Published January 24, 2014
| Version v1
Publication
Open
The Role of Viral and Host MicroRNAs in the Aujeszky's Disease Virus during the Infection Process
Creators
- 1. Center for Research in Agricultural Genomics
- 2. Universitat Autònoma de Barcelona
- 3. Centre de Recerca en Sanitat Animal
- 4. Centro Nacional de Sanidad Agropecuaria
- 5. Government of Catalonia
Description
Porcine production is a primary market in the world economy. Controlling swine diseases in the farm is essential in order to achieve the sector necessities. Aujeszky's disease is a viral condition affecting pigs and is endemic in many countries of the world, causing important economic losses in the swine industry. microRNAs (miRNAs) are non-coding RNAs which modulates gene expression in animals, plants and viruses. With the aim of understanding miRNA roles during the Aujeszky's disease virus [ADV] (also known as suid herpesvirus type 1 [SuHV-1]) infection, the expression profiles of host and viral miRNAs were determined through deep sequencing in SuHV-1 infected porcine cell line (PK-15) and in an animal experimental SuHV-1 infection with virulent (NIA-3) and attenuated (Begonia) strains. In the in vivo approach miR-206, miR-133a, miR-133b and miR-378 presented differential expression between virus strains infection. In the in vitro approach, most miRNAs were down-regulated in infected groups. miR-92a and miR-92b-3p were up-regulated in Begonia infected samples. Functional analysis of all this over expressed miRNAs during the infection revealed their association in pathways related to viral infection processes and immune response. Furthermore, 8 viral miRNAs were detected by stem loop RT-qPCR in both in vitro and in vivo approaches, presenting a gene regulatory network affecting 59 viral genes. Most described viral miRNAs were related to Large Latency Transcript (LLT) and to viral transcription activators EP0 and IE180, and also to regulatory genes regarding their important roles in the host-pathogen interaction during viral infection.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
إنتاج الخنازير هو السوق الرئيسي في الاقتصاد العالمي. السيطرة على أمراض الخنازير في المزرعة أمر ضروري من أجل تحقيق ضرورات القطاع. مرض Aujeszky هو حالة فيروسية تؤثر على الخنازير ومتوطنة في العديد من بلدان العالم، مما تسبب في خسائر اقتصادية كبيرة في صناعة الخنازير. microRNAs (miRNAs) هي RNAs غير مشفرة تعدل التعبير الجيني في الحيوانات والنباتات والفيروسات. بهدف فهم أدوار miRNA أثناء عدوى فيروس مرض Aujeszky [ADV] (المعروف أيضًا باسم عدوى فيروس الهربس السويدي من النوع 1 [SuHV -1])، تم تحديد ملامح التعبير عن المضيف و miRNAs الفيروسية من خلال التسلسل العميق في خط خلايا الخنازير المصابة بـ SuHV -1 (PK -15) وفي عدوى SuHV -1 التجريبية الحيوانية مع سلالات خبيثة (NIA -3) وموهنة (Begonia). في النهج داخل الجسم الحي miR -206، قدم miR -133a و miR -133b و miR -378 تعبيرًا تفاضليًا بين عدوى سلالات الفيروس. في النهج المختبري، تم تقليل تنظيم معظم miRNAs في المجموعات المصابة. تم زيادة تنظيم miR -92a و miR -92b -3p في العينات المصابة بالبيغونيا. كشف التحليل الوظيفي لكل هذا عبر miRNAs المعبر عنها أثناء العدوى عن ارتباطها بالمسارات المتعلقة بعمليات العدوى الفيروسية والاستجابة المناعية. وعلاوة على ذلك، تم الكشف عن 8 miRNAs الفيروسية عن طريق حلقة الجذعية RT - qPCR في كل من النهج في المختبر وفي الجسم الحي، وتقديم شبكة تنظيمية الجينات التي تؤثر على 59 الجينات الفيروسية. ارتبطت معظم الحمض النووي الريبي الفيروسي الموصوف بنسخة الكمون الكبيرة (LLT) ومنشطات النسخ الفيروسي EP0 و IE180، وكذلك بالجينات التنظيمية فيما يتعلق بأدوارها المهمة في تفاعل المضيف الممرض أثناء العدوى الفيروسية.Translated Description (French)
La production porcine est un marché primaire dans l'économie mondiale. La lutte contre les maladies porcines dans l'exploitation est essentielle pour répondre aux besoins du secteur. La maladie d'Aujeszky est une maladie virale affectant les porcs et est endémique dans de nombreux pays du monde, causant d'importantes pertes économiques dans l'industrie porcine. Les microARN (miARN) sont des ARN non codants qui modulent l'expression des gènes chez les animaux, les plantes et les virus. Dans le but de comprendre les rôles des miARN au cours de l'infection par le virus de la maladie d'Aujeszky [ADV] (également connu sous le nom d'herpèsvirus suid de type 1 [SuHV-1]), les profils d'expression des miARN hôtes et viraux ont été déterminés par séquençage profond dans la lignée cellulaire porcine infectée par SuHV-1 (PK-15) et dans une infection expérimentale animale par SuHV-1 avec des souches virulentes (NIA-3) et atténuées (Begonia). Dans l'approche in vivo, miR-206, miR-133a, miR-133b et miR-378 ont présenté une expression différentielle entre les souches virales infectées. Dans l'approche in vitro, la plupart des miARN étaient régulés à la baisse dans les groupes infectés. miR-92a et miR-92b-3p ont été régulés à la hausse dans les échantillons infectés par Begonia. L'analyse fonctionnelle de tout cela sur les miARN exprimés pendant l'infection a révélé leur association dans les voies liées aux processus d'infection virale et à la réponse immunitaire. De plus, 8 miARN viraux ont été détectés par RT-qPCR de la boucle souche dans des approches in vitro et in vivo, présentant un réseau de régulation génique affectant 59 gènes viraux. La plupart des miARN viraux décrits étaient liés au Large Latency Transcript (LLT) et aux activateurs de transcription virale EP0 et IE180, ainsi qu'aux gènes régulateurs concernant leurs rôles importants dans l'interaction hôte-pathogène au cours de l'infection virale.Translated Description (Spanish)
