختلاف الجيني. علاوة على ذلك، لوحظت قيم مؤشر التثبيت المنخفض (F) لـ T. aduncus و S. attenuata عند -0.231 ± 0.024 و -0.312 ± 0.042، على التوالي، مما يشير إلى أنه من غير المرجح أن يكون التزاوج الداخلي قد حدث لكلا النوعين على مدى العقود الماضية. تم العثور على ثلاث مجموعات وراثية على الأقل من كلا النوعين في بحر أندامان التايلاندي، وتشير مؤشرات التنوع لكل نوع إلى أن هذه الأنواع ليست في مستوى حرج للانقراض. ومع ذلك، ينبغي إعطاء الأولوية لرصد وضعهم السكاني لمراقبة أي تغييرات مستقبلية في مستوى التنوع.Translated Description (French)
Le grand dauphin de l'Indo-Pacifique, Tursiops aduncus, et le dauphin tacheté pantropical, Stenella attenuata, sont des mammifères marins protégés en Thaïlande ; cependant, les connaissances concernant les populations des deux espèces dans les mers thaïlandaises sont minimales. Nous avons cherché à révéler la diversité génétique et la structure de la population de deux espèces, T. aduncus et S. attenuata, sur la base de répétitions de séquences inter-simples (ISSR). Des échantillons de T. aduncus échoués (n = 30) et de S. attenuata (n = 23) trouvés le long des côtes thaïlandaises de la mer d'Andaman de 1998 à 2018 ont été utilisés dans cette étude. Au total, 17 et 16 amorces ISSR produisant des bandes claires et polymorphes ont été sélectionnées pour T. aduncus et S. attenuata, respectivement. Les pourcentages les plus élevés de bandes polymorphes pour T. aduncus et S. attenuata étaient de 93,750 % et 92,857 %, respectivement. Les dendrogrammes phylogénétiques indiquent que la population de chaque espèce est regroupée en trois groupes. Ce résultat était cohérent avec la structure de la population génétique, car les deux suggéraient trois groupes génétiques (DK = 3). L'analyse de la diversité génétique a révélé que l'indice d'information moyen de Shannon (I) était de 1,926 ± 0,066 pour T. aduncus et de 1,714 ± 0,090 pour S. attenuata, ce qui indique un niveau élevé de variation génétique. En outre, de faibles valeurs d'indice de fixation (F) ont été observées pour T. aduncus et S. attenuata à -0,231 ± 0,024 et -0,312 ± 0,042, respectivement, suggérant qu'il est peu probable que la consanguinité se soit produite pour les deux espèces au cours des dernières décennies. Au moins trois grappes génétiques des deux espèces ont été trouvées dans la mer d'Andaman thaïlandaise, et les indices de diversité de chaque espèce ont indiqué que ces espèces ne sont pas à un niveau critique pour l'extinction. Cependant, le suivi de l'état de leur population devrait être prioritaire pour observer tout changement futur du niveau de diversité.Translated Description (Spanish)
El delfín nariz de botella del Indo-Pacífico, Tursiops aduncus, y el delfín manchado pantropical, Stenella attenuata, son mamíferos marinos protegidos en Tailandia; sin embargo, el conocimiento sobre las poblaciones de ambas especies en los mares tailandeses es mínimo. Nuestro objetivo fue revelar la diversidad genética y la estructura de la población de dos especies, T. aduncus y S. attenuata, basadas en repeticiones de secuencia intersimple (ISSR). En este estudio se utilizaron muestras de T. aduncus trenzado (n = 30) y S. attenuata (n = 23) encontradas a lo largo de las costas del mar de Andamán tailandés de 1998 a 2018. Se seleccionaron un total de 17 y 16 cebadores ISSR que produjeron bandas claras y polimórficas para T. aduncus y S. attenuata, respectivamente. Los porcentajes más altos de bandas polimórficas para T. aduncus y S. attenuata fueron 93.750% y 92.857%, respectivamente. Los dendrogramas filogenéticos indicaron que la población de cada especie se agrupaba en tres grupos. Este resultado fue consistente con la estructura de la población genética, ya que ambos sugirieron tres grupos genéticos (DK = 3). El análisis de diversidad genética reveló que el índice de información de Shannon promedio (I) fue de 1.926 ± 0.066 para T. aduncus y 1.714 ± 0.090 para S. attenuata, lo que indica un alto nivel de variación genética. Además, se observaron valores bajos de índice de fijación (F) para T. aduncus y S. attenuata en -0.231 ± 0.024 y -0.312 ± 0.042, respectivamente, lo que sugiere que es poco probable que se haya producido endogamia para ambas especies en las últimas décadas. Al menos tres grupos genéticos de ambas especies se encontraron en el mar de Andamán tailandés, y los índices de diversidad de cada especie indicaron que estas especies no se encuentran en un nivel crítico para la extinción. Sin embargo, se debe priorizar el monitoreo del estado de su población para observar cualquier cambio futuro en el nivel de diversidad.Files
13.pdf.pdf
Files
(226 Bytes)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:5360980bad11bf9723da89687501effc
|
226 Bytes | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- أول دراسة للتنوع الوراثي والهيكل السكاني للدلافين الهندو- المحيط الهادئ (Tursiops aduncus) والدلافين المرقطة الاستوائية (Stenella attenuata) في بحر أندامان التايلاندي على أساس ISSR
- Translated title (French)
- La première étude de la diversité génétique et de la structure de la population du grand dauphin de l'Indo-Pacifique (Tursiops aduncus) et du dauphin tacheté pantropical (Stenella attenuata) dans la mer d'Andaman thaïlandaise basée sur l'ISSR
- Translated title (Spanish)
- El primer estudio de la diversidad genética y la estructura de la población del delfín mular del Indo-Pacífico (Tursiops aduncus) y del delfín manchado pantropical (Stenella attenuata) en el mar de Andamán tailandés basado en ISSR
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4292608983
- DOI
- 10.14202/vetworld.2022.2004-2011
References
- https://openalex.org/W1986476628
- https://openalex.org/W2004444667
- https://openalex.org/W2035839217
- https://openalex.org/W2046619496
- https://openalex.org/W2056514891
- https://openalex.org/W2057552610
- https://openalex.org/W2060891246
- https://openalex.org/W2062846637
- https://openalex.org/W2063917613
- https://openalex.org/W2076672640
- https://openalex.org/W2081160727
- https://openalex.org/W2098063778
- https://openalex.org/W2098126593
- https://openalex.org/W2104987411
- https://openalex.org/W2106114872
- https://openalex.org/W2121512231
- https://openalex.org/W2124020140
- https://openalex.org/W2145690636
- https://openalex.org/W2157391450
- https://openalex.org/W2163149929
- https://openalex.org/W2170882445
- https://openalex.org/W2307546595
- https://openalex.org/W2320328969
- https://openalex.org/W2555661304
- https://openalex.org/W2779628469
- https://openalex.org/W2903130098
- https://openalex.org/W2906968187
- https://openalex.org/W2937941593
- https://openalex.org/W2957773992
- https://openalex.org/W2975662702
- https://openalex.org/W3099259405
- https://openalex.org/W3142486511
- https://openalex.org/W3165706301
- https://openalex.org/W3186579208
- https://openalex.org/W4241672898
- https://openalex.org/W4252793934