Published July 1, 2019 | Version v1
Publication Open

Mortality in adult patients with culture-positive and culture-negative meningitis in the Botswana national meningitis survey: a prevalent cohort study

Creators

  • 1. Botswana Open University
  • 2. University of Washington
  • 3. Ministry of Health
  • 4. University of Botswana
  • 5. Botswana Harvard AIDS Institute Partnership
  • 6. London School of Hygiene & Tropical Medicine
  • 7. University of Pennsylvania

Description

CNS infections are a leading cause of HIV-related deaths in sub-Saharan Africa, but causes and outcomes are poorly defined. We aimed to determine mortality and predictors of mortality in adults evaluated for meningitis in Botswana, which has an estimated 23% HIV prevalence among adults.In this prevalent cohort study, patient records from 2004-15 were sampled from the Botswana national meningitis survey, a nationwide audit of all cerebrospinal fluid (CSF) laboratory records from patients receiving a lumbar puncture for evaluation of meningitis. Data from all patients with culture-confirmed pneumococcal and tuberculous meningitis, and all patients with culture-negative meningitis with CSF white cell count (WCC) above 20 cells per μL were included in our analyses, in addition to a random selection of patients with culture-negative CSF and CSF WCC of up to 20 cells per μL. We used patient national identification numbers to link CSF laboratory records from the national meningitis survey to patient vital registry and HIV databases. Univariable and multivariable Cox proportional hazards models were used to evaluate clinical and laboratory predictors of mortality.We included data from 238 patients with culture-confirmed pneumococcal meningitis, 48 with culture-confirmed tuberculous meningitis, and 2900 with culture-negative CSF (including 1691 with CSF WCC of up to 20 cells per μL and 1209 with CSF WCC above 20 cells per μL). Median age was 37 years (IQR 31-46), 1605 (50%) of 3184 patients were male, 2188 (72%) of 3023 patients with registry linkage had documentation of HIV infection, and median CD4 count was 139 cells per μL (IQR 63-271). 10-week and 1-year mortality was 47% (112 of 238) and 49% (117 of 238) for pneumococcal meningitis, 46% (22 of 48) and 56% (27 of 48) for tuberculous meningitis, and 41% (1181 of 2900) and 49% (1408 of 2900) for culture-negative patients. When the analysis of patients with culture-negative CSF was restricted to those with known HIV infection, WCC (0-20 cells per μL vs >20 cells per μL) was not predictive of mortality (average hazard ratio 0·93, 95% CI 0·80-1·09).Mortality from pneumococcal, tuberculous, and culture-negative meningitis was high in this setting of high HIV prevalence. There is an urgent need for improved access to diagnostics, to better define aetiologies and develop novel diagnostic tools and treatment algorithms.National Institutes of Health, President's Emergency Plan for AIDS Relief, National Institute for Health Research.