Published October 29, 2015 | Version v1
Publication Open

Genome-wide analysis correlates Ayurveda Prakriti

Creators

  • 1. Centre for Cellular and Molecular Biology
  • 2. Manipal Academy of Higher Education
  • 3. Shri Dharmasthala Manjunatheswara College of Ayurveda and Hospital
  • 4. Sinhgad Dental College and Hospital
  • 5. Foundation for Revitalisation of Local Health Traditions
  • 6. Savitribai Phule Pune University
  • 7. Indian Institute of Science Bangalore

Description

Abstract The practice of Ayurveda , the traditional medicine of India, is based on the concept of three major constitutional types (Vata, Pitta and Kapha) defined as " Prakriti ". To the best of our knowledge, no study has convincingly correlated genomic variations with the classification of Prakriti. In the present study, we performed genome-wide SNP (single nucleotide polymorphism) analysis (Affymetrix, 6.0) of 262 well-classified male individuals (after screening 3416 subjects) belonging to three Prakritis. We found 52 SNPs ( p ≤ 1 × 10 −5 ) were significantly different between Prakritis , without any confounding effect of stratification, after 10 6 permutations. Principal component analysis (PCA) of these SNPs classified 262 individuals into their respective groups (Vata, Pitta and Kapha) irrespective of their ancestry, which represent its power in categorization. We further validated our finding with 297 Indian population samples with known ancestry. Subsequently, we found that PGM1 correlates with phenotype of Pitta as described in the ancient text of Caraka Samhita, suggesting that the phenotypic classification of India's traditional medicine has a genetic basis; and its Prakriti -based practice in vogue for many centuries resonates with personalized medicine.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الخلاصة تعتمد ممارسة الأيورفيدا ، الطب التقليدي في الهند، على مفهوم ثلاثة أنواع دستورية رئيسية (فاتا وبيتا وكافا) تعرف باسم " براكريتي ". على حد علمنا، لم تربط أي دراسة الاختلافات الجينية بشكل مقنع بتصنيف براكريتي. في هذه الدراسة، أجرينا تحليل SNP على مستوى الجينوم (تعدد أشكال النيوكليوتيدات المفردة) (Affymetrix، 6.0) لـ 262 من الأفراد الذكور المصنفين تصنيفاً جيداً (بعد فحص 3416 شخصاً) ينتمون إلى ثلاثة من التهاب براكريتيس. وجدنا أن 52 SNPs ( p ≤ 1 × 10 −5 ) كانت مختلفة بشكل كبير بين التهاب البراكيت، دون أي تأثير مربك للطبقات، بعد 10 6 تباديل. صنف تحليل المكون الرئيسي (PCA) لهذه الاستراتيجيات الاستراتيجية الوطنية 262 فردًا في مجموعاتهم الخاصة (فاتا وبيتا وكافا) بغض النظر عن أسلافهم، والتي تمثل قوتها في التصنيف. كما تحققنا من صحة النتائج التي توصلنا إليها مع 297 عينة من السكان الهنود من أصل معروف. بعد ذلك، وجدنا أن PGM1 يرتبط بالنمط الظاهري لبيتا كما هو موضح في النص القديم لكاراكا سامهيتا، مما يشير إلى أن التصنيف الظاهري للطب التقليدي في الهند له أساس وراثي ؛ وممارسته القائمة على براكريتي في رواج لعدة قرون يتردد صداها مع الطب الشخصي.

Translated Description (French)

Résumé La pratique de l'Ayurveda , la médecine traditionnelle de l'Inde, repose sur le concept de trois grands types constitutionnels (Vata, Pitta et Kapha) définis comme « Prakriti ». À notre connaissance, aucune étude n'a corrélé de manière convaincante les variations génomiques avec la classification de Prakriti. Dans la présente étude, nous avons effectué une analyse SNP (polymorphisme d'un seul nucléotide) à l'échelle du génome (Affymetrix, 6.0) de 262 individus masculins bien classés (après sélection de 3416 sujets) appartenant à trois prakrites. Nous avons trouvé que 52 SNP ( p ≤ 1 × 10 −5 ) étaient significativement différents entre Prakritis, sans aucun effet confondant de stratification, après 10 6 permutations. L'analyse en composantes principales (ACP) de ces SNP a classé 262 individus dans leurs groupes respectifs (Vata, Pitta et Kapha) indépendamment de leur ascendance, ce qui représente son pouvoir de catégorisation. Nous avons en outre validé notre constatation avec 297 échantillons de population indienne d'ascendance connue. Par la suite, nous avons constaté que PGM1 est en corrélation avec le phénotype de Pitta tel que décrit dans le texte ancien de Caraka Samhita, suggérant que la classification phénotypique de la médecine traditionnelle indienne a une base génétique ; et sa pratique basée sur Prakriti en vogue depuis de nombreux siècles résonne avec la médecine personnalisée.

