Published October 3, 2011 | Version v1
Publication Open

The molecular epidemiology of circulating rotaviruses: three-year surveillance in the region of Monastir, Tunisia

Creators

  • 1. University of Monastir
  • 2. Hospital Fatuma Bourguiba Monastir

Description

Rotavirus infection is the most common cause of severe, dehydrating, gastroenteritis among children worldwide. In developing countries, approximately 1440 children die from rotavirus infections each day, with an estimated 527,000 annually. In infants, rotavirus is estimated to cause more than 2 million hospitalizations every year depending on the income level of the country. The purpose of this study was to estimate the proportion of rotavirus gastroenteritis and identify the distribution of circulating G and P genotype rotavirus strains among children consulting several dispensaries in the region of Monastir (outpatients departments) or admitted to Monastir University Hospital (inpatients department) with acute gastroenteritis.This study was undertaken during a 3-year period from April 2007 to April 2010 in Tunisian children under 13 suffering from acute gastroenteritis. Group A rotaviruses were detected in stools by ELISA and genotyped using multiplex reverse transcription PCRs with type-specific primers on the basis of their outer capsid proteins. Statistical analyses were performed with SPSS software, version 19.Of the 435 stool samples from children with acute gastroenteritis, 27.6% were positive for rotavirus A. The predominant G type was G1 (37.5%), followed by G3 (25%), G2 (17.5%), G4 (12.5%), G9 (2.5%) and three mixed-G infections G3G4 (2.5%) were identified. Only P[8] (80.8%), P[4] (16.7%) and P[9] (0.8%) genotypes were found. The predominant single G/P combination was G1P[8] (37.5%), followed by G3P[8] (25%), G2P[4] (16.7%), G4P[8] (12.5%), G9P[8] (1.7%) and one case of the unusual combination G9P[9] (0.8%). The G-mixed types G3G4 combined with P[8] (2.5%). Infants less than 3 months of age were most frequently affected. The prevalence of rotavirus infection peaked in the winter season, when temperatures were low, and decreased in summer.Rotavirus gastroenteritis is a common disease associated with significant morbidity, mortality, and economic burden. Epidemiological knowledge of rotavirus is critical for the development of effective preventive measures, including vaccines. These data will help to make informed decisions as to whether rotavirus vaccine should be considered for inclusion in Tunisia's National Immunisation Programme.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

عدوى فيروس الروتا هي السبب الأكثر شيوعًا لالتهاب المعدة والأمعاء الشديد والجفاف بين الأطفال في جميع أنحاء العالم. في البلدان النامية، يموت ما يقرب من 1440 طفلاً من عدوى فيروس الروتا كل يوم، مع ما يقدر بنحو 527000 طفل سنويًا. بالنسبة للرضع، تشير التقديرات إلى أن فيروس الروتا يتسبب في أكثر من مليوني حالة دخول إلى المستشفى كل عام اعتمادًا على مستوى الدخل في البلاد. كان الغرض من هذه الدراسة هو تقدير نسبة التهاب المعدة والأمعاء بالفيروس العجلي وتحديد توزيع سلالات الفيروس العجلي الوراثي G و P المتداولة بين الأطفال الذين يستشيرون العديد من المستوصفات في منطقة المنستير (أقسام المرضى الخارجيين) أو يتم إدخالهم إلى مستشفى المنستير الجامعي (قسم المرضى الداخليين) المصابين بالتهاب المعدة والأمعاء الحاد. أجريت هذه الدراسة خلال فترة 3 سنوات من أبريل 2007 إلى أبريل 2010 على الأطفال التونسيين دون سن 13 عامًا الذين يعانون من التهاب المعدة والأمعاء الحاد. تم اكتشاف فيروسات الروتا من المجموعة أ في البراز بواسطة ELISA وتم تنميطها جينيًا باستخدام تفاعلات البوليميراز المتسلسلة متعددة النسخ العكسي مع برايمر محدد النوع على أساس بروتينات القفيصة الخارجية. تم إجراء التحليلات الإحصائية باستخدام برنامج SPSS، الإصدار 19. من بين 435 عينة براز من الأطفال المصابين بالتهاب المعدة والأمعاء الحاد، كانت نسبة 27.6 ٪ إيجابية لفيروس الروتا A. كان النوع G السائد هو G1 (37.5 ٪)، تليها G3 (25 ٪)، G2 (17.5 ٪)، G4 (12.5 ٪)، G9 (2.5 ٪) وثلاث إصابات مختلطة G G3G4 (2.5 ٪). تم العثور على الأنماط الجينية P[8] (80.8 ٪) و P[4] (16.7 ٪) و P[9] (0.8 ٪) فقط. كانت تركيبة G/P الفردية السائدة هي G1P[8] (37.5 ٪)، تليها G3P[8] (25 ٪)، G2P[4] (16.7 ٪)، G4P[8] (12.5 ٪)، G9P[8] (1.7 ٪) وحالة واحدة من التركيبة غير العادية G9P[9] (0.8 ٪). G - أنواع مختلطة G3G4 جنبا إلى جنب مع P[8] (2.5 ٪). كان الرضع الذين تقل أعمارهم عن 3 أشهر هم الأكثر تضررًا. بلغ انتشار عدوى فيروس الروتا ذروته في فصل الشتاء، عندما كانت درجات الحرارة منخفضة، وانخفض في الصيف. التهاب المعدة والأمعاء الناجم عن فيروس الروتا هو مرض شائع يرتبط بارتفاع معدلات الاعتلال والوفيات والعبء الاقتصادي. المعرفة الوبائية بفيروس الروتا أمر بالغ الأهمية لتطوير تدابير وقائية فعالة، بما في ذلك اللقاحات. ستساعد هذه البيانات في اتخاذ قرارات مستنيرة بشأن ما إذا كان ينبغي النظر في إدراج لقاح فيروس الروتا في البرنامج الوطني للتحصين في تونس.

