Published May 28, 2021 | Version v1
Publication Open

Phenotypic and Genotypic Characterization of the New Bacillus Cereus Phage SWEP1

Creators

  • 1. China Agricultural University
  • 2. Huazhong University of Science and Technology
  • 3. Hefei University of Technology
  • 4. King University
  • 5. Peking University

Description

Abstract A new Bacillus cereus phage SWEP1 was isolated from black soil. The host lysis activity of phage SWEP1 has a relatively short latent time (20 min) and a small burst size of 83 PFU. The genome of SWEP1 consists of 162,461 bp with 37.77% G+C content. The phage encodes 278 predicted proteins where 103 were assigned functionally. No tRNA gene was found. Comparative genomics analysis indicated that SWEP1 is related to Bacillus phage B4 (86.91% identity, 90% query coverage). Phenotypic and genotypic characterization suggesting that SWEP1 is a new member of a new species in the genus Bequatrovirus , family Herelleviridae .

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الملخص تم عزل عاثية العصوية المخيخية الجديدة SWEP1 من التربة السوداء. نشاط تحلل المضيف للعاثية SWEP1 له وقت كامن قصير نسبيًا (20 دقيقة) وحجم انفجار صغير من 83 PFU. يتكون جينوم SWEP1 من 162,461 نقطة أساس مع محتوى G+C بنسبة 37.77 ٪. تشفر العاثية 278 بروتينًا متوقعًا حيث تم تعيين 103 بروتينًا وظيفيًا. لم يتم العثور على جين الحمض النووي الريبي. أشار تحليل الجينوم المقارن إلى أن SWEP1 مرتبط بعاثية العصوية B4 (هوية 86.91 ٪، تغطية استعلام 90 ٪). التوصيف الظاهري والجيني الذي يشير إلى أن SWEP1 هو عضو جديد في نوع جديد من جنس Bequatrovirus ، عائلة Herelleviridae .

Translated Description (French)

Résumé Un nouveau phage de Bacillus cereus SWEP1 a été isolé du sol noir. L'activité de lyse de l'hôte du phage SWEP1 a un temps de latence relativement court (20 min) et une petite taille d'éclatement de 83 pfu. Le génome de SWEP1 se compose de 162 461 pb avec une teneur en G+C de 37,77 %. Le phage code pour 278 protéines prédites où 103 ont été attribuées fonctionnellement. Aucun gène d'ARNt n'a été trouvé. L'analyse génomique comparative a indiqué que SWEP1 est lié au Bacillus phage B4 (86,91 % d'identité, 90 % de couverture de requête). Caractérisation phénotypique et génotypique suggérant que SWEP1 est un nouveau membre d'une nouvelle espèce du genre Bequatrovirus , famille Herelleviridae .

Translated Description (Spanish)

Resumen Se aisló un nuevo fago SWEP1 de Bacillus cereus de suelo negro. La actividad de lisis del huésped del fago SWEP1 tiene un tiempo latente relativamente corto (20 min) y un tamaño de ráfaga pequeño de 83 PFU. El genoma de SWEP1 consta de 162,461 pb con un contenido de G+C del 37.77%. El fago codifica 278 proteínas predichas donde 103 se asignaron funcionalmente. No se ha encontrado ningún gen de ARNt. El análisis genómico comparativo indicó que SWEP1 está relacionado con el fago B4 de Bacillus (86.91% de identidad, 90% de cobertura de consulta). Caracterización fenotípica y genotípica que sugiere que SWEP1 es un nuevo miembro de una nueva especie del género Bequatrovirus , familia Herelleviridae .

Files

latest.pdf.pdf

Files (357.7 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:a166d01d68018d405dc72fc4a2964ac1
357.7 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التوصيف الظاهري والجيني للعصية المخيخية الجديدة SWEP1
Translated title (French)
Caractérisation phénotypique et génotypique du nouveau phage Bacillus Cereus SWEP1
Translated title (Spanish)
Caracterización fenotípica y genotípica del nuevo fago SWEP1 de Bacillus Cereus

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4242985443
DOI
10.21203/rs.3.rs-522035/v1

Is supplement to
https://openalex.org/W4313454223 (Other)
https://openalex.org/W3024293266 (Other)
https://openalex.org/W2780394266 (Other)
https://openalex.org/W2741956085 (Other)
https://openalex.org/W2598136427 (Other)
https://openalex.org/W2521359463 (Other)
https://openalex.org/W2072600448 (Other)
https://openalex.org/W2016180000 (Other)
https://openalex.org/W2011351575 (Other)
https://openalex.org/W1559956031 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W2004609153
  • https://openalex.org/W2033703580
  • https://openalex.org/W2039652718
  • https://openalex.org/W2054875433
  • https://openalex.org/W2077509079
  • https://openalex.org/W2077914268
  • https://openalex.org/W2097542482
  • https://openalex.org/W2103441770
  • https://openalex.org/W2113679889
  • https://openalex.org/W2115639442
  • https://openalex.org/W2119888547
  • https://openalex.org/W2123648316
  • https://openalex.org/W2125227271
  • https://openalex.org/W2129766767
  • https://openalex.org/W2132926880
  • https://openalex.org/W2137015675
  • https://openalex.org/W2142875232
  • https://openalex.org/W2156212552
  • https://openalex.org/W2234602261
  • https://openalex.org/W2338552642
  • https://openalex.org/W2345791363
  • https://openalex.org/W2396047262
  • https://openalex.org/W2514983714
  • https://openalex.org/W2524306559
  • https://openalex.org/W2571861146
  • https://openalex.org/W2588775853
  • https://openalex.org/W2736190180
  • https://openalex.org/W2740966378
  • https://openalex.org/W2742910645
  • https://openalex.org/W2792167152
  • https://openalex.org/W2989244205
  • https://openalex.org/W3025751907
  • https://openalex.org/W4255613908