Published August 21, 2017 | Version v1
Publication Open

Candidate gene polymorphisms study between human African trypanosomiasis clinical phenotypes in Guinea

Creators

  • 1. Centre international de recherche-développement sur l'elevage en zone subhumide
  • 2. University of Liverpool
  • 3. Nazi Boni University
  • 4. Université Jean Lorougnon Guédé
  • 5. Institut de Recherche pour le Développement
  • 6. Wellcome Centre for Molecular Parasitology
  • 7. Wellcome Trust
  • 8. Makerere University

Description

Background Human African trypanosomiasis (HAT), a lethal disease induced by Trypanosoma brucei gambiense, has a range of clinical outcomes in its human host in West Africa: an acute form progressing rapidly to second stage, spontaneous self-cure and individuals able to regulate parasitaemia at very low levels, have all been reported from endemic foci. In order to test if this clinical diversity is influenced by host genetic determinants, the association between candidate gene polymorphisms and HAT outcome was investigated in populations from HAT active foci in Guinea. Methodology and results Samples were collected from 425 individuals; comprising of 232 HAT cases, 79 subjects with long lasting positive and specific serology but negative parasitology and 114 endemic controls. Genotypes of 28 SNPs in eight genes passed quality control and were used for an association analysis. IL6 rs1818879 allele A (p = 0.0001, OR = 0.39, CI95 = [0.24–0.63], BONF = 0.0034) was associated with a lower risk of progressing from latent infection to active disease. MIF rs36086171 allele G seemed to be associated with an increased risk (p = 0.0239, OR = 1.65, CI95 = [1.07–2.53], BONF = 0.6697) but did not remain significant after Bonferroni correction. Similarly MIF rs12483859 C allele seems be associated with latent infections (p = 0.0077, OR = 1.86, CI95 = [1.18–2.95], BONF = 0.2157). We confirmed earlier observations that APOL1 G2 allele (DEL) (p = 0.0011, OR = 2.70, CI95 = [1.49–4.91], BONF = 0.0301) is associated with a higher risk and APOL1 G1 polymorphism (p = 0.0005, OR = 0.45, CI95 = [0.29–0.70], BONF = 0.0129) with a lower risk of developing HAT. No associations were found with other candidate genes. Conclusion Our data show that host genes are involved in modulating Trypanosoma brucei gambiense infection outcome in infected individuals from Guinea with IL6 rs1818879 being associated with a lower risk of progressing to active HAT. These results enhance our understanding of host-parasite interactions and, ultimately, may lead to the development of new control tools.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

خلفية إن داء المثقبيات الأفريقي البشري (HAT)، وهو مرض مميت يسببه المثقبيات البروسية الغامبية، له مجموعة من النتائج السريرية في مضيفه البشري في غرب إفريقيا: شكل حاد يتقدم بسرعة إلى المرحلة الثانية، وعلاج ذاتي تلقائي والأفراد القادرين على تنظيم طفيلية الدم عند مستويات منخفضة للغاية، تم الإبلاغ عنها جميعًا من بؤر متوطنة. من أجل اختبار ما إذا كان هذا التنوع السريري يتأثر بالمحددات الوراثية للمضيف، تم التحقيق في العلاقة بين تعدد أشكال الجينات المرشحة ونتائج HAT في السكان من بؤر HAT النشطة في غينيا. المنهجية والنتائج تم جمع العينات من 425 فردًا ؛ تتألف من 232 حالة قبعة، و 79 شخصًا يعانون من أمصال إيجابية ومحددة طويلة الأمد ولكن علم الطفيليات سلبي و 114 عنصر تحكم متوطن. اجتازت الأنماط الجينية لـ 28 SNPs في ثمانية جينات مراقبة الجودة واستخدمت لتحليل الارتباط. ارتبط IL6 rs1818879 allele A (p = 0.0001، OR = 0.39، CI95 = [0.24-0.63]، BONF = 0.0034) بانخفاض خطر التقدم من العدوى الكامنة إلى المرض النشط. يبدو أن MIF rs36086171 allele G مرتبط بزيادة المخاطر (p = 0.0239، OR = 1.65، CI95 = [1.07-2.53]، BONF = 0.6697) ولكنه لم يظل كبيرًا بعد تصحيح Bonferroni. وبالمثل، يبدو أن أليل MIF rs12483859 C مرتبط بالعدوى الكامنة (p = 0.0077، OR = 1.86، CI95 = [1.18–2.95]، BONF = 0.2157). أكدنا الملاحظات السابقة أن أليل APOL1 G2 (DEL) (p = 0.0011، OR = 2.70، CI95 = [1.49-4.91]، BONF = 0.0301) يرتبط بمخاطر أعلى وتعدد أشكال APOL1 G1 (p = 0.0005، OR = 0.45، CI95 = [0.29-0.70]، BONF = 0.0129) مع خطر أقل لتطوير القبعة. لم يتم العثور على ارتباطات مع جينات مرشحة أخرى. تظهر بياناتنا أن الجينات المضيفة تشارك في تعديل نتيجة عدوى المثقبية البروسية الغامبية لدى الأفراد المصابين من غينيا مع ارتباط IL6 rs1818879 بانخفاض خطر التقدم إلى القبعة النشطة. تعزز هذه النتائج فهمنا للتفاعلات بين المضيف والطفيلي، وقد تؤدي في النهاية إلى تطوير أدوات تحكم جديدة.