Translated Description (French)

L'infection à rotavirus est la cause la plus fréquente de gastro-entérite sévère et déshydratante chez les enfants du monde entier. Dans les pays en développement, environ 1 440 enfants meurent chaque jour d'infections à rotavirus, avec environ 527 000 par an. Chez les nourrissons, on estime que le rotavirus provoque plus de 2 millions d'hospitalisations chaque année en fonction du niveau de revenu du pays. L'objectif de cette étude était d'estimer la proportion de gastro-entérites à rotavirus et d'identifier la distribution des souches circulantes de rotavirus de génotype G et P chez les enfants consultant plusieurs dispensaires de la région de Monastir (services ambulatoires) ou admis au CHU de Monastir (service hospitalier) avec gastro-entérites aiguës.Cette étude a été menée sur une période de 3 ans d'avril 2007 à avril 2010 chez des enfants tunisiens de moins de 13 ans souffrant de gastro-entérite aiguë. Les rotavirus du groupe A ont été détectés dans les selles par ELISA et génotypés à l'aide de PCR de transcription inverse multiplex avec des amorces spécifiques au type sur la base de leurs protéines de capside externe. Des analyses statistiques ont été effectuées avec le logiciel SPSS, version 19. Sur les 435 échantillons de selles d'enfants atteints de gastro-entérite aiguë, 27,6 % étaient positifs pour le rotavirus A. Le type G prédominant était G1 (37,5 %), suivi de G3 (25 %), G2 (17,5 %), G4 (12,5 %), G9 (2,5 %) et trois infections mixtes G3G4 (2,5 %). Seuls les génotypes P[8] (80,8 %), P[4] (16,7 %) et P[9] (0,8 %) ont été trouvés. La combinaison G/P unique prédominante était G1P[8] (37,5 %), suivie de G3P[8] (25 %), G2P[4] (16,7 %), G4P[8] (12,5 %), G9P[8] (1,7 %) et d'un cas de la combinaison inhabituelle G9P[9] (0,8 %). Les types G-mélangés G3G4 combinés avec P[8] (2,5%). Les nourrissons de moins de 3 mois étaient les plus fréquemment touchés. La prévalence de l'infection à rotavirus a culminé pendant la saison hivernale, lorsque les températures étaient basses, et a diminué en été. La gastro-entérite à rotavirus est une maladie courante associée à une morbidité, une mortalité et un fardeau économique importants. La connaissance épidémiologique du rotavirus est essentielle pour le développement de mesures préventives efficaces, y compris les vaccins. Ces données aideront à prendre des décisions éclairées quant à savoir si le vaccin contre le rotavirus devrait être inclus dans le programme national de vaccination de la Tunisie.

