Published March 18, 2019 | Version v1
Publication Open

A novel species and a new combination of Daldinia from Ban Hua Thung community forest in the northern part of Thailand

Creators

  • 1. National Center for Genetic Engineering and Biotechnology
  • 2. Helmholtz Centre for Infection Research

Description

During a survey of Xylariales in northern Thailand, several specimens with affinities to the genus Daldinia were found and examined for morphological characters, secondary metabolites, and molecular phylogenetic traits. Aside from morphological and chemotaxonomic studies, a multi-locus phylogenetic analysis using internal transcribed spacers regions (ITS) and the large subunit (LSU) of the ribosomal DNA, the second largest subunit of the RNA polymerase (RPB2), and beta-tubulin (TUB2) genes was performed. Among the specimens was a new species and a new record of a species that had previously never been sequenced and studied for its anamorphic morphology. This species, previously described by Ju and Rogers as Hypoxylon kretzschmarioides based on a single record from Indonesia, showed secondary metabolite profiles reminiscent of those of the genus Daldinia and even clustered in the latter genus in the phylogenetic tree. Therefore, it is transferred to Daldinia as D. kretzschmarioides comb. nov. A second new species, D. subvernicosa sp. nov., was found to have a close relationship with D. vernicosa based on morphological and molecular evidence, but differs from D. vernicosa by long-stipitate asci with mostly subglobose ascospores, and the basal ascospores are often elongated.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

خلال مسح Xylariales في شمال تايلاند، تم العثور على العديد من العينات ذات الصلات بجنس Daldinia وفحصها بحثًا عن الصفات المورفولوجية، والمستقلبات الثانوية، والسمات الوراثية الجزيئية. بصرف النظر عن الدراسات المورفولوجية والتصنيفية الكيميائية، تم إجراء تحليل تطوري متعدد المواضع باستخدام مناطق الفواصل الداخلية المنسوخة (ITS) والوحدة الفرعية الكبيرة (LSU) للحمض النووي الريبوسومي، ثاني أكبر وحدة فرعية من بوليميراز الحمض النووي الريبي (RPB2)، وجينات بيتا توبولين (TUB2). من بين العينات كان هناك نوع جديد وسجل جديد من الأنواع التي لم يتم تسلسلها ودراستها من قبل لتشكلها المشوه. أظهر هذا النوع، الذي وصفه جو وروجرز سابقًا بأنه kretzschmarioides hypoxylon استنادًا إلى سجل واحد من إندونيسيا، ملامح مستقلبات ثانوية تذكرنا بتلك الخاصة بجنس الدالدينيا وحتى متجمعة في الجنس الأخير في شجرة التطور. لذلك، يتم نقله إلى الدالدينيا باسم D. kretzschmarioides comb. nov. تم العثور على نوع جديد ثانٍ، D. subvernicosa sp. nov.، له علاقة وثيقة مع D. vernicosa بناءً على الأدلة المورفولوجية والجزيئية، ولكنه يختلف عن D. vernicosa عن طريق أسكي طويل الأمد مع أبواغ أسكوسبورية شبه كروية في الغالب، وغالبًا ما تكون الأبواغ الأسكوسبورية القاعدية ممدودة.

Translated Description (French)

Au cours d'une étude des Xylariales dans le nord de la Thaïlande, plusieurs spécimens ayant des affinités avec le genre Daldinia ont été trouvés et examinés pour les caractères morphologiques, les métabolites secondaires et les traits phylogénétiques moléculaires. Outre les études morphologiques et chimiotaxonomiques, une analyse phylogénétique multi-locus utilisant les régions d'espaceurs internes transcrits (ITS) et la grande sous-unité (LSU) de l'ADN ribosomique, la deuxième plus grande sous-unité des gènes de l'ARN polymérase (RPB2) et de la bêta-tubuline (TUB2) a été réalisée. Parmi les spécimens, il y avait une nouvelle espèce et un nouvel enregistrement d'une espèce qui n'avait jamais été séquencée et étudiée pour sa morphologie anamorphique. Cette espèce, précédemment décrite par Ju et Rogers comme Hypoxylon kretzschmarioides sur la base d'un seul enregistrement en Indonésie, a montré des profils de métabolites secondaires rappelant ceux du genre Daldinia et même regroupés dans ce dernier genre dans l'arbre phylogénétique. Par conséquent, il est transféré à Daldinia en tant que D. kretzschmarioides comb. nov. Une deuxième nouvelle espèce, D. subvernicosa sp. nov., s'est avérée avoir une relation étroite avec D. vernicosa sur la base de preuves morphologiques et moléculaires, mais diffère de D. vernicosa par des asques long-stipités avec principalement des ascospores sous-globoses, et les ascospores basales sont souvent allongées.

