Published January 1, 2019 | Version v1
Publication Open

Plasmid-mediated mcr-1 gene in Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa: first report from Pakistan

Creators

  • 1. Khyber Medical University
  • 2. Anhui University

Description

The increased use of colistin against infections caused by Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa has resulted in colistin resistance. The purpose of this study was to detect plasmid-mediated mcr-1 gene in colistin-resistant A. baumannii and P. aeruginosa isolates.A total of 146 clinical isolates of A. baumannii (n = 62) and P. aeruginosa (n = 84) were collected from the four largest tertiary care hospitals in Peshawar, Pakistan. All bacterial isolates were phenotypically screened for multidrug resistance using the Kirby-Baur disc diffusion method. The minimum inhibitory concentration (MIC) of colistin in all isolates was phenotypically performed using dilution methods. mcr-1 gene was detected through polymerase chain reaction and the nucleotide sequence of amplicon was determined using Sanger sequencing.Approximately 96.7% A. baumannii and 83.3% P. aeruginosa isolates were resistant to multiple antibiotics. Colistin resistance was found in 9.6% (6/62) of A. baumannii and 11.9% (10/84) of P. aeruginosa isolates. Among 16 colistin resistant isolates, the mcr-1 gene was detected in one A. baumannii (1.61% of total isolates; 16.6% of colistin resistant isolates) and one P. aeruginosa strain (1.19% of total isolates; 10% of colistin resistant isolates). Nucleotide BLAST showed 98-99% sequence similarity to sequences of the mcr-1 gene in GenBank.Our study reports, for the first time, the emergence of plasmid-mediated mcr-1-encoded colistin resistance in multidrug resistant strains of A. baumannii and P. aeruginosa. Further large scales studies are recommended to investigate the prevalence of this mode of resistance in these highly pathogenic bacteria.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

أدى الاستخدام المتزايد للكوليستين ضد الالتهابات التي تسببها Acinetobacter baumannii و Pseudomonas aeruginosa إلى مقاومة للكوليستين. كان الغرض من هذه الدراسة هو الكشف عن جين mcr -1 بوساطة البلازميد في عزلات A. baumannii و P. aeruginosa المقاومة للكوليستين. تم جمع ما مجموعه 146 عزلًا سريريًا لـ A. baumannii (العدد = 62) و P. aeruginosa (العدد = 84) من أكبر أربعة مستشفيات رعاية ثالثة في بيشاور، باكستان. تم فحص جميع العزلات البكتيرية بشكل نمطي لمقاومة الأدوية المتعددة باستخدام طريقة نشر القرص Kirby - Baur. تم إجراء الحد الأدنى من التركيز المثبط (MIC) للكوليستين في جميع العزلات بشكل نمطي باستخدام طرق التخفيف. تم الكشف عن جين mcr -1 من خلال تفاعل سلسلة البلمرة وتم تحديد تسلسل النيوكليوتيدات للأمبيليكون باستخدام تسلسل سانجر. كانت ما يقرب من 96.7 ٪ A. baumannii و 83.3 ٪ P. aeruginosa معزولات مقاومة للمضادات الحيوية المتعددة. تم العثور على مقاومة للكوليستين في 9.6 ٪ (6/62) من A. baumannii و 11.9 ٪ (10/84) من عزلات P. aeruginosa. من بين 16 عزلًا مقاومًا للكوليستين، تم اكتشاف جين mcr -1 في واحد A. baumannii (1.61 ٪ من إجمالي العزلات ؛ 16.6 ٪ من العزلات المقاومة للكوليستين) وسلالة P. aeruginosa واحدة (1.19 ٪ من إجمالي العزلات ؛ 10 ٪ من العزلات المقاومة للكوليستين). أظهر انفجار النيوكليوتيد تشابهًا في التسلسل بنسبة 98-99 ٪ مع تسلسل جين mcr -1 في GenBank.Our تقارير الدراسة، لأول مرة، ظهور مقاومة الكوليستين المشفرة بوساطة البلازميد mcr -1 في سلالات مقاومة للأدوية المتعددة من A. baumannii و P. aeruginosa. يوصى بإجراء المزيد من دراسات المقاييس الكبيرة للتحقيق في انتشار هذا النمط من المقاومة في هذه البكتيريا شديدة الإمراض.

Translated Description (French)

L'utilisation accrue de la colistine contre les infections causées par Acinetobacter baumannii et Pseudomonas aeruginosa a entraîné une résistance à la colistine. Le but de cette étude était de détecter le gène mcr-1 à médiation plasmidique dans les isolats d'A. baumannii et de P. aeruginosa résistants à la colistine. Un total de 146 isolats cliniques d'A. baumannii (n = 62) et de P. aeruginosa (n = 84) ont été collectés dans les quatre plus grands hôpitaux de soins tertiaires de Peshawar, au Pakistan. Tous les isolats bactériens ont été soumis à un dépistage phénotypique de la multirésistance à l'aide de la méthode de diffusion sur disque Kirby-Baur. La concentration minimale inhibitrice (CMI) de colistine dans tous les isolats a été phénotypiquement réalisée à l'aide de méthodes de dilution. Le gène mcr-1 a été détecté par réaction en chaîne de la polymérase et la séquence nucléotidique de l'amplicon a été déterminée à l'aide du séquençage de Sanger. Environ 96,7 % des isolats d'A. baumannii et 83,3 % de P. aeruginosa étaient résistants à de multiples antibiotiques. La résistance à la colistine a été trouvée dans 9,6% (6/62) des isolats d'A. baumannii et 11,9% (10/84) des isolats de P. aeruginosa. Parmi 16 isolats résistants à la colistine, le gène mcr-1 a été détecté chez un A. baumannii (1,61 % des isolats totaux ; 16,6 % des isolats résistants à la colistine) et une souche de P. aeruginosa (1,19 % des isolats totaux ; 10 % des isolats résistants à la colistine). Le BLAST nucléotidique a montré une similarité de séquence de 98-99% avec les séquences du gène mcr-1 dans GenBank. Notre étude rapporte, pour la première fois, l'émergence d'une résistance à la colistine codée par mcr-1 à médiation plasmidique chez des souches multirésistantes d'A. baumannii et P. aeruginosa. D'autres études à grande échelle sont recommandées pour étudier la prévalence de ce mode de résistance chez ces bactéries hautement pathogènes.