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تعد عدوى الجهاز العصبي المركزي سببًا رئيسيًا للوفيات المرتبطة بفيروس نقص المناعة البشرية في أفريقيا جنوب الصحراء الكبرى، ولكن الأسباب والنتائج غير محددة بشكل جيد. كنا نهدف إلى تحديد الوفيات والتنبؤات بالوفيات لدى البالغين الذين تم تقييمهم لالتهاب السحايا في بوتسوانا، والتي يقدر معدل انتشار فيروس نقص المناعة البشرية فيها بنسبة 23 ٪ بين البالغين. في هذه الدراسة الجماعية السائدة، تم أخذ عينات من سجلات المرضى من 2004-2015 من المسح الوطني لالتهاب السحايا في بوتسوانا، وهو تدقيق على الصعيد الوطني لجميع السجلات المختبرية للسائل النخاعي من المرضى الذين يتلقون بزل قطني لتقييم التهاب السحايا. تم تضمين بيانات من جميع المرضى الذين يعانون من التهاب السحايا الرئوي والسلّي المؤكّد بالثقافة، وجميع المرضى الذين يعانون من التهاب السحايا السلبي بالثقافة والذين لديهم عدد خلايا بيضاء في السائل النخاعي أعلى من 20 خلية لكل ميكرولتر في تحليلاتنا، بالإضافة إلى مجموعة عشوائية من المرضى الذين يعانون من التهاب السحايا النخاعي السلبي بالثقافة و التهاب السحايا النخاعي الذي يصل إلى 20 خلية لكل ميكرولتر. استخدمنا أرقام التعريف الوطنية للمريض لربط سجلات مختبرات السائل النخاعي من المسح الوطني لالتهاب السحايا بقواعد بيانات السجل الحيوي للمريض وفيروس نقص المناعة البشرية. تم استخدام نماذج المخاطر النسبية لـ COX أحادية المتغير ومتعددة المتغيرات لتقييم التنبؤات السريرية والمخبرية للوفيات. قمنا بتضمين بيانات من 238 مريضًا يعانون من التهاب السحايا بالمكورات الرئوية المؤكدة الثقافة، و 48 مصابًا بالتهاب السحايا السلي المؤكدة الثقافة، و 2900 مصابًا بـ CSF سلبي الثقافة (بما في ذلك 1691 مع CSF WCC تصل إلى 20 خلية لكل ميكرولتر و 1209 مع CSF WCC أعلى من 20 خلية لكل ميكرولتر). كان متوسط العمر 37 عامًا (31-46 ريالًا عراقيًا)، و 1605 (50 ٪) من 3184 مريضًا من الذكور، و 2188 (72 ٪) من 3023 مريضًا لديهم ارتباط بالتسجيل لديهم وثائق عن الإصابة بفيروس نقص المناعة البشرية، وكان متوسط عدد خلايا CD4 139 خلية لكل ميكرولتر (63-271 ريالًا عراقيًا). كان معدل الوفيات لمدة 10 أسابيع وسنة واحدة 47 ٪ (112 من 238) و 49 ٪ (117 من 238) لالتهاب السحايا بالمكورات الرئوية، و 46 ٪ (22 من 48) و 56 ٪ (27 من 48) لالتهاب السحايا السلي، و 41 ٪ (1181 من 2900) و 49 ٪ (1408 من 2900) للمرضى السلين. عندما اقتصر تحليل المرضى الذين يعانون من السائل الدماغي الشوكي السلبي للثقافة على أولئك الذين يعانون من عدوى فيروس نقص المناعة البشرية المعروفة، لم يكن WCC (0-20 خلية لكل ميكرولتر مقابل >20 خلية لكل ميكرولتر) يتنبأ بالوفيات (متوسط نسبة الخطر 0·93، 95 ٪ CI 0·80-1·09). كان معدل الوفيات من التهاب السحايا بالمكورات الرئوية والسلية والسلبية للثقافة مرتفعًا في هذا الإعداد من ارتفاع معدل انتشار فيروس نقص المناعة البشرية. هناك حاجة ملحة لتحسين الوصول إلى التشخيص، لتحديد المسببات بشكل أفضل وتطوير أدوات تشخيصية وخوارزميات علاجية جديدة. المعاهد الوطنية للصحة، خطة الرئيس الطارئة للإغاثة من الإيدز، المعهد الوطني للبحوث الصحية.

