Published August 1, 2019 | Version v1
Publication Open

Peer Review #2 of "Fleas of black rats (Rattus rattus) as reservoir host of Bartonella spp. in Chile (v0.1)"

Creators

  • 1. University of Concepción
  • 2. Austral University of Chile
  • 3. San Sebastián University
  • 4. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas

Description

Background.Rattus rattus is a widely distributed, invasive species that presents an important role in disease transmission, either directly or through vector arthropods such as fleas.These black rats can transmit a wide variety of pathogens, including bacteria of the genus Bartonella, which can cause diseases in humans and animals.In Chile, no data are available identifying fleas from synanthropic rodents as Bartonella vectors.The aim of this study was to investigate the prevalence of Bartonella spp. in the fleas of R. rattus in areas with different climate conditions and featuring different human population densities.Methods.In all, 174 fleas collected from 261 R. rattus captured from 30 localities with different human densities (cities, villages, and wild areas) across five hydrographic zones of Chile (hyper-arid, arid, semiarid, sub-humid, and hyper-humid) were examined.Bartonella spp.presence was determined through polymerase chain reaction, using gltA and rpoB genes, which were concatenated to perform a similarity analysis with BLAST and phylogenetic analysis.Results.Overall, 15 fleas species were identified; Bartonella gltA and rpoB fragments were detected in 21.2% (37/174) and 19.5% (34/174) of fleas, respectively.Ten of the 15 fleas species found were positive for Bartonella DNA.Leptopsylla segnis was the most commonly collected flea species (n=55), and it also presented a high prevalence of Bartonella DNA (P%=34.5%).The highest numbers of fleas of this species were collected in villages of the arid zone.There were no seasonal differences in the prevalence of Bartonella DNA.The presence of Bartonella DNA in fleas was recorded in all hydrographic areas, and the arid zone presented the highest prevalence of this species.Regarding areas with different human densities, the highest prevalence was noted in the villages (34.8% gltA and 31.8%rpoB), followed by cities (14.8% gltA and 11.1% rpoB) and wild areas (7.4% gltA and 14.8% rpoB).The BLAST analysis showed a high similitude (>96%) with four uncharacterized Bartonella genotypes and with two species with zoonotic potential: B. mastomydis and B. tribocorum.The phylogenetic analysis showed a close relationship with B. elizabethae and B. tribocorum.This is the first study to provide evidence of the presence of Bartonella in fleas of R. rattus in Chile, indicating that the villages and arid zone correspond to areas with higher infection risk.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

