First LIPA Mutational Analysis in Egyptian Patients Reveals One Novel Variant: Wolman Disease
Creators
- 1. National Research Centre
- 2. Al Azhar University
- 3. Helwan University
- 4. Ain Shams University
- 5. Minia University
Description
Abstract Lysosomal acid lipase (LAL) is a necessary enzyme for the hydrolysis of both triglycerides (TGs) and cholesteryl esters (CEs) in the lysosome. Deficiency of this enzyme encoded by the lipase A ( LIPA ) gene leads to LAL deficiency (LAL-D). A severe disease subtype of LAL-D is known as Wolman disease (WD), present with diarrhea, hepatosplenomegaly, and adrenal calcification. Untreated patients do not survive more than a year. The aim of this study was to assess the clinical and molecular characterizations of WD patients in Egypt. A total of seven patients (from five unrelated Egyptian families) were screened by targeted next-generation sequencing (NGS), and the co-segregation of causative variants was analyzed using Sanger sequencing. Furthermore, multiple in silico analyses were performed to assess the pathogenicity of the candidate variants. Overall, we identified three diseases causing variants harbored in the LIPA gene. One of these variants is a novel missense variant (NM_000235.4: c.1122 T > G; p. His374Gln), which was classified as a likely pathogenic variant. All variants were predicted to be disease causing using in silico analyses. Our findings expand the spectrum of variants involved in WD which may help to investigate phenotype-genotype correlation and assist genetic counseling. To the best of our knowledge, this is the first clinico-genetic study carried out on Egyptian patients affected with WD.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
إنزيم ليباز حمض الليزوزومال التجريدي (LAL) هو إنزيم ضروري للتحلل المائي لكل من الدهون الثلاثية (TGs) وإسترات الكوليسترول (CEs) في الليزوزوم. يؤدي نقص هذا الإنزيم المشفر بواسطة جين الليباز A ( LIPA ) إلى نقص LAL (LAL - D). يُعرف النوع الفرعي الحاد من LAL - D باسم مرض وولمان (WD)، وهو موجود مع الإسهال وتضخم الكبد والطحال وتكلس الغدة الكظرية. لا يعيش المرضى غير المعالجين أكثر من عام. كان الهدف من هذه الدراسة هو تقييم الخصائص السريرية والجزيئية لمرضى WD في مصر. تم فحص ما مجموعه سبعة مرضى (من خمس عائلات مصرية غير ذات صلة) من خلال تسلسل الجيل التالي المستهدف (NGS)، وتم تحليل الفصل المشترك للمتغيرات المسببة باستخدام تسلسل Sanger. علاوة على ذلك، تم إجراء العديد من التحليلات السيليكية لتقييم إمراض المتغيرات المرشحة. بشكل عام، حددنا ثلاثة أمراض تسبب المتغيرات الموجودة في جين ليبا. أحد هذه المتغيرات هو متغير خاطئ جديد (NM_000235.4: c.1122 T > G; p. His374Gln)، والذي تم تصنيفه على أنه متغير ممرض محتمل. كان من المتوقع أن تكون جميع المتغيرات مسببة للأمراض باستخدام تحليلات السيليكو. تعمل النتائج التي توصلنا إليها على توسيع نطاق المتغيرات المشاركة في WD والتي قد تساعد في التحقيق في ارتباط النمط الجيني الظاهري وتساعد في الاستشارة الجينية. على حد علمنا، هذه هي أول دراسة وراثية سريرية يتم إجراؤها على المرضى المصريين المتضررين من مرض ويسترن ديجيتال.Translated Description (French)
Résumé La lipase acide lysosomale (LAL) est une enzyme nécessaire à l'hydrolyse des triglycérides (TG) et des esters cholestériques (EC) dans le lysosome. Une déficience de cette enzyme codée par le gène de la lipase A ( LIPA ) entraîne une déficience en LAL (LAL-D). Un sous-type grave de LAL-D est connu sous le nom de maladie de Wolman (WD), présente avec diarrhée, hépatosplénomégalie et calcification surrénalienne. Les patients non traités ne survivent pas plus d'un an. L'objectif de cette étude était d'évaluer les caractérisations cliniques et moléculaires des patients atteints de WD en Égypte. Au total, sept patients (issus de cinq familles égyptiennes non apparentées) ont été dépistés par séquençage ciblé de nouvelle génération (NGS), et la co-ségrégation des variants causatifs a été analysée à l'aide du séquençage de Sanger. De plus, de multiples analyses in silico ont été réalisées pour évaluer la pathogénicité des variants candidats. Dans l'ensemble, nous avons identifié trois maladies causant des variants hébergés dans le gène LIPA. L'une de ces variantes est une nouvelle variante faux-sens (NM_000235.4 : c.1122 T > G ; p. His374Gln), qui a été classé comme un variant pathogène probable. Il a été prédit que toutes les variantes provoquaient des maladies en utilisant des analyses in silico. Nos résultats élargissent le spectre des variants impliqués dans WD, ce qui peut aider à étudier la corrélation phénotype-génotype et à aider le conseil génétique. À notre connaissance, il s'agit de la première étude clinico-génétique réalisée sur des patients égyptiens atteints de DEO.Translated Description (Spanish)
