Published December 1, 2023 | Version v1
Publication Open

Use of ISSR markers to assess the genetic diversity of an endemic plant of Morocco (Euphorbia resinifera O. Berg)

Creators

  • 1. Université Sultan Moulay Slimane

Description

Euphorbia resinifera is a melliferous, medicinal, and endemic plant to Morocco. Nevertheless, its ecological and genetic diversity still unknown. The objective of this study is to analyze the diversity and genetic structure of Moroccan wild populations of E. resinifera using ISSR markers. Twelve natural populations collected from its geographical range in Morocco were analyzed using 14 ISSR primers.A total of 125 bands were obtained, with polymorphism of 74.81%. The polymorphic information content (PIC), resolving power (Rp), Shannon's information index (I), and total genetic diversity (Ht) were 0.33, 2.8, 0.35, and 0.21, respectively. The analysis of molecular variance showed that 75.56% of the total variability is present within populations and that 24.44% exists among populations. Also, the analysis showed a very low genetic differentiation between groups of mountain range type (FCT = 0.066), mountain versant type groups (FCT = -0.024), and altitude groups (FCT = -0.022). Moreover, the geographical distances between populations are correlated with their corresponding genetic distances according to the Mantel test (r = 0.507; P < 0.0001).These results suggest that the population structuring follows a model of isolation by geographical distance. Indeed, the genetic structuring of populations into two groups obtained from PCoA and structure analysis revealed a dependence on the geographical origin of the populations. By contrast, the genetic distances are not correlated with the altitude.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

Euphorbia resinifera هو نبات مليفوري وطبي ومتوطن في المغرب. ومع ذلك، لا يزال تنوعها البيئي والجيني غير معروف. الهدف من هذه الدراسة هو تحليل التنوع والبنية الجينية للسكان البرية المغربية من E. resinifera باستخدام علامات ISSR. تم تحليل اثني عشر مجموعة طبيعية تم جمعها من نطاقها الجغرافي في المغرب باستخدام 14 بادئ ISSR. تم الحصول على ما مجموعه 125 فرقة، مع تعدد الأشكال بنسبة 74.81 ٪. كان محتوى المعلومات متعدد الأشكال (PIC)، وقوة التحليل (Rp)، ومؤشر معلومات شانون (I)، والتنوع الجيني الكلي (Ht) 0.33 و 2.8 و 0.35 و 0.21 على التوالي. أظهر تحليل التباين الجزيئي أن 75.56 ٪ من التباين الكلي موجود بين السكان وأن 24.44 ٪ موجود بين السكان. كما أظهر التحليل تمايزًا وراثيًا منخفضًا جدًا بين مجموعات من نوع سلسلة الجبال (FCT = 0.066)، ومجموعات من النوع الجبلي (FCT = -0.024)، ومجموعات الارتفاعات (FCT = -0.022). علاوة على ذلك، ترتبط المسافات الجغرافية بين السكان بالمسافات الوراثية المقابلة لها وفقًا لاختبار Mantel (r = 0.507 ؛ P < 0.0001). تشير هذه النتائج إلى أن هيكلة السكان تتبع نموذج العزلة حسب المسافة الجغرافية. في الواقع، كشفت الهيكلة الوراثية للسكان في مجموعتين تم الحصول عليها من تحليل PCoA وتحليل الهيكل عن الاعتماد على الأصل الجغرافي للسكان. على النقيض من ذلك، لا ترتبط المسافات الوراثية بالارتفاع.

Translated Description (French)

Euphorbia resinifera est une plante mellifère, médicinale et endémique du Maroc. Néanmoins, sa diversité écologique et génétique est encore inconnue. L'objectif de cette étude est d'analyser la diversité et la structure génétique des populations sauvages marocaines d'E. resinifera à l'aide de marqueurs ISSR. Douze populations naturelles collectées dans son aire géographique au Maroc ont été analysées à l'aide de 14 amorces ISSR. Un total de 125 bandes ont été obtenues, avec un polymorphisme de 74,81%. Le contenu en information polymorphe (CIP), le pouvoir de résolution (Rp), l'indice d'information de Shannon (I) et la diversité génétique totale (Ht) étaient de 0,33, 2,8, 0,35 et 0,21, respectivement. L'analyse de la variance moléculaire a montré que 75,56% de la variabilité totale est présente au sein des populations et que 24,44% existe au sein des populations. En outre, l'analyse a montré une très faible différenciation génétique entre les groupes de type chaîne de montagnes (FCT = 0,066), les groupes de type versant montagne (FCT = -0,024) et les groupes d'altitude (FCT = -0,022). De plus, les distances géographiques entre les populations sont corrélées avec leurs distances génétiques correspondantes selon le test de Mantel (r = 0,507 ; P < 0,0001)Ces résultats suggèrent que la structuration des populations suit un modèle d'isolement par distance géographique. En effet, la structuration génétique des populations en deux groupes obtenue à partir de la PCoA et de l'analyse de structure a révélé une dépendance à l'origine géographique des populations. En revanche, les distances génétiques ne sont pas corrélées avec l'altitude.

