Published December 1, 2017
| Version v1
Publication
Open
Central nervous system transcriptome of Biomphalaria alexandrina, an intermediate host for schistosomiasis
Creators
- 1. University of California, Davis
- 2. Mansoura University
- 3. Theodor Bilharz Research Institute
- 4. University of Puerto Rico, Medical Sciences Campus
- 5. University of Puerto Rico at Río Piedras
- 6. Dalhousie University
Description
Globally, more than 200 million people live at risk of the neglected tropical disease schistosomiasis (or snail fever). Larval schistosomes require the presence of specific snail species that act as intermediate hosts, supporting their multiplication and transformation into forms that can infect humans. This project was designed to generate a transcriptome from the central nervous system (CNS) of Biomphalaria alexandrina, the major intermediate host for Schistosoma mansoni in Egypt. A transcriptome was generated from five pooled central nervous systems dissected from uninfected specimens of B. alexandrina. Raw Illumina RNA-seq data (~ 20.3 million paired end reads of 150 base pairs length each) generated a transcriptome consisting of 144,213 transcript elements with an N50 contig size of 716 base pairs. Orthologs of 15,246 transcripts and homologs for an additional 16,810 transcripts were identified in the UniProtKB/Swiss-Prot database. The B. alexandrina CNS transcriptome provides a resource for future research exploring parasite-host interactions in a simpler nervous system. Moreover, increased understanding of the neural signaling mechanisms involved in the response of B. alexandrina to infection by S. mansoni larvae could lead to novel and highly specific strategies for the control of snail populations.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
على الصعيد العالمي، يعيش أكثر من 200 مليون شخص في خطر الإصابة بمرض البلهارسيات الاستوائي المهمل (أو حمى الحلزون). تتطلب البلهارسيات اليرقية وجود أنواع محددة من الحلزونات التي تعمل كمضيفات وسيطة، مما يدعم تكاثرها وتحويلها إلى أشكال يمكن أن تصيب البشر. تم تصميم هذا المشروع لتوليد ترانسكريبتوم من الجهاز العصبي المركزي (CNS) من Biomphalaria alexandrina، المضيف الوسيط الرئيسي للبلهارسيا المانسونية في مصر. تم إنشاء ترانسكريبتوم من خمسة أجهزة عصبية مركزية مجمعة تم تشريحها من عينات غير مصابة من B. alexandrina. أنتجت بيانات تسلسل الحمض النووي الريبوزي الخام (~ 20.3 مليون قراءة نهاية مقترنة بطول 150 زوجًا أساسيًا لكل منها) ترانسكريبتوم يتكون من 144،213 عنصرًا نصيًا بحجم N50 متجاور من 716 زوجًا أساسيًا. تم تحديد مخطوطات 15246 نصًا ومتجانسات لـ 16810 نصًا إضافيًا في قاعدة بيانات UniProtKB/Swiss - Prot. يوفر B. alexandrina CNS transcriptome موردًا للبحث المستقبلي لاستكشاف التفاعلات بين الطفيليات والمضيف في جهاز عصبي أبسط. علاوة على ذلك، يمكن أن يؤدي الفهم المتزايد لآليات الإشارات العصبية المشاركة في استجابة B. alexandrina للعدوى بواسطة يرقات S. mansoni إلى استراتيجيات جديدة ومحددة للغاية للسيطرة على مجموعات الحلزون.Translated Description (French)
À l'échelle mondiale, plus de 200 millions de personnes sont exposées au risque de schistosomiase (ou fièvre des escargots), une maladie tropicale négligée. Les schistosomes larvaires nécessitent la présence d'espèces d'escargots spécifiques qui agissent comme hôtes intermédiaires, soutenant leur multiplication et leur transformation en formes pouvant infecter les humains. Ce projet a été conçu pour générer un transcriptome à partir du système nerveux central (SNC) de Biomphalaria alexandrina, l'hôte intermédiaire majeur de Schistosoma mansoni en Égypte. Un transcriptome a été généré à partir de cinq systèmes nerveux centraux regroupés disséqués à partir de spécimens non infectés de B. alexandrina. Les données brutes Illumina RNA-seq (~ 20,3 millions de lectures d'extrémité appariées de 150 paires de bases de longueur chacune) ont généré un transcriptome composé