La producción porcina es un mercado primario en la economía mundial. El control de las enfermedades porcinas en la granja es esencial para satisfacer las necesidades del sector. La enfermedad de Aujeszky es una afección viral que afecta a los cerdos y es endémica en muchos países del mundo, causando importantes pérdidas económicas en la industria porcina. Los microARN (miARN) son ARN no codificantes que modulan la expresión génica en animales, plantas y virus. Con el objetivo de comprender las funciones de los miARN durante la infección por el virus de la enfermedad de Aujeszky [Adv] (también conocido como herpesvirus suido tipo 1 [SuHV-1]), los perfiles de expresión de los miARN del huésped y virales se determinaron mediante secuenciación profunda en la línea celular porcina infectada con SuHV-1 (PK-15) y en una infección experimental animal por SuHV-1 con cepas virulentas (NIA-3) y atenuadas (Begonia). En el enfoque in vivo, miR-206, miR-133a, miR-133b y miR-378 presentaron expresión diferencial entre la infección por cepas de virus. En el enfoque in vitro, la mayoría de los miARN estaban regulados negativamente en grupos infectados. MiR-92a y miR-92b-3p estaban regulados positivamente en muestras infectadas con Begonia. El análisis funcional de todo esto sobre los miARN expresados durante la infección reveló su asociación en las vías relacionadas con los procesos de infección viral y la respuesta inmune. Además, se detectaron 8 miARN virales mediante RT-qPCR de bucle troncal en enfoques tanto in vitro como in vivo, presentando una red reguladora de genes que afecta a 59 genes virales. La mayoría de los miARN virales descritos estaban relacionados con el transcrito de gran latencia (LLT) y con los activadores de la transcripción viral EP0 e IE180, y también con los genes reguladores con respecto a sus importantes funciones en la interacción huésped-patógeno durante la infección viral.Files
journal.pone.0086965&type=printable.pdf
Files
(675.3 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:7e4fc6e4a6ebde6afd399bd56dd2c042
|
675.3 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- دور الميكرو رنا الفيروسية والمضيفة في فيروس مرض أوجيسكي أثناء عملية العدوى
- Translated title (French)
- Le rôle des microARN viraux et hôtes dans le virus de la maladie d'Aujeszky pendant le processus d'infection
- Translated title (Spanish)
- El papel de los microARN virales y del huésped en el virus de la enfermedad de Aujeszky durante el proceso de infección
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W1969993552
- DOI
- 10.1371/journal.pone.0086965
References
- https://openalex.org/W144423133
- https://openalex.org/W1529281406
- https://openalex.org/W1538875611
- https://openalex.org/W1577577364
- https://openalex.org/W1969963419
- https://openalex.org/W1975319407
- https://openalex.org/W1980548655
- https://openalex.org/W1985313214
- https://openalex.org/W1992695694
- https://openalex.org/W2007431542
- https://openalex.org/W2010461414
- https://openalex.org/W2016038592
- https://openalex.org/W2017426710
- https://openalex.org/W2019028138
- https://openalex.org/W2021107621
- https://openalex.org/W2026520054
- https://openalex.org/W2032419419
- https://openalex.org/W2039778160
- https://openalex.org/W2040650999
- https://openalex.org/W2045058009
- https://openalex.org/W2045756360
- https://openalex.org/W2051674645
- https://openalex.org/W2059357290
- https://openalex.org/W2061359459
- https://openalex.org/W2069229237
- https://openalex.org/W2070571588
- https://openalex.org/W2070777085
- https://openalex.org/W2075601020
- https://openalex.org/W2076034752
- https://openalex.org/W2080766929
- https://openalex.org/W2086848163
- https://openalex.org/W2095027598
- https://openalex.org/W2096894782
- https://openalex.org/W2100085836
- https://openalex.org/W2103017472
- https://openalex.org/W2112192177
- https://openalex.org/W2112543725
- https://openalex.org/W2119820853
- https://openalex.org/W2120456037
- https://openalex.org/W2121266203
- https://openalex.org/W2123079914
- https://openalex.org/W2128219894
- https://openalex.org/W2131388056
- https://openalex.org/W2133968430
- https://openalex.org/W2137338154
- https://openalex.org/W2141157874
- https://openalex.org/W2144896290
- https://openalex.org/W2150361201
- https://openalex.org/W2151868278
- https://openalex.org/W2155142785
- https://openalex.org/W2159675211
- https://openalex.org/W2162674813
- https://openalex.org/W2166208529
- https://openalex.org/W2167977613
- https://openalex.org/W2171260596