خلفية. راتوس راتوس هو نوع غازي موزع على نطاق واسع يمثل دورًا مهمًا في انتقال المرض، إما مباشرة أو من خلال المفصليات الناقلة مثل البراغيث. يمكن لهذه الفئران السوداء أن تنقل مجموعة واسعة من مسببات الأمراض، بما في ذلك بكتيريا جنس بارتونيلا، والتي يمكن أن تسبب أمراضًا للإنسان والحيوان. في تشيلي، لا توجد بيانات متاحة تحدد البراغيث من القوارض المتجانسة كنواقل للبرطونيلا. كان الهدف من هذه الدراسة هو التحقيق في انتشار البارتونيلا في براغيث ر. راتوس في المناطق ذات الظروف المناخية المختلفة والتي تتميز بكثافة سكانية مختلفة. تم فحص 174 برغوثًا تم جمعها من 261 R. راتوس تم التقاطها من 30 موقعًا بكثافات بشرية مختلفة (مدن وقرى ومناطق برية) عبر خمس مناطق هيدروغرافية في تشيلي (شديدة الجفاف والقاحلة وشبه القاحلة وشبه الرطبة وفائقة الرطوبة). تم تحديد وجود البارتونيلا من خلال تفاعل البوليميراز المتسلسل، باستخدام جينات gltA و rpoB، والتي كانت متسلسلة لإجراء تحليل تشابه مع تحليل الانفجار والتطور. النتائج. بشكل عام، تم تحديد 15 نوعًا من البراغيث ؛ تم اكتشاف شظايا Bartonella gltA و rpoB في 21.2 ٪ (37/174) و 19.5 ٪ (34/174) من البراغيث، على التوالي. كان عشرة من أصل 15 نوعًا من البراغيث التي تم العثور عليها إيجابية بالنسبة للحمض النووي لبارتونيلا. كان الببتوبسيلا سيجنيس أكثر أنواع البراغيث التي تم جمعها شيوعًا (العدد=55)، كما أنه أظهر انتشارًا مرتفعًا للحمض النووي لبارتونيلا (النسبة المئوية=34.5 ٪). تم جمع أكبر عدد من البراغيث من هذا النوع في قرى المنطقة القاحلة. لم تكن هناك اختلافات موسمية في انتشار الحمض النووي لبارتونيلا. تم تسجيل وجود الحمض النووي لبارتونيلا في البراغيث في جميع المناطق الهيدروغرافية، وقدمت المنطقة القاحلة أعلى معدل انتشار لهذا النوع. مع مراعاة المناطق ذات الكثافة البشرية المختلفة، لوحظ أعلى معدل انتشار في القرى (34.8 ٪ gltA و 31.8 ٪ rpoB)، تليها المدن (14.8 ٪ gltA و 11.1 ٪ rpoB) والمناطق البرية (7.4 ٪ gltA و 14.8 ٪ rpoB). أظهر تحليل الانفجار تشابهًا عاليًا (>96 ٪) مع أربعة أنماط جينية غير مميزة من البارتونيلا ومع نوعين لهما إمكانات حيوانية المصدر: B. mastomydis و B. tribocorum. أظهر التحليل الوراثي علاقة وثيقة مع B. elizabethae و B. tribocorum. هذه هي الدراسة الأولى التي تقدم دليلًا على وجود البارتونيلا في البراغيث من R. rattus في تشيلي، مما يشير إلى أن القرى والمناطق القاحلة تتوافق مع المناطق ذات مخاطر العدوى العالية.

Translated Description (French)

Contexte.Rattus rattus est une espèce invasive largement répandue qui joue un rôle important dans la transmission de la maladie, soit directement, soit par l'intermédiaire d'arthropodes vecteurs tels que les puces.Ces rats noirs peuvent transmettre une grande variété d'agents pathogènes, y compris des bactéries du genre Bartonella, qui peuvent causer des maladies chez les humains et les animaux.Au Chili, aucune donnée n'est disponible pour identifier les puces de rongeurs synanthropes comme vecteurs de Bartonella.L' objectif de cette étude était d'étudier la prévalence de Bartonella spp. dans les puces de R. rattus dans des zones présentant différentes conditions climatiques et différentes densités de population humaine.Méthodes.En tout, 174 puces prélevées sur 261 R. rattus capturés dans 30 localités de différentes densités humaines (villes, villages et zones sauvages) dans cinq zones hydrographiques du Chili (hyper-arides, arides, semi-arides, sub-humides et hyper-humides) ont été examinées. La présence de Bartonella spp. a été déterminée par réaction en chaîne de la polymérase, à l'aide des gènes gltA et rpoB, qui ont été concaténés pour effectuer une analyse de similarité avec une analyse BLASTIQUE et phylogénétique. Résultats. Au total, 15 espèces de puces ont été identifiées ; des fragments de Bartonella gltA et rpoB ont été détectés dans 21,2 % (37/174) et 19,5 % (34/174) des puces, respectivement. Dix des 15 espèces de puces trouvées étaient positives pour l'ADN de Bartonella. Leptopsylla segnis était l'espèce de puces la plus couramment collectée (n=55), et elle présentait également une prévalence élevée d'ADN de Bartonella (P%=34,5 %). Le plus grand nombre de puces de cette espèce ont été collectées dans les villages de la zone aride. Il n'y avait pas de différences saisonnières dans la prévalence de l'ADN de Bartonella. La présence d'ADN de Bartonella dans les puces a été enregistrée dans toutes les zones hydrographiques, et la zone aride présentait la prévalence la plus élevée de cette espèce. zones à densités humaines différentes, la prévalence la plus élevée a été observée dans les villages (34,8% gltA et 31,8%rpoB), suivies des villes (14,8% gltA et 11,1% rpoB) et des zones sauvages (7,4% gltA et 14,8% rpoB).L' analyse par EXPLOSION a montré une similitude élevée (>96%) avec quatre génotypes de Bartonella non caractérisés et avec deux espèces à potentiel zoonotique : B. mastomydis et B. tribocorum.L' analyse phylogénétique a montré une relation étroite avec B. elizabethae et B. tribocorum.Il s'agit de la première étude à fournir des preuves de la présence de Bartonella chez les puces de R. rattus au Chili, ce qui indique que les villages et la zone aride correspondent à des zones à risque d'infection plus élevé.

