Published June 29, 2022
| Version v1
Publication
Open
Epidemiological and virological surveillance of influenza viruses in China during 2020–2021
Creators
- 1. National Institute for Viral Disease Control and Prevention
- 2. Center for Disease Control
- 3. Victorian Infectious Diseases Reference Laboratory
Description
During the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, seasonal influenza activity declined globally and remained below previous seasonal levels, but intensified in China since 2021. Preventive measures to COVID-19 accompanied by different epidemic characteristics of influenza in different regions of the world. To better respond to influenza outbreaks under the COVID-19 pandemic, we analyzed the epidemiology, antigenic and genetic characteristics, and antiviral susceptibility of influenza viruses in the mainland of China during 2020-2021.Respiratory specimens from influenza like illness cases were collected by sentinel hospitals and sent to network laboratories in Chinese National Influenza Surveillance Network. Antigenic mutation analysis of influenza virus isolates was performed by hemagglutination inhibition assay. Next-generation sequencing was used for genetic analyses. We also conducted molecular characterization and phylogenetic analysis of circulating influenza viruses. Viruses were tested for resistance to antiviral medications using phenotypic and/or sequence-based methods.In the mainland of China, influenza activity recovered in 2021 compared with that in 2020 and intensified during the traditional influenza winter season, but it did not exceed the peak in previous years. Almost all viruses isolated during the study period were of the B/Victoria lineage and were characterized by genetic diversity, with the subgroup 1A.3a.2 viruses currently predominated. 37.8% viruses tested were antigenically similar to reference viruses representing the components of the vaccine for the 2020-2021 and 2021-2022 Northern Hemisphere influenza seasons. In addition, China has a unique subgroup of 1A.3a.1 viruses. All viruses tested were sensitive to neuraminidase inhibitors and endonuclease inhibitors, except two B/Victoria lineage viruses identified to have reduced sensitivity to neuraminidase inhibitors.Influenza activity increased in the mainland of China in 2021, and caused flu season in the winter of 2021-2022. Although the diversity of influenza (sub)type decreases, B/Victoria lineage viruses show increased genetic and antigenic diversity. The world needs to be fully prepared for the co-epidemic of influenza and severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) virus globally.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
خلال جائحة فيروس كورونا 2019 (COVID -19)، انخفض نشاط الأنفلونزا الموسمية على مستوى العالم وظل أقل من المستويات الموسمية السابقة، لكنه اشتد في الصين منذ عام 2021. التدابير الوقائية من كوفيد-19 مصحوبة بخصائص وبائية مختلفة للأنفلونزا في مناطق مختلفة من العالم. للاستجابة بشكل أفضل لتفشي الأنفلونزا في ظل جائحة كوفيد-19، قمنا بتحليل علم الأوبئة والخصائص المستضدية والجينية وقابلية فيروسات الأنفلونزا المضادة للفيروسات في البر الرئيسي للصين خلال الفترة 2020-2021. تم جمع عينات الجهاز التنفسي من حالات الأمراض الشبيهة بالأنفلونزا من قبل مستشفيات الحارس وإرسالها إلى مختبرات الشبكة في الشبكة الوطنية الصينية لترصد الأنفلونزا. تم إجراء تحليل الطفرات المستضدية لعزلات فيروس الأنفلونزا عن طريق مقايسة تثبيط التراص الدموي. تم استخدام تسلسل الجيل التالي للتحليلات الجينية. كما أجرينا التوصيف الجزيئي والتحليل الوراثي لفيروسات الأنفلونزا المتداولة. تم اختبار الفيروسات لمقاومة الأدوية المضادة للفيروسات باستخدام الأساليب الظاهرية و/أو القائمة على التسلسل. في البر الرئيسي للصين، تعافى نشاط الأنفلونزا في عام 2021 مقارنة مع ذلك في عام 2020 وتكثف خلال موسم الشتاء التقليدي للأنفلونزا، لكنه لم يتجاوز الذروة في السنوات السابقة. كانت جميع الفيروسات المعزولة تقريبًا خلال فترة الدراسة من سلالة