Published May 15, 2019 | Version v1
Publication Open

Polymorphisms in IL-10 and TGF-β gene promoter are associated with lower risk to gastric cancer in a Mexican population

Creators

  • 1. Duke University Hospital
  • 2. Duke Medical Center
  • 3. Instituto Nacional de Salud Pública
  • 4. Mexican Social Security Institute
  • 5. Hospital Infantil de México Federico Gómez

Description

Helicobacter pylori infection is recognized as the main risk factor for gastric cancer (GC), the fifth most common neoplasia worldwide. H. pylori interacts with the immune system, disrupting the cytokine network and inducing chronic inflammation. This work aimed to evaluate the association between single nucleotide polymorphisms (SNPs) in selected cytokine gene promoters and GC.The study included 359 subjects, 125 GC patients, 109 intestinal metaplasia (IM) patients and 125 asymptomatic controls. DNA was extracted from white blood cells and nine SNPs in cytokine gene promoters were genotyped using predesigned 5'-endonulease assays. The association of the SNPs with IM and GC was evaluated using multinomial regression models.Both genotypes, TC (OR = 0.51, 95% CI = 0.27-0.98) and TT (OR = 0.42, 95% CI = 0.20-0.91) in the locus - 509 of the TGF-β promoter were significantly associated with GC. The TT genotype in the locus - 819 of the IL-10 promoter was also significantly associated with GC (OR = 0.37, 95% CI = 0.17-0.81). No significant association was found with SNPs IL-4 -590 T/C (rs1800629), IL-6 -573G/C (rs1800796), IL-10 -592C/A (rs1800872), IL-10 -1082A/G (rs1800896), and, IFN-γ -1615C/T (rs2069705).SNPs in TGFβ (- 509 C/T, rs1800469) and IL-10 (- 819 C/T, rs1800871) promoters were associated with a lower risk for GC in a Mexican population.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

من المسلم به أن عدوى الملوية البوابية هي عامل الخطر الرئيسي لسرطان المعدة (GC)، وهو خامس أكثر الأورام شيوعًا في جميع أنحاء العالم. يتفاعل الملوية البوابية مع الجهاز المناعي، مما يعطل شبكة السيتوكين ويسبب التهابًا مزمنًا. يهدف هذا العمل إلى تقييم الارتباط بين تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) في معززات الجينات السيتوكينية المختارة و GC. وشملت الدراسة 359 مشاركًا و 125 مريضًا بـ GC و 109 مرضى بالحؤول المعوي (IM) و 125 ضابطا بدون أعراض. تم استخراج الحمض النووي من خلايا الدم البيضاء وتم تنميط تسعة SNPs في معززات الجينات السيتوكينية باستخدام مقايسات 5'- endonulease المصممة مسبقًا. تم تقييم ارتباط SNPs مع IM و GC باستخدام نماذج الانحدار متعددة الحدود. كل من الأنماط الجينية، TC (OR = 0.51، 95 ٪ CI = 0.27-0.98) و TT (OR = 0.42، 95 ٪ CI = 0.20-0.91) في الموضع - 509 من معزز TGF - β ارتبط بشكل كبير بـ GC. كما ارتبط النمط الجيني لـ TT في الموضع - 819 من معزز IL -10 بشكل كبير بـ GC (OR = 0.37، 95 ٪ CI = 0.17-0.81). لم يتم العثور على ارتباط كبير مع SNPs IL -4 -590 T/C (rs1800629)، IL -6 -573G/C (rs1800796)، IL -10 -592C/A (rs1800872)، IL -10 -1082A/G (rs1800896)، و، IFN - γ -1615C/T (rs2069705). تم ربط SNPs في TGFβ (-509 C/T، rs1800469) و IL -10 (-819 C/T، rs1800871) بمخاطر أقل لـ GC في السكان المكسيكيين.

Translated Description (French)

L'infection à Helicobacter pylori est reconnue comme le principal facteur de risque de cancer gastrique (GC), la cinquième néoplasie la plus fréquente dans le monde. H. pylori interagit avec le système immunitaire, perturbant le réseau de cytokines et induisant une inflammation chronique. Ce travail visait à évaluer l'association entre les polymorphismes mononucléotidiques (SNP) chez des promoteurs de gènes de cytokines sélectionnés et GC.L' étude comprenait 359 sujets, 125 patients GC, 109 patients atteints de métaplasie intestinale (IM) et 125 témoins asymptomatiques. L'ADN a été extrait des globules blancs et neuf SNP dans les promoteurs du gène des cytokines ont été génotypés à l'aide de dosages prédéfinis de 5'-endonuléase. L'association des SNP avec IM et GC a été évaluée à l'aide de modèles de régression multinomiale. Les deux génotypes, TC (OR = 0,51, IC à 95 % = 0,27-0,98) et TT (OR = 0,42, IC à 95 % = 0,20-0,91) dans le locus - 509 du promoteur TGF-β étaient significativement associés à GC. Le génotype TT dans le locus - 819 du promoteur de l'IL-10 était également significativement associé à la GC (OR = 0,37, IC à 95 % = 0,17-0,81). Aucune association significative n'a été trouvée avec les promoteurs SNPS IL-4 -590 T/C (rs1800629), IL-6 -573G/C (rs1800796), IL-10 -592C/A (rs1800872), IL-10 -1082A/G (rs1800896) et IFN-γ -1615C/T (rs2069705) .SNP dans le TGFβ (- 509 C/T, rs1800469) et IL-10 (- 819 C/T, rs1800871) étaient associés à un risque plus faible de GC dans une population mexicaine.