Translated Description (Spanish)

Antecedentes. Rattus rattus es una especie invasora de amplia distribución que presenta un papel importante en la transmisión de enfermedades, ya sea directamente o a través de artrópodos vectores como las pulgas. Estas ratas negras pueden transmitir una amplia variedad de patógenos, incluidas las bacterias del género Bartonella, que pueden causar enfermedades en humanos y animales. En Chile, no se dispone de datos que identifiquen las pulgas de roedores sinantrópicos como vectores de Bartonella. El objetivo de este estudio fue investigar la prevalencia de Bartonella spp. en las pulgas de R. rattus en áreas con diferentes condiciones climáticas y con diferentes densidades de población humana. En total, Se examinaron 174 pulgas recolectadas de 261 R. rattus capturadas de 30 localidades con diferentes densidades humanas (ciudades, pueblos y áreas silvestres) en cinco zonas hidrográficas de Chile (hiperáridas, áridas, semiáridas, subhúmedas e hiperhúmedas). La presencia de Bartonella spp. se determinó a través de la reacción en cadena de la polimerasa, utilizando los genes gltA y rpoB, que se concatenaron para realizar un análisis de similitud con el análisis BLÁSTICO y filogenético. Resultados. En general, se identificaron 15 especies de pulgas; se detectaron fragmentos de Bartonella gltA y rpoB en el 21,2% (37/174) y el 19,5% (34/174) de las pulgas, respectivamente. Diez de las 15 especies de pulgas encontradas fueron positivas para el ADN de Bartonella. Leptopsylla segnis fue la especie de pulga más comúnmente recolectada (n=55), y también presentó una alta prevalencia de ADN de Bartonella (P%=34.5%). El mayor número de pulgas de esta especie se recolectó en aldeas de la zona árida. No hubo diferencias estacionales en la prevalencia de ADN de Bartonella. La presencia de ADN de Bartonella en las pulgas se registró en todas las áreas hidrográficas, y la zona árida presentó la mayor prevalencia de esta especie. áreas con diferentes densidades humanas, la mayor prevalencia se observó en las aldeas (34.8% gltA y 31.8%rpoB), seguidas de ciudades (14.8% gltA y 11.1% rpoB) y áreas silvestres (7.4% gltA y 14.8% rpoB). El análisis BLAST mostró una alta similitud (>96%) con cuatro genotipos de Bartonella no caracterizados y con dos especies con potencial zoonótico: B. mastomydis y B. tribocorum. El análisis filogenético mostró una estrecha relación con B. elizabethae y B. tribocorum. Este es el primer estudio que proporciona evidencia de la presencia de Bartonella en pulgas de R. rattus en Chile, lo que indica que las aldeas y la zona árida corresponden a áreas con mayor riesgo de infección.