Translated Description (French)

Les infections du SNC sont l'une des principales causes de décès liés au VIH en Afrique subsaharienne, mais les causes et les résultats sont mal définis. Nous avons cherché à déterminer la mortalité et les prédicteurs de la mortalité chez les adultes évalués pour la méningite au Botswana, où la prévalence du VIH est estimée à 23 % chez les adultes. Dans cette étude de cohorte répandue, les dossiers des patients de 2004 à 2015 ont été échantillonnés à partir de l'enquête nationale sur la méningite au Botswana, un audit national de tous les dossiers de laboratoire du liquide céphalorachidien (LCR) des patients recevant une ponction lombaire pour l'évaluation de la méningite. Les données de tous les patients présentant une méningite pneumococcique et tuberculeuse confirmée par culture et de tous les patients présentant une méningite à culture négative avec un nombre de globules blancs (WCC) du LCR supérieur à 20 cellules par μL ont été incluses dans nos analyses, en plus d'une sélection aléatoire de patients présentant un LCR et un WCC du LCR négatifs pour la culture allant jusqu'à 20 cellules par μL. Nous avons utilisé les numéros d'identification nationaux des patients pour relier les dossiers de laboratoire du LCR de l'enquête nationale sur la méningite au registre vital des patients et aux bases de données sur le VIH. Des modèles de risques proportionnels de Cox univariables et multivariables ont été utilisés pour évaluer les prédicteurs cliniques et de laboratoire de la mortalité. Nous avons inclus les données de 238 patients atteints de méningite pneumococcique confirmée par culture, 48 avec une méningite tuberculeuse confirmée par culture et 2900 avec un LCR négatif par culture (dont 1691 avec un LCR allant jusqu'à 20 cellules par μL et 1209 avec un LCR supérieur à 20 cellules par μL). L'âge médian était de 37 ans (IQR 31-46), 1605 (50%) des 3184 patients étaient des hommes, 2188 (72%) des 3023 patients avec un lien avec le registre avaient une documentation d'infection par le VIH, et le nombre médian de CD4 était de 139 cellules par μL (IQR 63-271). La mortalité à 10 semaines et à 1 an était de 47% (112 sur 238) et 49% (117 sur 238) pour la méningite à pneumocoque, 46% (22 sur 48) et 56% (27 sur 48) pour la méningite tuberculeuse, et 41% (1181 sur 2900) et 49% (1408 sur 2900) pour les patients de culture négative. Lorsque l'analyse des patients dont le LCR était négatif pour la culture était limitée à ceux dont l'infection par le VIH était connue, le WCC (0-20 cellules par μL contre >20 cellules par μL) n'était pas prédictif de la mortalité (risque relatif moyen 0,93, IC à 95 % 0,80-1,09). La mortalité due à la méningite pneumococcique, tuberculeuse et négative pour la culture était élevée dans ce contexte de prévalence élevée du VIH. Il est urgent d'améliorer l'accès aux diagnostics, de mieux définir les étiologies et de développer de nouveaux outils de diagnostic et algorithmes de traitement. National Institutes of Health, President' s Emergency Plan for AIDS Relief, National Institute for Health Research.

Translated Description (Spanish)

