Published July 2, 2020 | Version v1
Publication Open

Anopheles sundaicus complex and the presence of Anopheles epiroticus in Indonesia

Creators

  • 1. Hasanuddin University
  • 2. Eijkman Institute for Molecular Biology
  • 3. University of Notre Dame
  • 4. Ministry of Health
  • 5. University of Indonesia
  • 6. Kasetsart University

Description

Anopheles sundaicus s.l. is an important malaria vector primarily found in coastal landscapes of western and central Indonesia. The species complex has a wide geographical distribution in South and Southeast Asia and exhibits ecological and behavioural variability over its range. Studies on understanding the distribution of different members in the complex and their bionomics related to malaria transmission might be important guiding more effective vector intervention strategies. Female An. sundaicus s.l. were collected from seven provinces, 12 locations in Indonesia representing Sumatra: North Sumatra, Bangka-Belitung, South Lampung, and Bengkulu; in Java: West Java; and the Lesser Sunda Islands: West Nusa Tenggara and East Nusa Tenggara provinces. Sequencing of ribosomal DNA ITS2 gene fragments and two mitochondrial DNA gene markers, COI and cytb, enabled molecular identification of morphologically indistinguishable members of the complex. Findings allowed inference on the distribution of the An. sundaicus s.l. present in Indonesia and further illustrate the phylogenetic relationships of An. epiroticus within the complex. A total of 370 An. sundaicus s.l specimens were analysed for the ITS2 fragment. The ITS2 sequence alignment revealed two consistent species-specific point mutations, a T>C transition at base 479 and a G>T transversion at base 538 that differentiated five haplotypes: TG, CG, TT, CT, and TY. The TG haplotype matched published An. epiroticus–indicative sequences from Thailand, Vietnam and peninsular Malaysia. The previously described insertion event (base 603) was observed in all identified specimens. Analysis of the COI and cytb genes revealed no consistent nucleotide variations that could definitively distinguish An. epiroticus from other members in the Sundaicus Complex. The findings indicate and support the existence of An. epiroticus in North Sumatra and Bangka-Belitung archipelago. Further studies are recommended to determine the full distributional extent of the Sundaicus complex in Indonesia and investigate the role of these species in malaria transmission.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

Anopheles sundaicus s.l. هو ناقل مهم للملاريا يوجد في المقام الأول في المناظر الطبيعية الساحلية في غرب ووسط إندونيسيا. يتمتع مجمع الأنواع بتوزيع جغرافي واسع في جنوب وجنوب شرق آسيا ويظهر تقلبات بيئية وسلوكية على نطاقه. قد تكون الدراسات حول فهم توزيع الأعضاء المختلفين في المجمع وعلمهم الحيوي المتعلق بانتقال الملاريا مهمة في توجيه استراتيجيات تدخل ناقلات الأمراض الأكثر فعالية. تم جمع إناث AN. sundaicus s.l. من سبع مقاطعات، و 12 موقعًا في إندونيسيا تمثل سومطرة: شمال سومطرة، وبانكا بيليتونج، وجنوب لامبونغ، وبنغكولو ؛ في جاوة: جاوة الغربية ؛ وجزر سوندا الصغرى: مقاطعات نوسا تنغارا الغربية وشرق نوسا تنغارا. مكن تسلسل شظايا جين الحمض النووي الريبوسومي ITS2 واثنين من علامات جين الحمض النووي للميتوكوندريا، COI و cytb، من التحديد الجزيئي للأعضاء التي لا يمكن تمييزها شكليًا في المجمع. سمحت النتائج بالاستدلال على توزيع An. sundaicus s.l. الموجود في إندونيسيا وتوضح بشكل أكبر العلاقات التطورية لـ An. epiroticus داخل المجمع. تم تحليل ما مجموعه 370 عينة من An. sundaicus s.l لشظية ITS2. كشفت محاذاة تسلسل ITS2 عن طفرتين نقطيتين ثابتتين خاصتين بالأنواع، انتقال T>C عند القاعدة 479 وانقلاب G>T عند القاعدة 538 التي ميزت خمسة أنماط فردية: TG و CG و TT و CT و TY. طابق النمط الفرداني لـ TG تسلسلات An. epiroticus - indicative من تايلاند وفيتنام وشبه جزيرة ماليزيا. لوحظ حدث الإدخال الموصوف سابقًا (القاعدة 603) في جميع العينات المحددة. كشف تحليل جينات COI و cytb عن عدم وجود اختلافات نيوكليوتيدات ثابتة يمكن أن تميز بشكل قاطع An. epiroticus عن الأعضاء الآخرين في مجمع Sundaicus. تشير النتائج إلى وجود An. epiroticus في شمال سومطرة وأرخبيل Bangka - Belitung وتدعمه. يوصى بإجراء مزيد من الدراسات لتحديد المدى التوزيعي الكامل لمجمع صندايكوس في إندونيسيا والتحقيق في دور هذه الأنواع في انتقال الملاريا.

