Published February 25, 2015
| Version v1
Publication
Open
A Novel Mitosomal β-Barrel Outer Membrane Protein in Entamoeba
Creators
- 1. National Institute of Infectious Diseases
- 2. National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
- 3. Tokai University
- 4. Ehime University
- 5. Ain Shams University
- 6. Saitama University
- 7. University of Tsukuba
Description
Abstract Entamoeba possesses a highly divergent mitochondrion-related organelle known as the mitosome. Here, we report the discovery of a novel protein in Entamoeba , which we name M itosomal β-barrel O uter M embrane P rotein of 30 kDa (MBOMP30). Initially identified through in silico analysis, we experimentally confirmed that MBOMP30 is indeed a β-barrel protein. Circular dichroism analysis showed MBOMP30 has a predominant β-sheet structure. Localization to Entamoeba histolytica mitosomes was observed through Percoll-gradient fractionation and immunofluorescence assay. Mitosomal membrane integration was demonstrated by carbonate fractionation, proteinase K digestion and immunoelectron microscopy. Interestingly, the deletion of the putative β-signal, a sequence believed to guide β-barrel outer membrane protein (BOMP) assembly, did not affect membrane integration, but abolished the formation of a ~240 kDa complex. MBOMP30 represents only the seventh subclass of eukaryotic BOMPs discovered to date and lacks detectable homologs outside Entamoeba , suggesting that it may be unique to Entamoeba mitosomes.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تمتلك Entamoeba التجريدية عضية شديدة التباين مرتبطة بالميتوكوندريون تعرف باسم الميتوسوم. هنا، نبلغ عن اكتشاف بروتين جديد في Entamoeba ، والذي نسميه M itosomal β - barrel O uter M embrane P rotein من 30 kDa (MBOMP30). تم تحديده في البداية من خلال تحليل السيليكو، وأكدنا تجريبيًا أن MBOMP30 هو بالفعل بروتين β - barrel. أظهر تحليل ثنائي اللون الدائري أن MBOMP30 له بنية ورقة β سائدة. لوحظ توطين جسيمات ميتوسومات التحلل النسيجي للعدوى من خلال تجزئة تدرج البيركول ومقايسة التألق المناعي. تم توضيح تكامل غشاء الميتوسوم من خلال تجزئة الكربونات وهضم البروتيناز K والفحص المجهري المناعي. ومن المثير للاهتمام أن حذف إشارة β المفترضة، وهو تسلسل يُعتقد أنه يوجه مجموعة بروتين الغشاء الخارجي للبرميل بيتا (نتوء)، لم يؤثر على تكامل الغشاء، ولكنه ألغى تكوين مركب ~240 كيلو دالتون. يمثل MBOMP30 فقط الفئة الفرعية السابعة من BOMPs حقيقية النواة المكتشفة حتى الآن ويفتقر إلى المتجانسات القابلة للكشف خارج Entamoeba ، مما يشير إلى أنه قد يكون فريدًا لـ Entamoeba mitosomes.Translated Description (English)
Abstract Entamoeba possesses a highly divergent mitochondrion-related organelle known as the mitosome. Here, we report the discovery of a novel protein in Entamoeba , which we name M itosomal β-barrel O uter M embrane P rotein of 30 kDa (MBOMP30). Initially identified through silico analysis, we experimentally confirmed that MBOMP30 is indeed a β-barrel protein. Circular dichroism analysis showed MBOMP30 has a predominant β-sheet structure. Localization to Entamoeba histolytica mitosomes was observed through Percoll-gradient fractionation and immunofluorescence assay. Mitosomal membrane integration was demonstrated by carbonate fractionation, proteinase K digestion and immunoelectron microscopy. Interestingly, the deletion of the putative β-signal, a sequence believed to guide β-barrel outer membrane protein (bump) assembly, did not affect membrane integration, but abolished the formation of a ~240 kDa complex. MBOMP30 represents only the seventh subclass of eukaryotic BOMPs discovered to date and lacks detectable homologs outside Entamoeba , suggesting that it may be unique to Entamoeba mitosomes.Translated Description (French)
Les entamibes abstraites possèdent un organite très divergent lié à la mitochondrie connu sous le nom de mitosome. Ici, nous rapportons la découverte d'une nouvelle protéine chez Entamoeba , que nous nommons M itosomal β-barrel O uter M embrane P rotein de 30 kDa (MBOMP30). Initialement identifiés par analyse silico, nous avons confirmé expérimentalement que MBOMP30 est bien une protéine β-barrel. L'analyse du dichroïsme circulaire a montré que MBOMP30 a une structure de feuille β prédominante. La localisation des mitosomes d'Entamoeba histolytica a été observée par fractionnement à gradient de Percoll et immunofluorescence. L'intégration de la membrane mitosomale a été démontrée par fractionnement du carbonate, digestion de la protéinase K et microscopie immunoélectronique. Il est intéressant de noter que la délétion du signal β putatif, une séquence censée guider l'assemblage de la protéine de la membrane externe du barillet β (bump), n'a pas affecté l'intégration membranaire, mais a aboli la formation d'un complexe d'environ240 kDa. MBOMP30 ne représente que la septième sous-classe de BOMP eucaryotes découverts à ce jour et manque d'homologues détectables en dehors d'Entamoeba , ce qui suggère qu'il peut être unique aux mitosomes d'Entamoeba.Translated Description (Spanish)