Files

submission.pdf

Files (1.4 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:d583aac939afa84ab1609e34026dfda1
1.4 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
مراجعة الأقران رقم2 لـ "براغيث الفئران السوداء (راتوس راتوس) كمضيف لخزان Bartonella spp. في تشيلي (v0.1 )"
Translated title (French)
Examen par les pairs n °2 de « Puces de rats noirs (Rattus rattus) en tant qu'hôte réservoir de Bartonella spp. au Chili (v0.1) »
Translated title (Spanish)
Revisión por pares #2 de "Pulgas de ratas negras (Rattus rattus) como reservorio huésped de Bartonella spp. en Chile (v0.1)"

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4246613769
DOI
10.7287/peerj.7371v0.1/reviews/2

Is supplement to
https://openalex.org/W4284966193 (Other)
https://openalex.org/W2898799235 (Other)
https://openalex.org/W2178026020 (Other)
https://openalex.org/W2130076355 (Other)
https://openalex.org/W2082860237 (Other)
https://openalex.org/W2013243191 (Other)
https://openalex.org/W1993764875 (Other)
https://openalex.org/W1990804418 (Other)
https://openalex.org/W1953398709 (Other)
https://openalex.org/W1641042124 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Argentina

References

  • https://openalex.org/W1515266091
  • https://openalex.org/W1522082154
  • https://openalex.org/W1543034242
  • https://openalex.org/W1782794432
  • https://openalex.org/W1943972844
  • https://openalex.org/W1957854800
  • https://openalex.org/W1965877261
  • https://openalex.org/W1969401732
  • https://openalex.org/W1970694974
  • https://openalex.org/W1971265257
  • https://openalex.org/W1974508499
  • https://openalex.org/W1976848281
  • https://openalex.org/W1982080432
  • https://openalex.org/W1990235573
  • https://openalex.org/W1997752500
  • https://openalex.org/W2002611691
  • https://openalex.org/W2005751521
  • https://openalex.org/W2007324415
  • https://openalex.org/W2012139247
  • https://openalex.org/W2015114210
  • https://openalex.org/W2026487835
  • https://openalex.org/W2026950499
  • https://openalex.org/W2034058490
  • https://openalex.org/W2040513598
  • https://openalex.org/W2056085948
  • https://openalex.org/W2062079951
  • https://openalex.org/W2075533859
  • https://openalex.org/W2080684355
  • https://openalex.org/W2087076382
  • https://openalex.org/W2087759282
  • https://openalex.org/W2091902262
  • https://openalex.org/W2097580592
  • https://openalex.org/W2107675943
  • https://openalex.org/W2108740222
  • https://openalex.org/W2110202393
  • https://openalex.org/W2113583715
  • https://openalex.org/W2113960709
  • https://openalex.org/W2117637696
  • https://openalex.org/W2121225712
  • https://openalex.org/W2121796498
  • https://openalex.org/W2121825686
  • https://openalex.org/W2121869304
  • https://openalex.org/W2122138060
  • https://openalex.org/W2123054380
  • https://openalex.org/W2136421054
  • https://openalex.org/W2137084229
  • https://openalex.org/W2137447212
  • https://openalex.org/W2138705402
  • https://openalex.org/W2138946315
  • https://openalex.org/W2141903826
  • https://openalex.org/W2147597255
  • https://openalex.org/W2148698435
  • https://openalex.org/W2150344385
  • https://openalex.org/W2160770640
  • https://openalex.org/W2165703020
  • https://openalex.org/W2168532904
  • https://openalex.org/W2181588992
  • https://openalex.org/W2237816860
  • https://openalex.org/W2299631211
  • https://openalex.org/W2311203695
  • https://openalex.org/W2324068748
  • https://openalex.org/W2398375764
  • https://openalex.org/W2470046702
  • https://openalex.org/W2507281466
  • https://openalex.org/W2553554592
  • https://openalex.org/W2560656909
  • https://openalex.org/W2571486566
  • https://openalex.org/W2581525223
  • https://openalex.org/W2604358300
  • https://openalex.org/W2619511705
  • https://openalex.org/W2754185893
  • https://openalex.org/W2770802066
  • https://openalex.org/W2806251641
  • https://openalex.org/W2921897422
  • https://openalex.org/W4240898657
  • https://openalex.org/W4246167858
  • https://openalex.org/W4293368835
  • https://openalex.org/W4313426308