Translated Description (French)

Anopheles sundaicus s.l. est un important vecteur du paludisme principalement présent dans les paysages côtiers de l'ouest et du centre de l'Indonésie. Le complexe d'espèces a une large répartition géographique en Asie du Sud et du Sud-Est et présente une variabilité écologique et comportementale sur son aire de répartition. Des études sur la compréhension de la répartition des différents membres du complexe et de leur bionomique liée à la transmission du paludisme pourraient être importantes pour orienter des stratégies d'intervention vectorielle plus efficaces. Les femelles An. sundaicus s.l. ont été recueillies dans sept provinces, 12 endroits en Indonésie représentant Sumatra : Sumatra du Nord, Bangka-Belitung, South Lampung et Bengkulu ; à Java : Java Ouest ; et les îles de la Petite Sonde : provinces de Nusa Tenggara Ouest et Nusa Tenggara Est. Le séquençage des fragments du gène ITS2 de l'ADN ribosomique et de deux marqueurs du gène de l'ADN mitochondrial, COI et cytb, a permis l'identification moléculaire des membres morphologiquement indiscernables du complexe. Les résultats ont permis d'inférer la distribution de l'An. sundaicus s.l. présent en Indonésie et illustrent davantage les relations phylogénétiques de l'An. epiroticus au sein du complexe. Au total, 370 échantillons d'An. sundaicus s.l ont été analysés pour le fragment ITS2. L'alignement de la séquence ITS2 a révélé deux mutations ponctuelles cohérentes spécifiques à l'espèce, une transition T>C à la base 479 et une transversion G>T à la base 538 qui différenciaient cinq haplotypes : TG, CG, TT, CT et TY. L'haplotype TG correspondait à des séquences indicatives d'An. epiroticus publiées de Thaïlande, du Vietnam et de Malaisie péninsulaire. L'événement d'insertion précédemment décrit (base 603) a été observé dans tous les échantillons identifiés. L'analyse des gènes COI et cytb n'a révélé aucune variation nucléotidique cohérente qui pourrait définitivement distinguer An. epiroticus des autres membres du complexe Sundaicus. Les résultats indiquent et soutiennent l'existence d'An. epiroticus dans le nord de Sumatra et l'archipel de Bangka-Belitung. D'autres études sont recommandées pour déterminer l'étendue de la distribution complète du complexe Sundaicus en Indonésie et étudier le rôle de ces espèces dans la transmission du paludisme.

Translated Description (Spanish)