Resumen La lipasa ácida lisosomal (Lal) es una enzima necesaria para la hidrólisis tanto de triglicéridos (TG) como de ésteres de colesterilo (CE) en el lisosoma. La deficiencia de esta enzima codificada por el gen de la lipasa A ( LIPA ) conduce a la deficiencia de Lal (LAL-D). Un subtipo de enfermedad grave de LAL-D se conoce como enfermedad de Wolman (WD), que se presenta con diarrea, hepatoesplenomegalia y calcificación suprarrenal. Los pacientes no tratados no sobreviven más de un año. El objetivo de este estudio fue evaluar las caracterizaciones clínicas y moleculares de los pacientes con WD en Egipto. Un total de siete pacientes (de cinco familias egipcias no relacionadas) se examinaron mediante secuenciación dirigida de próxima generación (NGS), y se analizó la cosegregación de variantes causales utilizando la secuenciación de Sanger. Además, se realizaron múltiples análisis in silico para evaluar la patogenicidad de las variantes candidatas. En general, identificamos tres enfermedades que causan variantes albergadas en el gen LIPA. Una de estas variantes es una nueva variante de sentido erróneo (NM_000235.4: c.1122 T > G; p. His374Gln), que se clasificó como una variante patógena probable. Se predijo que todas las variantes eran causantes de enfermedad utilizando análisis in silico. Nuestros hallazgos amplían el espectro de variantes involucradas en WD, lo que puede ayudar a investigar la correlación fenotipo-genotipo y ayudar al asesoramiento genético. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio clínico-genético realizado en pacientes egipcios afectados con WD.Files
s12031-023-02139-6.pdf.pdf
Files
(1.2 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:3d476cab699643e353dadd3733112fcb
|
1.2 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- أول تحليل ليبا للطفرات في المرضى المصريين يكشف عن متغير جديد واحد: مرض وولمان
- Translated title (French)
- La première analyse mutationnelle LIPA chez des patients égyptiens révèle une nouvelle variante : la maladie de Wolman
- Translated title (Spanish)
- El primer análisis mutacional de LIPA en pacientes egipcios revela una nueva variante: la enfermedad de Wolman
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4384818648
- DOI
- 10.1007/s12031-023-02139-6
References
- https://openalex.org/W1178631282
- https://openalex.org/W1535676584
- https://openalex.org/W1901525248
- https://openalex.org/W1995292072
- https://openalex.org/W1995523527
- https://openalex.org/W1997618612
- https://openalex.org/W2051978340
- https://openalex.org/W2052877626
- https://openalex.org/W2057624500
- https://openalex.org/W2069487948
- https://openalex.org/W2080241641
- https://openalex.org/W2132032261
- https://openalex.org/W2160246648
- https://openalex.org/W2332438071
- https://openalex.org/W2586665644
- https://openalex.org/W2588546436
- https://openalex.org/W2589278242
- https://openalex.org/W2601101140
- https://openalex.org/W2741355356
- https://openalex.org/W2755942998
- https://openalex.org/W2792790685
- https://openalex.org/W2890609398
- https://openalex.org/W2896238192
- https://openalex.org/W2909621790
- https://openalex.org/W2921683028
- https://openalex.org/W2945793460
- https://openalex.org/W2950528096
- https://openalex.org/W2963476527
- https://openalex.org/W2968845371
- https://openalex.org/W3005232559
- https://openalex.org/W3112289311
- https://openalex.org/W3128319366
- https://openalex.org/W3153817661
- https://openalex.org/W3154479146
- https://openalex.org/W3160492664