de 144 213 éléments de transcription avec une taille de contig N50 de 716 paires de bases. Des orthologues de 15 246 transcrits et des homologues pour 16 810 transcrits supplémentaires ont été identifiés dans la base de données UniProtKB/Swiss-Prot. Le transcriptome du SNC de B. alexandrina fournit une ressource pour de futures recherches explorant les interactions parasite-hôte dans un système nerveux plus simple. De plus, une meilleure compréhension des mécanismes de signalisation neurale impliqués dans la réponse de B. alexandrina à l'infection par les larves de S. mansoni pourrait conduire à des stratégies nouvelles et très spécifiques pour le contrôle des populations d'escargots.Translated Description (Spanish)
A nivel mundial, más de 200 millones de personas viven en riesgo de padecer la enfermedad tropical desatendida esquistosomiasis (o fiebre del caracol). Los esquistosomas larvarios requieren la presencia de especies de caracoles específicas que actúan como huéspedes intermedios, apoyando su multiplicación y transformación en formas que pueden infectar a los humanos. Este proyecto fue diseñado para generar un transcriptoma del sistema nervioso central (SNC) de Biomphalaria alexandrina, el principal huésped intermedio de Schistosoma mansoni en Egipto. Se generó un transcriptoma a partir de cinco sistemas nerviosos centrales agrupados diseccionados a partir de especímenes no infectados de B. alexandrina. Los datos de RNA-seq de Illumina sin procesar (~ 20.3 millones de lecturas finales emparejadas de 150 pares de bases de longitud cada una) generaron un transcriptoma que consistía en 144,213 elementos de transcripción con un tamaño de cóntigo N50 de 716 pares de bases. Se identificaron ortólogos de 15 246 transcripciones y homólogos para 16 810 transcripciones adicionales en la base de datos UniProtKB/Swiss-Prot. El transcriptoma del SNC de B. alexandrina proporciona un recurso para futuras investigaciones que exploren las interacciones parásito-huésped en un sistema nervioso más simple. Además, una mayor comprensión de los mecanismos de señalización neuronal involucrados en la respuesta de B. alexandrina a la infección por larvas de S. mansoni podría conducir a estrategias novedosas y altamente específicas para el control de las poblaciones de caracoles.Files
s13104-017-3018-6.pdf
Files
(1.2 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:399a929067b7e55b4429f1d747020a18
|
1.2 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- ترانسكريبتوم الجهاز العصبي المركزي من Biomphalaria alexandrina، مضيف وسيط لداء البلهارسيا
- Translated title (French)
- Transcriptome du système nerveux central de Biomphalaria alexandrina, un hôte intermédiaire de la schistosomiase
- Translated title (Spanish)
- Transcriptoma del sistema nervioso central de Biomphalaria alexandrina, un huésped intermedio para la esquistosomiasis
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2774333587
- DOI
- 10.1186/s13104-017-3018-6
References
- https://openalex.org/W1600836121
- https://openalex.org/W1954100204
- https://openalex.org/W1967050695
- https://openalex.org/W1974241761
- https://openalex.org/W2008042344
- https://openalex.org/W2012352378
- https://openalex.org/W2022442996
- https://openalex.org/W2050985009
- https://openalex.org/W2065872027
- https://openalex.org/W2069097192
- https://openalex.org/W2074934602
- https://openalex.org/W2098186057
- https://openalex.org/W2112985291
- https://openalex.org/W2126419817
- https://openalex.org/W2131271579
- https://openalex.org/W2149585737
- https://openalex.org/W2155628349
- https://openalex.org/W2166925176
- https://openalex.org/W2182530666
- https://openalex.org/W2560669138
- https://openalex.org/W2592811885
- https://openalex.org/W2616817562
- https://openalex.org/W4238433626
- https://openalex.org/W4376453272