ب/فيكتوريا وتتميز بالتنوع الجيني، مع غلبة فيروسات المجموعة الفرعية 1 أ .3 أ .2 حاليًا. كانت 37.8 ٪ من الفيروسات التي تم اختبارها مشابهة من الناحية الجينية للفيروسات المرجعية التي تمثل مكونات اللقاح لموسمي إنفلونزا نصف الكرة الشمالي 2020-2021 و 2021-2022. بالإضافة إلى ذلك، لدى الصين مجموعة فرعية فريدة من فيروسات 1A.3a.1. كانت جميع الفيروسات التي تم اختبارها حساسة لمثبطات النورامينيداز ومثبطات النوكلياز، باستثناء فيروسين من سلالة ب/فيكتوريا تم تحديدهما لتقليل الحساسية لمثبطات النورامينيداز. زاد نشاط الإنفلونزا في البر الرئيسي للصين في عام 2021، وتسبب في موسم الإنفلونزا في شتاء 2021-2022. على الرغم من انخفاض تنوع أنواع الأنفلونزا (الفرعية)، إلا أن فيروسات سلالة ب/فيكتوريا تظهر تنوعًا وراثيًا ومستضديًا متزايدًا. يجب أن يكون العالم مستعدًا تمامًا للوباء المشترك للأنفلونزا وفيروس كورونا 2 للمتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة (SARS - CoV -2) على مستوى العالم.Translated Description (French)
Au cours de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), l'activité grippale saisonnière a diminué dans le monde entier et est restée inférieure aux niveaux saisonniers précédents, mais s'est intensifiée en Chine depuis 2021. Mesures préventives contre la COVID-19 accompagnées de différentes caractéristiques épidémiques de la grippe dans différentes régions du monde. Pour mieux répondre aux épidémies de grippe dans le cadre de la pandémie de COVID-19, nous avons analysé l'épidémiologie, les caractéristiques antigéniques et génétiques et la sensibilité antivirale des virus de la grippe en Chine continentale au cours de la période 2020-2021. Des échantillons respiratoires provenant de cas de grippe ont été collectés par des hôpitaux sentinelles et envoyés aux laboratoires du réseau du Réseau national chinois de surveillance de la grippe. L'analyse des mutations antigéniques des isolats du virus de la grippe a été effectuée par un test d'inhibition de l'hémagglutination. Le séquençage de nouvelle génération a été utilisé pour les analyses génétiques. Nous avons également effectué la caractérisation moléculaire et l'analyse phylogénétique des virus grippaux en circulation. Les virus ont été testés pour la résistance aux médicaments antiviraux à l'aide de méthodes phénotypiques et/ou séquentielles. En Chine continentale, l'activité grippale s'est rétablie en 2021 par rapport à 2020 et s'est intensifiée pendant la saison hivernale traditionnelle de la grippe, mais elle n'a pas dépassé le pic des années précédentes. Presque tous les virus isolés au cours de la période d'étude étaient de la lignée B/Victoria et étaient caractérisés par une diversité génétique, les virus du sous-groupe 1A.3a.2 prédominant actuellement. 37,8 % des virus testés étaient antigéniquement similaires aux virus de référence représentant les composants du vaccin pour les saisons grippales 2020-2021 et 2021-2022 de l'hémisphère Nord. En outre, la Chine a un sous-groupe unique de virus 1A.3a.1. Tous les virus testés étaient sensibles aux inhibiteurs de la neuraminidase et aux inhibiteurs de l'endonucléase, à l'exception de deux virus de la lignée B/Victoria identifiés comme ayant une sensibilité réduite aux inhibiteurs de la neuraminidase. L'activité grippale a augmenté en Chine continentale en 2021 et a provoqué la saison de la grippe à l'hiver 2021-2022. Bien que la diversité du (sous-)type de grippe diminue, les virus de la lignée B/Victoria montrent une diversité génétique et antigénique accrue. Le monde doit être pleinement préparé à la co-épidémie du virus de la grippe et du syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) à l'échelle mondiale.Translated Description (Spanish)