Translated Description (Spanish)

Resumen La práctica del Ayurveda , la medicina tradicional de la India, se basa en el concepto de tres tipos constitucionales principales (Vata, Pitta y Kapha) definidos como " Prakriti ". Hasta donde sabemos, ningún estudio ha correlacionado convincentemente las variaciones genómicas con la clasificación de Prakriti. En el presente estudio, realizamos un análisis de SNP (polimorfismo de un solo nucleótido) de todo el genoma (Affymetrix, 6.0) de 262 individuos masculinos bien clasificados (después de examinar a 3416 sujetos) pertenecientes a tres Prakritis. Encontramos que 52 SNP ( p ≤ 1 × 10 −5 ) fueron significativamente diferentes entre Prakritis , sin ningún efecto de confusión de la estratificación, después de 10 6 permutaciones. El análisis de componentes principales (PCA) de estos SNP clasificó a 262 individuos en sus respectivos grupos (Vata, Pitta y Kapha) independientemente de su ascendencia, lo que representa su poder en la categorización. Además, validamos nuestro hallazgo con 297 muestras de población india con ascendencia conocida. Posteriormente, encontramos que PGM1 se correlaciona con el fenotipo de Pitta como se describe en el antiguo texto de Caraka Samhita, lo que sugiere que la clasificación fenotípica de la medicina tradicional de la India tiene una base genética; y su práctica basada en Prakriti en boga durante muchos siglos resuena con la medicina personalizada.

Files

srep15786.pdf.pdf

Files (1.1 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:c85b796a7dcf0a4d41d03bc3a3a8807c
1.1 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التحليل على مستوى الجينوم يربط الأيورفيدا براكريتي
Translated title (French)
Corrélats de l'analyse à l'échelle du génome Ayurveda Prakriti
Translated title (Spanish)
El análisis de todo el genoma correlaciona Ayurveda Prakriti

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2176913036
DOI
10.1038/srep15786

Is supplement to
https://openalex.org/W2788277189 (Other)
https://openalex.org/W2130076355 (Other)
https://openalex.org/W2119695867 (Other)
https://openalex.org/W2117258802 (Other)
https://openalex.org/W2082860237 (Other)
https://openalex.org/W2046158694 (Other)
https://openalex.org/W2013243191 (Other)
https://openalex.org/W1993764875 (Other)
https://openalex.org/W1990804418 (Other)
https://openalex.org/W1971568933 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
India

References

  • https://openalex.org/W1555811114
  • https://openalex.org/W1577124699
  • https://openalex.org/W1976843725
  • https://openalex.org/W1982556615
  • https://openalex.org/W1982862899
  • https://openalex.org/W1986265706
  • https://openalex.org/W1995099400
  • https://openalex.org/W2000064163
  • https://openalex.org/W2009144436
  • https://openalex.org/W2009993434
  • https://openalex.org/W2024010930
  • https://openalex.org/W2033151532
  • https://openalex.org/W2047923046
  • https://openalex.org/W2056946864
  • https://openalex.org/W2058962873
  • https://openalex.org/W2059542829
  • https://openalex.org/W2067005158
  • https://openalex.org/W2079903236
  • https://openalex.org/W2087039034
  • https://openalex.org/W2088486634
  • https://openalex.org/W2105269157
  • https://openalex.org/W2108169091
  • https://openalex.org/W2110266900
  • https://openalex.org/W2119228812
  • https://openalex.org/W2120741200
  • https://openalex.org/W2140968934
  • https://openalex.org/W2161633633