Translated Description (Spanish)

El aumento del uso de colistina contra las infecciones causadas por Acinetobacter baumannii y Pseudomonas aeruginosa ha dado lugar a la resistencia a la colistina. El propósito de este estudio fue detectar el gen mcr-1 mediado por plásmidos en aislados de A. baumannii y P. aeruginosa resistentes a la colistina. Se recogieron un total de 146 aislados clínicos de A. baumannii (n = 62) y P. aeruginosa (n = 84) de los cuatro hospitales de atención terciaria más grandes de Peshawar, Pakistán. Todos los aislados bacterianos se analizaron fenotípicamente para determinar la resistencia a múltiples fármacos utilizando el método de difusión de disco de Kirby-Baur. La concentración inhibitoria mínima (MIC) de colistina en todos los aislados se realizó fenotípicamente utilizando métodos de dilución. El gen mcr-1 se detectó a través de la reacción en cadena de la polimerasa y la secuencia de nucleótidos del amplicón se determinó utilizando la secuenciación de Sanger. Aproximadamente el 96,7% de los aislados de A. baumannii y el 83,3% de P. aeruginosa fueron resistentes a múltiples antibióticos. Se encontró resistencia a la colistina en 9.6% (6/62) de A. baumannii y 11.9% (10/84) de aislados de P. aeruginosa. Entre 16 aislados resistentes a la colistina, el gen mcr-1 se detectó en una cepa de A. baumannii (1,61% del total de aislados; 16,6% de los aislados resistentes a la colistina) y una cepa de P. aeruginosa (1,19% del total de aislados; 10% de los aislados resistentes a la colistina). El BLAST de nucleótidos mostró una similitud de secuencia del 98-99% con las secuencias del gen mcr-1 en GenBank. Nuestro estudio informa, por primera vez, la aparición de resistencia a la colistina codificada por mcr-1 mediada por plásmidos en cepas resistentes a múltiples fármacos de A. baumannii y P. aeruginosa. Se recomiendan más estudios a gran escala para investigar la prevalencia de este modo de resistencia en estas bacterias altamente patógenas.

Files

1678-9849-rsbmt-52-e20190237.pdf.pdf

Files (1.8 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:7d0184aac174d87347a70171d3aac7f6
1.8 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
جين mcr -1 بوساطة البلازميد في البكتيريا الخاملة والزائفة الزنجارية: التقرير الأول من باكستان
Translated title (French)
Gène mcr-1 à médiation plasmidique chez Acinetobacter baumannii et Pseudomonas aeruginosa : premier rapport du Pakistan
Translated title (Spanish)
Gen mcr-1 mediado por plásmido en Acinetobacter baumannii y Pseudomonas aeruginosa: primer informe de Pakistán

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2971905412
DOI
10.1590/0037-8682-0237-2019

Is supplement to
https://openalex.org/W4385226696 (Other)
https://openalex.org/W4323318977 (Other)
https://openalex.org/W3118386232 (Other)
https://openalex.org/W3084016177 (Other)
https://openalex.org/W2904854709 (Other)
https://openalex.org/W2163670039 (Other)
https://openalex.org/W2161069049 (Other)
https://openalex.org/W2073242321 (Other)
https://openalex.org/W2004581388 (Other)
https://openalex.org/W1971252925 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Pakistan

References

  • https://openalex.org/W1888541961
  • https://openalex.org/W1971252925
  • https://openalex.org/W1979973356
  • https://openalex.org/W2003112779
  • https://openalex.org/W2026917976
  • https://openalex.org/W2034009934
  • https://openalex.org/W2036456340
  • https://openalex.org/W2072494970
  • https://openalex.org/W2105838577
  • https://openalex.org/W2116245384
  • https://openalex.org/W2123135656
  • https://openalex.org/W2137081432
  • https://openalex.org/W2152944378
  • https://openalex.org/W2154755488
  • https://openalex.org/W2163015800
  • https://openalex.org/W2165158988
  • https://openalex.org/W2191273704
  • https://openalex.org/W2300994186
  • https://openalex.org/W2406191933
  • https://openalex.org/W2414599770
  • https://openalex.org/W2472938473
  • https://openalex.org/W2526127963
  • https://openalex.org/W2532347900
  • https://openalex.org/W2592573920
  • https://openalex.org/W2592810481
  • https://openalex.org/W2603182397
  • https://openalex.org/W2606917734
  • https://openalex.org/W2751939257
  • https://openalex.org/W2765403617
  • https://openalex.org/W2789869591
  • https://openalex.org/W2899549732
  • https://openalex.org/W2903344862
  • https://openalex.org/W2952020764
  • https://openalex.org/W2967889824
  • https://openalex.org/W2986560203
  • https://openalex.org/W846546774