Durante la pandemia de enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), la actividad de la influenza estacional disminuyó a nivel mundial y se mantuvo por debajo de los niveles estacionales anteriores, pero se intensificó en China desde 2021. Medidas preventivas al COVID-19 acompañadas de diferentes características epidémicas de influenza en diferentes regiones del mundo. Para responder mejor a los brotes de influenza bajo la pandemia de COVID-19, analizamos la epidemiología, las características antigénicas y genéticas y la susceptibilidad antiviral de los virus de la influenza en China continental durante 2020-2021. Los hospitales centinela recolectaron muestras respiratorias de casos de enfermedades similares a la influenza y las enviaron a los laboratorios de la red en la Red Nacional de Vigilancia de la Influenza de China. El análisis de mutaciones antigénicas de los aislados del virus de la influenza se realizó mediante un ensayo de inhibición de la hemaglutinación. Se utilizó la secuenciación de próxima generación para los análisis genéticos. También realizamos la caracterización molecular y el análisis filogenético de los virus de la gripe circulantes. Los virus se probaron para determinar su resistencia a los medicamentos antivirales utilizando métodos fenotípicos y/o basados en secuencias. En China continental, la actividad de la influenza se recuperó en 2021 en comparación con la de 2020 y se intensificó durante la temporada tradicional de invierno de influenza, pero no superó el pico de años anteriores. Casi todos los virus aislados durante el período de estudio eran del linaje B/Victoria y se caracterizaron por la diversidad genética, predominando actualmente los virus del subgrupo 1A.3a.2. El 37.8% de los virus analizados fueron antigénicamente similares a los virus de referencia que representan los componentes de la vacuna para las temporadas de influenza del hemisferio norte 2020-2021 y 2021-2022. Además, China tiene un subgrupo único de virus 1A.3a.1. Todos los virus analizados fueron sensibles a los inhibidores de la neuraminidasa y a los inhibidores de la endonucleasa, excepto dos virus de linaje B/Victoria que se identificó que tenían una sensibilidad reducida a los inhibidores de la neuraminidasa. La actividad de la gripe aumentó en la China continental en 2021 y causó la temporada de gripe en el invierno de 2021-2022. Aunque la diversidad del (sub)tipo de influenza disminuye, los virus del linaje B/Victoria muestran una mayor diversidad genética y antigénica. El mundo debe estar completamente preparado para la coepidemia del virus de la gripe y el coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV-2) a nivel mundial.Files
s40249-022-01002-x.pdf
Files
(3.4 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:d278f6dea833579a7debd780b3ebdb02
|
3.4 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- المراقبة الوبائية والفيروسية لفيروسات الأنفلونزا في الصين خلال الفترة 2020–2021
- Translated title (French)
- Surveillance épidémiologique et virologique des virus grippaux en Chine au cours de la période 2020–2021
- Translated title (Spanish)
- Vigilancia epidemiológica y virológica de los virus de la gripe en China durante 2020–2021
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4283763363
- DOI
- 10.1186/s40249-022-01002-x
References
- https://openalex.org/W1886211768
- https://openalex.org/W2017562232
- https://openalex.org/W2031611770
- https://openalex.org/W2053895922
- https://openalex.org/W2062517800
- https://openalex.org/W2062665189
- https://openalex.org/W2077897437
- https://openalex.org/W2158756247
- https://openalex.org/W2159665724
- https://openalex.org/W2160378127
- https://openalex.org/W2343247318
- https://openalex.org/W2475131042
- https://openalex.org/W2775569101
- https://openalex.org/W2795164460
- https://openalex.org/W2903908768
- https://openalex.org/W2964808436
- https://openalex.org/W2995931456
- https://openalex.org/W3096701970
- https://openalex.org/W3126740395
- https://openalex.org/W3159448946
- https://openalex.org/W3209839027
- https://openalex.org/W4220879443
- https://openalex.org/W4302444898