Translated Description (Spanish)

La infección por rotavirus es la causa más común de gastroenteritis grave y deshidratante entre los niños de todo el mundo. En los países en desarrollo, aproximadamente 1.440 niños mueren a causa de infecciones por rotavirus cada día, con un estimado de 527.000 al año. En los bebés, se estima que el rotavirus causa más de 2 millones de hospitalizaciones cada año, dependiendo del nivel de ingresos del país. El propósito de este estudio fue estimar la proporción de gastroenteritis por rotavirus e identificar la distribución de las cepas de rotavirus de genotipo G y P circulantes entre los niños que consultan varios dispensarios en la región de Monastir (departamentos de pacientes ambulatorios) o ingresados en el Hospital Universitario de Monastir (departamento de pacientes hospitalizados) con gastroenteritis aguda. Este estudio se realizó durante un período de 3 años de abril de 2007 a abril de 2010 en niños tunecinos menores de 13 años que padecían gastroenteritis aguda. Los rotavirus del grupo A se detectaron en las heces mediante ELISA y se genotipificaron utilizando PCR de transcripción inversa multiplex con cebadores específicos de tipo sobre la base de sus proteínas de la cápside externa. Los análisis estadísticos se realizaron con el software SPSS, versión 19. De las 435 muestras de heces de niños con gastroenteritis aguda, el 27,6% fueron positivas para rotavirus A. El tipo G predominante fue G1 (37,5%), seguido de G3 (25%), G2 (17,5%), G4 (12,5%), G9 (2,5%) y tres infecciones mixtas-G G3G4 (2,5%). Solo se encontraron los genotipos P[8] (80,8%), P[4] (16,7%) y P[9] (0,8%). La combinación G/P única predominante fue G1P[8] (37,5%), seguida de G3P[8] (25%), G2P[4] (16,7%), G4P[8] (12,5%), G9P[8] (1,7%) y un caso de la combinación inusual G9P[9] (0,8%). Los tipos G-mixtos G3G4 combinados con P[8] (2,5%). Los bebés menores de 3 meses de edad fueron los más afectados. La prevalencia de la infección por rotavirus alcanzó su punto máximo en la temporada de invierno, cuando las temperaturas eran bajas, y disminuyó en verano. La gastroenteritis por rotavirus es una enfermedad común asociada con una morbilidad, mortalidad y carga económica significativas. El conocimiento epidemiológico del rotavirus es fundamental para el desarrollo de medidas preventivas eficaces, incluidas las vacunas. Estos datos ayudarán a tomar decisiones informadas sobre si la vacuna contra el rotavirus debe considerarse para su inclusión en el Programa Nacional de Inmunización de Túnez.

Files

1471-2334-11-266.pdf

Files (207.1 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:47e570e81827859f40b97a59c51301cc
207.1 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
علم الأوبئة الجزيئي للفيروسات العجلية المتداولة: مراقبة لمدة ثلاث سنوات في منطقة المنستير، تونس
Translated title (French)
L'épidémiologie moléculaire des rotavirus circulants : surveillance triennale dans la région de Monastir, Tunisie
Translated title (Spanish)
La epidemiología molecular de los rotavirus circulantes: vigilancia de tres años en la región de Monastir, Túnez

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2140735999
DOI
10.1186/1471-2334-11-266

Is supplement to
https://openalex.org/W3138704042 (Other)
https://openalex.org/W2797451129 (Other)
https://openalex.org/W2786173736 (Other)
https://openalex.org/W2757311760 (Other)
https://openalex.org/W2651950297 (Other)
https://openalex.org/W2174615771 (Other)
https://openalex.org/W2137650597 (Other)
https://openalex.org/W2126402298 (Other)
https://openalex.org/W2111984938 (Other)
https://openalex.org/W2039347178 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Tunisia

References

  • https://openalex.org/W1964871727
  • https://openalex.org/W1982558893
  • https://openalex.org/W1992121443
  • https://openalex.org/W1994550851
  • https://openalex.org/W2015388060
  • https://openalex.org/W2055112920
  • https://openalex.org/W2089916092
  • https://openalex.org/W2101028607
  • https://openalex.org/W2102960939
  • https://openalex.org/W2106104808
  • https://openalex.org/W2108085157
  • https://openalex.org/W2118387028
  • https://openalex.org/W2123497124
  • https://openalex.org/W2130815453
  • https://openalex.org/W2140640005
  • https://openalex.org/W2141220841
  • https://openalex.org/W2143886904
  • https://openalex.org/W2148942349
  • https://openalex.org/W2149610423
  • https://openalex.org/W2153692661
  • https://openalex.org/W2159825588
  • https://openalex.org/W2162183803
  • https://openalex.org/W2162295389
  • https://openalex.org/W4245353981