Translated Description (French)

Contexte La trypanosomiase humaine africaine (THA), une maladie mortelle induite par Trypanosoma brucei gambiense, a une gamme de résultats cliniques chez son hôte humain en Afrique de l'Ouest : une forme aiguë évoluant rapidement vers un deuxième stade, une auto-cure spontanée et des individus capables de réguler la parasitémie à des niveaux très faibles, ont tous été signalés à partir de foyers endémiques. Afin de tester si cette diversité clinique est influencée par les déterminants génétiques de l'hôte, l'association entre les polymorphismes des gènes candidats et les résultats de la THA a été étudiée dans des populations de foyers actifs de la THA en Guinée. Méthodologie ET résultats Des échantillons ont été prélevés sur 425 personnes ; comprenant 232 cas de THA, 79 sujets avec une sérologie positive et spécifique de longue durée mais une parasitologie négative et 114 témoins endémiques. Les génotypes de 28 SNP dans huit gènes ont passé le contrôle de qualité et ont été utilisés pour une analyse d'association. L'allèle A de l'IL6 rs1818879 (p = 0,0001, OR = 0,39, IC95 = [0,24-0,63], BONF = 0,0034) était associé à un risque plus faible de progression d'une infection latente à une maladie active. L'allèle G de MIF rs36086171 semblait être associé à un risque accru (p = 0,0239, OR = 1,65, IC95 = [1,07-2,53], BONF = 0,6697) mais ne restait pas significatif après la correction de Bonferroni. De même, l'allèle MIF rs12483859 C semble être associé à des infections latentes (p = 0,0077, OR = 1,86, IC95 = [1,18-2,95], BONF = 0,2157). Nous avons confirmé les observations antérieures selon lesquelles l'allèle APOL1 G2 (DEL) (p = 0,0011, OR = 2,70, CI95 = [1,49-4,91], BONF = 0,0301) est associé à un risque plus élevé et le polymorphisme APOL1 G1 (p = 0,0005, OR = 0,45, CI95 = [0,29-0,70], BONF = 0,0129) à un risque plus faible de développer une THA. Aucune association n'a été trouvée avec d'autres gènes candidats. Conclusion Nos données montrent que les gènes hôtes sont impliqués dans la modulation de l'issue de l'infection à Trypanosoma brucei gambiense chez les individus infectés de Guinée, l'IL6 rs1818879 étant associée à un risque plus faible de progression vers une THA active. Ces résultats améliorent notre compréhension des interactions hôte-parasite et, en fin de compte, peuvent conduire au développement de nouveaux outils de contrôle.

Translated Description (Spanish)