Anopheles sundaicus s.l. es un importante vector de la malaria que se encuentra principalmente en los paisajes costeros del oeste y centro de Indonesia. El complejo de especies tiene una amplia distribución geográfica en el sur y sudeste de Asia y exhibe variabilidad ecológica y de comportamiento en su área de distribución. Los estudios sobre la comprensión de la distribución de los diferentes miembros en el complejo y su bionómica relacionada con la transmisión de la malaria podrían ser importantes para guiar estrategias de intervención de vectores más efectivas. Se recolectaron hembras de An. sundaicus s.l. de siete provincias, 12 ubicaciones en Indonesia que representan a Sumatra: Sumatra del Norte, Bangka-Belitung, Lampung del Sur y Bengkulu; en Java: Java Occidental; y las Islas Menores de la Sonda: las provincias de Nusa Tenggara Occidental y Nusa Tenggara Oriental. La secuenciación de fragmentos génicos de ITS2 de ADN ribosómico y dos marcadores génicos de ADN mitocondrial, COI y cytb, permitió la identificación molecular de miembros morfológicamente indistinguibles del complejo. Los hallazgos permitieron inferir sobre la distribución de An. sundaicus s.l. presente en Indonesia e ilustran aún más las relaciones filogenéticas de An. epiroticus dentro del complejo. Se analizaron un total de 370 especímenes de An. sundaicus s.l para el fragmento ITS2. El alineamiento de secuencias de ITS2 reveló dos mutaciones puntuales consistentes específicas de la especie, una transición T>C en la base 479 y una transversión G>T en la base 538 que diferenciaba cinco haplotipos: TG, CG, TT, CT y TY. El haplotipo TG coincidió con las secuencias indicativas publicadas de An. epiroticus de Tailandia, Vietnam y Malasia peninsular. El evento de inserción descrito anteriormente (base 603) se observó en todas las muestras identificadas. El análisis de los genes COI y cytb no reveló variaciones de nucleótidos consistentes que pudieran distinguir definitivamente a An. epiroticus de otros miembros del complejo Sundaicus. Los hallazgos indican y respaldan la existencia de An. epiroticus en el norte de Sumatra y el archipiélago de Bangka-Belitung. Se recomiendan más estudios para determinar la extensión distributiva total del complejo Sundaicus en Indonesia e investigar el papel de estas especies en la transmisión de la malaria.

Files

journal.pntd.0008385&type=printable.pdf

Files (2.3 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:8781203103e3b82c48de3ce013a6f6d2
2.3 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
مركب أنوفيليس سونديكوس ووجود أنوفيليس إبيروتيكوس في إندونيسيا
Translated title (French)
Complexe d'Anopheles sundaicus et présence d'Anopheles epiroticus en Indonésie
Translated title (Spanish)
Complejo Anopheles sundaicus y presencia de Anopheles epiroticus en Indonesia

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3038698285
DOI
10.1371/journal.pntd.0008385

Is supplement to
https://openalex.org/W4242422371 (Other)
https://openalex.org/W3165728476 (Other)
https://openalex.org/W2519010896 (Other)
https://openalex.org/W2421810400 (Other)
https://openalex.org/W2409070081 (Other)
https://openalex.org/W2128377962 (Other)
https://openalex.org/W2052261230 (Other)
https://openalex.org/W2042974272 (Other)
https://openalex.org/W2013828213 (Other)
https://openalex.org/W1876914075 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Thailand

References

  • https://openalex.org/W1492436430
  • https://openalex.org/W1515062641
  • https://openalex.org/W1518688722
  • https://openalex.org/W1968932277
  • https://openalex.org/W1972938569
  • https://openalex.org/W1981663750
  • https://openalex.org/W1999882673
  • https://openalex.org/W2024839750
  • https://openalex.org/W2030966943
  • https://openalex.org/W2036678624
  • https://openalex.org/W2036998665
  • https://openalex.org/W2048544108
  • https://openalex.org/W2074583233
  • https://openalex.org/W2097706568
  • https://openalex.org/W2102456788
  • https://openalex.org/W2108167939
  • https://openalex.org/W2108221956
  • https://openalex.org/W2111991902
  • https://openalex.org/W2116671811
  • https://openalex.org/W2121677860
  • https://openalex.org/W2122715089
  • https://openalex.org/W2128214917
  • https://openalex.org/W2129108102
  • https://openalex.org/W2137506286
  • https://openalex.org/W2138253687
  • https://openalex.org/W2141204948
  • https://openalex.org/W2142269327
  • https://openalex.org/W2150477652
  • https://openalex.org/W2152207030
  • https://openalex.org/W2162714623
  • https://openalex.org/W2164501940
  • https://openalex.org/W2165657591
  • https://openalex.org/W2171981494
  • https://openalex.org/W2395746167
  • https://openalex.org/W2478368021
  • https://openalex.org/W2528153790
  • https://openalex.org/W2734625957
  • https://openalex.org/W2783569653
  • https://openalex.org/W2806686059
  • https://openalex.org/W2887362359
  • https://openalex.org/W4244235990
  • https://openalex.org/W4381434035
  • https://openalex.org/W8769360