Translated Description (Spanish)

Euphorbia resinifera es una planta melífera, medicinal y endémica de Marruecos. Sin embargo, su diversidad ecológica y genética sigue siendo desconocida. El objetivo de este estudio es analizar la diversidad y la estructura genética de las poblaciones silvestres marroquíes de E. resinifera utilizando marcadores ISSR. Se analizaron doce poblaciones naturales recolectadas de su área de distribución geográfica en Marruecos utilizando 14 cebadores ISSR. Se obtuvieron un total de 125 bandas, con un polimorfismo del 74,81%. El contenido de información polimórfica (PIC), el poder de resolución (Rp), el índice de información de Shannon (I) y la diversidad genética total (Ht) fueron 0.33, 2.8, 0.35 y 0.21, respectivamente. El análisis de varianza molecular mostró que el 75.56% de la variabilidad total está presente dentro de las poblaciones y que el 24.44% existe entre las poblaciones. Además, el análisis mostró una diferenciación genética muy baja entre grupos de tipo cordillera (FCT = 0,066), grupos de tipo versante de montaña (FCT = -0,024) y grupos de altitud (FCT = -0,022). Además, las distancias geográficas entre poblaciones se correlacionan con sus correspondientes distancias genéticas de acuerdo con la prueba de Mantel (r = 0,507; P < 0,0001). Estos resultados sugieren que la estructuración de la población sigue un modelo de aislamiento por distancia geográfica. De hecho, la estructuración genética de las poblaciones en dos grupos obtenida del análisis de PCoA y estructura reveló una dependencia del origen geográfico de las poblaciones. Por el contrario, las distancias genéticas no están correlacionadas con la altitud.

Files

s43141-023-00543-4.pdf

Files (1.6 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:9b1d65ddc2f733b84bdacc073219b0a4
1.6 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
استخدام علامات ISSR لتقييم التنوع الجيني لنبات متوطن في المغرب (Euphorbia resinifera O. Berg)
Translated title (French)
Utilisation de marqueurs ISSR pour évaluer la diversité génétique d'une plante endémique du Maroc (Euphorbia resinifera O. Berg)
Translated title (Spanish)
Uso de marcadores ISSR para evaluar la diversidad genética de una planta endémica de Marruecos (Euphorbia resinifera O. Berg)

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4386467131
DOI
10.1186/s43141-023-00543-4

Is supplement to
https://openalex.org/W4385728222 (Other)
https://openalex.org/W3026655967 (Other)
https://openalex.org/W2587129239 (Other)
https://openalex.org/W2189485559 (Other)
https://openalex.org/W2161079302 (Other)
https://openalex.org/W2146427739 (Other)
https://openalex.org/W2079559442 (Other)
https://openalex.org/W2078068324 (Other)
https://openalex.org/W2032901464 (Other)
https://openalex.org/W1968871119 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Morocco

References

  • https://openalex.org/W1522274554
  • https://openalex.org/W1555826535
  • https://openalex.org/W1905134462
  • https://openalex.org/W1964510979
  • https://openalex.org/W1967482605
  • https://openalex.org/W1976166235
  • https://openalex.org/W1984533321
  • https://openalex.org/W1998794607
  • https://openalex.org/W2000424142
  • https://openalex.org/W2033236942
  • https://openalex.org/W2035839217
  • https://openalex.org/W2047845716
  • https://openalex.org/W2054913273
  • https://openalex.org/W2055335617
  • https://openalex.org/W2060558272
  • https://openalex.org/W2069337334
  • https://openalex.org/W2078870235
  • https://openalex.org/W2079182722
  • https://openalex.org/W2088711731
  • https://openalex.org/W2098126593
  • https://openalex.org/W2119799171
  • https://openalex.org/W2127160580
  • https://openalex.org/W2155649556
  • https://openalex.org/W2159031265
  • https://openalex.org/W2161339576
  • https://openalex.org/W2163333061
  • https://openalex.org/W2166799481
  • https://openalex.org/W2167968733
  • https://openalex.org/W2182447601
  • https://openalex.org/W2189513678
  • https://openalex.org/W2315814590
  • https://openalex.org/W2483240831
  • https://openalex.org/W2548910012
  • https://openalex.org/W2549915152
  • https://openalex.org/W2562398189
  • https://openalex.org/W2590892885
  • https://openalex.org/W2772454852
  • https://openalex.org/W2905309966
  • https://openalex.org/W2942283230
  • https://openalex.org/W2963772338
  • https://openalex.org/W3037042160
  • https://openalex.org/W3088311439
  • https://openalex.org/W3196676453
  • https://openalex.org/W3197447790
  • https://openalex.org/W4205583525
  • https://openalex.org/W4230386416
  • https://openalex.org/W4252553567
  • https://openalex.org/W4299798461
  • https://openalex.org/W4319339574