Translated Description (Spanish)

La infección por Helicobacter pylori se reconoce como el principal factor de riesgo para el cáncer gástrico (GC), la quinta neoplasia más común en todo el mundo. H. pylori interactúa con el sistema inmunitario, interrumpiendo la red de citocinas e induciendo inflamación crónica. Este trabajo tuvo como objetivo evaluar la asociación entre polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en promotores de genes de citocinas seleccionados y GC.El estudio incluyó 359 sujetos, 125 pacientes con GC, 109 pacientes con metaplasia intestinal (IM) y 125 controles asintomáticos. Se extrajo ADN de glóbulos blancos y se genotipificaron nueve SNP en promotores de genes de citocinas utilizando ensayos de endonucleasa 5'prediseñados. La asociación de los SNP con IM y GC se evaluó mediante modelos de regresión multinomial. Ambos genotipos, TC (OR = 0,51, IC 95% = 0,27-0,98) y TT (OR = 0,42, IC 95% = 0,20-0,91) en el locus - 509 del promotor TGF-β se asociaron significativamente con GC. El genotipo TT en el locus - 819 del promotor de IL-10 también se asoció significativamente con GC (OR = 0.37, IC del 95% = 0.17-0.81). No se encontró asociación significativa con los SNP IL-4 -590 T/C (rs1800629), IL-6 -573G/C (rs1800796), IL-10 -592C/A (rs1800872), IL-10 -1082A/G (rs1800896) e IFN-γ -1615C/T (rs2069705). Los SNP en los promotores TGFβ (-509 C/T, rs1800469) e IL-10 (-819 C/T, rs1800871) se asociaron con un menor riesgo de GC en una población mexicana.

Files

s12885-019-5627-z.pdf

Files (603.7 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:4a56eca4cd3c4a8f46967ab1ea295ebf
603.7 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
يرتبط تعدد الأشكال في IL -10 ومحفز جين TGF - β بانخفاض خطر الإصابة بسرطان المعدة لدى السكان المكسيكيين
Translated title (French)
Les polymorphismes dans le promoteur du gène IL-10 et TGF-β sont associés à un risque plus faible de cancer gastrique dans une population mexicaine
Translated title (Spanish)
Los polimorfismos en el promotor del gen IL-10 y TGF-β se asocian con un menor riesgo de cáncer gástrico en una población mexicana

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2947510812
DOI
10.1186/s12885-019-5627-z

Is supplement to
https://openalex.org/W3212414177 (Other)
https://openalex.org/W2891858816 (Other)
https://openalex.org/W2795723184 (Other)
https://openalex.org/W2042874675 (Other)
https://openalex.org/W2025529750 (Other)
https://openalex.org/W2007418658 (Other)
https://openalex.org/W1969771092 (Other)
https://openalex.org/W1967718992 (Other)
https://openalex.org/W184057646 (Other)
https://openalex.org/W129398428 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Mexico

References

  • https://openalex.org/W1591464477
  • https://openalex.org/W1757407923
  • https://openalex.org/W1826148430
  • https://openalex.org/W1921416115
  • https://openalex.org/W1973113660
  • https://openalex.org/W1974793840
  • https://openalex.org/W1975605578
  • https://openalex.org/W1977516332
  • https://openalex.org/W1985511732
  • https://openalex.org/W1991190482
  • https://openalex.org/W2000762690
  • https://openalex.org/W2014885453
  • https://openalex.org/W2016283253
  • https://openalex.org/W2025487609
  • https://openalex.org/W2025710239
  • https://openalex.org/W2033998941
  • https://openalex.org/W2037038224
  • https://openalex.org/W2043305810
  • https://openalex.org/W2053244132
  • https://openalex.org/W2053406704
  • https://openalex.org/W2053478879
  • https://openalex.org/W2055996962
  • https://openalex.org/W2057486848
  • https://openalex.org/W2070429585
  • https://openalex.org/W2080179829
  • https://openalex.org/W2081181980
  • https://openalex.org/W2088543460
  • https://openalex.org/W2088934402
  • https://openalex.org/W2091581429
  • https://openalex.org/W2098760550
  • https://openalex.org/W2101104221
  • https://openalex.org/W2104537472
  • https://openalex.org/W2113726636
  • https://openalex.org/W2117879926
  • https://openalex.org/W2125085532
  • https://openalex.org/W2129658496
  • https://openalex.org/W2137340802
  • https://openalex.org/W2146457049
  • https://openalex.org/W2170058428
  • https://openalex.org/W2171795093
  • https://openalex.org/W2396414992
  • https://openalex.org/W2438687757
  • https://openalex.org/W2468562573
  • https://openalex.org/W2578604674
  • https://openalex.org/W2599614749
  • https://openalex.org/W2617162944
  • https://openalex.org/W2735240044
  • https://openalex.org/W2755506889
  • https://openalex.org/W2789793276
  • https://openalex.org/W2794528510
  • https://openalex.org/W2824606123
  • https://openalex.org/W4297875023