Las infecciones del SNC son una de las principales causas de muertes relacionadas con el VIH en el África subsahariana, pero las causas y los resultados están mal definidos. Nuestro objetivo fue determinar la mortalidad y los predictores de mortalidad en adultos evaluados para la meningitis en Botswana, que tiene una prevalencia estimada del 23% de VIH entre los adultos. En este estudio de cohorte prevalente, se tomaron muestras de los registros de pacientes de 2004-15 de la encuesta nacional de meningitis de Botswana, una auditoría nacional de todos los registros de laboratorio de líquido cefalorraquídeo (LCR) de pacientes que recibieron una punción lumbar para la evaluación de la meningitis. Se incluyeron en nuestros análisis los datos de todos los pacientes con meningitis neumocócica y tuberculosa confirmada por cultivo, y todos los pacientes con meningitis negativa por cultivo con recuento de glóbulos blancos en LCR (WCC) superior a 20 células por μL, además de una selección aleatoria de pacientes con LCR negativo por cultivo y CSF WCC de hasta 20 células por μL. Utilizamos los números de identificación nacional de los pacientes para vincular los registros de laboratorio de LCR de la encuesta nacional de meningitis con el registro vital de los pacientes y las bases de datos de VIH. Se utilizaron modelos de riesgos proporcionales de Cox univariables y multivariables para evaluar los predictores clínicos y de laboratorio de la mortalidad. Incluimos datos de 238 pacientes con meningitis neumocócica confirmada por cultivo, 48 con meningitis tuberculosa confirmada por cultivo y 2900 con LCR negativo por cultivo (incluidos 1691 con LCR WCC de hasta 20 células por μL y 1209 con LCR WCC por encima de 20 células por μL). La mediana de edad fue de 37 años (IQR 31-46), 1605 (50%) de 3184 pacientes eran hombres, 2188 (72%) de 3023 pacientes con vinculación al registro tenían documentación de infección por VIH, y la mediana del recuento de CD4 fue de 139 células por μL (IQR 63-271). La mortalidad a las 10 semanas y a 1 año fue del 47% (112 de 238) y del 49% (117 de 238) para meningitis neumocócica, del 46% (22 de 48) y del 56% (27 de 48) para meningitis tuberculosa, y del 41% (1181 de 2900) y del 49% (1408 de 2900) para pacientes con cultivo negativo. Cuando el análisis de pacientes con LCR negativo para el cultivo se limitó a aquellos con infección por VIH conocida, el CMI (0-20 células por μL frente a >20 células por μL) no fue predictivo de mortalidad (cociente de riesgo promedio 0,93, IC del 95% 0,80-1,09). La mortalidad por meningitis neumocócica, tuberculosa y negativa para el cultivo fue alta en este entorno de alta prevalencia del VIH. Existe una necesidad urgente de mejorar el acceso a los diagnósticos, definir mejor las etiologías y desarrollar nuevas herramientas de diagnóstico y algoritmos de tratamiento. Institutos Nacionales de Salud, Plan de Emergencia del Presidente para el Alivio del SIDA, Instituto Nacional de Investigación en Salud.

Files

Mortality-in-adult-patients.pdf.pdf

Files (1.0 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:5c7465dfed5ec0efe081a9a3a98d0ff2
1.0 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
معدل الوفيات في المرضى البالغين الذين يعانون من التهاب السحايا الإيجابي للثقافة والسالب للثقافة في المسح الوطني لالتهاب السحايا في بوتسوانا: دراسة جماعية سائدة
Translated title (French)
Mortalité chez les patients adultes atteints de méningite à culture positive et négative dans l'enquête nationale sur la méningite au Botswana : une étude de cohorte répandue
Translated title (Spanish)
Mortalidad en pacientes adultos con meningitis de cultivo positivo y de cultivo negativo en la encuesta nacional de meningitis de Botsuana: un estudio de cohorte prevalente

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2954258832
DOI
10.1016/s1473-3099(19)30066-0

Is supplement to
https://openalex.org/W4392500018 (Other)
https://openalex.org/W4233778304 (Other)
https://openalex.org/W2899022551 (Other)
https://openalex.org/W2565460586 (Other)
https://openalex.org/W2406224619 (Other)
https://openalex.org/W2359306063 (Other)
https://openalex.org/W2088750112 (Other)
https://openalex.org/W2061169681 (Other)
https://openalex.org/W2033723922 (Other)
https://openalex.org/W1984356223 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Botswana

References

  • https://openalex.org/W192409491
  • https://openalex.org/W1976256249
  • https://openalex.org/W1987279177
  • https://openalex.org/W2001501762
  • https://openalex.org/W2013135627
  • https://openalex.org/W2033412631
  • https://openalex.org/W2101195119
  • https://openalex.org/W2123687736
  • https://openalex.org/W2125373483
  • https://openalex.org/W2140809531
  • https://openalex.org/W2150241610
  • https://openalex.org/W2150492824
  • https://openalex.org/W2155330030
  • https://openalex.org/W2156311275
  • https://openalex.org/W2171772632
  • https://openalex.org/W2184980221
  • https://openalex.org/W2277731646
  • https://openalex.org/W2410321392
  • https://openalex.org/W2546273436
  • https://openalex.org/W2611697423
  • https://openalex.org/W2613372787
  • https://openalex.org/W2753952100
  • https://openalex.org/W2791888954
  • https://openalex.org/W2898567236
  • https://openalex.org/W4241002592