Resumen Entamoeba posee un orgánulo relacionado con las mitocondrias altamente divergente conocido como el mitosoma. Aquí, informamos sobre el descubrimiento de una nueva proteína en Entamoeba , a la que denominamos P roteína de membrana O uterina M itosómica de 30 kDa (MBOMP30). Inicialmente identificado a través del análisis silico, confirmamos experimentalmente que MBOMP30 es de hecho una proteína de barril β. El análisis de dicroísmo circular mostró que MBOMP30 tiene una estructura predominante de lámina β. La localización en mitosomas de Entamoeba histolytica se observó a través del fraccionamiento en gradiente de Percoll y el ensayo de inmunofluorescencia. La integración de la membrana mitosómica se demostró mediante fraccionamiento de carbonato, digestión con proteinasa K y microscopía inmunoelectrónica. Curiosamente, la eliminación de la supuesta señal β, una secuencia que se cree que guía el ensamblaje de la proteína de la membrana externa del barril β (protuberancia), no afectó la integración de la membrana, pero abolió la formación de un complejo de ~240 kDa. MBOMP30 representa solo la séptima subclase de BOMP eucariotas descubiertas hasta la fecha y carece de homólogos detectables fuera de Entamoeba , lo que sugiere que puede ser exclusivo de los mitosomas de Entamoeba.Files
srep08545.pdf.pdf
Files
(2.1 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:f140c9745f68496cbc6853bcf41e0b3b
|
2.1 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- بروتين جديد للأغشية الخارجية للميتوسوم بيتا برميل في المتحولة
- Translated title (English)
- A Novel Mitosomal β-Barrel Outer Membranes Protein in Entamoeba
- Translated title (French)
- Une nouvelle protéine membranaire externe de β-barillet mitosomique dans Entamoeba
- Translated title (Spanish)
- Una nueva proteína de membranas externas de barril β mitosómico en Entamoeba
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2039395278
- DOI
- 10.1038/srep08545
References
- https://openalex.org/W1496602679
- https://openalex.org/W1551504358
- https://openalex.org/W1582151198
- https://openalex.org/W1849262363
- https://openalex.org/W1965466016
- https://openalex.org/W1966779747
- https://openalex.org/W1971147414
- https://openalex.org/W1971535868
- https://openalex.org/W1972576217
- https://openalex.org/W1976358872
- https://openalex.org/W1984378331
- https://openalex.org/W1991608395
- https://openalex.org/W1991653634
- https://openalex.org/W1997527771
- https://openalex.org/W2004242436
- https://openalex.org/W2012534599
- https://openalex.org/W2014550271
- https://openalex.org/W2015054686
- https://openalex.org/W2017094932
- https://openalex.org/W2019035668
- https://openalex.org/W2021246206
- https://openalex.org/W2022247544
- https://openalex.org/W2026727321
- https://openalex.org/W2026869749
- https://openalex.org/W2028503280
- https://openalex.org/W2030353309
- https://openalex.org/W2032549722
- https://openalex.org/W2037311670
- https://openalex.org/W2040889492
- https://openalex.org/W2042281452
- https://openalex.org/W2043355127
- https://openalex.org/W2051210555
- https://openalex.org/W2052306339
- https://openalex.org/W2056214445
- https://openalex.org/W2064394301
- https://openalex.org/W2065089322
- https://openalex.org/W2068333952
- https://openalex.org/W2069490007
- https://openalex.org/W2072480910
- https://openalex.org/W2072863297
- https://openalex.org/W2074404252
- https://openalex.org/W2075102823
- https://openalex.org/W2077752559
- https://openalex.org/W2081866213
- https://openalex.org/W2082212717
- https://openalex.org/W2089499735
- https://openalex.org/W2094077114
- https://openalex.org/W2097347505
- https://openalex.org/W2109084265
- https://openalex.org/W2114531694
- https://openalex.org/W2122126700
- https://openalex.org/W2127177253
- https://openalex.org/W2127322768
- https://openalex.org/W2127774996
- https://openalex.org/W2128944252
- https://openalex.org/W2134180405
- https://openalex.org/W2135621733
- https://openalex.org/W2140260269
- https://openalex.org/W2140850020
- https://openalex.org/W2142529984
- https://openalex.org/W2143059772
- https://openalex.org/W2155548114
- https://openalex.org/W2158019552
- https://openalex.org/W2160005603
- https://openalex.org/W2163484619
- https://openalex.org/W2169262243
- https://openalex.org/W4233334497