Translated Description (Spanish)

Durante un estudio de Xylariales en el norte de Tailandia, se encontraron varios especímenes con afinidades al género Daldinia y se examinaron en busca de caracteres morfológicos, metabolitos secundarios y rasgos filogenéticos moleculares. Aparte de los estudios morfológicos y quimiotaxonómicos, se realizó un análisis filogenético de múltiples locus utilizando regiones espaciadoras transcritas internas (ITS) y la subunidad grande (LSU) del ADN ribosómico, la segunda subunidad más grande de los genes de la ARN polimerasa (RPB2) y la beta-tubulina (TUB2). Entre los ejemplares había una nueva especie y un nuevo registro de una especie que nunca antes había sido secuenciada y estudiada por su morfología anamórfica. Esta especie, descrita previamente por Ju y Rogers como Hypoxylon kretzschmarioides a partir de un único registro de Indonesia, presentaba perfiles de metabolitos secundarios que recordaban a los del género Daldinia e incluso agrupados en este último género en el árbol filogenético. Por lo tanto, se transfiere a Daldinia como D. kretzschmarioides comb. nov. Se encontró que una segunda especie nueva, D. subvernicosa sp. nov., tiene una estrecha relación con D. vernicosa basada en evidencia morfológica y molecular, pero difiere de D. vernicosa por ascostipitate largo con ascosporas en su mayoría subglobosas, y las ascosporas basales a menudo son alargadas.

Files

s11557-019-01469-3.pdf.pdf

Files (2.2 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:c7eed43f26e1068d664e13b3021caa34
2.2 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
نوع جديد ومزيج جديد من الدالدينيا من غابة بان هوا تونغ المجتمعية في الجزء الشمالي من تايلاند
Translated title (French)
Une nouvelle espèce et une nouvelle combinaison de Daldinia de la forêt communautaire de Ban Hua Thung dans la partie nord de la Thaïlande
Translated title (Spanish)
Una nueva especie y una nueva combinación de Daldinia del bosque de la comunidad Ban Hua Thung en la parte norte de Tailandia

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2920838149
DOI
10.1007/s11557-019-01469-3

Is supplement to
https://openalex.org/W4231749709 (Other)
https://openalex.org/W2639406310 (Other)
https://openalex.org/W2394236990 (Other)
https://openalex.org/W2059979003 (Other)
https://openalex.org/W2054545390 (Other)
https://openalex.org/W2044643119 (Other)
https://openalex.org/W2043550541 (Other)
https://openalex.org/W1923269086 (Other)
https://openalex.org/W1549154960 (Other)
https://openalex.org/W1512297289 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Thailand

References

  • https://openalex.org/W1575196615
  • https://openalex.org/W1883639496
  • https://openalex.org/W1963999629
  • https://openalex.org/W1984168306
  • https://openalex.org/W1984250222
  • https://openalex.org/W2006444758
  • https://openalex.org/W2009520825
  • https://openalex.org/W2012899054
  • https://openalex.org/W2028302194
  • https://openalex.org/W2040120605
  • https://openalex.org/W2040308655
  • https://openalex.org/W2048761669
  • https://openalex.org/W2068111995
  • https://openalex.org/W2132926880
  • https://openalex.org/W2138012030
  • https://openalex.org/W2141052558
  • https://openalex.org/W2161444534
  • https://openalex.org/W2296324289
  • https://openalex.org/W2317555721
  • https://openalex.org/W2328503288
  • https://openalex.org/W2334191601
  • https://openalex.org/W2560655403
  • https://openalex.org/W2623117690
  • https://openalex.org/W2755567899
  • https://openalex.org/W2804765831
  • https://openalex.org/W2899107863
  • https://openalex.org/W2901951811
  • https://openalex.org/W4232863037
  • https://openalex.org/W4241233446
  • https://openalex.org/W4242930767