Antecedentes La tripanosomiasis africana humana (HAT), una enfermedad letal inducida por Trypanosoma brucei gambiense, tiene una variedad de resultados clínicos en su huésped humano en África occidental: se ha informado de una forma aguda que progresa rápidamente a la segunda etapa, autocuración espontánea e individuos capaces de regular la parasitemia a niveles muy bajos, desde focos endémicos. Con el fin de probar si esta diversidad clínica está influenciada por los determinantes genéticos del huésped, se investigó la asociación entre los polimorfismos de los genes candidatos y el resultado de HAT en poblaciones de focos activos de HAT en Guinea. Metodología y resultados Se recogieron muestras de 425 individuos; que comprenden 232 casos HAT, 79 sujetos con serología positiva y específica de larga duración pero parasitología negativa y 114 controles endémicos. Los genotipos de 28 SNP en ocho genes pasaron el control de calidad y se utilizaron para un análisis de asociación. IL6 rs1818879 alelo A (p = 0,0001, OR = 0,39, CI95 = [0,24-0,63], BONF = 0,0034) se asoció con un menor riesgo de progresar de infección latente a enfermedad activa. El alelo G de MIF rs36086171 parecía estar asociado con un mayor riesgo (p = 0,0239, OR = 1,65, CI95 = [1,07-2,53], BONF = 0,6697), pero no siguió siendo significativo después de la corrección de Bonferroni. De manera similar, el alelo MIF rs12483859 C parece estar asociado con infecciones latentes (p = 0.0077, OR = 1.86, CI95 = [1.18-2.95], BONF = 0.2157). Confirmamos observaciones anteriores de que el alelo APOL1 G2 (DEL) (p = 0.0011, OR = 2.70, CI95 = [1.49-4.91], BONF = 0.0301) se asocia con un mayor riesgo y el polimorfismo APOL1 G1 (p = 0.0005, OR = 0.45, CI95 = [0.29–0.70], BONF = 0.0129) con un menor riesgo de desarrollar HAT. No se encontraron asociaciones con otros genes candidatos. Conclusión Nuestros datos muestran que los genes del huésped están involucrados en la modulación del resultado de la infección por Trypanosoma brucei gambiense en individuos infectados de Guinea con IL6 rs1818879 que se asocia con un menor riesgo de progresar a HAT activo. Estos resultados mejoran nuestra comprensión de las interacciones huésped-parásito y, en última instancia, pueden conducir al desarrollo de nuevas herramientas de control.

Files

journal.pntd.0005833&type=printable.pdf

Files (1.0 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:842353e22e0dbbee5445487f6a21fb9d
1.0 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
دراسة تعدد أشكال الجينات المرشحة بين الأنماط الظاهرية السريرية لداء المثقبيات الأفريقي البشري في غينيا
Translated title (French)
Étude des polymorphismes des gènes candidats entre les phénotypes cliniques de la trypanosomiase humaine africaine en Guinée
Translated title (Spanish)
Estudio de polimorfismos de genes candidatos entre fenotipos clínicos de tripanosomiasis africana humana en Guinea

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2748096092
DOI
10.1371/journal.pntd.0005833

Is supplement to
https://openalex.org/W4387464331 (Other)
https://openalex.org/W4383562910 (Other)
https://openalex.org/W4246762309 (Other)
https://openalex.org/W3177731040 (Other)
https://openalex.org/W2408861667 (Other)
https://openalex.org/W2343575195 (Other)
https://openalex.org/W2151877638 (Other)
https://openalex.org/W2119204264 (Other)
https://openalex.org/W2008637356 (Other)
https://openalex.org/W2004696862 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes

References

  • https://openalex.org/W1506343731
  • https://openalex.org/W1533942137
  • https://openalex.org/W1867338125
  • https://openalex.org/W1967081185
  • https://openalex.org/W1977482627
  • https://openalex.org/W1978733317
  • https://openalex.org/W1980459782
  • https://openalex.org/W1981394186
  • https://openalex.org/W1981629041
  • https://openalex.org/W1983987984
  • https://openalex.org/W1993096431
  • https://openalex.org/W1996286571
  • https://openalex.org/W1999030993
  • https://openalex.org/W2012139771
  • https://openalex.org/W2012844467
  • https://openalex.org/W2020461960
  • https://openalex.org/W2024785984
  • https://openalex.org/W2027110135
  • https://openalex.org/W2028260332
  • https://openalex.org/W2038465978
  • https://openalex.org/W2044101774
  • https://openalex.org/W2049170930
  • https://openalex.org/W2059927435
  • https://openalex.org/W2062359839
  • https://openalex.org/W2066172067
  • https://openalex.org/W2085559468
  • https://openalex.org/W2085874276
  • https://openalex.org/W2104686984
  • https://openalex.org/W2105658033
  • https://openalex.org/W2110499439
  • https://openalex.org/W2124641083
  • https://openalex.org/W2133901452
  • https://openalex.org/W2138375068
  • https://openalex.org/W2140107100
  • https://openalex.org/W2147528500
  • https://openalex.org/W2149616337
  • https://openalex.org/W2161633633
  • https://openalex.org/W2169982370
  • https://openalex.org/W2170506790
  • https://openalex.org/W2299099273
  • https://openalex.org/W2339336535
  • https://openalex.org/W2619254835
  • https://openalex.org/W2621352615